A cada ano, os surtos de gripe sazonal afetam profundamente as sociedades em todo o mundo. Apesar dos esforços globais, a gripe continua sendo um fardo intratável para a saúde. A principal estratégia para reduzir as infecções é a vacinação anual. Em indivíduos que contraíram gripe, os medicamentos antivirais podem atenuar os sintomas. Há uma necessidade clara e não atendida de desenvolver estratégias alternativas para combater a gripe. Vários modelos animais foram criados para modelar as interações hospedeiro-influenza. Aqui, são descritos protocolos para geração de modelos de peixe-zebra para infecção sistêmica e localizada pelo vírus influenza A humano (IAV). Usando um modelo de infecção sistêmica por IAV, pequenas moléculas com potencial atividade antiviral podem ser rastreadas. Como prova de princípio, é descrito um protocolo que demonstra a eficácia do medicamento antiviral Zanamivir em peixes-zebra infectados com IAV. Ele mostra como os fenótipos da doença podem ser quantificados para pontuar a eficácia relativa de potenciais antivirais em peixes-zebra infectados com IAV. Nos últimos anos, tem havido uma maior apreciação pelo papel crítico que os neutrófilos desempenham na resposta do hospedeiro humano à infecção por influenza. O peixe-zebra tem se mostrado um modelo indispensável para o estudo da biologia dos neutrófilos, com impactos diretos na medicina humana. Um protocolo para gerar uma infecção localizada por IAV na linhagem de peixe-zebra Tg(mpx:mCherry) para estudar a biologia de neutrófilos no contexto de uma infecção viral localizada é descrito. O recrutamento de neutrófilos para locais de infecção localizados fornece um fenótipo quantificável adicional para avaliar manipulações experimentais que podem ter aplicações terapêuticas. Ambos os protocolos de peixe-zebra descreveram fielmente recapitular aspectos da infecção humana por IAV. O modelo de peixe-zebra possui inúmeras vantagens inerentes, incluindo alta fecundidade, clareza óptica, facilidade de triagem de drogas e disponibilidade de linhagens transgênicas, incluindo aquelas em que células imunes, como neutrófilos, são marcadas com proteínas fluorescentes. Os protocolos detalhados aqui exploram essas vantagens e têm o potencial de revelar insights críticos sobre as interações hospedeiro-IAV que podem se traduzir na clínica.