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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
A perda irregular do meio de placas de microtitulação afecta a reprodutibilidade de formação de esferóides de tumor multicelular uniforme. A melhoria das condições de cultura de forma a reduzir a perda significativa vai melhorar a reprodutibilidade de formação de esferóides e os resultados de ensaios baseados em esferóides utilizando a técnica de sobreposição de líquido.
Modelos de tumor que imitam de perto as condições in vivo estão a tornar-se cada vez mais popular na descoberta e desenvolvimento de medicamentos para o rastreio de potenciais drogas anti-cancro. Esferóides multicelulares (tumorais) MCTSes eficazmente imitar as condições fisiológicas de tumores sólidos, tornando-os excelentes em modelos in vitro para a optimização de chumbo e validação de alvos. Fora das várias técnicas disponíveis para a cultura de MCTS, o método líquida de sobreposição em agarose é um dos métodos mais barato para a produção de MCTS. No entanto, a transferência segura de culturas MCTS usando líquida de sobreposição para rastreio de alto rendimento podem ser comprometidas por um número de limitações, incluindo o revestimento de placas de microtitulação (MPs) com agarose e o irreproducibility de formação MCTS uniforme entre poços. MPs são significativamente propenso a efeitos de borda que resultam da evaporação excessiva de forma a partir do exterior da placa, evitando a utilização de toda a placa de drogatestes. Este manuscrito fornece melhorias técnicas detalhadas para a técnica líquida de sobreposição para aumentar a escalabilidade e reprodutibilidade da formação uniforme MCTS. Além disso, os pormenores sobre uma ferramenta de software simples, semi-automático, e universalmente aplicável para a avaliação das características de MCTS após o tratamento droga é apresentada.
As células cancerosas em tumores são fisiologicamente dispostos numa estrutura complexa, 3-dimensionais (3D) rodeado por matriz extracelular e células que interagem. Como quase todas as células em tecidos residir em um ambiente 3D, a necessidade de mais fisiologicamente relevante em modelos tumorais in vitro que imitam as características de tumor, resultou no desenvolvimento de várias técnicas de cultura 3D 1, 2, 3. Estes modelos estão agora a tornar-se ferramentas fundamentais de investigação para estudar o papel do microambiente do tumor em metástases de células e resposta a agentes terapêuticos em 3D 2. Além disso, em comparação com 2-dimensionais culturas de células (2d) 4, modelos 3D permitem uma melhor compreensão das interacções tumor do estroma, que afetam as vias de sinalização de células.
esferóides multicelulares de tumores (MCTSes) de linhas celulares de cancro são frequentemente usados na célula c 3Dmodelos ULTURA devido à sua proximidade em relação aos tumores in vivo. Dentre as diversas técnicas em uso, a técnica líquida de sobreposição (LOT) de geração de MCTS em placas revestidas de agarose ganhou um interesse significativo para a validação de otimização de chumbo e meta de 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11. Isto é evidente a partir dos estudos recentes que foram capazes de executar telas piloto de bibliotecas de compostos em culturas MCTS usando LOT 6, 7 com sucesso. No entanto, a variabilidade de poço-a-poço na morfologia e crescimento MCTS devido à perda irregular induzida por evaporação do meio de barreiras são comuns que acompanham o lote utilizando placas de microtitulação (MPS). Consequentemente, a formação de MCTSes não uniforme compromete a importância e relevânciade dados de ensaios farmacológicos 8, 12, 13. Além dos problemas de reprodutibilidade, um outro problema prático que afecta ensaios de alto rendimento à base de lote é o revestimento das MPs com agarose quando se utiliza líquido automático unidades de fornecimento. Embora a unidade de distribuição pode ser mantido aquecido para evitar a gelificação de agarose, o entupimento da cassete de distribuição e tubagem é uma preocupação potencial para sistemas robóticos 6.
Para superar alguns desses desafios, que recentemente inventou algumas modificações no lote de MCTS cultura 8. Estas modificações são baseadas principalmente em possíveis maneiras de evitar a perda de meio irregular das MPs, usando instrumentos que são comumente encontrados em laboratórios de rastreio de alto rendimento. Um procedimento pormenorizado do lote modificado para a geração de MCTSes de tamanho uniforme e reprodutível através trêsplacas de 84 poços (WPS) é aqui apresentado. O manuscrito apresenta também uma rotina semi-automatizado para a avaliação do tamanho de MCTS, particularmente em MCTSes parcialmente desintegradas, tratados com o fármaco que não têm um limite bem definido para a medição de área de secção transversal.
1. Preparação de placas de agarose revestidas
2. celular Cultura e MCTS Formação
3. meio de permuta Usando um sistema robótico
Imagem 4. Alto conteúdo de MCTS e Análise de Imagem semi-automatizado

Figura 1:Preparação de tampas ambientais e um fluxograma da rotina de semi-automático. (A) A imagem de uma tampa ambiental de redução de evaporação preenchido com a correta (à esquerda) e excesso (direita) quantidade de enchimento líquido (neste caso, 5% DMSO). A seta indica a calha-lado curto para a adição de líquido. O asterisco indica o intervalo no meio da tampa, seguindo a adição do volume correcto de DMSO. (B) Um fluxo de trabalho que mostra os passos envolvidos na rotina de análise de imagem semi-automatizada. Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
A perda irregular de meio, principalmente a partir de poços periféricos, é uma questão frequentemente encontrada em MPs com volumes de cultura pequenas. Substancialmente melhores condições de cultura, tais como incubadoras com sistemas bem controlados temperatura / umidificação e deputados de redução de evaporação e tampas de placas, reduzir a perda significativa de meio através poços 8. Para medir a evaporação relativa, volumes iguais de Orange G (OG) foram adicionados a cada poço, e a mudança na absorvância OG durante 3 dias foi gravado em placas com tampas regulares e ambientais em incubadoras convencionais e rotativos. Os poços da placa foram divididos em 6 grupos com base na sua distância a partir do bordo da placa (Figura 2A). Em grupos de 1-4, houve uma alteração significativa na absorvância ao longo do tempo de OG em placas com tampas regulares em uma incubadora normal (Figura 2B). Apesar de haver também uma variação na absorvância de OGgrupo 1 em poços de placas sob a tampa / combinação incubadora rotativa ambiental (Figura 2C), os coeficientes de variação (CV) foram muito mais baixas em comparação com as das placas com tampas regulares em uma incubadora normal (Figura 2D).
A perda irregular induzida por evaporação do meio é um dos potenciais motivos de variabilidade poço a poço em tamanho MCTS e leitura ensaio em MPs 8. No entanto, placas de 384 poços com a combinação de CT incubadora ambiental tampa / rotativo resultou na formação de MCTSes uniformes entre os 6 grupos de cavidades (Figura 2E). Em contraste, MCTSes em placas com o / combinação incubadora padrão tampa regulares variar significativamente em tamanho e solidez (Figura 3F). A solidez é uma medida de MCTS esfericidade e dá o grau de desintegração da MCTS. A solidez de uma região 2D é a proporção dos pixels na convex casco da região de interesse (ROI) e é determinado pela divisão da área da ROI pela área do casco convexo da ROI. Ambas as regiões circulares e elípticas têm uma solidez de 1, e como o MCTS se desintegra, a solidez diminui. A diferença na área já tem sido relatada em Das et al. (2016) 8. O volume foi calculado a partir dos eixos maior e menor dos MCTSes.

Figura 2: As placas com a sequência mínima evaporação num aumento da reprodutibilidade MCTS. (A) Um mapa da placa é apresentado para mostrar a divisão de poços em 6 grupos. (B e C) Existe uma variação dependente do tempo significativa na absorvância relativa de OG a partir de poços em grupos de 1-4, em placas de cultura numa incubadora padrão regularmente com tampas (B) e a partir de um grupo quells em placas com tampas ambientais em uma incubadora rotativa (C). Absorv�cias Dia 3-5 OG são normalizados ao dia 0. (D) Média de currículos de OG absorção do grupo 1 poços de dias 3-5 são mostrados para as combinações tampa / incubadora duas placas. CVs são médias de 3 experiências independentes. (E) MCTSes formados em placas com a combinação tampa / incubadora rotativa ambiental não diferiram significativamente entre os 6 grupos de poços. (B) No entanto, as placas com tampas regularmente em um incubador padrão formado MCTSes de tamanho variável. Os dados são mostrados para n> 60 MCTSes por grupo. As caixas e barras horizontais dentro das caixas nas boxplots representam os dias 25 e 75 percentis e médio, respectivamente. Os bigodes representam os 5 e 95 percentis e os valores extremos são indicados pelos pontos pretos alinhados nas boxplots. Os valores de p da análise de Kruskal-Wallis, são apresentados abaixo EACh boxplot. Os dados são de pelo menos 3 ensaios independentes por placa combinação tampa / incubadora. Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Para determinar a potencial aplicabilidade da rotina, MCTSes sete dias de idade foram tratados com paclitaxel (PTX), vincristina (VCR), oxaliplatina (OXA), doxorrubicina (DOX), e 5-fluorouracilo (5-FU) a 3 concentrações diferentes durante 4 dias. As drogas foram obtidos a partir do Hospital Universitário Olomouc, Universidade Palacky. As imagens MCTS foram então analisados, ea área, eixos maior e menor, perímetro e solidez de MCTSes tratados foram comparados com controles (CTLs). Os eixos maior e menor foram utilizados para calcular o volume geométrico. Houve uma redução dependente da concentração na área de MCTS e o volume após o tratamento de droga (Figura 3). Apesar de 0,001 ug / mL VCR e 0,4 ug / ml de DOX e 5-FU resultou em aumento da área de MCTS, o volume aumentou significativamente apenas na sequência de 0,001 ug / ml VCR. MCTS perímetro foi significativamente diferente apenas nas maiores concentrações de PTX, DOX e 5-FU, que afetou completamente o tamanho MCTS. PTX e VCR a 0,25 ug / mL e 0,06 ug / mL e DOX e 5-FU a 100 ug / ml, resultou numa diminuição significativa na solidez, indicando uma desintegração completa-a-parcial das MCTSes (Figura 3).

Figura 3: Medida de efeitos de drogas em MCTSes pela rotina semi-automatizado. (A) Imagens de CTL e MCTSes tratados com a droga são apresentados. Barra de escala = 10 mm. As concentrações em fig / mL são dadas para cada imagem. (B) Os gráficos de barras mostram um efeito dose-dependente da PTX, VCR, OXA, DOX e 5-FU naárea e volume de 7 MCTSes dias de idade após 4 dias de tratamento. perímetros MCTS foram significativamente reduzido após 0,25 ug / ml de PTX e 100 ug / mL de DOX e 5-FU. As concentrações de droga que resultaram na desintegração completa-a-parcial de MCTSes reduziu significativamente MCTS solidez em comparação com CTL. Os dados são a média ± SD de pelo menos 5 MCTSes de 3 placas independentes. * P <0,001, # p <0,01, φ p <0,05 droga-tratado versus CTL, ANOVA de uma via com o teste de comparação múltipla de Dunnett. Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Os autores não têm nada a revelar.
A perda irregular do meio de placas de microtitulação afecta a reprodutibilidade de formação de esferóides de tumor multicelular uniforme. A melhoria das condições de cultura de forma a reduzir a perda significativa vai melhorar a reprodutibilidade de formação de esferóides e os resultados de ensaios baseados em esferóides utilizando a técnica de sobreposição de líquido.
Este trabalho foi financiado por doações do Ministério checo da Educação, Juventude e Desporto (LO1304) e da Agência Tecnológica da República Checa (TE01020028). Os autores gostariam de agradecer ao Dr. Lakshman Varanasi para tirar as imagens estáticas de tampas ambientais.
| Agarose | Sigma-Aldrich | A9414 | |
| McCOY's 5A Médio | Sigma-Aldrich | M8403 | |
| " rápido" Filtro Filtermax | TPP | 99505 | 0.22 μ m, 500 mL |
| Multidrop™ Dispensador de Reagente Combi | Thermo Fisher Scientific | 5840300 | |
| de Dispensação de Tubo Pequeno | Thermo Fisher Scientific | 24073295 | Ponta de metal |
| Placa TC de 384 poços | Tipode placa de 6057308 | PerkinElmer | - |
| de distribuição de tubo padrão | CellCarrier Thermo Fisher Scientific | 24072670 | |
| MicroClime Environmental Lid | Labcyte | LLS-0310 | |
| Incubadora rotativa DMSO | Sigma | D4540 | |
| (SteriStore) | HighRes Biosolutions | 23641 | Nº de série: D00384 |
| Dispensador de Máquina de Lavar Microplacas | BioTek | Modelo Não Especificado | : EL406 |
| Sistema de Imagem de Alto Conteúdo (CellVoyager) | Yokogawa Electric Corporation | Não Especificado | Modelo: CV7000 |
| Orange G | New England Biolabs | B7022S | |
| TrypLE™ Reagente de dissociação celular recombinante expresso | Thermo Fisher Scientific | 12604021 | Vermelho de fenol livre |