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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
O protocolo descrito aqui descreve a análise de imunofluorescência, recuperação de biocytin e reconstruções de alta qualidade de hippocampal CA2 interneurônios seguindo o intracelulares gravações eletrofisiológicas in vitro, permitindo neuronal caracterização e anatomia neuronal, finalmente, bem a ser estudado.
Como atividade cortical rede processa informações é de importância para um grande número de questões científicas básicas e clínicas. O protocolo descrito aqui identifica os blocos de construção básicos deste circuito. Os estudos em profundidade das regiões corticais, finalmente, irão fornecer outros cientistas com os componentes do circuito necessário para a compreensão de como o cérebro adquire, processa e armazena as informações e o que dá errado na doença, enquanto o eletrofisiológicos e dados morfológicos são amplamente utilizados pelos neurocientistas computacionais na construção de redes de modelo que explorar o processamento de informações. O protocolo descrito aqui descreve como células cheias de biocytin gravadas na região do hipocampo de CA2 são recuperadas e depois reconstruídas em 3D. Além disso, o protocolo descreve a demonstração da proteína de ligação de cálcio ou peptídeo conteúdo em interneurônios gravados.
O córtex e hipocampo são estruturas de complexidade que a classificação de neuronal subtipos1,2,3,4, mapas das conexões entre eles5,6 , 7 , 8 , 9 , 10 , 11 e como este circuito suporta funções cognitivas12,13,14,15 ainda estão sob intenso estudo e objecto de debate contínuo. Por exemplo, para entender os detalhes e complexidades do circuito e coordenar dados obtidos de muitos estudos diferentes, é extremamente útil ser capaz de definir e descrever os componentes, mas continua a ser tema de debate como muitos diferentes classes de neurônios existem, ou mesmo se é possível definir todos os neurônios como pertencendo a uma classe específica. Ferramentas computacionais que podem construir e testar circuitos com diferentes graus de complexidade estão sendo desenvolvidos16,17,18, mas central para estes empreendimentos é a necessidade de estudos detalhados, os tipos de células e as propriedades das conexões entre eles. Uma grande quantidade de informações sobre os circuitos locais do neocórtex de ratos adultos já foram coletada usando o protocolo descrito aqui10,19,20,21, 22. embora o "diagrama de fiação" está longe de ser completa, alguns limpar padrões ou regras surgiram. Além disso, embora alguns detalhes variam, estas regras são comuns a duas espécies de mamíferos (rato e gato) e através de várias regiões neocortical, permitindo o desenvolvimento de blocos de construção básicos que são susceptíveis de ser igualmente aplicável ao neocórtex humano. A técnica descrita aqui é usada para estender a nossa compreensão do mapa funcional de circuitos corticais identificando os neurônios pré-sináptica e pós-sináptica envolvidos nas conexões, nas regiões que não têm sido estudadas em detalhe antes, usando um protocolo Isso permite que tecido excelente preservação e recuperação de coloração notável no tecido do cérebro de um adulto. Foram coletados dados sobre os circuitos locais em CA2 e propriedades neuronais neste subcampo com este método combinando intracelulares eletrofisiológicas gravações (emparelhado com microeletrodos afiados) com biocytin de enchimento, imunofluorescência, procedimentos histológicos e reconstruções neuronais altamente detalhados, permitindo a comparação direta com o vizinho CA regiões23,24,25.
A técnica descrita neste artigo foi desenvolvida ao longo dos anos para obter detalhadas sobre anatomia neuronal, permitindo a correcta classificação das células e da alta qualidade e precisa reconstruções de ambos seus dendríticas e axonal mandris, dados que podem ser correlacionados com dados eletrofisiológicos coletados de emparelhados gravações usando eletrodos afiados. O protocolo histológico foi otimizado para preservar a ultraestrutura dos neurônios e obter excelente recuperação de mandris axonal e dendríticas (incluindo espinhos). Por exemplo, o princípio da técnica dupla fixação imergindo-se em primeiro lugar em uma solução de fixador e em segundo lugar, pós-fixação em tetróxido de ósmio dá um bom contraste para microscopia de luz26. Uma pequena quantidade de solução de ácido pícrico e glutaraldeído são adicionados à solução fixador para melhorar a penetração do anticorpo e preservar a ultraestrutura das células, como sugerido em um anterior de estudo27. A permeabilização das fatias de cérebro usando o método de congelamento-descongelamento combinado com cryo-proteção com sacarose, ao invés de um detergente tradicional, também oferece óptima preservação dos tecidos para análise morfológica detalhada das células gravadas. Além disso, a visualização particularmente de muito belas estruturas é melhorada através da redução de coloração de fundo, com a incubação com peróxido de hidrogênio (H2O2) e o boro-hidreto de sódio (NaBH4). Adição de cloreto de níquel (NiCl2) para a peroxidase de rábano (HRP) reação para obtenção de um produto de reação de pigmento preto também aumenta o contraste.
O protocolo seguinte descreve os procedimentos utilizados para determinar a preservação de tecido excelente e altamente detalhadas reconstruções 3D neuronais após gravações intracelular em vitro. A descrição da preparação fatia, intracelulares emparelhadas gravações usando eletrodos em ponto e subsequentes procedimentos histológicos utilizados em nosso laboratório têm sido relatado anteriormente28. Embora o protocolo aplica-se às células intracelular repleta de biocytin em fatias grossas de 450-500 μm, o mesmo protocolo pode ser usado após gravações de células inteiras. No entanto, o uso das mais finas fatias resultará em menos completas reconstruções das células.
Todos os procedimentos utilizados ao longo deste estudo foram realizados de acordo com os regulamentos da British Home Office no que respeita a lei de procedimentos científicos Animal 1986.
1. determinação da ligação da proteína ou proteína conteúdo de interneurônios e visualização de Biocytin seguintes gravações eletrofisiológicas e enchimento de Biocytin de cálcio
Nota: No final das gravações eletrofisiológicos, que contêm células cheias de biocytin fatias são fixos durante a noite antes de procedimentos histológicos. A solução fixador será substituída com uma simples mudança de tampão de fosfato 0,1 M na manhã seguinte, se o resto do procedimento é realizado em outro dia, a fim de evitar danos aos tecidos. A solução de fixação (paraformaldeído 4%, solução de ácido pícrico 0,2% saturada, solução de glutaraldeído 0.025% em tampão de fosfato 0,1 M (PB)) deve ser feita fresca no dia das gravações para obter melhores resultados.
2. 3D reconstruções Neuronal
Nota: O software de Neurolucida é usado. Instruções fornecidas abaixo aplicam-se somente a um sistema de reconstrução de neurônio específico (Tabela de materiais). As seções obtidas a partir do corte são comparadas antes as reconstruções usando um microscópio.
3. resolução de problemas
Neurônios no hipocampo CA2 estavam cheios de biocytin seguindo eletrofisiológicas gravações (figuras 1Ac, Ad e 1Bc, Bd). As fatias foram corrigidas durante a noite, após as gravações e a neuroquímica e caracterização morfológica de neurônios foram revelados seguindo o protocolo descrito aqui.
A proteína de ligação de cálcio ou teor de proteínas dos interneurônios preenchidos foi determinada por incubar as fatias primeiro com os anticorpos primários e, em seguida, com fluorescente etiquetados anticorpos secundários. As características de disparo dos interneurônios durante as gravações irão ditar a escolha de anticorpos primários usados. Avidina-AMCA foi usado para visualizar o interneurônio cheio de biocytin e isotiocianato de fluoresceína anti-rato (FITC) e de cabra anticoelho vermelho Texas (TR) foram usado para caracterizar a neuroquímica interneuronal (Figura 1Bb).
Após a visualização de fluorescência, utilizou-se um protocolo HRP para revelar o biocytin (Figura 1Ab). Bem anatomia detalhada do CA2 interneurônios então foi desenhada em 3D usando um software de reconstrução do neurônio (Figura 2 e Figura 3a). Um vídeo de uma reconstrução 3D de uma célula de cesta gravado e preenchido CA2 é exibido no vídeo. Neuronais reconstruções foram consideradas como concluída se ambos os mandris dendríticas e axonal foram confinados a profundidade da fatia 450-500 μm. Pobre arbor axonal coloração foi avaliada pela presença de ramos truncados com um final aberto no topo ou no fundo da fatia, ou por uma mancha que foi limitada para o segmento inicial do axônio e ramos muito proximais. A Figura 4 representa os exemplos de uma boa e uma má HRP coloração seguir biocytin visualização.
Análise morfométrica de reconstruções 3D (Figura 3) pode ser realizada para demonstrar a complexidade do ramo, área de superfície de soma e a área de superfície e volume dos mandris dendríticas e axonal.

Figura 1 : Neuronais reconstruções de dois tipos de células de cesta gravado e preenchido na região CA2 hippocampal e correlacionaram eletrofisiológicos dados obtidos após as gravações intracelulares em vitro. Esta figura foi modificada em anteriores estudos23,24. Então Stratum Oriens, SP estrato Pyramidale, SR Stratum Radiatum, SLM estrato Lacunosum Moleculare. (A) Aa: reconstrução de uma célula de cesta de CA2 com restrito da árvore dendrítica e axonal usando um tubo de desenho (1000 X). Os dendritos são em preto, e o axônio é em vermelho. AB: Imagem da célula de cesto cheio de biocytin, seguindo o protocolo de avidina-HRP descrito aqui. AC: Traço representativo de respostas tensão hiperpolarização e despolarizantes injeção atual de uma célula de cesta de CA2 com restrito da árvore dendrítica e axonal. Anúncio: Exemplo de uma pirâmide de CA2 para restringir ligações de celular cesta arbor gravado usando eletrodos afiados. Potencial pós-sináptico excitatório composto (EPSP) médias mostram trem breve depressão aparente durante respostas para trens de três pontas. (B) Ba: reconstrução 2D de uma célula de cesta de CA2 com mandris dendríticas e axonal larga usando um tubo de desenho (1000 X). A árvore dendrítica desta célula de cesta (em preto) estendida radialmente por meio de todas as camadas da região CA2 e horizontalmente em SO e SP das regiões CA2 e CA3. Um dendrito horizontal também atingiu a região CA1. O axônio (em vermelho) estendido às regiões CA3 e CA1. BB: A biocytin-cheia (AMCA coloração) célula cesta foi PV-immunopositive (coloração de FITC) e CB-immunonegative (coloração vermelho-Texas). BC: Traço representativo de respostas tensão hiperpolarização e despolarizantes injeção atual de uma célula de cesta de CA2 com largura dendrítica e axonal arbor. BD: Composto EPSP médias mostram breve trem facilitação aparente durante respostas para trens de três pontas. Exemplos de outros tipos de interneurônios gravados em CA2 podem ser encontrados em anteriores estudos25,30. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 2 : Reconstrução 3D corpo celular. (A) rastreamento 3D do corpo celular. Vista de contornos diferentes rastreados em posições diferentes z enquanto centrando-se através do corpo celular. (B) vista 3D de contornos diferentes. (C) vista 3D do corpo celular em um ângulo diferente. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 3 : Análises de morfometria das reconstruções 3D de neuronais. (A) reconstrução 3D de uma célula de cesta CA2 arbor estreitas. Cada ramificação dendrítica é representada por uma cor (verde, azul, vermelho e rosa) e axônio é em azul claro. (B) dendrograma da célula cesta que representa o número de ramificações dendríticas e o comprimento de cada segmento contido em esferas concêntricas com o soma e a 100 μm intervalos do soma. As cores sobre a dendrograma correspondem dos dendritos na. (C) exemplo de Análise morfométrica realizada em células piramidais de CA2 (adaptadas de um anterior estudo23). O número de ramificações dendríticas foi plotado contra a distância entre a soma das células piramidais CA2. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 4 : Exemplos de bom (A) e pobre (B) HRP coloração. (A) Biocytin recuperação revelou um interneurônio muito bem preenchido em CA2. O corpo celular (CB) é límpdo e tem contornos claros. Os dendritos são frisados e exibido algumas espinhas (representadas por estrelas vermelhas). A arbor axonal (A) é densa e apresenta pequenas boutons. (B) exemplo de um pobre dendrítica e axonal coloração de 2 células piramidais em CA2. A coloração de CB é fraca com nenhum esquema claro. Coloração pobre é frequentemente associada com gravações eletrofisiológicas mais curtas, resultando na presença de muito poucos ramos biocytin-cheia. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Vídeo 1: Reconstrução neuronal 3D de uma célula de cesta de CA2 com arbor dendrítica restrita (também referida como célula de cesto estreito arbor CA2) com sua soma no estrato pyramidale, dendrites, abrangendo todas as camadas e axônio em CA2 estrato pyramidale e estrato adjacentes oriens e radiatum. Muito poucos ramos chegaram a proximal CA3 estrato oriens e CA3 estrato pyramidale. Esta célula foi preenchida com biocytin após gravações eletrofisiológicas e seções foram processadas com avidina-HRP seguindo o protocolo descrito aqui. Devido ao corte, apenas o axônio dentro da profundidade da fatia foi recuperado, embora os dendritos estão intactos. Dendritos são em rosa escuro e axônio em branco. Limites de camada e região foram adicionados no início do vídeo. Reconstrução 3D por Georgia Economides-3D de vídeo por Svenja Falk. O vídeo foi gravado com um software de reconstrução do neurônio, como indicado no passo 2.17 e editado com um software de edição de vídeo. Link para o vídeo:30. Clique aqui para baixar este vídeo.
| Soluções utilizadas | Composição/instruções |
| Solução de fixação | paraformaldeído 4%, 0,2% solução saturada de ácido pícrico, solução de glutaraldeído 0.025% em tampão de fosfato 0,1 M (PB) |
| 0,1 M tampão fosfato pH 7,6 | Adicionar 100 mL de Buffer de 1 M de fosfato de estoque para 900 mL de água destilada |
| Tampão fosfato salino (PBS) pH 7,4/7.5 | Adicionar 10 mL de tampão de fosfato 0,1 M, 0,2 g de KCl e 8,76 g de NaCl a 990 mL de água destilada |
| Tampão de pH TRIS 7.5 | Dissolva 5,72 g de cloridrato de Tris e 1,66 g de Tris Base em 50 mL de água destilada. Então faça até 1 L com água destilada. |
| Solução tamponada de fixador glutaraldeído e paraformaldeído | paraformaldeído 4%, 0,2% saturada, solução de ácido pícrico, solução de glutaraldeído 0.025% em tampão de fosfato 0,1 M. |
| Solução de ABC | Solução a ser feita pelo menos 30 min antes do uso do kit de ABC. Adicione 1 gota da solução A e 1 gota de solução B a 2,5 mL de PBS. |
| Resina epóxi de Durcupan: | Para fazer 20 potes: 20 g de um componente, 20 g de componente B, 0,6 g de componente C e 0,4 g de componente D - |
| Protege o equilíbrio dos derramamentos, cobrindo a placa com um círculo de papel de filtro. Pese cuidadosamente os reagentes para um copo de tripour nas proporções acima referido. Misture bem, agitando vigorosamente usando duas varas de madeira pelo menos 5 min. A mistura deve tornar-se uma cor marrom escura de densidade uniforme. Coloca o copo no forno a ~ 50 ° C por um período máximo de 10 min para remover todas as bolhas de ar possível. Nota: A resina vai começar a curar, se você deixa o béquer no forno mais 10 min. decantar a resina em potes de plástico ou seringas de 5ml, datá-los e guarde no congelador-20 ° C pronto para uso. |
Tabela 1: Tabela de soluções.
Os autores não têm nada para divulgar.
O protocolo descrito aqui descreve a análise de imunofluorescência, recuperação de biocytin e reconstruções de alta qualidade de hippocampal CA2 interneurônios seguindo o intracelulares gravações eletrofisiológicas in vitro, permitindo neuronal caracterização e anatomia neuronal, finalmente, bem a ser estudado.
Esta pesquisa recebeu financiamento da Novartis Pharma (Basel) e o Conselho de pesquisa médica, atribuído a Prof Alex Thomson, a biotecnologia e biológicas Ciências do Conselho de pesquisa (BBSRC-BB/G008639/1), a sociedade Physiological, União Europeia Horizonte de 2020 programa-quadro de investigação e inovação sob o subsídio específico acordo n. º 720270 (cérebro humano projeto SGA1) e sob o acordo específico Grant n º 785907 (cérebro humano projeto SGA2). Somos extremamente gratos ao Prof Alex Thomson para configurar o protocolo em outras regiões corticais, financiamento e o seu contínuo apoio para este projeto. Contribuições feitas pelo laboratório-Membros, que ajudou a optimização do protocolo de recuperação e reconstruíram CA2 neurônios são reconhecidas com gratidão: Deuchars J. H. Pawelzik, D. I. Hughes, A. P. Bannister, K. Eastlake, H. Trigg, N. A. Botcher.
| Anticorpo Avidin-7-amino-4-metilcumarina-3-ácido acético (Avidin-AMCA) - 20,8 mg/mL | Vector laboratories | A2008 | |
| Biocytin ≥ 98% (TLC) | Sigma | B4261 | |
| 3,5 comprimido de diaminobenzidina (DAB), Para preparar 5 mL | Sigma | D4293 | |
| Resina epóxi Durcupan A | Sigma | 44611 | |
| Resina epóxi Durcupan B | Sigma | 44612 | |
| Resina epóxi Durcupan C | Sigma | 44613 | |
| Resina epóxi Durcupan D | Sigma | 44614 | |
| Etanol, puriss. p.a., absoluto, ≥ 99,8% | Sigma | 32221 | |
| Gelatina | Sigma | 48723 | |
| Solução de glutaraldeído, grau I, 25% em H2O | Sigma | G5882 | |
| Glicerol, ≥ 99% | Sigma | G5516 | |
| Soro de cabra | Sigma | G9023 | |
| Isotiocianato de fluoresceína anti-camundongo de cabra (FITC) - 14,3 mg / mL | Sigma | F2653 | |
| Cabra anti-coelho Texas Red (TR) - 3,3 mg / mL | Invitrogen | T2767 | |
| Peróxido de hidrogênio, solução a 30% | Sigma | H-1009 | |
| Óleo de imersão, viscosidade 1,250 cSt (lit.) | Sigma | I0890 | |
| Cloreto de níquel (NiCl2 . 6H2O) | Sigma | N5756 | |
| Tetróxido de ósmio, para microscopia eletrônica, 4% em H2O | Sigma | 75632 | |
| Paraformaldeído, grau reagente, cristalino | Sigma | P6148 | |
| Ácido pícrico, umedecido com água, ≥ Tampão de fosfato 98% | Sigma | 197378 | |
| 1 M | Sigma | P3619 | |
| Óxido de propileno (C3H6O), 99% | Alfa Aesar | 30765 | |
| Tetrahidroborato de sódio | VWR | 27885.134 | |
| Sacarose | Fisher scientific | S/8600/53 | |
| Cloridrato de Trizma, ≥ 99.0% | Sigma | T5941 | |
| Base Trizma, ≥ 99.9% | Sigma | T6066 | |
| Vectashield Antifade Montagem Média, , índice de refração 1.45 | Vector laboratories | H-1000 | |
| Vectastain Elite ABC HRP kit | Vector laboratories | PK6100 | |
| Equipamento usado | |||
| Vibratome | Agar Scientific | ||
| C4A Pranchetas de alumínio em forma de concha | GA-MA & ASSOCIADOS, INC. | ||
| Microscópio Leica DMR | Leica Microsystems | ||
| X-Cite 120PC Q fonte de luz de fluorescência | Excelitas Technologies | ||
| Câmera de microscópio digital Leica DFC450 | Leica Microsystems | ||
| Caneta de desenho técnico Rapidograph 0.18mm | Centrográfico de Londres | ||
| 0.18 mm ponta | de gráficode Londres Centro de gráficos | ||
| de Londres Caneta de desenho técnico de rapidógrafo 0.25mm | Centrográfico de Londres | ||
| 0,25 mm | Centrográfico | de Londres | |
| Sistema Neurolucida incluindo estação de trabalho para PC, palco, câmera e joystic para controle de palco XYZ | Microbrighfield (MBF) Bioscience | ||
| Neurolucida software versão 2017 | Microbrighfield (MBF) Bioscience | ||
| CorelDRAW graphics Suite X5 | Corel | ||
| Software de edição de vídeo | Frascos de vidroAdobe Premiere Pro | ||
| 14 mL | Fisher scientific |