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A radiação ionizante (IR) induz numerosas aberrações cromossômicas estáveis e instáveis. Aberrações instáveis, onde a morfologia cromossômica está substancialmente comprometida, podem ser facilmente identificadas por técnicas convencionais de coloração cromossômica. No entanto, a detecção de aberrações estáveis, que envolvem troca ou translocação de materiais genéticos sem modificação considerável na morfologia cromossômica, requer técnicas sofisticadas de pintura cromossômica que dependem da hibridização in situ de sondas de DNA marcadas com fluorescência, uma técnica de pintura cromossômica popularmente conhecida como fluorescência in situ hibridização (FISH). As sondas FISH podem ser específicas para cromossomos inteiros ou sub-regiões precisas em cromossomos O método não só permite a visualização de aberrações estáveis, mas também pode permitir a detecção do(s) cromossomo(s) ou sequência(s) específica(s) de DNA envolvida(s) em uma formação de aberração específica. Uma variedade de técnicas de pintura cromossômica está disponível em citogenética; aqui, dois métodos altamente sensíveis, hibridização in situ de fluorescência múltipla (mFISH) e cariótipo espectral (SKY), são discutidos para identificar aberrações estáveis intercromossômicas que se formam nas células da medula óssea de camundongos após a exposição à irradiação total do corpo. Embora ambas as técnicas dependam de sondas de DNA marcadas com fluorescência, o método de detecção e o processo de aquisição de imagens dos sinais fluorescentes são diferentes. Essas duas técnicas têm sido utilizadas em diversas áreas de pesquisa, como biologia da radiação, citogenética do câncer, biodosimetria retrospectiva por radiação, citogenética clínica, citogenética evolutiva e citogenética comparativa.