Neste artigo, descrevemos os protocolos de determinação de estrutura, purificação, cristalização e expressão da proteína do domínio N-terminal do receptor de ryanodine do diamondback moth (Plutella plutella).
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Artigo de método
* These authors contributed equally
Neste artigo, descrevemos os protocolos de determinação de estrutura, purificação, cristalização e expressão da proteína do domínio N-terminal do receptor de ryanodine do diamondback moth (Plutella plutella).
Desenvolvimento de inseticidas potentes e eficientes como alvo receptores ryanodine inseto (RyRs) tem sido de grande interesse na área de controle de pragas agrícolas. Até à data, vários insecticidas de diamido visando pragas que ryrs ter sido comercializados, que geram receita anual de 2 bilhões de dólares. Mas a compreensão do modo de ação de inseticidas RyR-direcionamento é limitada pela falta de informações estruturais sobre inseto RyR. Isto por sua vez restringe a compreensão do desenvolvimento da resistência de inseticida em pragas. O diamondback moth (DBM) é uma praga devastadora destruindo crucíferas culturas em todo o mundo, que também tem sido relatada para mostrar resistência aos inseticidas de diamido. Portanto, é de grande importância prática para desenvolver novas inseticidas visando o RyR DBM, especialmente visando uma região diferente do local de ligação do diamido tradicional. Aqui, apresentamos um protocolo para caracterizar estruturalmente o domínio N-terminal do RyR da DBM. A estrutura de cristal de raio-x foi resolvida por substituição molecular em uma resolução de 2.84 Å, que mostra um motivo de dobramento de beta-trevo e uma acompanhamento alfa-hélice. Este protocolo pode ser adaptado para a expressão, purificação e caracterização estrutural de proteínas ou outros domínios em geral.
Ryanodine receptors (RyRs) são canais de íon específico, que mediam a permeação dos íons de Ca2 + através das membranas do retículo sarcoplasmático (RS) em células musculares. Portanto, eles jogam um papel importante na processo de acoplamento excitação contração. Na sua forma funcional, RyR monta como um homo-tetrâmero com uma massa molecular de > 2 MDa, com cada subunidade composto por resíduos de aminoácidos ~ 5000. Em mamíferos, existem três isoformas: RyR1 - tipo de músculo esquelético, RyR2 - tipo de músculo cardíaco e RyR3-ubiquitously expressa em tecidos diferentes1.
Em insetos, há apenas um tipo d....
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1. Gene clonagem e expressão de proteínas purificação
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Purificação
O domínio N-terminal da DBM RyR foi expressa como uma proteína de fusão com uma marca de hexahistidine, uma marca MBP e um local de clivagem de protease TEV. Nós seguimos uma estratégia de purificação de cinco etapas para obter uma proteína altamente pura, adequada para efeito de cristalização. Em primeiro lugar, a proteína de fusão foi purificada da fracção solúvel de lisado celular por coluna Ni-NTA (HisTrap HP). Em s.......
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Neste artigo, descrevemos o procedimento para expressar recombinantes, purificar, cristalizar e determinar a estrutura de DBM RyR NTD. Para cristalização, um requisito crucial é a obtenção de proteínas com homogeneidade, pureza e alta solubilidade. Em nosso protocolo, escolhemos usar pET-28a-HMT vetor que contém uma marca de hexahistidine e MBP, ambos os quais poderiam ser utilizados para a purificação obter uma maior pureza de dobra. Além disso, as aids marca MBP na solubilidade da proteína alvo. Nós purificado da prote.......
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Os autores não têm nada para divulgar.
Financiamento para esta pesquisa foi fornecida por: nacional chave de pesquisa e desenvolvimento programa de China (2017YFD0201400, 2017YFD0201403), nacional natureza Science Foundation da China (31320103922, 31230061) e projeto de pesquisa básica nacional (973) programa de China (2015CB856500, 2015CB856504). Somos gratos ao pessoal sobre a trajetória de BL17U1 em instalações de radiação síncrotron de Shanghai (SSRF).
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| Nome | Empresa | Número de catálogo | Comentários |
|---|---|---|---|
| pET-28a-HMT | Este vetor pET modificado contém uma marca de hexa-histidina, uma proteína de fusão MBP e um local de clivagem da protease TEV no terminal N (Lobo e Van Petegem, 2009) | ||
| < em>E. coli< / em> cepa BL21 (DE3) Novagen | 69450-3CN | ||
| Coluna HisTrapHP (5 mL) | GE Healthcare | 45-000-325 | |
| Coluna de resina de amilose | New England Biolabs | E8021S | |
| Q Sepharose coluna de alto desempenho | Concentradores Amicon GE Healthcare | 17-1154-01 | |
| (10 kDa MWCO) | Millipore | UFC901008 | |
| Superdex 200 26/600 coluna de filtração em gel | GE Healthcare | 28-9893-36 | |
| Sistema robótico automatizado de manuseio de líquidos | Art Robbins Instruments | Gryphon | |
| 96 Well CrystalQuick | Greiner bio-one | 82050-494 | |
| Uni-Puck | Molecular Dimensions | MD7-601 | |
| Montado CryoLoop - 20 mícrons | Hampton Research | HR4-955 | |
| CryoWand | Molecular Dimensions | MD7-411 | |
| Puck ferramenta de carregamento dewar | Molecular Dimensões | MD7-607 | |
| Nano drop | Thermo Scientific | NanoDrop One | |
| Incubadora de cristal | Dimensões moleculares | MD5-605 | |
| Difrator de raios-X | Rigaku | FRX | |
| Máquina de PCR | Eppendorf | Nexus GX2 | |
| Kit de mini-preparação de plasmídeo | Qiagen | 27104 | |
| Extração de gel kit | Qiagen | 28704 | |
| SspI endonuclease de restrição | NEB | R0132S | |
| T4 DNA polimerase | Novagen | 2868713 | |
| Kanamycin | Scientific Chemical | 25389940 | |
| IPTG | Genview | 367931 | |
| HEPES | Genview | 7365459 | |
| β-mercaptoetanol | Genview | 60242 | |
| Centrífuga | Thermo Scientific | Sorvall LYNX 6000 | |
| Sonnicator | Scientz | II-D | |
| Sistema de purificação de proteínas | GE Healthcare | Akta Microscópio de luz pura | |
| Nikon | SMZ745 | ||
| Corante de cristal IzIt | Hampton Research | HR4-710 | |
| Unidade de eletroforese | Bio-Rad | 1658005EDU | |
| Shaker Incubadora | Zhicheng | ZWYR-D2401 | |
| Tela de cristal de índice | Hampton Research | HR2-144 | |
| Tela de cristal de estrutura | Dimensões moleculares | MD1-01 | |
| Tela de cristal ProPlex | Dimensões moleculares | MD1-38 | |
| PACT tela de cristal premier | Dimensões moleculares | MD1-29 | |
| Tela de cristal JCSG-plus | Molecular Dimensões | MD1-37 |
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