Neste protocolo, descrevemos técnicas para a adequada dissecção da Arabidopsis flores e siliques, algumas técnicas básicas de compensação e selecionados coloração procedimentos para observações de toda a montagem de estruturas reprodutivas.
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Artigo de método
Neste protocolo, descrevemos técnicas para a adequada dissecção da Arabidopsis flores e siliques, algumas técnicas básicas de compensação e selecionados coloração procedimentos para observações de toda a montagem de estruturas reprodutivas.
Devido às suas formidáveis ferramentas para estudos de genéticas molecular, Arabidopsis thaliana é uma das espécies modelo mais proeminentes em biologia vegetal e, especialmente, na biologia reprodutiva de plantas. No entanto, planta morfológica, anatômica e análises ultra-estruturais tradicionalmente envolvem a incorporação demorados e procedimentos para campo claro, varredura e microscopia eletrônica de corte. Recentes progressos em microscopia de fluorescência confocal, estado-da-arte em 3D auxiliado por computador análises microscópicas e o refinamento contínuo de técnicas moleculares para ser usado em amostras de toda a montagem minimamente processadas, conduziu a um aumento da demanda por desenvolvimento de técnicas de processamento de amostra mínima e eficiente. Neste protocolo, descrevemos técnicas para corretamente dissecando Arabidopsis flores e siliques, básicos de técnicas, de compensação e alguns procedimentos de coloração para toda montagem observações de estruturas reprodutivas.
Flores estão entre os mais importantes definindo órgãos das angiospérmicas. Plantas apareceu há alguns anos 90 milhões1e diversificou-se tão rápido que sua rápida aparição foi descrita como um "abominável mistério" por Charles Darwin2. Os interesses dos investigadores da planta em desenvolvimento da flor são diversos. Algumas pesquisas centrou-se na compreensão da origem evolutiva da flor como um todo, ou a evolução das propriedades específicas de anatômicas, estruturais e funcionais de flores3,4,5,6 . A alta variação na forma floral e estrutura, bem como os modos de reprodução sexual e assexual, confiando neles, fazer a flor de uma estrutura altamente complexa. Isto levou a diversos esforços para caracterizar as anatomia e características estruturais dos órgãos florais, usando técnicas de microscópica luz e o elétron que poderiam ser combinadas com investigações genéticas e moleculares7. Além disso, como a fonte de frutos e sementes, as flores são de suma importância para a nutrição humana e animal. Portanto, a caracterização de desenvolvimento de flores e frutas tem muitas implicações para a investigação aplicada, incluindo a segurança alimentar de uma população humana crescente e estratégias de conservação ecológica sob uma mudança de ambiente8 , 9 , 10.
Desenvolvimento da flor em Arabidopsis começa com indução de flor e a transformação do meristema vegetativa para uma meristema de inflorescência (grupo de flores). Primordia flor é iniciada lateralmente no flanco do meristema inflorescência11. O primordia órgão floral forma progressivamente em espirais concêntricos de fora para o centro da flor e eventualmente evoluir para sépalas, pétalas, estames e carpelos7. Estes órgãos florais cumprir distinta nutritiva, protetora e funcional (por exemplo, atração de polinizadores) funções em diferentes espécies de plantas, com os órgãos sexuais, sustentando o desenvolvimento de gametófitos masculinos e femininos, respectivamente,12 , 13. os gametófitos, por sua vez, cada diferenciam um par do sexo masculino (esperma) e gametas femininas (ovo e célula central), que unem a dupla fertilização para formar a próxima geração, o zigoto e o endosperma primário, um terminal tecido apoiando o desenvolvimento do embrião14,15. Desenvolvimento de frutos e sementes apoiar o crescimento, maturação e preservação do embrião e, eventualmente, a sua dispersão. Extensas pesquisas tem sido realizada para caracterizar o desenvolvimento de flor e embrião em espécies de plantas diversas, especialmente nas espécies modelo Arabidopsis7,16,17.
Primeiras análises microscópicas de desenvolvimento da flor basearam-se na observação técnicas, tais como a parafina ou resina incorporação e seccionamento, combinado com a luz ou microscopia eletrônica e processamento de amostra demorada. Estas técnicas microscópicas tradicionais eram frequentemente usadas em combinação com as investigações de genéticas moleculares, tais como análises microscópica de mutantes, a localização do RNA por hibridação in situ ou imuno-detecção de proteínas. Recentes progressos em microscopia de fluorescência de campo amplo e confocal, no estado-da-arte em 3D auxiliado por computador imagem análises e o contínuo refinamento dos métodos moleculares que podem ser usados em espécimes de toda a montagem minimamente processados, levou a uma necessidade de técnicas de processamento eficiente e mínimo de amostra que são preferencialmente passíveis de análises quantitativas. Nos últimos anos, tem sido feitos progressos significativos no desenvolvimento de técnicas de compensação em toda a montagem espécime animal. Eles processam a amostra transparente usando reagentes aquosa ou açúcar-à base de ureia (por exemplo, escala, SeeDB, cúbicos)18,19,20, ou removendo seletivamente lipídios (usando o detergente SDS) após incorporação de amostras em hidrogel estável; a remoção de lipídios pode ser alcançado por difusão passiva (por exemplo, modificação clareza protocolo21, pacto-PARS-aros22) ou ativamente por eletroforese (original clareza protocolo23 e PRESTO ACT24). Encorajado por este progresso rápido, também estão surgindo algumas técnicas derivadas para uso em plantas.
Este papel de métodos focado no modelo Arabidopsis, descrevemos o procedimento para a adequada dissecção de botões florais, flores e siliques jovens e a limpeza de toda a montagem amostras para coloração diversa e procedimentos de observação usando clássica ou um recente método de compensação baseada em SDS. Exemplos de amido, callose e mancha de cromatina são dadas. Embora esses procedimentos podem precisar de mais melhorias e adaptações quando usado com outras espécies, esperamos que irão definir o cenário para uma pesquisa mais adicional sobre esses métodos simples, mas essenciais que são o ponto de partida de muitos projetos de pesquisa.
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1. a flor e a fixação de síliqua
2. dissecação sob o microscópio estereoscópico
3. com base em hidrato de cloral compensação e compensação combinada de coloração
Nota: Os melhores resultados para a compensação baseada em hidrato de cloral são obtidos com FPA50 fixada de material.
4. combinado Alexander manchando e Herr 4½ clareira de anteras
Nota: O protocolo original de Alexander baseia-se em liberar os grãos de pólen no slide antes de coloração. Uma eficiente e mais informativo, modificado Alexander manchando e procedimento de compensação são a coloração dos grãos de pólen maduros dentro de anteras maduras mas não-deiscente.
5. remover o Exine de grãos de pólen
Nota: Recomendamos o uso de fixador do Carnoy para coloração de DAPI.
6. sódio Dodecil sulfato (SDS) de compensação
Nota: Dependendo do órgão floral para ser analisado e em habilidades do pesquisador para dissecar espécimes muito macias e pequenas, o tratamento de SDS pode ser realizado antes (por pesquisadores experientes) ou após a dissecação passo (para menos experientes pesquisadores) em metanol-ácido acético fixada material.
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Arabidopsis pertence à família Brassicacea, rolamento inflorescências com flores bissexuais, dispostas em uma panícula (Figura 1). Cada flor tem quatro sépalas, pétalas de quatro, seis estames (quatro longas e dois curtas) e um gineceu syncarpous, consistindo de dois congenitamente carpelos (Figura 1F-H) dispostos em quatro verticilos concêntricos25,26...
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A existência de muitos botões de flores dentro de um único inflorescência de Arabidopsis, abrangendo todas as fases do desenvolvimento de flor, oferece uma oportunidade única para estudos vista caracterizar um efeito de um tratamento ou uma característica do desenvolvimento simultaneamente em diferentes fases do desenvolvimento da flor. Um ponto de referência boa entre diferentes plantas individuais é a abertura da primeira flor da inflorescência a principal. As plantas são tratadas de forma a que a floração é s...
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Os autores não têm nada para divulgar.
Este trabalho foi apoiado pela Universidade de Zurique, um IEF Marie Curie Grant (conceder n. TransEpigen-254797 de A.H.), um avançado Grant do Conselho Europeu de investigação (conceder n. Medea-250358 de U.G.) e um projeto de pesquisa e desenvolvimento tecnológico (grant MecanX de U.G.) de SystemsX.ch, a iniciativa Suíça em biologia de sistemas.
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| Nome | Empresa | Número de catálogo | Comentários |
|---|---|---|---|
| Reagentes e Materiais | |||
| Etanol | Scharlau | ET00102500 | |
| Ácido Acético | Applichem | A3686,2500 | 100% Grau de Biologia |
| Molecular Ácido Acético | Glacial Sigma-Aldrich | 320099 | Grau de Biologia Molecular |
| Metanol | Scharlau ME03062500 | ||
| Solução de formaldeído | Sigma-Aldrich | F1635 | |
| Ácido propiônico | Sigma-Aldrich | 81910-250 ml | |
| Hidrato de cloral | Sigma-Aldrich | 15307 | |
| Glicerol | Roth | 3783.1 | |
| Goma arábica | Fluka | 51198 | |
| Ácido láctico | Fluka | 69773 | |
| Fenol | Sigma-Aldrich | 77607-250ML | Usamos fenol líquido (use a densidade para encontrar o volume necessário para sua solução) |
| Óleo de cravo | Sigma-Aldrich | C8392-100ML | |
| Xileno | Roth | 4436.1 | |
| Iodo | Fluka | 57665 | |
| Iodeto de potássio | Merck | 5043 | |
| Malaquita Verde | Fluka | 63160 | |
| Ácido fucsina | Fluka | 84600 | |
| Laranja G | Sigma | 7252 | |
| Dodecil Sulfato de Sódio | Sigma-Aldrich | L3771 | Hidróxido |
| de Sódio | Sigma-Aldrich | 71690 | |
| Di-Hidrogenofosfato de Sódio | Applichem | A1047,1000 | |
| Fosfato de Sódio dibásico | Sigma-Aldrich | S9763-1KG | |
| Fosfato de potássio | Sigma-Aldrich | 04347 | |
| EDTA | Applichem | A2937,1000 | |
| Calcofluor | Sigma | F6259 | Branqueador fluorescente 28 |
| Auramina | Chroma | 10120 | |
| DAPI | Sigma | D9542 | tóxico |
| Triton-X-100 | Sigma | T8787 | |
| Anilina azul | Merck | 1275 | |
| MS médio | Carolina | 19-57030 | |
| Substrato rico em nutrientes | Einheitserde | ED73 | |
| Vidro | Sem marca específica | ||
| Tubos de centrífuga de falcão de 15 ml | VWR | 62406-200 | |
| Pinça Dumond | Actimed | 0208-5SPSF-PS | |
| Fórceps | DUMONT BIOLOGY | 0108-5 | |
| Seringa | BD | BD Plastipak 300013 | 1 ml |
| Agulha de preparação | BD | BD Microlance 304000 | |
| Lâminas de microscópio | Thermo Scientific | 10143562CE | bordas |
| cortadas Lamínulas | Thermo Scientific | DV40008 | |
| Caixa | Uma caixa de plástico com papel toalha úmido e suportes de slides dentro | ||
| Nome | Empresa | Número de catálogo | Comentários |
| Soluções< | |||
| forte>Fixadores | |||
| de Carnoy (Farmer's) | Etanol absoluto: ácido acético glacial, 3:1 (ml:ml) | ||
| Metanol/fixador | 50 % (v/v) de metanol, 10 % (v/v) de ácido acético glacial em água desionizada | ||
| Fixador | Formina, ácido propiónico, etanol a 50%; 5:5:90 (ml:ml:ml) | ||
| Soluções de limpeza | |||
| Hidrato de cloral/glicerol | Hidrato de cloral : glicerol : água, 8:1:2 (g:ml:ml). Pode ser usado para todos os estágios de desenvolvimento da flor e para o desenvolvimento da silique com microscopia DIC. O melhor fixador é a | ||
| Arábica Modificada | formalina 7,5 g, hidrato de cloral 100 g, glicerol 5 ml, água 30 ml. Pode ser usado para todos os estágios de desenvolvimento da flor e para o desenvolvimento da silique com microscopia DIC. O melhor fixador é o FPA50 | ||
| Herr's 4½ | Ácido lático, hidrato de cloral, cristais de fenol, óleo de cravo, xileno; 2:2:2:2:1, em peso. Pode ser usado para todos os estágios de desenvolvimento da flor (especialmente para o desenvolvimento do estame) e para o desenvolvimento do silique com microscopia DIC. O melhor fixador é a | ||
| SDS / NaOH | Dilua a SDS e a solução estoque de NaOH a 1% de SDS / 0,2 N NaOH (diluição de 10x). Para todas as fases de desenvolvimento da flor e da sílica. O melhor fixador é o fixador metano/ácido acético; Os outros dois fixadores também podem ser usados. Pode ser combinado com calcofluor, auramina, DAPI e solução de coloração azul de anilina. | ||
| SDS solução-mãe | 10 % (m/v) de dodecilo sulfato de sódio. Dissolver 10 g de dodecil sulfato de sódio em 80 ml de água desionizada e completar o volume com água desionizada até 100 ml. | ||
| Solução-mãe | Solução de NaOH 2 N: dissolver 4 g de NaOH em 40 ml de água desionizada e completar o volume de 100 ml com água | ||
| soluções combinadas de limpeza e coloração deionizadas | |||
| Herr's IKI-4½ | Para um padrão 4½ (9 g no total) adicionar: 100 mg de iodo, 500 mg de iodeto de potássio. Esta solução de limpeza pode ser usada para todos os estágios de desenvolvimento da flor e para o desenvolvimento da sílica, seja para aumentar o contraste ou para caracterizar a dinâmica do amido. Use FPA50 para análise estrutural e fixador de Carnoy para análise quantitativa de amido. | ||
| Coloração | Etanol 95% 10ml, verde malaquita (1% em 95% EtOH) 1 ml, ácido fucsina (1% em ddH2O) 5ml, laranja G (1% em ddH2O) 0,5ml, fenol 5g, hidrato de cloral 5g, ácido acético glacial 2ml, glicerol 25ml . Esta limpeza/coloração sozinha ou em combinação com o 4½ de Herr; solução pode ser usada para avaliar o aborto de pólen em flores com grãos de pólen maduros e tricelulares. É usado em material não fixo recém-cortado. | ||
| Soluções de coloração | |||
| forteCalcofluor | Calcofluor 0,007% em água (g:ml). Originalmente usado como um branqueador óptico. Pode ser usado para corar celulose, polissacarídeos carboxilados e calose nas paredes celulares. Freqüentemente usado para manchar a parte interna do grão de pólen. Todos os três fixadores podem ser usados com esta solução. | ||
| de auramina | Auramina 0,01% em água (g:ml). Este corante fluorescente lipofílico pode ser usado para colorir cutículas, cutina e exina, entre outros. Todos os três fixadores podem ser usados com esta solução | ||
| Calcofluor-Mistura | auramina Solução de auramina : Solução de Calcofluor, 3:1. Pode ser usado para uma coloração combinada por ambas as soluções. Outras proporções podem ser testadas mantendo uma proporção menor de calcofluor em relação à auramina. | ||
| Solução | DAPI 0,4 ug / ml, tampão fosfato de sódio 0,1 M (pH 7), 0,1% Triton-X-100, EDTA 1 mM. Esta solução pode ser usada para corar as propagações cromossômicas durante a meiose masculina e feminina e os núcleos celulares de qualquer tecido. Freqüentemente usado para estudar o desenvolvimento do grão de pólen. Carnoy e metanol / ácido acético são os melhores fixadores para esta solução. Fixadores à base de formaldeído, como o FPA50, podem interferir na coloração. Excitação no UV e emissão máxima em torno de 461 nm. | ||
| Tampão fosfato de sódio (0,1 M) | Receptor de prótons: 0,2 M Na2HPO4, doador de prótons: 0,2 M NaH2PO4, proporção doador de prótons / receptor de prótons: 1,364 (para pH 7) | ||
| Solução | 0,1% (p / v) azul de anilina, 108 mM K3PO4 (pH 11), 2% de glicerol. Esta solução pode ser usada para corar calose e celulose de vários estágios de desenvolvimento (por exemplo, deposição de calose em terads masculinos e femininos, tampões de calose em tubos polínicos). Excitação no UV e emissão máxima em torno de 455. Também pode ser excitado a 514 nm com emissão no vermelho para coloração do conteúdo celular. |
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