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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Este protocolo tem como objetivo gerar interneurônios diretamente reprogramados in vivo, usando um sistema viral baseado em AAV no cérebro e um repórter GFP orientado por synapsin FLEX, que permite a identificação celular e análise mais aprofundada in vivo.
Convertendo glia residente no cérebro em neurônios funcionais e subtipo-específicos in vivo fornece um passo em frente para o desenvolvimento de terapias alternativas de reposição celular, criando também ferramentas para estudar o destino da célula in situ. Até à data, foi possível obter neurônios via in vivo reprogramação, mas o fenótipo preciso desses neurônios ou como eles amadurecem não foi analisado em detalhes. Neste protocolo, nós descrevemos uma conversão mais eficiente e uma identificação Cell-specific dos neurônios in vivo reprogramados, usando um sistema viral AAV-baseado do vetor. Também fornecemos um protocolo para avaliação funcional da maturação neuronal das células reprogramadas. Injetando os vetores da aleta-excisão (Flex), contendo os genes reprogramação e do repórter synapsin-conduzidos aos tipos específicos da pilha no cérebro que servem como o alvo para a reprogramação da pilha. Esta técnica permite a fácil identificação de neurônios recém-reprogramados. Os resultados mostram que os neurônios reprogramados obtidos funcionalmente amadurecem ao longo do tempo, recebem contatos sinápticos e mostram Propriedades eletrofisiológicas de diferentes tipos de interneurônios. Usando os fatores de transcrição Ascl1, Lmx1a e Nurr1, a maioria das células reprogramadas tem propriedades de fast-spiking, parvalbumin-contendo interneurônios.
O objetivo geral deste método é converter eficientemente a glia residente cerebral in vivo em neurônios funcionais e subtipo-específicos, como interneurônios expressando parvalbumina. Isto fornece uma etapa para a frente para o desenvolvimento de uma terapia alternativa da recolocação da pilha para doenças de cérebro sem a necessidade para uma fonte de pilha exógena. Ele também cria uma ferramenta para estudar o destino da célula switches in situ.
O cérebro tem apenas uma capacidade limitada para gerar novos neurônios. Conseqüentemente, em doenças neurológicas, há uma necessidade de fontes de pilha exógenas para o reparo do cérebro. Para isso, diferentes fontes de células têm sido submetidas a intensa pesquisa ao longo dos anos, incluindo células do tecido primário, células derivadas da célula-tronco e células reprogramadas1,2,3. A reprogramação direta de células cerebrais residentes em neurônios é uma abordagem recente que poderia fornecer um método atraente para o reparo cerebral, pois usa as próprias células do paciente para gerar novos neurônios dentro do cérebro. Até à data, vários relatórios mostraram in vivo reprogramação através da entrega viral do vetor no cérebro4,5,6,78,9 em diferentes regiões do cérebro, como o córtex, a medula espinhal, o estriado e o midbrain5,10,11, bem como no cérebro intacto e lesionado5,8,11,12. Ambos os neurônios inibitórios e excitatórios foram obtidos4,8, mas o fenótipo preciso ou funcionalidade dessas células ainda não foi analisado em detalhes.
Neste protocolo, nós descrevemos uma reprogramação mais eficiente e uma identificação Cell-specific de neurônios in vivo reprogramados. Nós fornecemos um protocolo para a avaliação funcional da maturação neuronal e da caracterização do phenotype baseada na funcionalidade e em traços immunohistochemical.
Nós usamos um vetor CRE-inducible AAV e um repórter de GFP para identificar os neurônios in vivo reprogramados. Essa escolha de vetores virais tem a vantagem de infectar as células de divisão e não-divisoras do cérebro, aumentando o número de células direcionadas, como alternativa ao uso do retrovírus7,8. Um repórter de FLEX (GFP), orientado por synapsin, específico do neurônio, permitiu-nos detectar especificamente os neurônios recém-gerados. Estudos prévios utilizaram promotores específicos do subtipo para a reprogramação in vivo7,9, que também permitem a expressão de reprogramar genes e repórteres em tipos específicos de células. Entretanto, esse método exige a identificação mais adicional de neurônios reprogramados pela análise pós-morte da coexpressão do repórter e dos marcadores neuronal. O uso de um repórter Neuron-específico, tal como esse descrito nisto, permite uma identificação direta. Isto fornece uma prova direta de uma conversão bem sucedida e permite uma identificação viva da pilha que seja exigida para a electrofisiologia da remendo-braçadeira.
Todos os procedimentos experimentais foram realizados ao abrigo da diretiva da União Europeia (2010/63/UE) e aprovados pelo Comité de ética para a utilização de animais de laboratório na Universidade de Lund e no departamento de agricultura sueco (Jordbruksverket). Os camundongos estão alojados em um ciclo de luz/escuridão de 12 h com acesso ad libitum à comida e água.
1. vetores virais
2. injeção de fatores de reprogramação no cérebro
3. gravações electrofisiológicas
4. Immunohistochemistry, Stereology, e quantificação
Nota: Dedique um grupo específico de camundongos para immunohistochemistry, porque as seções do tecido usadas para a electrofisiologia não são ideais para immunohistochemistry.
A injeção de vetores de AAV é usada para reprogramar com sucesso pilhas NG2 do glia do residente nos neurônios no estriado do rato de NG2-CRE (Figura 1a). Para direcionar especificamente NG2 glia, os vetores FLEX com genes de reprogramação/repórter, são inseridos em uma direção antisense e ladeados por dois pares de sites antiparalelos, heterotípicos loxP (Figura 1b). Cada um dos três genes de reprogramação (Ascl1, Lmx1a e Nurr1) é colocado o controle do promotor CBA onipresente em vetores individuais. A fim certificar-se que a expressão de GFP é restrita aos neurônios reprogramados que originam de uma pilha CRE-expressando, GFP está coloc o controle do promotor do sinapsina neurônio-específico, (também em um vetor do Flex).
O uso da combinação de reprogramação e de construções de repórter permite a geração de neurônios GFP-positivos no estriado do rato (Figura 1C, C '). O uso do constructo repórter sem a presença de genes de reprogramação não produz neurônios GFP-positivos (Figura 1D).
Os neurônios reprogramados que são biocitin-preenchidos são visíveis após a imuno-coloração post-mortem (Figura 2a). Se a conversão for bem-sucedida, deve haver extensa morfologia neuronal. As gravações eletrofisiológicas de neurônios reprogramados demonstram presença de conexões funcionais pós-sinápticas com medidas espontâneas de atividade (Figura 2b, C). Isso pode ser bloqueado com um bloqueador de gabaérgica ou glutamatérgico ionotrópico (Picrotoxina ou CNQX), sugerindo entrada sináptica excitatória e inibidora para os neurônios reprogramados. A ocorrência de atividade espontânea aumenta com o tempo pós-injeção viral (Figura 2D), indicando uma maturação gradual.
Os potenciais de ação atuais-induzidos estão atuais em neurônios funcionais. Os potenciais de ação aumentam em número ao longo do tempo após a conversão (Figura 2e). Isto indica ainda a maturação na função neuronal. Em um Neuron imaturo, a corrente induz qualquer um ou muito poucos potenciais de ação (Figura 2F).
Os padrões de queima de um neurônio é o tipo de célula específico, pois depende de fatores como a morfologia das células e a expressão do canal15. Os padrões gravados nos neurônios reprogramados in vivo podem ser distinguidos em grupos e comparados com os subtipos neuronais endógenos, por exemplo, interneurônios de cravamento rápido (célula tipo B, Figura 3B) ou outros tipos de células (Figura 3a, C, D ). As diferenças eletrofisiológicas observadas podem ser confirmadas pela presença de marcadores de subtipo específicos e coexpressão com GFP (Figura 3E-H). Ao todo, esses dados indicam que os neurônios reprogramados presentes no estriado apresentam propriedades de diferentes tipos de interneurônios, como Parvalbumina, ChAt e NPY, expressando interneurônios, bem como a identidade do neurônio médio estriatal (DARPP32 +) ( Figura 3E -H).

Figura 1: reprogramação in vivo de NG2 glia residente em neurônios. (A) representação esquemática da reprogramação in vivo mediada pelo vírus AAV de NG2 glia estriatal. (B) representação esquemática dos CONSTRUCTOS Flex AAV5 utilizados na reprogramação in vivo, em que a expressão gênica é regulada pela expressão CRE nas células visadas. (C e c ') os neurônios reprogramados in vivo, resultantes da injeção de SYN-GFP + ALN no striatum. (D) ausência de neurônios reprogramados quando nenhum fator de reprogramação é adicionado ao coquetel viral, e somente a construção de repórter é injetada in vivo. Barras de escala = 100 mm (C), 25 mm (C '), 25 mm (D). Por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 2: os neurônios reprogramados in vivo são funcionais e mostram a maturação ao longo do tempo. (A) Neuron reprogramado biocytin-enchido, mostra a morfologia neuronal madura, incluindo espinhas dendríticas. Traços mostra (B) atividade inibitória (gabaérgica) que é bloqueada com Picrotoxina, um antagonista do receptor GABAa e (C) atividade excitatórios que é bloqueada com CNQX, um antagonista do receptor de AMPA. (D) o número de neurônios com atividade pós-sináptica aumenta ao longo do tempo. (E) os neurônios remendado mostram o acendimento repetitivo já em 5 semanas após a injeção (w.p.i.) e continuam a mostrar que em 8 e 12 w.p.i. (F) o potencial de ação atual-induzido e a atividade pós-sináptica de um neurônio imaturo, mostrando poucos sináptica eventos e poucos potenciais de ação em comparação com B e D. barra de escala = 25 mm por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 3: os neurônios reprogramados in vivo apresentam propriedades imuno-histoquímicas e eletrofisiológicas de interneurônios estriatal. (A-D) Os padrões de disparo dos neurônios reprogramados in vivo podem ser de tipos distintos: (a) o tipo a é semelhante ao neurônio spiny médio ENDÓGENO (DARPP32 +); (B) semelhantes aos interneurônios de cravagem rápida (PV +); (C) semelhante a neurônios de cravagem de baixo limiar com caída proeminente (NPY +); (D) neurônios disparando com grande pós-hiperpolarização (chat +). (E-H) Imagens confocais mostrando colocalização de GFP e os marcadores de interneurônio PV (e), ChAT (F), NPY (G) e marcador de neurônio de projeção DARPP32 (H). Todas as barras de escala = 50 mm. por favor clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Os autores não têm nada a revelar.
Este protocolo tem como objetivo gerar interneurônios diretamente reprogramados in vivo, usando um sistema viral baseado em AAV no cérebro e um repórter GFP orientado por synapsin FLEX, que permite a identificação celular e análise mais aprofundada in vivo.
A Marcella Birtele foi financiada pelo programa Horizonte 2020 da União Europeia (2020-MSCA-ITN-2015) no âmbito das redes de formação inovadoras Marie Skłodowska-Curie e da Convenção de subvenção n. º 676408. Daniella Rylander Ottosson foi financiada pelo Conselho de pesquisa Sueco (2017-01234).
| < REAGENTES > FORTE PARA CLONAGEM AAV5 E PREPARAÇÃO > | VETOR VILAR< / strong | ||
| pAAV-CA-FLEX | AddGene | 38042 | |
| Ascl1 | AddGene | 67291 | NM_008553,4 |
| Lmx1a | AddGene | 33013 | NM_0033652,5 |
| Nurr1 | AddGene | 35000 | NM_013613,2 |
| GFP-syn | AddGene | 30456 | |
| LoxP (FLEX) sequência 1 | GATCTccataacttcgtataaagtatcctatac gaagttatcaaaataggaagaccaatgcttc accatcgacccgaattgccaagcatcaccatcg acccataacttcgtataatgtatgctatacgaa gttatactagtcccgggaaggcgaagacgcgga agagctctaga | ||
| LoxP (FLEX) sequências 2 | tactagtataacttcgtataggatactttatac gaagttatcattgggattcttcctattttgatc caagcatcaccatcgaccctctagtccacatct caccatcgacccataacttcgtatagcatacat tatacgaagttatgtccctcgaagaggttcgaa ttcgtttaaacGGTACCCTCGAC | ||
| pDP5 | Fábrica de plasmídeos | PF435 | |
| Fábrica de plasmídeos | pDP6 | PF436 | |
| Solução salina tamponada com fosfato (PBS) | Thermo Fisher Scientific | 10010023 | |
| FBS (soro fetal bovino) | Thermo Fisher Scientific | 10500064 | |
| Penicilina estreptomicina | Thermo Fisher Scientific | 15140122 | |
| DMEM (Dulbecco's Modified Eagle Medium)+ Glutamax | Thermo Fisher Scientific | 61965026 | |
| DPBS (Dulbecco's Phosphate Buffer Saline) | Thermo Fisher Scientific | 14190094 | |
| células HEK293 | Thermo Fisher Scientific | 85120602-1VL | |
| Frascos | BD Falcon | 10078780 | 175 cm2 |
| Tris H-CL | Sigma Aldrich | 10812846001 | Para tampão TE use 10 mM, pH 8,0; para tampão de lise use 50mM, pH 8,5; para tampão IE use 20 mM, pH 8,0; para tampão de eluição use 20 mM, pH 8,0 |
| EDTA | EDTA: Invitrogen | EDTA: AM9260G | Para uso de buffer TE 1 mM EDTA |
| ultrapura | veja Sistema de água ultrapura | ||
| CaCl2 | SigmaAldrich | C5080 | 2.5 M |
| Dulbecco&agudo; s solução salina tamponada com fosfato (DPBS) | Thermo Fisher Scientific | 14190136 | |
| NaCl | Sigma-Aldrich | S3014 | PARA HBS use 140 mM; para tampão de lise use 150 mM; para tampão IE use 15 mM; para tampão de eluição use 250 |
| mM MgCl2 | Sigma-Aldrich | M8266-100G | Para tampão de lise: 1 mM |
| Tubos de vedação de ultracentrífuga | Beckman Coulter | Quick-Seal® Tubo de | Polipropileno |
| OptiPrep™ Gradiente de densidade Médio | Sigma Aldrich | D1556-250ML | |
| seringa de 10 mL-18G agulha | BD | 305064 | |
| Frascos de vidro de laboratório | VWR | ? | |
| Filtro de troca aniônica | PALL MSTG25Q6 de laboratório | Unidade Acrodisc com membrana Mustang Q | |
| Unidade de filtro centrífugo | Dispositivo Merck | Z740210-24EA | Amicon Ultra-4 |
| Kits de isolamento de DNA de plasmídeo livre de endotoxinas | Thermo Fisher Scientific | A33073 | |
| Na2PO4 | Sigma-Aldrich | S7907 | |
| HEPES | Sigma-Aldrich | H7523 | Tubo Falconde 15 mL |
| Thermo Fisher Scientific | Corning 352196 | ||
| Tubo Falcon | Thermo Fisher Scientific | Corning 352070 | |
| Frascos de vidro | Novatech | 30209-1232 | CGGCCTCAGFGAGCGA |
| Primer direto para sequência | de repetição terminal invertida (ITR) | GGAACCCCTAGTGATGGAGTT | |
| Primer reverso para sequência | de repetição terminal invertida (ITR) | CACTCCCTCTCTGCGCGCTCG | |
| 5&agudo; FAM / 3&agudo; Sonda BHQ1 | Jena Bioscience | ||
| filtro de 0,22 mm | Filtro Merck | SLGV004SL | Millex-GV |
| EQUIPMENT AAV5 PREPARAÇÃO DO VETOR VIRAL | |||
| Freezer -20 ° C | |||
| Freezer -80 ° C | |||
| Geladeira +4 ° C | |||
| AAV sala | viral | ||
| Sistema de água ultrapura | Merck | Milli-Q® IQ 7000 | |
| Misturador de vórtice | VWR | 444-0004 | |
| Ultracentrífuga | Beckman Coulter | Beckman Optima LE-80K Ultracentrifuge | |
| Autoclave | Tuttnauer | 2540 EL | |
| Reação em cadeia da polimerase (PCR) | BioRad | C1000 Touch Thermal Cycler | |
| PCR quantitativo (qPCR) | Roche | LightCycler® 480 Sistema | |
| Centrífuga | Thermo Fisher Scientific | Sorvall ST16 | |
| Banho-maria | Thermo Fisher Scientific | TSGP02 | |
| ANIMAL MODEL | |||
| NG2-Cre camundongos | Jackson | NG2-CrexB6129, estoque #008533 | |
| REAGENTES PARA INJEÇÃO DE FATORES DE REPROGRAMAÇÃO NO CÉREBRO | |||
| Water | |||
| Saline | Apoteket AB | 70% | |
| Etanol | Solveco | ||
| Isolfurane | Apoteket AB | Diluir a 1% solução com água morna. | |
| Virkon | Viroderm | 7511 | |
| Pentobarbital | Apoteket AB | P0500000 | i.p. para procedimento terminal na dose de 60 mg/ml. |
| Sacarose | Merck | S0389-500G | |
| Trypan Blu | Thermo Fisher Scientific | 15250061 | |
| Retrobeads | Lumafluor | R170 | |
| Buprenorfina | Apoteket AB | ||
| strong>EQUIPAMENTO PARA INJEÇÃO DE FATORES DE REPROGRAMAÇÃO NO CÉREBRO | da RSG Solingen. | ||
| Tesouras | VWR | 233-1552 | da Biochem. |
| Pinça | VWR | 232-0007 | |
| Pinça | VWR | 232-0120 | |
| Suporte para bisturi | VWR | RSGA106.621 | Número 20. |
| Bisturi | VWR | RSGA106.200 | |
| Estrutura estereotáxica | Stoelting Europe | 51500D | |
| Barras auriculares de rato | Stoelting Europe | 51648 | 5 ul |
| Seringa com agulha amovível | Hamilton Company | 65 | 0,75 diâmetro interior e 1,5 diâmetro exterior. |
| Glass capilaries | Stoelting | 50811 | |
| Extrator capilar de vidro | Sutter company | P-1000 | |
| Broca odontológica | Agnthos AB | 1464 | |
| Barbeador | Agnthos AB | GT420 | |
| Isoflurano Câmara e bomba | Agnthos AB | 8323101 | Seringas de 2 mL |
| Merck | Z118400-30EA | 25G | |
| Agulhas | Merck | Z192414 Adaptador | de rato e rato neonatal Aldrich|
| para estrutura estereotáxica | Stoelting | 51625 | |
| Almofada de aquecimento | Braintree scientific, inc | 53800M | De Covidien 2187. |
| Gaze de algodão | Fisher Scientific | 22-037-902 | |
| Tubo de borracha | Elfa Distrelec | HFT-A-9.5/4.8 PO-X BK 150 | |
| Cotonetes | Fisher Scientific | 18-366-473 | |
| REAGENTES PARA GRAVAÇÕES DE PATCH CLAMP DE CÉLULAS INTEIRAS | |||
| NaCl | Sigma-Aldrich | S3014 | |
| KCl | Sigma-Aldrich | P9333 | |
| NaH2PO4-H2O | Sigma-Aldrich | S9638 | |
| MgCl2-6 H2O | Sigma-Aldrich | M2670 | |
| CaCl2-6 H2O | Sigma-Aldrich | C8106 | |
| MgSO4-7 H2O | Sigma-Aldrich | 230391 | |
| NaHCO3 | Sigma-Aldrich | S5761 | |
| Glicose | Sigma-Aldrich | G7021 | ver Sistema de Água Ultrapura |
| Ultrapura | Prepare 1 ou 2M. | ||
| KOH | Sigma-Aldrich | P5958-500G | |
| K-D-gluconato | Sigma-Aldrich | G4500 Sigma | |
| KCl | Sigma-Aldrich | P9541 | |
| KOH-EGTA (Etilene glicol-bis-N-ácido tetrético) | Sigma-Aldrich | E3889 Ácido Sigma | |
| KOH- Hepes (ácido N-2-hidroxietilpiperazina-N'-2-etanossulfônico) | Sigma-Aldrich | H7523 | |
| NaCl | Sigma-Aldrich | S3014 | |
| Mg2ATP | Sigma-Aldrich | A9187 | |
| Na3GTP | Sigma-Aldrich | G8877 | |
| Biocytin | Sigma-Aldrich | B4261 | |
| Picrotoxina | Merck | P1675 Sigma | |
| CNQX | Merck | C239 Sigma | |
| Ice | |||
| EQUIPMENT FOR WHOLE-CELL PATCH CLAMP RECORDINGS | Pipeta de|||
| vidro borossilicato | Sutter Company | B150-86-10 | |
| Extrator capilar de vidro | Sutter company | P-1000 | |
| Vibratome | Leica | Leica VT1000 S | |
| Banho-maria | Thermo Fisher Scientific | TSGP02 | |
| Clampfit software | Molecular Devices | ||
| Multiclamp software | Molecular Devices | ||
| REAGENTS FOR IMMUNOHISTOCHEMISTRY | Use a uma concentração de 4%. CUIDADO: O PFA é um fixador potente. Evite a ingestão e o contato com a pele. | ||
| Paraformaldeído (PFA) | Merck Millipore | 1040051000 | Uso na concentração de 0,1%. |
| Triton X-100 | Fisher Scientific | 10254640 | Burro.Use na concentração de 1: 400. |
| Soro | Merck Millipore | S30-100ML | Reconstitua o pó em água Milli-Q a 1 mg/mL. Alíquota e loja a -20° C, sensível à luz. Use na concentração de 1: 500. |
| 4′,6-Diamidino-2′-fenilindol dicloridrato (DAPI) | Sigma Aldrich | D9542 | 1: 600 em KPBS-T. |
| estreptavidina- Cy3 | Thermo Fisher Scientific | 434315 | 1:5000, coelho. |
| Anti-GAD65/67 | Abcam | 1:2000, camundongo. | |
| Anti-PV | Sigma | P3088 | 1:200, cabra. |
| Anti-Chat | Merk | AB143 | 1:5000, coelho. |
| Anti-NPY | Immunostar | 22940 | |
| K2HPO4 | Sigma-Aldrich | P3786 | |
| NaCl | Sigma-Aldrich | S3014 | |
| KH2PO4 | Sigma-Aldrich | NIST200B | 1:1000, frango. |
| Anti-GFP | Abcam | ab13970 | |
| Solução de montagem | Merck | 10981 | Meio de montagem de álcool polivinílico com DABCO®, antidesbotamento |
| OCT | Agar Scientific | ||
| Glycerol | Sigma-Aldrich | G9012-100ML | |
| Água | destilada | ||
| Solução anticongelante | Tissue Pro Technology | AFS05-1000N, 1000 mL / ea. | |
| < FORTE>EQUIPAMENTO PARA IMUNO-HISTOQUÍMICA< / forte> | |||
| Microscópio de fluorescência invertida | Leica | DMI6000 B | |
| Microscópio confocal | de | varredura a laser Leica TCS SP8. | |
| Prism | GraphPad | ||
| Micrótomo | Leica | SM2010R |