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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Descrevemos um método para medir a velocidade dos fagossomos que se movem em direção ao centro celular em células vivas infectadas com ou sem o vírus da imunodeficiência humana (HIV) tipo 1, usando microscopia de fluorescência confocal de disco giratório para identificar células infectadas fluorescentes e microscopia de campo claro para detectar fagossomos.
Os macrófagos são células fagocíticas que desempenham um papel importante na encruzilhada entre a imunidade inata e a específica. Eles podem ser infectados pelo vírus da imunodeficiência humana (HIV)-1 e, devido à sua resistência aos seus efeitos citopáticos, podem ser considerados reservatórios virais persistentes. Além disso, os macrófagos infectados pelo HIV exibem funções defeituosas que contribuem para o desenvolvimento de doenças oportunistas.
O mecanismo exato pelo qual o HIV-1 prejudica a resposta fagocítica dos macrófagos era desconhecido. Havíamos mostrado anteriormente que a absorção de vários materiais particulados pelos macrófagos era inibida quando eles estavam infectados com o HIV-1. Essa inibição foi apenas parcial e os fagossomos se formaram dentro dos macrófagos infectados pelo HIV. Portanto, nos concentramos em analisar o destino desses fagossomos. A maturação dos fagossomos é acompanhada pela migração desses compartimentos em direção ao centro celular, onde se fundem com os lisossomos, gerando fagolisossomos, responsáveis pela degradação do material ingerido. Usamos glóbulos vermelhos de ovelha opsonizados por IgG como alvo para fagocitose. Para medir a velocidade do movimento centrípeto de fagossomos em macrófagos individuais infectados pelo HIV, usamos uma combinação de microscopia confocal de campo claro e fluorescência. Estabelecemos um método para calcular a distância dos fagossomos em direção ao núcleo e, em seguida, calcular a velocidade dos fagossomos. As células infectadas pelo HIV foram identificadas graças a um vírus que expressa GFP, mas o método é aplicável a células não infectadas ou a qualquer tipo de infecção ou tratamento.
Os macrófagos desempenham um papel importante no sistema imunológico inato e na homeostase. São fagócitos profissionais que internalizam e eliminam patógenos e detritos por um processo denominado fagocitose 1,2. O fagossomo, o compartimento fechado que se forma após o engolfamento do material particulado, sofre uma série de eventos de fusão e fissão com compartimentos endocíticos, levando a um compartimento degradativo chamado fagolisossomo. Este compartimento tem um pH ácido, devido à aquisição de v-ATPases de bombeamento de prótons, contém enzimas hidrolíticas e é enriquecido em proteínas de membrana associadas a lisossomos (LAMPs). A maturação dos fagossomos é acompanhada por sua migração nos microtúbulos 3,4 em direção ao centro da célula para atingir um local perinuclear onde os lisossomos são acumulados.
Muitos patógenos foram relatados para sequestrar a maturação do fagossomo, incluindo bactérias com estilos de vida intracelulares que modificam o ambiente vacuolar onde residem 5. O Vírus da Imunodeficiência Humana (HIV)-1 tem como alvo os macrófagos, além das células T. Como os macrófagos são resistentes aos efeitos citopáticos do vírus, ao contrário das células T, eles podem ser considerados como um reservatório para o vírus. Além disso, macrófagos infectados com HIV-1 apresentam funções fagocíticas defeituosas e contribuem para o surgimento de doenças oportunistas. Em particular, a doença invasiva grave de Salmonella não tifoide causada por Salmonella Typhimurium ST313 tem sido prevalente nas últimas três décadas em crianças ou adultos da África Subsaariana infectados com HIV 6. Estima-se que o risco de desenvolver tuberculose seja mais de 20 vezes maior em pessoas vivendo com HIV do que entre aquelas sem infecção pelo HIV.
Por todas essas razões, é importante definir melhor os mecanismos moleculares subjacentes aos defeitos fagocíticos em macrófagos infectados pelo HIV. Mostramos que a absorção de material particulado, partículas opsonizadas, bactérias ou fungos, foi inibida em macrófagos infectados pelo HIV 7. Dado que essa inibição é parcial, começamos a analisar o destino dos fagossomos internalizados em macrófagos humanos infectados pelo HIV 8. Como a maturação do fagossomo está intimamente ligada à migração para o centro celular e à fusão com os lisossomos, um defeito na maturação fagossômica pode ser devido a modificações das modalidades de tráfego na célula infectada. O método descrito aqui usa glóbulos vermelhos de ovelha opsonizados por IgG (IgG-SRBCs) como um modelo para direcionar a fagocitose mediada por receptor e, em particular, receptores para a porção Fc das imunoglobulinas (FcR). Essas partículas são mais fáceis de visualizar em campo claro (BF) do que as esferas de látex porque os SRBCs extracelulares e intracelulares mostram propriedades de refração diferentes 9. Para medir a velocidade dos fagossomos que se movem em direção ao núcleo em macrófagos infectados pelo HIV, usamos um vírus fluorescente 10 e configuramos um método de rastreamento manual simples descrito aqui. O método não requer programação avançada e simplesmente usa ImageJ. É passível de células aderentes e qualquer tipo de partícula ou patógeno que possa ser visualizado com microscopia de campo claro ou com imagens fluorescentes.
O protocolo tem de ser efectuada em estrita conformidade com as legislações nacionais e internacionais e regulamentos locais. O sangue de doadores saudáveis que deram o seu consentimento para doar sangue para fins de pesquisa foi obtido a partir de centros de transfusão de sangue com o qual as instituições assinaram acordo. protecções especiais devem ser tomados ao usar sangue humano. As experiências com o HIV-1 deve ser realizado em um nível de segurança biológica, ou 2 3 (BSL-3 ou 2) laboratório de acordo com a legislação local.
1. Preparação de macrófagos humanos Monócitos-derivados (hMDMs) por centrifugação em gradiente de densidade e por adesão Selecção
2. Produção e quantificação do VIH-1 reservas virais
NOTA: NLR4.3 HIV-1 Gag-IGFP (Green Fluorescent Protein) carregando um envelope R5-trópico, presente de M. Schindler 10 é utilizado para infectar macrófagos e células infectadas para ver em tempo real.
3. A infecção de hMDMs com HIV-1
4. Opsonização de ovelhas Glóbulos vermelhos
5. células vivas Vídeo Microscopy fagocitose Assay
6. Análise da Time-lapse Filmes


Fagocitose mediada por FcR-hMDMs HIV-1 infectadas e não-infectadas é descrito aqui usando SRBCs IgG-opsonizadas como alvos modelo (Figura 1). Os passos críticos deste protocolo são a preparação de hMDMs ea infecção com HIV-1. Com efeito, o rendimento e a qualidade dos macrófagos diferenciados varia entre dadores, bem como a taxa de infecção com eficiências na gama de 10-40%. Além disso, a preparação de IgG-opsonizado-SRBCs também é importante para evitar danificar os eritrócitos, porque isto poderia induzir o seu reconhecimento e absorção como detritos em vez de por fagocitose mediada por FcR. opsonização óptima irá garantir fagocitose eficiente.
fagossoma no movimento vivo macrófagos infectados pelo VIH é analisado em tempo real com o canal de BF em um microscópio confocal de disco giratório no laboratório BSL-3. As configurações do canal BF são críticos to ver o núcleo (Figura 2, azul círculo) e para discriminar o externo (Figura 2, setas vermelhas) a partir das SRBCs internalizados (Figura 2, círculos vermelhos). A microscopia de BF é considerado como o mais simples técnica de iluminação microscopia óptica suficiente para ver os phagosomes, que são menos do que os refringentes SRBCs externas.
O primeiro passo após a aquisição de sequências de imagens é rastreamento manual sobre o software ImageJ (Figura 3). Este ponto pode ser particularmente longa e fastidiosa, uma vez que é preferível para controlar cada fagossoma, um por um para todas as sequências da imagem e considera-se que os ensaios em ter de ser repetido com pelo menos 3 doadores por condição para atingir um tamanho de amostra suficiente para evitar a análise estatística (pelo menos 30 fagossomos com 3 doadores diferentes).
O segundo passo é a análiseno software de planilha para calcular a velocidade fagossoma durante os primeiros 5 minutos após a internalização para cada SRBCs internalizados (Figura 4). Para isso, marcamos para cada fagossomo a distância percorrida durante os 5 primeiros minutos contra o tempo. Um exemplo representativo é mostrado na hMDMs não infectados em Figura 5A. Em seguida obtém-se a velocidade do fagossoma, o que é o declive da curva de regressão linear. Uma velocidade de 0,5384 pM / min foi encontrada para este fagossoma.
De nota, é possível analisar a velocidade de fagossoma durante os primeiros minutos após a internalização, tal como descrito aqui ou em Dumas et al., 8, ou mais tarde por análise da velocidade em escalas de tempo mais longos. Em nosso estudo, observou-se que a velocidade fagossoma durante os primeiros 5 minutos após a internalização em hMDMs infectados pelo HIV é menor em comparação com hMDMs não infectados (Figura 5B).

Figura 2. aquisição em tempo real durantefagocitose por controlo representativo e hMDMs infectados pelo HIV. hMDMs são preparados e infectadas, como descrito na Figura 1. As células NLR4.3 HIV-1Gag-IGFP infectadas são detectados com o laser de 491 nm. Z-pilhas de imagens confocal disco giratório são adquiridos e analisados utilizando tanto o software de aquisição de microscópio e ImageJ (painéis da esquerda). Galerias de imagens BF representam um (painéis superiores correspondentes a Filme 1) não infectados e um NLR4.3 HIV-1Gag-IGFP infectadas (painéis inferiores correspondentes a Movie 2) celular durante uma aquisição de 45 min (46 imagens com o tempo indicado como hh :milímetros). A membrana celular (linha pontilhada preto), o núcleo (círculo azul), os SRBCs externos (alguns deles indicados com setas vermelhas) e os SRBCs internos (alguns deles indicados com círculos vermelhos) são detectáveis em imagens BF. Bar = 10 mm. Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 3. passos de instrução para análise de imagem com o plugin O Tracking Manual on ImageJ. Depois de abrir o plug-in "Manual de Monitoramento" (1) e carregar o lapso de tempo vídeo no canal BF (2), digite os parâmetros de aquisição (3). Clique em "Adicionar faixa" (4) e iniciar a medição do tracking, clicando em um fagossoma (5) para obter uma nova janela com posições X e Y do fagossoma escolhido (6, caixa vermelha). Para seguir o fagossomo na sequência de tempo por conveniência, variar o brilho e contraste (5 '). Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 4. Passos de instruções para análise da velocidade de migração fagossomo em software de planilha de dados. (A) Montar a posição X e Y do núcleo e cada fagossomo (caixa vermelha) em uma tabela de planilha. Em uma outra coluna (caixa roxa), calcular a distância entre o fagossoma e o núcleo com o teorema de Pitágoras, onde c representa a distância entre o núcleo e o SRBC e a e b os comprimentos dos outros dois lados de um triângulo rectângulo ( B). (C) Finalmente, calcular a distância percorrida pelos phagosomes em cada tempo (caixa verde) subtraindo a distância entre o SRBC eo núcleo em um determinado momento da distância inicial no tempo 0. Por favor clique aqui para ver uma versão maior esta figura.
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Figura 5. A quantificação da velocidade de migração fagossoma no controle e hMDMs infectados pelo HIV. (A) para cada SRBC e apenas após a internalização SRBC, a distância percorrida para o núcleo é medida e representada graficamente contra o tempo. Sua velocidade durante a primeira 5 min é calculado por meio de regressão linear em software de planilha. A experiência representativa é mostrado (o SRBC interna da Figura 3-4). (B) Todas as velocidades durante os primeiros 5 min são medidos para 66 phagosomes em não infectados (5 doadores) e 60 phagosomes em células infectadas pelo HIV (4 doadores). Os dados representam a média ± SEM (teste t de Student não pareado com correção de Welch; **, P <0,01). Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Filme 2: movimento fagossomo em um macrófago representante infectado pelo HIV. (Clique direito a download). HIV-1 (NLR4.3 HIV-1 Gag IGFP) infectados macrófagos foram identificados após iluminação com laser 491. O movimento de glóbulos vermelhos opsonizados foi detectada no canal de BF durante 45min da fagocitose com uma imagem por minuto (46 imagens com o tempo indicado como hh: mm). Barra = 10 uM.
Os autores não têm nada a divulgar.
Descrevemos um método para medir a velocidade dos fagossomos que se movem em direção ao centro celular em células vivas infectadas com ou sem o vírus da imunodeficiência humana (HIV) tipo 1, usando microscopia de fluorescência confocal de disco giratório para identificar células infectadas fluorescentes e microscopia de campo claro para detectar fagossomos.
Agradecemos ao Dr. Jamil Jubrail pela leitura do manuscrito. Este trabalho foi apoiado por bolsas do CNRS, Inserm, Université Paris Descartes, Agence Nationale de la Recherche (2011 BSV3 025 02), Fondation pour la Recherche Médicale (FRM DEQ20130326518 incluindo uma bolsa de doutorado para GLB) e Agence Nationale de Recherche sur le SIDA et les hépatites virales (ANRS, incluindo uma bolsa de pós-doutorado para CD) para FN. A. Dumas foi apoiado por bolsas de doutorado da Université Paris Descartes e Sidaction.
| Placa de cultura de células tratada com TC Falcon 100 mm | Corning | 353003 | Para produção viral |
| Placas de fundo de vidro 35 mm não revestidas 1.5 | MatTek corporation | P35G-1.5-14-C Caso | Para aquisição |
| Placas de cultura de tecidos Falcon 6 poços | Thermo Fischer Scientific | Corning. Inc. 353934 | Para macrófagos derivados de monócitos humanos |
| Placa Ficoll PLUS | Dominique Dutscher | 17-1440-03 | um polissacarídeo hidrofílico neutro, altamente ramificado, de alta massa, em solução para centrifugação por densidade |
| DPBS, sem cálcio, sem magnésio | Thermo Fischer Scientific | 14190-094 | RT |
| Dulbecco's Modified Eagle Medium (DMEM) 1x, líquido (Alta Glicose) | GIBCO, Sondas moleculares | 31966-021 | Conservado a 4 &graus; C ; para cultura de células HEK |
| RPMI 1640 medium GLUTAMAX Suplemento | Life technologies | 61870-010 | Conservado em 4 &graus; C; para hMDMs cultura |
| Fœ tal Soro de Panturrilha (FCS) | Eurobio | CVFSVF0001 | conservado em -20 > C ; |
| Penicilina-Estreptomicina descomplementada (10.000 U/ml) | Thermo Fischer Scientific | 15140-122 | Conservado a -20 ° C ; para cultura hMDMs |
| RPMI 1640 médio, sem vermelho de fenol (10x 500 ml) | Life technologies | 11835-105 | Quente em 37 &graus; C banho-maria antes do uso; para ensaio de fagocitose |
| FuGENE6 Reagente de Transfecção | Promega | E2692 | Conservado em 4 ° C ; para produção viral |
| Glóbulos vermelhos de ovelha (SRBCs) | Eurobio | DSGMTN00-0Q | Conservado em tampão Alsever a 4 &graus; C antes do uso |
| Glóbulos vermelhos anti-ovelhas IgG | MP Biomedicals | 55806 | Conservado em 4 ° C |
| Soro Bovino Albumina fração de choque térmico, pH 7, ≥ 98% | Sigma | A7906 | conservado em -20 &graus; C |
| Microscópio invertido DMI600 | Unidade | de Disco Giratório Confocal Leica||
| CSU-X1M1 | Yokogawa | ||
| 491 nm 50 mW laser | COBOLT CALYPSO | ||
| HCX PL APO CS Objectif | Leica | Lente objetiva ; Ampliação 100X ; Abertura numérica 1,40; Óleo de imersão | |
| CoolSnap HQ2 (FireWire) Câmera | Photometrics | Tamanho do pixel 6.45 µ m x 6.45 µ m ; Definição 1.392 x 1.040; Codificando a imagem no | |
| software Metamorph 7.7.5 | de 14 bitsDispositivos moleculares | Para o controle do microscópio | |
| Software GraphPad Prism | Para a análise estatística |