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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Este protocolo apresenta um método para a recuperação morfológica dos neurónios durante patched registos electrofisiolicos utilizando biocitina de enchimento e de pós-processamento subsequente imuno-histoquímica. Mostramos que as seções encheu-biocitina grossas que estavam manchados e lamínulas pode ser restained com um segundo dia de anticorpos primários ou meses mais tarde.
registos electrofisiolicos de células utilizando a técnica de fixação de membranas permitiram a identificação de diferentes tipos neuronais com base em padrões de disparo. A inclusão de biocitina / neurobiotin no eletrodo de gravação permite a recuperação post-hoc de detalhes morfológicos, que são necessários para determinar a arborização dendrítica e as regiões abrangidas pelos axônios dos neurônios registrados. No entanto, dada a presença de neurônios morfologicamente semelhantes com identidades distintas neuroquímicos e funções, coloração imuno-histoquímica de proteínas específicas de células-type-é essencial para identificar definitivamente neurônios. Para manter a conectividade de rede, secções do cérebro para gravações fisiológicas são preparadas com uma espessura de 300 nm ou mais. No entanto, esta espessura muitas vezes dificulta pós-processamento imuno devido a problemas com a penetração de anticorpos, sendo necessária a ressecção do tecido. Ressecção de fatias é uma arte difícil, muitas vezes ResulTing na perda de tecido e morfologia das células a partir do qual foi obtido dados electrofisiológico, tornando os dados inutilizável. Uma vez que a recuperação da morfologia iria limitar a perda de dados e guia na selecção de marcadores neuronais, adoptámos uma estratégia de recuperar a morfologia celular em primeiro lugar, seguido de imunocoloração secundário. Nós introduzimos uma abordagem prática para biocitina enchimento durante as gravações fisiológicas e subsequente imunocoloração de série para a recuperação da morfologia, seguido pelo restaining de secções para determinar a identidade neuroquímica. Relatamos que as secções que foram preenchidos com biocitina, fixadas com paraformaldeído (PFA), coradas, e lamínulas pode ser removida e corada novamente com um segundo anticorpo primário dias posteriores. Este restaining envolve a remoção da lamela, a lavagem das secções em uma solução tampão, e a incubação de anticorpos primários e secundários para revelar a identidade neuroquímica. O método é vantajoso para eliminar DATuma perda devido a uma incapacidade de recuperar morfologia e para estreitar os marcadores neuroquímicos a ser testados com base na morfologia.
O cérebro é conhecido pela diversidade das características estruturais e funcionais dos seus elementos neuronais individuais. Compreender os papéis de tipos neuronais distintas na função cerebral e patologia exige caracterização e identificação inequívoca dos neurônios. Estruturalmente, as características morfológicas definidos pela localização somato-dendrítica determinar as potenciais entradas que um determinado neurônio recebe, enquanto o padrão de arborização axonal identifica alvos potenciais pós-sinápticos. A diversidade estrutural dos neurônios tem sido apreciado desde os dias de estudos histológicos seminais do Ramón y Cajal 1. O advento das técnicas de gravação de uma única célula revelou que os neurônios estruturalmente distintos também mostram diferenças nos padrões de disparo e características sinápticas. A diversidade na estrutura e fisiologia é particularmente evidente em GABAérgicos neurónios inibitórios 2,3. Além disso, tornou-se cada vez mais evidente que structurallneurônios semelhantes y podem expressar diferentes marcadores neuroquímicos e mostrar correspondentes diferenças funcionais 4. Da mesma forma, os neurónios com os mesmos marcadores neuroquímicos podem ter estruturas e funções distintas 5-10. Assim, na prática, a análise das características funcionais de neurónios e o seu papel na rede requer a definição ambas as identidades morfológicas e neuroquímicas. Mesmo com o advento de linhas de ratinhos repórter segmentação marcadores neuroquímicos específicos, muitas vezes é necessário para determinar a morfologia e a identidade subtipo baseado em 11 imunohistologia.
O método padrão utilizado para caracterizar células registrados em fatias cerebrais agudas é para os encher biocitina ou neurobiotin durante a gravação, corrigir as seções de paraformaldeído (PFA), seguindo as gravações, e usar a imunohistoquímica para revelar a morfologia e neuroquímica. Uma vez que a espessura das secções para a fisiologia fatia são tipicamente 300 mmou mais, e porque a maioria dos anticorpos não conseguem penetrar todo o caminho através do que a profundidade, as fatias devem ser re-seccionados a 60 um ou menos, para permitir a imunocoloração simultânea para biocitina e marcadores neuroquímicos 12-14. Infelizmente, é trabalhoso ressecção; corre o risco de perda de tecido durante o corte; e pode conduzir a diferenças de encolhimento do tecido, o que complica reconstruções morfológicas. Além disso, o conhecimento prévio da morfologia poderia ajudar a diminuir os marcadores candidatos que são susceptíveis de ser expressa pelas células. Temos modificado os protocolos imunohistologia biocitina padrão para permitir o processamento em série de secções em primeiro lugar para a recuperação de morfologia e, em seguida, para a identificação de potenciais marcadores neuroquímicos.
A imuno-histoquímica é o estudo de distribuição de antigénio em células ou tecidos e pode ser visualizada utilizando uma enzima, marcadores fluorescentes, elementos radioactivos, ou partículas coloidais de ouro 15. O procedimento involves usando anticorpos primários para marcar especificamente e amplificar um ou mais antigénios específicos, seguido pela utilização de anticorpos secundários fluorescentes segmentação do anticorpo primário para visualização. Devido à necessidade de diferenciar os espectros de fluorescência de cada anticorpo secundário sem sobreposição, apenas um número limitado de antigénios podem ser examinados simultaneamente. Assim, o conhecimento prévio da morfologia poderiam ser úteis para seleccionar os marcadores neuroquímicos candidatos para a classificação de células. Conceptualmente, a razão de processamento em série de secções coradas já baseia-se na premissa de que imunomarcação para uma proteína ou péptido não deve interferir com a antigenicidade e imunomarcação subsequente para um péptido estruturalmente independente 16. Esta falta de interferência é devido à ligação dos anticorpos para um epítopo da proteína específica num antigénio e, portanto, permite a coloração simultânea de múltiplos antigénios no mesmo tecido. O número de antigénios revealed por imunocoloração é limitada pela necessidade de espectros de não sobreposição dos anticorpos secundários fluorescentes e pela necessidade de direccionar antigénios individuais com anticorpos criados em diferentes espécies de modo a eliminar a reactividade cruzada 17,18. Enquanto este é o raciocínio por trás de rotulagem de série em vez de em simultâneo com dois anticorpos diferentes que podem interagir, a nosso conhecimento, imunocoloração para um segundo antigénio não foi relatado após a conclusão da imunomarcação para um ou mais antígenos em seções montadas. Aqui, descrevemos um método para imuno série de secções previamente coradas e montadas. Embora pormenor este processo para um processo de imunomarcação de série para a recuperação da morfologia seguido por coloração para marcadores de proteína / péptido em secções espessas, os mesmos procedimentos podem ser usados no padrão, secções histológicas finas bem. Além disso, descreve-se uma abordagem prática para encher neurónios gravados com biocitina e o processo para desalojar oeléctrodo da célula após a conclusão de gravações para optimizar o enchimento do axonal e mandris dendríticas de neurónios, tal como apresentado na nossa recente 6,8 trabalho.
A vantagem mais importante do processo aqui descrito é que a morfologia da célula gravado pode ser totalmente recuperado e fotografada antes de tentar a ressecção ou imunocoloração das fatias. Embora os problemas com a penetração de determinados anticorpos podem tornar necessária a fatias de ressecção para imunocoloração secundário, os procedimentos detalhados aqui iria eliminar a necessidade de reconstruir neurónios complexos de múltiplas secções e evitar problemas devido à perda de tecido e o encolhimento diferencial, o que pode comprometer a reconstrução seguinte ressecção. Uma vantagem adicional é que o processo irá reduzir custos, tempo, esforço e anticorpos caros, limitando imunocoloração e re-corte às fatias em que os neurônios-cheia biocitina são recuperados. O aspecto mais prático é o anúncioimunocoloração nal que pode ser realizada em secções coradas meses antes de usar a técnica acima mencionada. Em particular, a recuperação da morfologia reduziria consideravelmente o potencial que os dados fisiológicos das células é rejeitado devido a uma incapacidade para obter uma caracterização morfológica básica do tipo de célula.
1. biocitina enchimento durante Eletrofisiologia
NOTA: Os leitores podem se referir a fontes alternativas de técnicas básicas de patch-clamp gravação e instrumentação 19-22, que não são elaborados em cima aqui. As etapas detalhadas aqui supor que o equipamento e os procedimentos para as gravações de patch-clamp já estão estabelecidos, e a descrição será restrito aos detalhes relacionados com biocitina-enchimento e imunocoloração post-hoc. Todas as experiências descritas neste manuscrito foram realizadas em ratazanas.

Figura 1. Sugestão de avião para se aproximar de células para biocitina preenchimentos. A imagem ilustra um celular Granule (GC) encher com biocitina durante a gravação que foi processada para revelar biocitina (em vermelho usando estreptavidina 594 conjugado). O GC tem suas dendrites orientadas no plano XY. Observe a célula granular cortadaaxônio (seta verde) devido ao movimento da pipeta ao longo do plano XY. Note que é ideal para abordar este neurônio ao longo do plano XZ. Barra de escala: 50 ^ m.
(Dia 1)
NOTA: O seguinte procedimento é imunocoloração para secções de flutuação livre e requer agitação continua a uma velocidade baixa (2 revoluções / min, rpm) num agitador durante todas as etapas de incubação.

Figura 2. sucedida CCK Coloração 1 semana após a recuperação de biocitina Coloração e C annabinoid Receptor tipo 1 (CB1 R) - <strong> rotulagem. (A - C) As imagens confocais a 60X mostrando o neurónio encheu-biocitina (A) e CB 1 R imunorreactividade (B), indicado pela seta. A mesma secção foi processada para a imunocoloração CCK após 1 semana (C). A sobreposição de imagens é mostrado na D. CCK imunorreatividade foi revelado usando far-vermelho e foi pseudo-colorido em ciano. (E) a reconstrução morfológica da célula-cheia biocitina em A. Observe que a biocitina e CB 1 R coloração são evidentes mesmo após a segunda imunocoloração CCK. Observe também a distribuição esperada de CB 1 R e padrões de positividade CCK. (F - H) imagem ampliada do axônio da célula, como em A, show de perto co-localização de biocitina e CB 1 R nos axônios (cabeças de seta). Barra de escala: 50 um (A - D), 100 um (E), e 10 uM ( et al. 2015 9. Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
(Dia 2)

Figura 3. sucesso Segundo imunocoloração após a recuperação de biocitina Morfologia e ressecção. (A1) confocal imagem de uma fatia de 300 mm que mostra a recuperação da morfologia dendrítica de uma célula cheia de biocitina. (<strong> A2) traços de tensão membrana do neurônio em resposta a +500 e -100 pA injeções atuais. (B) A recuperação da soma cheio de biocitina em uma seção 50 mm obtido após ressecção da secção 300 mm (na A1) após a montagem e imagem. (B2) imunocoloração subsequente da seção fina revelou co-localização da soma cheio de biocitina (painel à direita) com CCK (painel do meio). A imagem mesclada é ilustrado no painel da direita. Barra de escala: 50 ^ m. Painel A2 é reproduzido com permissão de Yu et al. , No prelo 25. Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
(Dia 3)
3. Coloração de o segundo anticorpo primário
Nota: Embora o segundo passo pode ser realizado imunocoloração 90 d após a primeira coloração, coloração óptima é conseguida, se a segunda coloração de anticorpo primário é realizada dentro de 7-10 d.
(Depois de 7-90 d)
Após a conclusão, as secções mantêm o preenchimento biocitina e a imunomarcação realizado no Passo 2 e pode ser fotografada usando confocal ou microscopia de epifluorescência. Além disso, as secções processadas também vai mostrar a imunocoloração para o antigénio marcado durante o processamento subsequente na etapa 3. Na secção ilustrada na Figura 2, a morfologia de um neurónio encheu-biocitina numa secção grossa (300 um) foi revelada utilizando estreptavidina visualizado em vermelho e a primeira primária (CB 1 R) visualizados em verde. O primeiro imunocoloração foi realizada dentro de 7 d de PFA fixação. A fatia foi montado num meio de montagem aquoso, fotografada usando um microscópio confocal, e armazenado por um período de dois meses antes da re-coloração com anticorpo para a CCK. Note-se a morfologia do neurónio gravado, incluindo mandris axonais (Figura 2E), foi reconstruída a partir das imagens confocais Sbtained após o primeiro processo de coloração. Co-localização do axônio com CB 1 R imunorreatividade (Figura 2 F - H) era esperado com base em estudos fisiológicos. A segunda coloração para CCK foi realizada em secções de dois meses após o primeiro processo de coloração. CCK foi fotografada na distante vermelho e foi pseudo-colorido em ciano para visualização. Da mesma forma, a Figura 3 ilustra um exemplo de uma célula na qual biocitina-marcação foi revelado e fotografada em uma secção de espessura (Figura 3A1). A fisiologia intrínseca do neurónio é ilustrado na Figura 3A2. A fatia foi re-seccionados a 50 mm e, embora algumas seções que contêm processos dendríticos foram perdidos, a seção que contém a soma recuperado (Figura 3B1). Subsequente imunocoloração CCK da seção fina mostraram expressão CCK em verde na soma marcado com biocitina. Montando a grossa fatia em meio aquoso impede eencolhimento do tecido xcessive. Em média, as secções 300 mícrons montado utilizando o meio aquoso redução de cerca de 25,67 ± 3,14% (n = 5 fatias) quando medida uma semana após a montagem. Assim, as secções espessas montado utilizando o meio aquoso são ~ 225 uM, permitindo a ressecção. Em vários estudos de controlo, verificou-se que o processo de imunomarcação para o segundo tempo não levou a marcação não-específica pelo anticorpo. Por exemplo, sabe-se que a parvalbumina (PV) e a imunorreactividade de CCK são mutuamente exclusivos em neurónios do hipocampo. Controlos em que o primeiro passo de imunomarcação (2) para biocitina (vermelho) e CCK (verde) foi seguido pelo segundo rotulagem para parvalbumina (com excitação a 405 nm e emissão a azul) mostraram padrões de expressão não-sobrepostas (Figura 4). Além disso, os padrões de coloração laminar axonal distintivas dos neurônios que expressam marcadores neuroquímicos específicos (PV, CCK, CB 1 R) não foram alterados pelo seriaprocedimentos l re-coloração (Figuras 2 - 4). Além disso, a coloração revelou consistentemente secundária co-marcação dos neurónios encheu-biocitina com os marcadores neuroquímicos esperados com base das gravações fisiológicas. Assim, estamos confiantes de que o procedimento restaining não levar à perda de especificidade na rotulagem.

Figura 4. Falta de sobreposição entre os marcadores mutuamente exclusivas sobre a Segunda Imunomarcação Seguindo Imunomarcação Antes e montagem das secções. (A - C) As imagens confocais a 10X mostrando um neurónio encheu-biocitina (A) no vermelho, indicado por uma ponta de seta, e a imunorreactividade de CCK em verde (B), indicado pela seta. Note-se a falta de sobreposição. A mesma secção foi processada para parvalbumina (PV) imunocoloração em azul depois de mais de 2 meses (C). o OVerlay de imagens é mostrado na D. Note-se que os axónios PV são distribuídas na camada de células granulares, com CCK na camada molecular do padrão não sobrepostas esperado. Observe também a falta de co-localização dos dois marcadores em somata neuronal. As imagens ampliadas à direita ilustram que o neurônio marcado com biocitina expressa PV (seta) e não CCK (seta). Barra de escala: 100? M (A - D), 20 uM (painéis à direita). Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Uma razão comum para biocitina sub-óptima preenche é o rompimento acidental dos processos neuronais com a pipeta de gravação quando se aproxima da célula. Um apêndice perdido da célula aparece como uma bolha de biocitina no final de um axónio, como ilustrado na Figura 1 (seta verde). Axonal bolhas umare muitas vezes visualizada quando remendar células superficiais, cujos axônios podem ser cortados durante os procedimentos de corte. No entanto, a optimização do plano de corte e de conhecimento do padrão de distribuição axonal de a classe de células alvo pode auxiliar em evitar que se aproxima o soma a partir da direcção do axónio putativo, que também pode cortar o axónio, resultando no aparecimento de uma bolha axonal . Na maioria dos tipos de células, é preferível a aproximar-se do corpo da célula ao longo do eixo Z (seta branca com ponto). A segunda questão diz respeito à aplicação de pressão positiva excessiva para a pipeta enquanto se aproximava da célula. Isto pode não só danificar a célula e as suas ligações, mas também faz com que a solução contendo biocitina interno para derramar em torno da célula, levando a alta fluorescência de fundo. Coloração de fundo, também aumenta quando o tempo necessário para se aproximar da célula é prolongada ou quando a qualidade de fatia não é óptima, o que pode comprometer a capacidade de definir a morfologia celular (Figura 5A). É possível puxar para fora o soma enquanto desalojar a pipeta. Isto irá resultar numa falta de morfologia somática (Figura 5B). Para evitar puxando para fora da célula, mover a pipeta cima e para fora em pequenas etapas, usando as configurações de movimento "fino" do manipulador. Se a célula parece estar ligado a pipeta através de uma extensão de comprimento da membrana, da torneira / movimento do manipulador suavemente para desalojar a pipeta a partir da célula. Evite usar as configurações do manipulador grosseiros até que a célula esteja completamente desalojado.

Figura 5. Imagens ilustram mal sucedidas Fills biocitina. (A) Imagem que mostra a alta fluorescência de fundo devido à excessiva pressão positiva na pipeta de gravação, resultando em visibilidade celular pobres. estruturas mais finas de processos neuronais, incluindo os axônios, são visualizados além da região de the derrame. Além disso, observe que a soma tenha sido puxado para fora. (B) Um neurônio com a soma tirou durante descolamento pipeta. As setas mostram preenchimentos de sucesso do axônio e dendritos, enquanto que a soma e apêndices proximal às flechas não foram recuperados. (C) Uma célula de patched em uma camada superficial da fatia (<50 mm a partir da superfície) resulta em células que exibem cheios axónio cortado e dendrites (setas). Observe o beading (setas) dos dendritos das células de grânulos, indicando a saúde das células pobres (C). Barra de escala: 50 ^ m. Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Finalmente, a fim de recuperar a morfologia celular completo sem axônios ou dendritos cortadas, é melhor a célula alvo> 50 mm de profundidade para a superfície da fatia. células superficiais podem ter processos que têmforam cortados e podem não ter o complemento normal de entradas sinápticas.
As armadilhas mais comuns nos procedimentos restaining estão associados com a remoção da lamela e a recuperação da secção, sem danificar o tecido. A segunda questão diz respeito a penetração de anticorpos no tecido grosso, especialmente quando incubadas durante a noite. Em vários casos, uma melhor penetração foi conseguido por incubação em anticorpo primário durante até 72 h a 4 ° C num agitador orbital colocados numa sala fria. Embora re-seccionamento do tecido é o processo mais eficaz para assegurar uma penetração anticorpo, prolongando a duração da incubação em anticorpo primário ou aumentando a concentração de detergente a 0,5 - 1% de Triton-X100 também podem auxiliar a penetração do anticorpo 24. Uma vez que a maioria dos neurónios gravadas estão localizados dentro de 50 - 100 | iM a partir da superfície da secção, descobrimos que a coloração de secções de espessura é adequada para etiquetar biocitinasomata -filled ou processos a este nível. No entanto, recomenda-se que a extensão da rotulagem anticorpo é verificado em cada seção antes de interpretar os resultados co-localização negativos.
Os autores não têm nada para revelar.
Este protocolo apresenta um método para a recuperação morfológica dos neurónios durante patched registos electrofisiolicos utilizando biocitina de enchimento e de pós-processamento subsequente imuno-histoquímica. Mostramos que as seções encheu-biocitina grossas que estavam manchados e lamínulas pode ser restained com um segundo dia de anticorpos primários ou meses mais tarde.
Os autores gostariam de agradecer o apoio do NIH / NINDS R01 NS069861 e NJCBIR CBIR14IRG024 para VS.
| NaCl | Sigma | S7653 | Imunocoloração |
| KCl | Fluka | 60129 | Imunocoloração |
| Na2HPO4 | Sigma | S7907 | Imunocoloração |
| KH2PO4 | Sigma | 229806 | Imunocoloração |
| Triton X-100 | Sigma | T8787 | Imunocoloração |
| para porquinho da Índia anti CB1 | Sigma | Af530-1 | Immunostaining |
| Mouse anti CCK | CURE, UCLA | cortesia de G. Ohning | Immunostaining |
| Rabbit anti Parvalbumin | Swant | PV27 | Immunostaining |
| Streptavidin, Alexa Fluor conjugado | Sondas moleculares | S11227 | Immunostaining |
| Soro de cabra normal (NGS) | Sigma | G9023 | Immunostaining |
| Vectashield | Vector Labs | H-1000 | Imunocoloração |
| Anticorpos | Secundários Invitogen Sondas | moleculares Alexa Corantes conjugados com flúor | Imunocoloração |
| Labnet orbit agitador de baixa velocidade | Bioexpress | S-2030-LS | Pinça de imunocoloração |
| Dumont | 11231-30 | Imunocoloração | |
| Pastas de lâminas | EMS | 71520 | Imunocoloração |
| Vibratome VT 1200 S | Leica | 14048142066 | Electrophysiology |
| Multiclamp 700B amplificador | Dispositivos moleculares | Multiclamp 700B | Electrophysiology |
| pCLAMP 10 Software | Molecular devices | pCLAMP 10 | Eletrofisiologia |
| Digitizer | Molecular Devices | Digidata 1440 digitizer | Electrophysiology |
| Filter tips | Nalgene | 171-0020 | Electrophysiology |
| Sonicator | Fisher Scientific | 15-335-100 | Microloadersde Eletrofisiologia |
| Eppendorf | 930001007 | ||
| Electrophysiology Biocytin | Sigma | B4261 | Eletrofisiologia |