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Research Article
Elizabeth Butterworth1, Wesley Dickerson2, Vindhya Vijay3, Kristina Weitzel1, Julia Cooper1, Eric W. Atkinson4, Jason E. Coleman5, Kevin J. Otto4, Martha Campbell-Thompson1
1Department of Pathology, Immunology and Experimental Medicine,University of Florida, 2Heller School for Social Policy and Management,Brandeis University, 3Department of Medicine, College of Medicine,University of Florida, 4Department of Biomedical Engineering, College of Engineering,University of Florida, 5Department of Pediatrics, College of Medicine,University of Florida
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Aqui, apresentamos um passivo de protocolo para seções de pâncreas humano imagem em três dimensões (3D) usando otimizado métodos de compensação. Este manuscrito demonstra estes procedimentos para compensação de óptica passiva seguido por imunofluorescência múltiplas coloração para identificar os elementos-chave das redes neurais sensoriais e autonômicas, que inervam ilhotas humanas.
Usando métodos tradicionais histológicos, pesquisadores são dificultados na sua capacidade de imagem inteira tecidos ou órgãos em 3D em grande escala. Histológicos são geralmente limitados para < 20 µm como formalina fixo seção de parafina em lâminas de vidro ou < 500 µm para seções fixas flutuantes. Portanto, grandes esforços são necessários para seccionamento serial e métodos de reconstrução de imagem em grande escala para recriar 3D para amostras > 500 µm usando métodos tradicionais. Além disso, luz dispersa de macromoléculas dentro de tecidos, particularmente de lipídios, impede que a imagem a uma profundidade > 150 µm com microscópios confocal mais. Para reduzir a dispersão de luz e para permitir a imagem do tecido profundo utilizando microscopia confocal simples, vários métodos de compensação óptica foram desenvolvidos que são relevantes para as amostras de tecido de roedores e humanos fixados por imersão. Vários métodos são relacionados e usam proteína reticulação com acrilamida e tecido limpando com sulfato dodecyl de sódio (SDS). Outras técnicas de compensação óptica usado vários solventes que cada modificação tinha várias vantagens e desvantagens. Aqui, um método de compensação óptica passiva otimizado é descrito por estudos de inervação do pâncreas humano e especificamente para interrogatório da inervação de ilhotas humanas.
Até recentemente, 3-dimensional (3D) reconstrução de grandes tecidos ou órgãos inteiros foi realizada através de seccionamento serial laborioso, coloração e reconstrução de imagem de várias seções. Esses métodos tinham várias desvantagens, incluindo a dependência de um grande número de seções seriais, tecido pobre penetração com anticorpos e luz espalhamento impedindo imagem profunda dentro de tecidos. Para permitir maior luz e penetração de anticorpo, os pesquisadores desenvolveram métodos químicos para preservar os antígenos da proteína enquanto remove a maioria dos lipídios de espalhamento de luz. Vários relacionados com métodos são Clear Lipid-Exchanged do acrilamido-hibridizado rígida tecido Imaging hidrogel (clareza), técnica passiva de clareza (Pacto) e assistida por perfusão de agente de liberação in situ (PARS) (revisado em 1,2 ,3,4,5,6). O método de clareza baseia-se na estabilização de proteínas usando um formaldeído, acrilamida e bis hidrogel seguido por remoção de lipídios, usando electroforese SDS solução2. Esta abordagem foi mais tarde modificada para compensação de passivo e avançada de imagem7. Otimização mais levou para a eliminação do bis e de diferentes percentagens de paraformaldeído na solução hidrogel (% de 1-4) para obter a estabilização de antígeno ideal com o menor tempo de compensação por uma técnica chamada pacto 8. Primeiras tentativas de desenvolver estas técnicas de compensação óptica envolveram orgânicos ou outros compostos que eram difíceis de trabalhar e extinta endógenas proteínas fluorescentes em modelos do rato transgénico. Estes métodos adicionais incluíam escalas, análise de Cocktails desobstruída do cérebro/corpo e computacional (cúbico), métodos SWITCH e Dimensional Imaging of Solvent-Cleared órgãos (discoteca), todos com várias vantagens e desvantagens9, 10,11,12. O método de clareza original foi desenvolvido em tecido de cérebro de rato rica em lipídios e métodos de compensação óptica tinham limitado a testes em tecidos humanos7,8,11,13,14 .
Métodos de compensação óptica são ideais para os nervos de rastreamento longas distâncias, como no sistema nervoso central do mouse intactos. O pâncreas é bem inervado pelo sistema nervoso autonômico e sensorial. O compartimento endócrino do pâncreas, ilhotas de Langerhans, compõem uma parte muito pequena do órgão inteiro (1-2%) e ilhéus tem conhecido a heterogeneidade em tamanhos (50-250 µm), proporções de células endócrinas e densidade particularmente no diabetes (revisto em 15 ,,16). No desenvolvimento de um protocolo, vários métodos de compensação óptica foram testados para o pâncreas humana e um procedimento de pacto foi encontrado para fornecer o melhor equilíbrio de tempo para limpar (~ 2 semanas) com excelente preservação morfológica dos nervos e ilhotas. O procedimento final otimizado é descrito aqui na delineação da rede neuro-insular para em grande escala (distâncias de milímetro) e imagem em 3D de alta resolução de várias ilhotas pancreáticas intactas. A técnica é adequada para o pâncreas humana imediatamente após a fixação, ou depois de armazenamento, bem como as amostras fixadas em formol tamponado neutro e incorporado em cera de parafina. As amostras são adequadas para a imagem latente por confocal ou microscopia lightsheet.
Todos os experimentos foram conduzidos de acordo com o Conselho de revisão institucional Universidade da Flórida e diretrizes federais.
Cuidado: Paraformaldehyde e acrilamida são tóxicos irritantes. Manipule os reagentes em uma coifa com equipamento de protecção adequado (jaleco, luvas, óculos de proteção, etc.).
1. deparaffinization de tecidos fixados em formol (se trabalhar com tecidos frescos, pule para a etapa 2)
2. prepare o fixador de paraformaldeído (PFA) 4%
3. pâncreas fixação
4. incorporar o tecido em hidrogel
5. desgaseificar a solução de monômero e polimerizar o hidrogel
6. tecido clareira
7. múltiplos de imunofluorescência
8. amostras de montagem para a imagem latente
9. imaging
Esses procedimentos de coloração foram desenvolvidos para fornecer uma análise em larga escala do pâncreas humano para examinar ilhotas e redes associadas autonômicas e sensoriais. Testaram-se vários procedimentos incluindo clareza7, iDISCO17, e pacto8 com o método de pacto encontrado melhor adequado para pâncreas humano e a imagem latente confocal.
Anticorpos primários foram inicialmente testados em fixo amostras de pâncreas humano com amostras de controlo adequados em positivo e negativo (mouse cérebro, outros). Os anticorpos primários e diluições sugeridas estão listadas na Tabela de materiais, embora cada laboratório pode esperar para otimizar as diluições de anticorpo dependendo da fonte de tecido e número de lote. Variação de lote para lote de anticorpo primário pode afetar a intensidade de coloração e a especificidade e exigem a validação para atingir o mesmo grau de intensidade da mancha como com reagentes antigo.
No pâncreas humano, ilhéus foram delineados pela insulina, glucagon e secretogranin 3 (Figura 2). Células de Schwann foram delineadas usando a proteína de ácida fibrilar glial (GFAP, Figura 2 e Figura 3A). Os nervos manchados com anticorpos contra o marcador parassimpático intestinal vasoativo (VIP) foram fotografados sobre o Lightsheet (Figura 3B). Nervos simpáticos podem ser vistos com coloração para Tirosina Hidroxilase (não mostrado).

Figura 1. Compensação óptica pâncreas humano. (A) uma lâmina de barbear é usada para cortar e soltar uma secção de tecido parafina (painéis superiores) antes de remover a seção de tecido e raspagem parafina excesso fora do tecido (painéis de fundo). Amostras representativas são mostradas antes (B esquerdo, C em cima) e depois (B certo, C médio) compensação óptica de tecido parafina, conforme descrito na seção de protocolo. O tecido limpo, fixo não é completamente transparente depois de limpar (B certo, top C) e muitas vezes o tecido inchaço pode ser apreciada (C, painel de média). O tecido limpo torna-se totalmente transparente após equilibration em aros (C, painel inferior). Barras de escala: 500 µm. clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 2. Rede humana neuro-insular. Amostras de pâncreas humano foram apuradas conforme descrito a partir de nPOD doadores de órgãos ou tecidos parafina arquivamento. (A-D) Células de Schwann (GFAP +, brancos) e células endócrinas são mostradas manchadas pela insulina (vermelha) e glucagon (verde). (A) Confocal microscopia e máxima projeção de intensidade (MIP) mostra o rastreamento das células de Schwann (GFAP +) nos nervos, correndo ao lado de vasos sanguíneos na periferia do Ilhéu e estendendo-se para os ilhéus. O baixo-relevo demonstra alta resolução obtidas e mostra o contato entre as células de Schwann GFAP + e células endócrinas. (B) uma imagem 3D do painel (escala: x = 50 µm, y = 20 µm, z = 25 µm) A. Uma amostra de parafina-pacto é mostrada a imagem através de microscopia confocal e apresentado como uma projeção de intensidade máxima (C) e em 3D (D), escala: x, y = 50 µm, z = 25 µm). Escala de barras , C: 50 µm. clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 3. visualização 3D e costura. Três pilhas de imagem costurados foram adquiridas das células de Schwann manchado usando microscopia confocal e GFAP e rastreadas utilizando um plugin de rastreamento de axônio do software de análise de imagem. (A) o preenchimento 3D do rastreamento é mostrado (barras de escala: x = 150 µm, y = 200 µm (0,2 mm), z = 120 µm) (B) A pacto amostra estava manchada com anticorpo VIP e fotografada usando um microscópio lightsheet. A pilha é > 1 mm em profundidade e fibras nervosas são claramente vistos em alta resolução. Fibras, envolvendo um duto (D, primeiro plano) e um gânglio (G, plano de fundo) podem ser vistas (grande grade: x, y, z = 200 µm; carrapato marcas: x, y, z = 40 µm). Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Os autores não têm nada para divulgar.
Aqui, apresentamos um passivo de protocolo para seções de pâncreas humano imagem em três dimensões (3D) usando otimizado métodos de compensação. Este manuscrito demonstra estes procedimentos para compensação de óptica passiva seguido por imunofluorescência múltiplas coloração para identificar os elementos-chave das redes neurais sensoriais e autonômicas, que inervam ilhotas humanas.
Os autores agradecer Dr. Ann Fu e Joseph Canzano para assistência técnica, Dr. Jennifer Treweek para o Conselho inestimável e Dr. Kristin Overton e Dr. Karl Deisseroth para treinamento de MCT através da oficina de clareza de Universidade de Stanford. JDRF nPOD e as organizações de contratos do órgão forneceram amostras de tecido. Este trabalho foi financiado pela JDRF (47-2014-1), Helmsley Charitable Trust (HCT 2015-PG-T1D052) e TR001773 de 1OT2 NIDDK ao MCT.
| 10x solução salina tamponada com fosfato (PBS) | Fisher | BP399-1 | Buffers |
| Fosfato de sódio dibásico anidro | Fisher | S375-500 | PB tampão (RIMS) |
| Fosfato de sódio monobásico monohidratado | Sigma | 71507-250 | PB tampão (RIMS) |
| 16% paraformaldeído (PFA) | Microscopia eletrônica Sciences | 15714-5 | Fixação por imersão, hidrogel, armazenamento solução |
| 40% de acrilamida | Bio-Rad | 161-0140 | Hidrogel |
| 2% bis-acrilamida | Bio-Rad | 161-0142 | Hidrogel |
| VA-044 iniciador | Wako Pure Chemical Industries, Ltd. | VA044 | Hidrogel |
| Dodecil sulfato de sódio (SDS) | Fisher | BP166-5 | Tampão de limpeza |
| Azida de sódio | Sigma | S8032 | Tampão de armazenamento de amostras |
| 18 agulhas de calibre | Fisher | 14-840-91 | Solução de hidrogel de desgaseificação |
| N2 tanque | AirGas | vários | Solução de hidrogel de desgaseificação |
| Triton X-100 | Sigma-Aldrich | 100 ml | Buffers |
| Cabra, soro normal | Vector | S-1000 | Use como 2% no tampão de bloqueio |
| Histodenz | Sigma | D2158-100G | RIMS |
| Lâminas de câmara de 8 poços | Ibidi | 80827 | Imaging |
| Microscópio confocal de varredura a laser | Zeiss | 710 | Imaging |
| LightSheet microscópio | Zeiss | Z1 | Imaging |
| Nome | Empresa | Número de Catálogo | Comentários |
| Primary Antibody | |||
| CD45 | Bioss | bs-4820R-A488 | Host: Rabbit Diluição: 1:100 Comentários: Não funcionou |
| CD45 | DAKO | M0754 | Host: Mouse Diluição: 1:200 Comentários: Não funcionou |
| GFAP | DAKO | Z0334 | Host: Rabbit Diluição: 1:50 Comentários: |
| Trabalhou Glucagon | BD Biosciences | 565891 | Host: Mouse Diluição: 1:50 Comentários: Trabalhou |
| Glucagon | Cell Signaling | 2760S | Anfitrião: Rabbit Diluição: 1:200 Comentários: Não funcionou |
| Glucagon | Abcam | ab10988 | Anfitrião: Mouse Diluição: 1:200 Comentários: Insulina |
| Trabalhada | DAKO | A0564 | Anfitrião: Guinea Pig Diluição: 1:200 Comentários: Trabalhou |
| NCAM (CD56) | DAKO | M730429-2 | Anfitrião: Mouse Diluição: 1:50 Comentários: Não funcionou |
| NCAM (CD56)-FITC conjugado | DAKO | M730429-2 | Host: Mouse Diluição: 1:50 Comentários: Não funcionou |
| Peripherin | EnCor | RPCA-Peri | Host: Rabbit Diluição: 1:100 Comentários: Funcionou |
| PGP9.5 | DAKO | Z5116 | Host: Rabbit Diluição: 1:50 Comentários: Não funcionou |
| Secretogranina 3 | Sigma | HPA006880 | Host: Rabbit Diluição: 1:200 Comentários: |
| Trabalhado Músculo liso actina | Sigma | A5228; C6198 (Cy5) | Hospedeiro: mouse Diluição: 1:200; 1:200 Comentários: Funcionou; Conjugado funcionou melhor do que não conjugado |
| Substância P | BioRad | 8450-0505 | Hospedeiro: Rat Diluição: 1:200 Comentários: |
| Tirosina Hidroxilase | Milipore | AB152 | Hospedeiro: Rabbit Diluição: 1:200 Comentários: |
| Tirosina Hidroxilase | Trabalhada AbcamAb76442 | Hospedeiro: Chicken Diluição: 1:100 Comentários: Funcionou, mas coloração fraca | |
| Peptídeo Intestinal Vasoativo (VIP) | Immunostar | 20077 | Hospedeiro: Rabbit Diluição: 1:100 Comentários: |
| Transportador de Acetilcolina Vesicular Trabalhado (VAChT) | Sistemas Sinápticos | 139103 | Hospedeiro: Rabbit Diluição: 1:50 Comentários: Trabalhado |
| Guiné suínos IgG | ThermoFisher Scientific | Vários | Hospedeiro: Goat Diluição: 1:200 Comentários: AlexaFluor conjugados |
| Camundongo IgG | ThermoFisher Scientific | Vários | Hospedeiro: Goat Diluição: 1:200 Comentários: AlexaFluor conjugados |
| Coelho IgG | ThermoFisher Scientific | Vários | Hospedeiro: Goat Diluição: 1:200 Comentários: AlexaFluor conjugados |
| Rato IgG | ThermoFisher Scientific | Vários | Hospedeiro: Bode, Burro Diluição: 1:200 Comentários: AlexaFluor conjugados |
| Frango IgG | ThermoFisher Scientific | Vários | Hospedeiro: Cabra Diluição: 1:200 Comentários: AlexaFluor conjugados |