O objetivo do presente protocolo é fornecer um guia passo a passo para realizar experiências em 3-d "fígado-on-a-chip" infecção com o vírus da hepatite B.
Artigo de método
O objetivo do presente protocolo é fornecer um guia passo a passo para realizar experiências em 3-d "fígado-on-a-chip" infecção com o vírus da hepatite B.
Apesar da excepcional infectividade do vírus da hepatite B (VHB) em in vivo, onde apenas três genomas virais podem resultar em uma cronicidade de chimpanzés experimentalmente infectados, mais modelos in vitro requerem várias centenas de milhares de genomas virais por célula em ordem para iniciar uma infecção transitória. Além disso, o estáticas 2D culturas de hepatócitos humanos primários (PHH) permitem apenas estudos de curto prazo devido a sua rápida quê. Aqui, descrevemos 3D culturas fígado-em-um-microplaqueta de poeira, monoculturas ou em cocultures com outras células do fígado-residente de parênquimas. Estes oferecem uma melhoria significativa ao estudo a longo prazo infecções HBV com respostas de célula fisiológico do hospedeiro. Além de facilitar estudos de eficácia de drogas, análise toxicológica e investigações sobre patogênese, estes sistemas de cultura microfluidic permitem a avaliação de terapias curativas para infecção pelo VHB, tendentes a eliminar covalentemente fechado, circular (ccc) DNA. Este apresentado método descreve o set-up de monoculturas PHH e culturas co de células de Kupffer/PHH, a infecção com o VHB purificado e a análise das respostas do hospedeiro. Este método é particularmente aplicável à avaliação dos efeitos a longo prazo da infecção pelo VHB, combinações de tratamento e patogênese.
O estudo do HBV foi complicado pela pobre susceptibilidade dos sistemas de cultura, que requerem várias centenas de milhares de cópias do genoma HBV por célula para iniciar a infecção1. Além disso, os hepatócitos humanos primários geralmente são excepcionalmente frágil e dedifferentiate rapidamente durante as culturas convencionais2. Isto é principalmente devido ao fato de que as superfícies de plástico lisas e dura não imitar os ambientes naturais extracelulares encontrados dentro do fígado e a falta de oxigenação das culturas na ausência de circulação microfluidic geral. Culturas de hepatócitos estáticos convencionais em placas com revestimento em colágeno rapidamente dedifferentiate e perdem a sua susceptibilidade à infecção de VHB3. Aqui, descrevemos o set-up e infecção de poeira crescida em culturas de fígado-em-um-microplaqueta 3D, que são imensamente vantajosas sobre convencional 2D estáticas culturas PHH em placas com revestimento em colagénio devido a sua competência estendida de metabólica e funcional, facilitando culturas a longo prazo pelo menos 40 dias4. Neste sistema, PHH são semeados em andaimes colágeno-revestido, que continuamente são pintadas com meio de cultura para fornecer oxigênio e nutrientes para as células. Apesar dos sistemas de cultura alternativa para PHH baseados no complexos cocultures de fibroblastos murino ou crescimento 3D em esferoides foram validados e são suscetíveis à infecção pelo VHB usando multiplicidades de infecção de 500 equivalentes do genoma (GE) do HBV por célula, 3D fígado-em-um-microplaqueta culturas permanecem suscetíveis a 0,05 sistema único modelo in vitro GE de HBV por célula4. Isto adicionalmente é sustentado pela necessidade do uso de altas concentrações de Dimetilsulfóxido (DMSO) e polietileno glicol (PEG) para estabelecer a infecção pelo VHB nessas culturas, que é dispensável para a infecção dos sistemas de cultura de fígado-em-um-microplaqueta 3D 4. entre as principais marcas do HBV infecção é a piscina de cccDNA, que atua como o modelo transcriptional para todos de novo–produzido virions5,6. Mesmo que o cccDNA pode ser detectado em culturas de hepatócitos convencional7,8, permanece incerto sobre se o Regulamento da cccDNA e quaisquer abordagens terapêuticas vistas a sua eliminação são recapituladas em parcialmente ou completamente os hepatócitos. Demonstrámos que cccDNA funcionalmente é formada em culturas de fígado-em-um-microplaqueta 3D, responde a estímulos fisiológicos e pode ser direcionado, interferindo com a acessibilidade da maquinaria transcricional do genoma de cccDNA4.
Respostas de anfitrião para infecção pelo VHB em 3D fígado-em-um-microplaqueta imitam aqueles observaram em pacientes infectados pelo VHB, permitindo a identificação de biomarcadores para infecção, bem como sucesso terapêutico. Entre as características únicas do fígado-em-um-microplaqueta culturas é a capacidade de avaliar as respostas de acolhimento a longo prazo entre a poeira e outras células parênquimas dentro do fígado, incluindo células4Kupffer, células estreladas9e fígado sinusoidal células endoteliais10,11. Isto oferece uma oportunidade única para avaliar interações célula/célula em um microambiente 3D complexa.
Além disso, o período prolongado de cultura desta plataforma facilita a avaliação dos tratamentos medicamentosos sequencial e seu impacto sobre a persistência do VHB, que não são possíveis usando sistemas de cultura hepatócito convencional.
Este protocolo descreve como 3D fígado-em-um-microplaqueta culturas são geradas, monoculturas de poeira ou para cocultures de poeira com células de Kupffer. Além disso, descrevemos a produção do HBV purificado para estudos de baixo-multiplicidade de infecção, bem como a análise posterior de host e respostas virais.
1. montagem e equilíbrio de placas
2. descongelar e propagação dos hepatócitos para monoculturas
3. descongelar e propagação de células de Kupffer e hepatócitos para culturas co
4. produção de um vírus de Hepatite infecciosa B para estudos de infecção
5. infecção das culturas 3D com HBV
6. quantificação de DNA HBV extracelular
7. quantificação de HBV intracelular Pregenomic (pg) do RNA
8. imunofluorescência coloração de antígeno Viral
9. humana albumina ELISA
10. interleucina (IL) 6 e factores de necrose tumoral (TNF) α produção em culturas co 3D
Nós descrevemos uma plataforma simples e versátil para a cultura a longo prazo das células de Kupffer humanas primárias e/ou hepatócitos e sua infecção com o VHB. Células humanas primárias são semeadas em andaimes de poliestireno revestido de colágeno dentro de um assembly de placa microfluídicos, que continuamente perfuses as células com o meio de crescimento (Figura 1a).
PHH, que geralmente são apenas estável para uma quantidade limitada de tempo nos sistemas de cultura convencional, pode ser funcionalmente mantida por longos períodos de tempo. Albumina humana, que é secretada pelos hepatócitos funcionais e é considerada o melhor marcador para a avaliação do metabolismo hepático, é estável e altamente expressa por culturas 3D até dia 40 pós-semeadura (Figura 2). Para cocultures, a viabilidade e a funcionalidade de células de Kupffer podem ser avaliadas pela secreção de citocinas específicas (por exemplo, IL6 e TNFa). Para medir a produção de citocinas, a utilização de meios de detecção baseada em captura sobre LPS-estimulação de cocultures é recomendada (Figura 3).
Células formam microtissues hepática, geralmente dentro de 3 dias da semeação de poeira, demonstrando canalículos biliares funcional e polarização de célula completa (Figura 2). Além de manter seu metabolismo celular fisiológico, essas culturas tornam-se excepcionalmente suscetíveis à infecção pelo VHB. DNA do HBV e outros marcadores virais, em contraste com outros sistemas de cultura, tornam-se prontamente detectáveis de pós-infecção do dia 2 (Figura 4). Além secretados marcadores de infecção viral, contendo hepatócito andaimes podem ser obtidas de culturas e usados para detecção de antígenos virais imunofluorescência (por exemplo, HBsAg, HBcAg) (Figura 4). Onde culturas de hepatócitos convencionais exigem inoculação pelo menos 500 GE HBV por célula e a adição de DMSO de 2% e 4% PEG, sómente 0,05 HBV GE são capazes de iniciar a infecção em culturas em 3D sem a necessidade de DMSO ou PEG (Figura 4).

Figura 1: configuração das culturas de fígado-em-um-microplaqueta 3-d. (um) este é um layout esquemático para a montagem da placa de cultura para garantir o estabelecimento de circulação microfluidic. (b) este painel mostra uma visão mais apurada dos poços de cultura, incluindo o papel de filtro, andaime e anel de retenção. (c) este painel mostra o processo de equilíbrio de placa antes da semeadura das culturas. Os próximos dois painéis mostram o processo de propagação para monoculturas de hepatócitos (d) e (e) células de Kupffer/hepatócito cocultures. (f) este painel mostra as etapas de lavagem envolvidos em alterações médias. (g) este painel mostra a afinação de infecção pelo VHB, incluindo a remoção de um inóculo. S.M. = meio de semeadura, M.M = meio de manutenção. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 2: viabilidade de formação e hepatócito hepática microtissue. (um) este painel mostra imagens brightfield longitudinal de monoculturas hepatócito 3D demonstrando a formação de microtissue após semeadura. (b) este painel mostra imagens de imunofluorescência de culturas para núcleos (azul) e a albumina humana (verde). (c) este painel mostra longitudinal albumina total, bem como por célula ajustado produção de albumina, durante 40 dias de monoculturas de hepatócitos, conforme determinado pelo ELISA. Os dados mostrados são média ± SD Esta figura é adaptada de Ortega-Prieto et al.4. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 3: funcionalidade de células de Kupffer em 3-d cocultures. Estes painéis mostram a secreção de (um) IL6 e (b) TNFa em monoculturas de hepatócitos e células de Kupffer/hepatócito cocultures 11 dias pós-semeadura em resposta a LPS exogenamente adicionados no dia 9 post de semeadura, conforme determinado usando humana magnético Ensaio de Luminex. Esta figura é adaptada de Ortega-Prieto et al.4. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 4: infecção pelo VHB em culturas de fígado-em-um-microplaqueta. (um) este painel mostra a detecção de microscopia de imunofluorescência de HBcAg (vermelho), HBsAg (verde) e núcleos (azul) 10 dias após a infecção das culturas com o VHB. (b) este painel mostra a susceptibilidade das culturas à infecção pelo VHB, usando diferentes multiplicidades de infecção, conforme determinado por uma quantificação do ADN do HBV nos sobrenadantes de cultura. (c) este painel mostra a quantificação da acumulação longitudinal de HBV pgRNA relativo para o gene de limpeza RPS11. Os dados mostrados são média ± SD Esta figura é adaptada de Ortega-Prieto et al.4. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Os desafios em manter culturas a longo prazo de poeira têm impulsionado o desenvolvimento de diversos modelos de cultura com maior funcionalidade e longevidade, cada um exibindo diferenciais vantagens e desvantagens. Agora é amplamente reconhecido que culturas 2D estáticas de poeira estão imitando certos aspectos da biologia do hepatócito para quantidades muito limitadas de tempo. Assim, micropatterned cocultures12,13, esferoide culturas14,15, e culturas de fígado-em-um-microplaqueta 3D16,17 estão rapidamente substituindo estes sistemas mais básicos. Especialmente quando estudar doenças infecciosas, que evoluíram com seu anfitrião para utilizar específico microambiente, o requisito de fornecer ambientes fisiológicas é sustentado pela natureza muitas vezes desafiador de cultivo humano-tropic doenças infecciosas, incluindo o vírus da hepatite C, HBV e malária.
O passo mais crítico no desempenho 3D fígado-em-um-microplaqueta de culturas é a qualidade dos tipos inicialmente origem célula primária. Estas células devem ser testadas pela sua capacidade de aderência e apenas montes de poeira plateable devem ser usados para assegurar a formação de tecido de sucesso e geração de cultura. Mesmo que PHH recentemente isolado pode ser usado, sua criopreservação é geralmente complicada e requer especiais congeladores taxa-controlada.
Em contraste com culturas convencionais de 2D estáticas, o fundo genético de anfitrião é insignificante em relação à susceptibilidade à infecção pelo VHB, e todos os doadores do hepatócito testado até agora são capazes de estabelecer de infecção pelo VHB4.
Mesmo que o paciente-derivado HBV estabelece infecções das culturas 3D, é imperativo utilizar PEG-precipitado e sacarose coxim-purificado HBV sempre usando célula de produtor HBV inducible linhas para a geração de inóculos virais. Sobrenadantes de cultura celular aplicados diretamente às culturas de fígado-em-um-microplaqueta 3D, quer através da presença de fatores inibitórios ou devido a uma incompatibilidade de fatores de crescimento presentes com hepatócitos, prontamente não resultar em infecção. Além disso, ao selecionar paciente-derivado de inóculos virais, só soro deve ser usado, desde que o plasma, inevitavelmente, coagula e obstrui a circulação microfluidic da plataforma de cultura.
Independentemente do inóculo viral utilizado, assegurando a viabilidade celular e diferenciação, bem como assegurar a remoção completa do inóculo inicial HBV, é chave para o sucesso a longo prazo estudos de infecção. A maneira mais conveniente de fazer isto é amostragem culturas após a remoção do inóculo viral, bem como medir os níveis de albumina de soro humano durante todo o período de cultura. Da nota, da mesma forma para todas as outras plataformas descritas, infecção pelo VHB, uma vez estabelecida, não prontamente espalha para células não infectadas. O mecanismo subjacente para isto continua elusivo, já que a infecção pelo VHB em vivo prontamente infecta a maioria dos hepatócitos no fígado.
No que se refere cocultures de poeira, células de Kupffer, é aconselhável realizar testes de monte de células de Kupffer para avaliar a secreção IL6 e TNFa em resposta à estimulação de LPS, uma vez que nem todos os dadores de células de Kupffer comercialmente disponíveis têm uma capacidade de resposta igual.
Importante, para todos os tratamentos com drogas ou infecção inicial das culturas com HBV, o volume total do poço (1,4 mL), bem como a partir do canal microfluidic (0,2 mL), devem ser tomadas em consideração para o cálculo das concentrações de droga ou de inóculo. Para garantir a dosagem exata, uma etapa de lavagem com meio contendo HBV ou drogas é executada para prime o canal microfluidic.
A plataforma usada utiliza PHH 600.000 por bem, o que garante várias camados hepatócitos dentro os andaimes. Mesmo que o número de células pode ser variado, a concentração de células escolhido garante resultados óptimos. O formato da placa possui um total de 12 andaimes, que pode ser actualizada para 36 andaimes. No entanto, devido às exigências de microfluidic, intensificação para números bem mais altos não é possível até à data.
Usando essas abordagens, as culturas podem ser mantidas com desempenho de célula ideal pelo menos 40 dias, que, até então, oferece oportunidades sem precedentes para avaliar candidatos a novos fármacos, bem como estudar a complexa interação entre diferentes células hepáticas populações durante a infecção pelo VHB.
Os autores não têm nada para divulgar.
Este trabalho foi financiado por uma concessão do acionador de partida do Conselho Europeu de investigação (637304), um Wellcome Trust Investigator Award (104771/Z/14/Z) e pelas inovações de Bio CN.
| Nome | Empresa | Número de catálogo | Comentários |
|---|---|---|---|
| ReagentesWilliam's | |||
| E Médio, sem fenol vermelho | GIBCO | A12176-01 | |
| Meio de descongelamento de hepatócitos | GIBCO | CM7500 | |
| Suplementos primários de descongelamento e revestimento de hepatócitos | GIBCO | CM3000 | |
| Suplementos primários de manutenção de hepatócitos | GIBCO | CM4000 | |
| DMEM/F-12 | GIBCO | 11320-033 | |
| DMEM | GIBCO | avançado 12491023 | |
| DPBS, sem cálcio, sem magnésio | GIBCO | 14190-144 | |
| MEM Aminoácidos não essenciais (NEAA) 100x | GIBCO | 11140050 | |
| Penicilina-estreptomicina (10.000 U/mL) | GIBCO | 15140-122 | |
| Soro bovino fetal, origem dos EUA, inativado por calor, filtrado estéril, adequado para cultura de células | SIGMA | 12106C | |
| Hidrocortisona | SIGMA | H0888 | |
| Azul tripano | Merck | T8154 | |
| Colágeno da pele de bezerro | Merck | C9791 | |
| G418 | SIGMA | G418-RO | |
| Tetraciclina | SIGMA | T3258 | |
| Polietilenoglicol 8000 | SIGMA | P2139 | |
| Sacarose | SIGMA | SO389 | |
| Carbonato de sódio anidro | SIGMA | 451614-25G | |
| Bicarbonato de sódio | SIGMA | S5761 | |
| Azida de sódio | SIGMA | S2002-5G | |
| Ácido sulfúrico, 99,999% | SIGMA | 339741 | |
| 4% Paraformaldeído | SIGMA | 252549 | |
| Triton-X 100 | SIGMA | X100 | |
| Tween 20 | SIGMA | P1379 | |
| DAPI | SIGMA | D9564 | |
| Albumina (humana) | SIGMA | A9731 | |
| Fisher BioReagent Albumina de Soro Bovino, Fração V, Tratamento com Choque Térmico | Fisher Scientific | BP9701-100 | |
| ProLong Gold Antifade Mountant | Invitrogen | P36930 | |
| TaqMan Universal Master Mix II, não UNG | Applied Biosystems | 4440040 | |
| SYBR Select Master Mix | Applied Biosystems | 4472903 | |
| Lipopolissacarídeo de Escherichia coli K12 | InvivoGen | tlrl-eklps | |
| Nome | Empresa | Número de catálogo | Comentários |
| Kits/Consumíveis | |||
| Membrana estéril | CN Bio inovações | LC-SC | |
| LiverChip Placa de cultura de células de perfusão | CN Bio innovations | LC12 | |
| Tampa da placa de cultura LiverChip | CN Bio innovations | LC-SC | |
| Papel de filtro redondo estéril | CN Bio innovations | LC-SC | |
| Andaime de fixação de células | CN Bio innovations | LC-SC | |
| Anel de retenção | CN Bio innovations | LC-SC | |
| Êmbolo estéril | CN Bio innovations | LC-ST | |
| Dneasy kit de sangue e tecido | Qiagen | 69506 | |
| Rneasy mini kit | Qiagen | 74106 | |
| Ensaio de Luminex Magnético Humano | R& D Systems | ||
| 1-Step Ultra TMB-ELISA Substrate Solution | ThermoFisher Scientific | 34028 | |
| Kit de transcrição reversa de cDNA de alta capacidade | ThermoFisher Scientific | 4368814 | |
| QIAamp Viral RNA Mini Accessory Set | Qiagen | 1048147 | Contendo RNA transportador |
| Millicell HY Frasco de cultura de células de 5 camadas, T-1000, Millipore estéril | (Merck) | ||
| Placa de reação óptica de 384 poços MicroAmp com tecnologias de vida de código de barras | 4309849 | ||
| Filme adesivo óptico MicroAmp | Life technologies | 4311971 | |
| Placas de 96 poços imuno não estéreis de fundo plano transparente | de 442404 | ThermoFisher Scientific | |
| para placas de 96 poços | ThermoFisher Scientific | 15036 | |
| Filtros de Garrafa Descartáveis Estéreis de Fluxo Rápido Nalgene com Membrana PES | ThermoFisher Scientific | 295-3345 | |
| Marca Fisher Lâminas microscópicas com bordas retificadas, Tubo | de FB58628 | Frost Fisher Scientific | |
| , Thinwall, Ultra-Clear, 38,5 mL, 25 x 89 mm | Beckman Coulter | 344058 | |
| Nome | Empresa | Número de catálogo | Comentários |
| Células primárias / Linhas celulares | |||
| Hepatócitos plaquetáveis humanos, transportador qualificado | Thermo Fisher Scientific | HMCPTS | |
| Células Kupffer humanas criopreservadas | Thermo Fisher Scientific | HUKCCS | |
| HepDE19 linha celular | Haitao Guo (Indiana University, IN, EUA) | ||
| Nome | Empresa | Número de catálogo | Comentários |
| Primers/Probes/Standards | |||
| HBV DNA forward primer | Invitrogen | 5'-GTGTCTGCGGCGTTTTATCA-3'HBV | |
| DNA reverse primer | Invitrogen | 5'-GACAAACGGGCAACATACCTT-3'HBV | |
| DNA probe | Invitrogen | 5'FAM-CCTCTKCATCCTGCTGCTATGCCTCATC-3'TAMRA | |
| pgRNA forward primer | Invitrogen | 5'-GAGTGTGGATTCGCACTCC-3'pgRNA | |
| reverse primer | Invitrogen | 5'-GAGGCGAGGGAGTTCTTCT-3'RPS11 | |
| forward primer | Invitrogen | 5'-GCCGAGACTATCTGCACTAC-3'RPS11 | |
| reverse primer | Invitrogen | 5'-ATGTCCAGCCTCAGAACTTC-3'pCMV-HBV | |
| Professor Christoph Seeger (Fox Chase Cancer Centre, PA, EUA) | |||
| Nome< | strong>Empresa | Número de catálogo | Comentários |
| Anticorpos | |||
| Anti-Hepatite B vírus anti-núcleo do antígeno IgG fração (policlonal) | DAKO | descontinuado | Lote 10102505 |
| Anticorpo de albumina humana, A80-129A | Bethyl Laboratories. inc | A80-129A | |
| Anticorpo de albumina humana adsorvido cruzada, A80-229P | Bethyl Laboratories. inc | A80-229P | |
| Anticorpo secundário de adsorção cruzada anti-coelho IgG (H+L) de cabra, Alexa Fluor 594 | ThermoFisher Scientific | # A-11072 | Lote 1431810 |
| Nome | Empresa | Número de Catálogo< | strong>Comentários |
| Equipamento | |||
| Bomba de vácuo LiverChip | CN Bio inovações | LC-PN | |
| LiverChip Conexão pneumática | CN Bio innovations | LC-PN | |
| Plataforma LiverChip CN | Bio innovations | LC-PN | |
| LiverChip doca de lavagem de chapas | CN Bio innovations | ||
| Pinça metálica autoclavável | VWR | 232-0106 | |
| Vortex Genie 2 | Scientific industries | SKU: SI-0236 | |
| Optima XPN-80 Ultracentrifuge | Beckman Coulter | A95765 | |
| Centrífuga Heraeus Multifuge X3R | Thermo Scientific | 75004500 | |
| SAM-12 Sucção Médica Alto Vácuo Alto Fluxo | MGE em todo o mundo | SAM12/01010101 | |
| incubadora NUAIRE 5800 SERIES | NUAIRE | NU-5841 | |
| Torgue de precisão automatizado | CN Bio innovations | ||
| Torque manual | CN Bio innovations | ||
| Compressor LiverChip | CN Bio innovations | ||
| Luminex LX-200 Instrument with xPONENT 3.1 | Luminex | ||
| Bloco Separador Magnético Portátil Millipore | ThermoFisher Scientific | Millipore™ 40-285 | |
| Leitor de Placas FluoStar Optima | BMG Labtech | ||
| KOLVER Chaves de fenda elétricas de precisão | VTECH ltd | FAB10RE/FR | |
| KOLVER Fonte de alimentação | VTECH ltd | EDU1FR | |
| BAMBI VTS75D | Equipamento de Ar | Descontinuado | |
| Sistema de PCR em tempo real Integra Vacuboy | INTEGRA | ||
| ViiA 7 com bloco de 384 poços | ThermoFisher Scientific | 4453536 |