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Enquanto o protocolo descrito usando os transgênicos c. elegans Coe BAT28 e RNAi contra lin-53 é simples, várias etapas são críticas em ordem para garantir o resultado esperado de células germinativas para reprogramação do neurônio. É importante que a tensão BAT28 é mantida a 15 ° C, em todos os momentos antes dos experimentos. Durante a manipulação e manutenção da tensão, o tempo em temperaturas acima de 15 ° C precisa ser minimizada tanto quanto possível. Condições de calor-choque adequada são importantes pois insuficiente indução de -1 superexpressão não resultará em células germinativas para conversão de neurônio ASE. Isto pode ser detectado medindo-se a penetrância fenótipo conforme descrito no protocolo. Calor-choque extensa pode levar a letalidade dos animais. Por exemplo, placas que foram colocadas perto de paredes internas ou no chão de uma incubadora de ar estática inferior frequentemente experimentam extensa de tratamento térmico. Portanto, é recomendável usar uma incubadora de calor ventilado. Além disso, timing da indução calor-choque é crítico desde sobre-expressão do -1 durante estágios larvas mais cedo então L3 pode levar a indução de gravidez ectópica gcy-5prom::gfp em regiões diferentes do corpo, tais como a vulva (Figura 3) 9. Além disso, calor-choque extensa pode ser detectada pela penetrância de fenótipo em animais de RNAi vetor vazio, que não deve estender a 5% e aumento de autofluorescência de outros tecidos, ou seja, o intestino.
Esporadicamente, RNAi bactérias podem perder sua atividade para produzir eficientemente dsRNA do gene do alvo. Infelizmente, isto não pode ser detectado antes do experimento de RNAi. Em tais casos uma raia fresca do glicerol deve ser cultivada como descrito na secção 2 do protocolo. Se houver ainda não causado por RNAi pleiotrópicos fenótipo visível, tais como o fenótipo pvul causada pelo sucesso RNAi contra lin-53, então um plasmídeo isolamento do DNA da bactéria respectivos deve ser executado e fresco HT115 bactérias precisam ser transformadas com o plasmídeo L4400 que contém a sequência de lin-53 .
Importante, a tensão de BAT28 tem um o fenótipo de rolo causado pela injeção marcador pRF4, que foi utilizada durante a transgênese dos animais com o hsp-16.2prom::che-1 construção de DNA. Ocasionalmente, os animais perdem o fenótipo de rolamento, que pode indicar o silenciamento do hsp-16.2prom::che-1 transgene. Para manter corretamente a tensão BAT28, escolher 10 animais de rolo para um prato fresco e propagar selecionando para rolar os animais.
A aplicação do protocolo é limitada para o procedimento de RNAi F1, que significa que os animais cujos pais (geração de P0) não tem sido expostos a lin-53 RNAi não mostrará células germinativas para conversão de neurônio devido resgate materno4. Um procedimento alternativo para converter as células germinativas em neurônios tem sido descrito por Ciosk e colegas15 usando RNAi knock-down de gld-1 e 3-mex sem sobre-expressão de um fator de transcrição. No entanto, os neurônios obtidos não pertencem a um tipo específico de neurônios e células germinativas também converter em células de músculo, como após mediada por RNAi depleção de gld-1 e mex-315. Anteriormente, foi demonstrado o RNAi contra lin-53 permitiu a conversão de células germinativas, em células gabaérgica neurônio após sobre-expressão do factor de transcrição de homoedomain de Pitx-tipo UNC-3016 em vez de-14 . Para direções futuras, transcrição de destino de indução diferente fatores podem ser testados se lin-53 depleção de células germinativas pode ser convertida em outros tipos de células do que neurônios específicos. Neste contexto, a superexpressão do factor de transcrição bHLH miogênico HLH-1, homólogo dos mamíferos MyoD17, induz a conversão de células germinativas de músculos sobre lin-53 RNAi5. A reprogramação estabelecida de células germinativas para um tipo específico de células somáticas sobre lin-53 RNAi e sobre-expressão de um fator de transcrição indutora de destino apropriado pode ser usada para um número de diferentes telas de genéticas. Essas telas supressor ou potenciador podem ajudar dissecando regulamentares vias que desempenham um papel durante a conversão de destino da célula.