Um protocolo de fracionamento abreviado para o enriquecimento dos agregados de proteína insolúvel em detergente do cérebro humano após a morte é descrito.
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Artigo de método
Um protocolo de fracionamento abreviado para o enriquecimento dos agregados de proteína insolúvel em detergente do cérebro humano após a morte é descrito.
Neste estudo, descrevemos um protocolo abreviado fracionamento de etapa única para o enriquecimento dos agregados de proteína insolúvel em detergente do cérebro humano após a morte. O detergente iônico N-Lauril-sarcosina (sarkosyl) efetivamente solubiliza proteínas dobradas nativamente no tecido cerebral, permitindo o enriquecimento de agregados da proteína insolúvel em detergente de uma ampla gama de proteinopathies neurodegenerativas, tais como A doença de Alzheimer (AD), doença de Parkinson e esclerose lateral amiotrófica e doenças de príon. Controle humano e tecidos do cérebro após a morte de AD foram homogeneizadas e sedimentada por ultracentrifugação na presença de sarkosyl para enriquecer agregados de proteína insolúvel em detergente incluindo tau fosforilada patológica, o componente do núcleo do tangles emaranhados em AD. Mancha ocidental demonstrou a solubilidade diferencial de agregados-tau fosforilada e a proteína solúvel em detergente, Early Endosome antígeno 1 (EEA1) no controle e no cérebro do AD. Análise proteômica também revelou o enriquecimento de β-amiloide (Aβ), tau, snRNP70 (U1 - 70 K) e apolipoproteína E (APOE) nas fracções sarkosyl insolúveis do cérebro AD comparados de controle, consistente com estratégias de fracionamento de tecido anterior . Assim, o presente protocolo simples enriquecimento é ideal para uma ampla gama de aplicações experimentais variando de mancha ocidental e proteína funcional ensaios de agregação co a espectrometria de massa-baseado proteomics.
Doenças neurodegenerativas, como a doença de Alzheimer (AD), a doença de Parkinson (PD), a doença de Huntington (HD), esclerose lateral amiotrófica (ela) e as doenças de príon estreitamente relacionadas são proteinopathies caracterizadas pelo acúmulo gradual de agregados de proteína insolúvel em detergente no cérebro com acompanhamento cognitivo declinam. 1 , 2 este recurso compartilhado patológico é pensado para jogar um papel central na etiologia e fisiopatologia dessas doenças neurodegenerativas. 2 estes agregados, normalmente, compostos de fibras de amiloides poliméricas, que são co....
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declaração de ética: todos os tecidos do cérebro foram obtidos a partir da Emory Alzheimer ' s doença Research Center (ADRC) banco de cérebro. Tecidos humanos após a morte foram adquiridos ao abrigo de protocolos apropriados institucional Review Board (IRB).
1. homogeneização e fracionamento
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O protocolo de sarkosyl de etapa única abreviado-fracionamento foi usado para enriquecer agregados de proteína insolúvel em detergente de controle e o cérebro após a morte de AD (Figura 1). Proteínas de frações TH-S, S1, S2 e P2 foram resolvidas por SDS-PAGE, fixado por 15 min em Coomassie azul reserva fixador seguida de coloração suave com buffer de coloração azul brilhante de Coomassie G-250. A etapa de ressuspensão é opcional, desde que não havia níveis in.......
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Neste documento vamos apresentar e discutir um protocolo de detergente-fracionamento de etapa única Abreviado que é aplicável a uma ampla variedade de aplicações experimentais que variam de análise proteômica de espectrometria de massa-baseado a proteína funcional ensaios de enrolamento e mancha ocidental. 5 , 6 , 7 , 10 esta metodologia é talvez mais eficaz quando usado para estudar proteinopa.......
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Os autores não têm nada para divulgar.
Os autores agradecer os Drs Jim Lah e Allan Levey, Emory departamento de Neurologia, sugestões e comentários úteis. Este trabalho foi parcialmente financiado pela parceria de medicina acelerando subvenção (U01AG046161-02), o Emory Alzheimer centro de pesquisa da doença (P50AG025688) e um Instituto Nacional sobre envelhecimento concedem (R01AG053960-01) para N.T.S. Esta pesquisa também foi apoiada em parte pelo núcleo neuropatologia da subvenção Emory neurociência NINDS núcleo instalações, P30NS055077.
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| Nome | Empresa | Número de catálogo | Comentários |
|---|---|---|---|
| Coquetel de inibidores de protease e fosfatase, sem EDTA (100X) | Coquetel de inibidores de protease e fosfatase | Thermo Fisher | 78441 |
| Sistema de desmembranador sônico (ultrassom) | de microponta de FB505110 | Fisher | |
| Scientific Ultracentrífuga Optimax TLX Ultracentrífuga | Beckman Coulter | 361545 | ultracentrífuga refrigerada |
| TLA120.1 rotor | de | ultracentrífuga | Beckman Coulter |
| 362224 500 ul (8 x 34 mm) tubos de policarbonato, parede espessa | Beckman Coulter | 343776 | para rotor TLA120.1 |
| Tampão de amostra 4X SDS | Solução caseira | N/A | SDS-PAGE |
| TCEP, pH neutro | Thermo Fisher | 77720 | tampão de bloqueio do agente redutor |
| (TBS) | Thermo Fisher | 37542 | tampão de bloqueio |
| (TBS) tampão de bloqueio + 0,05% Tween 20 | Thermo Fisher | 37543 | tampão de bloqueio e diluente de anticorpos |
| 4-12% Bolt Bis-Tris Plus géis, 10 poços | Thermo Fisher | NW04120BOX | géis SDS-PAGE pré-moldados |
| MES SDS Running Buffer (20X) | Thermo Fisher | B0002 | SDS-PAGE running buffer |
| N-Lauroilsarcosina sal de sódio (sarkosyl) | Sigma Detergente Aldrich | L5777-50G | |
| Anticorpo anti-Tau-2 (pan tau) | Anticorpos Chemicon | MAB375 | |
| Anticorpo anti-fosfo-treonina 231 Tau | Anticorpos Millipore | MAB5450 | |
| Anti-fosfo-seroína 202 e treonina 205 Anticorpo Tau (AT8) | Anticorpos Thermo Fisher | MN1020 | |
| Anticorpo anti-antígeno 1 do endossomo precoce (EEA1) | abcam | ab2900 | anticorpos |
| Alexa Fluor 680 anticorpo secundário IgG (H+L) de cabra anti-camundongo | Thermo Fisher | A21058 | anticorpos |
| Alexa Fluor 790 anticorpo secundário IgG (H+L) de burro | Thermo Fisher | A11374 | anticorpos |
| iBlot2 Dry Blotting System | Thermo Fisher | IB21001 | Transferência de gel |
| iBlot2 Pilhas de transferência, nitrocelulose, mini | Transferência | de | gel |
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