Aqui, é apresentado um procedimento para ativar seletivamente uma proteína neuronal com um pulso curto de luz codificando geneticamente um aminoácido não natural foto-reativo em uma proteína neuronal alvo expressa em neurônios em cultura ou in vivo.
Artigo de método
Aqui, é apresentado um procedimento para ativar seletivamente uma proteína neuronal com um pulso curto de luz codificando geneticamente um aminoácido não natural foto-reativo em uma proteína neuronal alvo expressa em neurônios em cultura ou in vivo.
A fotoestimulação é uma forma não invasiva de controlar eventos biológicos com excelente resolução espacial e temporal. Novos métodos são desejados para fotorregular proteínas endógenas expressas em seu ambiente nativo. Aqui, apresentamos uma abordagem para controlar opticamente a função de uma proteína neuronal diretamente nos neurônios usando um aminoácido não natural (Uaa) geneticamente codificado. Usando um par ortogonal de tRNA / aminoacil-tRNA sintetase para suprimir o códon âmbar, um Uaa 4,5-dimetoxi-2-nitrobenzil-cisteína foto-reativo (Cmn) é especificamente incorporado no poro de uma proteína neuronal Kir2.1, um canal de potássio retificador interno. O Cmn volumoso bloqueia fisicamente o poro do canal, tornando o Kir2.1 não condutor. A iluminação da luz converte instantaneamente o Cmn em um aminoácido natural menor Cys, ativando a função do canal Kir2.1. Expressamos esses canais de potássio farmacológicos(PIRK) em neurônios primários do hipocampo de ratos e demonstramos que a ativação luminosa do PIRK cessa o disparo neuronal devido ao fluxo de corrente de K + através dos canais Kir2.1 ativados. Usando eletroporação in utero, também expressamos PIRK no neocórtex embrionário de camundongo in vivo, mostrando a ativação luminosa de PIRK em neurônios neocorticais. A codificação genética do Uaa não impõe restrições ao tipo de proteína-alvo ou localização celular, e uma família de Uaas fotorreativos está disponível para modular diferentes resíduos de aminoácidos naturais. Essa técnica, portanto, tem o potencial de ser geralmente aplicada a muitas proteínas neuronais para alcançar a regulação óptica de diferentes processos no cérebro. O protocolo atual apresenta um procedimento acessível para a intrincada incorporação de Uaa em neurônios in vitro e in vivo para obter o fotocontrole da atividade da proteína neuronal em nível molecular.
Em comparação com a estimulação elétrica convencional, fotoestimulação oferece maior resolução temporal e espacial com a mínima interferência no sistema fisiológico das amostras. Desde a demonstração do uso de lasers para estimular neurônios em 1971 1, muitas maneiras criativas foram inventados para controlar exogenamente atividade neuronal com a luz. Libertação óptica de agonistas photocaged tem sido muito utilizado para estudar a resposta fisiológica da rede neuronal para ligandos 2,3,4. Esta técnica tem limitado especificidade devido à difusão de agonistas enjaulados. Especificidade genética é conseguido por ectopicamente que expressam canais de opsina sensíveis à luz e bombas de 5,6,7, e que tem sido aplicado com sucesso para modular redes neuronais seleccionadas em diversos organismos modelo. No entanto, seria difícil de aplicar este método para controlar opticamente várias outras proteínas neuronais, uma vez que enxertia photoresponsiveness das proteínas a outras proteínas opsina acolherá-D necessitam de engenharia intenso que podem alterar as características naturais da proteína em estudo. Quimicamente amarrar um ligando fotossensível exógeno a uma proteína demonstrou uma outra maneira de controlar a funcionalidade de proteínas de canal 8,9,10. O ligando é apresentado ou retirado do local de ligação da proteína através da foto-isomerização da porção azobenzeno. Partilha química limita a aplicação, principalmente, para o lado extracelular de proteínas de membrana, excluindo o lado intracelular e proteínas intracelulares.
Fotossensíveis UAAS, depois de ter sido incorporada em proteínas, fornecer uma estratégia geral para manipular proteínas com luz. Em esforços iniciais, tRNAs quimicamente acilados com UAAS photocaged receberam microinjeções em oócitos de Xenopus para incorporar as UAAS em receptores de membrana e canais iônicos 11, que têm avançado a compreensão de suas relações estrutura-função 12,13,14.Esta abordagem microinjeção é limitado principalmente para grandes oócitos. Incorporação genética de uma Uaa ignora o desafio técnico tRNA acilação e microinjecção usando um par ARNt / sintetase ortogonal, que incorpora SAU através da tradução de proteína endógena em células vivas 15,16,17,18. Uaa incorporação proteínas neuronais tem sido demonstrada em neurónios primárias e células estaminais neurais 19,20. Mais recentemente, fotossensíveis Uaa foi geneticamente incorporada uma proteína neuronal no cérebro de mamíferos, in vivo, pela primeira vez 21. Estes avanços tornam possível estudar proteínas neuronais com UAAS no seu ambiente celular nativo.
Interiormente retificação do canal de potássio Kir2.1 é um forte retificador que passa K + correntes mais facilmente em que para fora da célula, e é essencial na regulação de processos fisiológicos incluindo excitabilidade das células, tônus vascular, a frequência cardíaca, refluxo sal nal e insulina liberar 22. A sobre-expressão de Kir2.1 hiperpolariza o potencial de membrana do neurónio-alvo, que se torna menos excitável 23,24. Para controlar opticamente Kir2.1 nas suas células nativas, Kang et ai. Geneticamente incorporou um Uaa foto-sensível em Kir2.1 expresso em células de mamíferos, os neurónios e cérebro do rato embriónica 21. Uma breve pulso de luz foi capaz de converter o EAU em um aminoácido natural Cys, activando assim a proteína Kir2.1 alvo. Quando esta proteína de canal de foto-indutível interiormente rectificação de potássio (Pirk) foi expresso em neurónios primários do hipocampo do rato, que suprimiu o disparo neuronal em resposta à activação de luz. Além disso, o canal Pirk foi expressa no neocórtex de rato embrionário, e a corrente activado pela luz Pirk em neurónios corticais foi medida. A implementação bem sucedida da tecnologia Uaa in vivo no cérebro de mamíferos abre a porta para controlar opticamente proteínas neuronaisno seu ambiente nativo, o que permitirá dissecção óptico dos processos e mecanismos neuronais, a nível molecular.
Neste protocolo, descrevemos os procedimentos para a constituição genética de UAAS em neurônios primários na cultura e no cérebro do rato embrionário in vivo. O fotossensíveis Uaa CMN e Kir2.1 são utilizados para ilustrar o processo. Métodos para avaliar bem-sucedida incorporação Uaa e controle óptico da actividade da proteína neuronal são fornecidos. Este protocolo fornece um guia claro para codificar geneticamente UAAS em neurônios e in vivo, e para a regulação opticamente função da proteína neuronal através de um Uaa fotossensíveis. Esperamos que este protocolo para facilitar a adoção da tecnologia in vivo Uaa para a neurociência e estudos biológicos optogenética.
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Todos os procedimentos do presente estudo foram realizadas utilizando Institutional Animal Care e Use Committee (IACUC) aprovou protocolos para lidar com os animais no Instituto Salk para Estudos Biológicos, La Jolla, CA.
Uaa 1. Incorporação em Kir2.1 e Expressão da resultante Pirk na cultura neuronal primária
2. Incorporação Uaa em Kir2.1 e Expressão da Pirk resultante no Rato In Vivo cérebro embrionário
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Para incorporar um Uaa geneticamente para uma proteína em neurónios, o primeiro passo importante é a concepção de gene apropriado constrói para proporcionar e expressar genes de forma eficiente em neurónios. Há três componentes genéticos para Uaa incorporação: (1) o gene alvo com o codão de paragem TAG âmbar introduzido no local escolhido para Uaa incorporação (2) um ARNt ortogonal para reconhecer o codão de paragem TAG mutado, e (3) uma aminoacil ortogonal -tRNA sintetase de cobrar SAU ...
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Para alcançar photo-modulação eficaz, o passo inicial importante é decidir onde a incorporar SAU fotossensíveis na proteína alvo. A informação estrutural e funcional da proteína alvo é muito útil para orientar a selecção de locais candidatos. Ao mesmo tempo, o efeito de regulação da luz iria determinar que o local é o mais adequado. Depois de escolher locais candidatos, é recomendável para testar os sítios em linhas celulares de mamíferos, tais como o rim embrionário humano (HEK) células de cultura e mais fácil manipula...
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Os autores não têm nada a divulgar.
Agradecemos ao Dr. S. Szobota pela discussão útil sobre cultura de neurônios e transfecção de Ca-P. L.W. reconhece o apoio do The Salk Innovation Grant, do Instituto de Medicina Regenerativa da Califórnia (RN1-00577-1) e dos Institutos Nacionais de Saúde (1DP2OD004744).
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| Nome | Empresa | Número de catálogo | Comentários |
|---|---|---|---|
| Vidros de cobertura, círculos, 12 mm, espessura 0,13-0,17 mm | Carolina Biologicals | 633029 | |
| Corning BioCoat Poly-D-Lysine | Corning Discovery Labware | 354210 | |
| Solução de D-(+)-glicose | Sigma-Aldrich | G8769 | |
| Iris Spatula-curvada | Fine Science | Tool 10092-12 | |
| Faca de dissecação - Ponta | angular finaFerramenta de Ciência Fina | 10056-12 | |
| GlutaMAX-I Suplemento | Life Technologies | 35050-061 | |
| MITO+ Extensor de Soro | BD Biosciences | 355006 | |
| Falcon 40 µ m Filtro de células | Corning Life Sciences | 352340 | |
| BES (N,N-Bis(2-hidroxietil)-2-aminoetanossulfônico, N,N-Bis(2-hidroxietil)taurina) | Sigma-Aldrich | B6420 | |
| FONTE DE LUZ LED – Preto LED 385 | Prizmatix Ltd. | ||
| Agarose, baixo ponto de fusão, grau analítico | Promega | V2111 |
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