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Este estudo foi realizado em estrita conformidade com as recomendações do Guia para o Conselho de Revisão Institucional (UCSD) da Universidade da Califórnia em San Diego (UCSD). O IRB #090401 Aprovação foi recebido do Conselho de Revisão Institucional (IRB) da UCSD para coletar amostras cirúrgicas de pacientes para fins de pesquisa. Um consentimento informado foi obtido de cada paciente e um espécime cirúrgico de metástase do câncer de próstata foi obtido a partir do reparo ortopédico de uma fratura patológica no fêmur. Os protocolos animais foram realizados o #S10298 protocolo aprovado pelo Comitê de Assistência e Uso de Animais Institucionais (UcSD) da Universidade da Califórnia em San Diego (UCSD). Células de tecido tumoral mecanicamente e enzimático dissociado foram injetadas intra-femoralmente em Rag2masculino de 6 a 8 semanas-/-;γc-/- camundongos como descrito anteriormente17. O volume do tumor de xenoenxerto foi determinado usando um sistema de imagem de bioluminescência in vivo e medidas de pinça. Após o crescimento do tumor até 2,0 cm (o tamanho máximo permitido aprovado pelo IACUC), o tumor foi colhido para o estabelecimento de organoides 3D.
NOTA: A Figura 1 mostra o fluxo de trabalho para a criação de Organoides 3D e um número de protocolo para cada etapa dos procedimentos experimentais.
1. Processamento de tecidos tumorais derivados do paciente (PDX)
NOTA: Este é um passo inicial para o estabelecimento organoide para um tumor derivado de um modelo de rato xenoenxerto. Este protocolo é adaptado de uma publicação anterior de Drost et al.5 e modificamos as condições da mídia para incluir suplementação soro a mídia organoide.
- Processe o espécime tumoral como descrito abaixo.
- Mince amostras de tumor escaneie amostras de tumor escaneie 1-3 mm3 pedaços de tamanho e digerir as amostras com 10 mL de solução de dissociação celular por 45 min à temperatura ambiente.
- Para interromper a digestão, adicione 20 mL de mídia completa DMEM às amostras.
- Filtre a suspensão através de um filtro de célula de 70 μm. Use uma flange de êmbolo estéril para empurrar qualquer tecido restante na parte superior do filtro celular de 70 μm.
- Centrífuga a 300 x g por 5 min a 4 °C.
- Lave a pelota celular três vezes com mídia completa adDMEM fresca. Combine o volume de mídia para lavagem e resuspensão com o volume de mídia sugerido na Tabela 3. Por exemplo, para uma condição de cultura de placa de poço 24, o volume para a lavagem deve ser de 500 μL.
NOTA: Como mostrado na Tabela 3,o protocolo é aplicável a diferentes condições culturais.
- Determine contagem final de células usando tinantes azuis trypan e um hemocímetro.
- Após a obtenção da contagem de células, suspenda novamente a pelota celular em 80 μL de 2% de FBS em PBS por 2 x 106 células tumorais.
- Adicione 20 μL do Coquetel de Esgotamento celular do rato por 2 x 106 células tumorais. Misture bem e incuba por 15 min a 2-8 °C.
- Ajuste o volume para 500 μL com 2% de FBS em tampão PBS por 2 x 106 células tumorais.
NOTA: Até 1 x 107 células tumorais em 2,5 mL de suspensão celular podem ser processadas em uma coluna de LS.
- Carregue as colunas LS no separador da coluna magnética e coloque um tubo cônico de 15 mL em um rack por baixo para coletar o fluxo-through.
- Enxágüe cada coluna com 3 mL de 2% FBS em tampão PBS. Descarte o tubo cônico com o fluxo de lavagem e substitua por um novo tubo cônico estéril de 15 mL.
- Adicione a suspensão celular (até 2,5 mL de 1 x 107 células tumorais) na coluna. Coletar fluxo-through que será o enriquecido com células tumorais humanas.
- Lave a coluna duas vezes com 1 mL de 2% FBS no buffer PBS.
NOTA: É importante realizar etapas de lavagem assim que a coluna estiver vazia. Além disso, tente evitar formar bolhas de ar.
- Aliquot o volume apropriado de suspensão celular a um tubo de 1,5 mL para a cultura desejada configurada(Tabela 3).
- Centrífuga o tubo de 1,5 mL a 300 x g e 4 °C para 5 min.
- Remova cuidadosamente e descarte o supernatante.
2. Processamento de tecidos tumorais primários pacientes
NOTA: Este é um passo inicial para o estabelecimento organoide.
- Siga toda a etapa 1, exceto o processo de esgotamento das células do camundongo, o que não é necessário para o processamento de tecidos tumorais primários do paciente.
3. Formando uma cúpula redonda anexada na placa
NOTA: Este manuscrito descreve três maneiras de fazer uma cúpula a partir de uma mistura da pelota celular e da membrana do porão (por exemplo, Matrigel) como mostrado na Figura 1 e Figura 2. Nos passos 2-4, as células e a membrana do porão devem ser mantidas no gelo para evitar a solidificação da membrana do porão.
- Resuspender a pelota celular no volume apropriado da membrana do porão (por exemplo, 40 μL) para uma placa de 24 poços configurada(Tabela 3).
- Pipette para cima e para baixo suavemente para garantir que as células sejam resuspensas bem na membrana do porão.
- Pipette o volume apropriado (Tabela 3) da mistura de membrana do porão celular (e opcional 10 μL de mídia completa adDMEM) no centro da placa de cultura do tecido pré-aquecido.
- Inverta a placa e coloque imediatamente a placa de cabeça para baixo na incubadora de cultura celular CO2 situada em 5% CO2, 37 °C para 15 min. Isso impede que as células se acomodem e aderem ao fundo da placa, permitindo que a membrana do porão se solidifique.
- Pipette o volume apropriado (Tabela 3) de médio pré-aquecido contendo 10 μM Y-27632 dicloridor em cada poço.
- Coloque a placa do lado direito dentro da incubadora de cultura celular CO2 (5% CO2, 37 °C).
- Troque a mídia a cada 3-4 dias. Após 5-7 dias, use o meio cultural sem 10 μM Y-27632 dihidrocloreto para manter as culturas.
4. Formando uma cúpula flutuante de uma cúpula redonda anexada na placa
- Após o passo 3.7, desapego a cúpula usando um raspador de celular.
5. Formando contas flutuantes
NOTA: Este protocolo é nomeado como contas flutuantes, uma vez que a mistura de membrana de porão, mídia e organoides parecem contas.
- Corte um pedaço de filme de parafina de 2 polegadas x 4 polegadas.
- Coloque o filme de parafina na parte superior dos divots de um rack vazio de uma caixa de ponta de 1000 μL.
- Pressione suavemente o filme parafina para rastrear os divots usando um dedo indicador enluvado, mas sem quebrar o filme parafina.
- Pulverize a parafina com 70% de etanol e ligue a lâmpada UV no capô da cultura celular para esterilizar o filme de parafina preparado por pelo menos 30 min.
- Prepare uma mistura de células e 20 μL de membrana do porão. A densidade de sementes pode ser de 50.000 - 250.000 células por cúpula.
- Pipeta a mistura de células processadas a partir da etapa 1 ou 2, e 20 μL de membrana do porão no molde do divot formado no filme de parafina preparado.
- Resuspender a pelota celular na membrana do porão e pipeta a suspensão celular na parafina preparada filmada divots.
- Coloque as contas solidificadas e o filme de parafina em uma placa de 6 poços. Uma bem em uma placa de 6 poços pode caber até 5 contas.
- Pipette 3-5 mL de meio pré-aquecido contendo 10 μM Y-27632 dicloridor em cada poço enquanto escova suavemente contas fora do filme parafina.
NOTA: Como volume mínimo, recomenda-se 3 mL. Para um número máximo de contas (N=5) por poço, recomenda-se 5 mL de médio.
- Coloque a placa dentro de uma incubadora co2 (5% CO2, 37 °C).
- Troque a mídia organoide a cada 3-4 dias. Após 5-7 dias, use o meio cultural sem 10 μM Y-27632 dihidrocloreto para manter as culturas.
6. Na costura de imagem de organoides vivo usando microscópio8
NOTA: Certos microscópios são incapazes de alcançar o perímetro externo da placa celular (parede de borda); portanto, sugerimos usar os poços próximos ao perímetro da placa celular quando a costura da imagem.
- Coloque a placa de cultura celular em uma posição ascendente no suporte da placa no microscópio Keyence.
- Coloque a lente no centro da cúpula alvo.
- Configure o processo de costura automática selecionando o número dos quadros. Por exemplo, 3 x 3 ou 5 x 5 podem ser escolhidos para gerar 9 imagens ou 25 imagens no total.
- Pressione o botão de captura para iniciar o processo de imagem.
- Abra o software do visualizador de imagens e carregue um grupo de imagens tiradas pelo passo 4.
- Clique em Costura de Imagem para criar uma imagem costurada de alta resolução.
NOTA: A captura de imagens em série 9 ou 25 pode ser realizada por configuração manual ou automática para focar as células.
7. Processamento organoide para histologia: o método de rotação de agarose
NOTA: Este protocolo é adaptado de uma publicação anterior de Vlachogiannis et al.7. Adicionamos um passo envolvendo a incorporação de agaroses para incorporar com sucesso todas as populações de organoides.
- Remova a mídia existente do poço. Tenha cuidado para não aspirar as cúpulas da membrana do porão.
- Adicione um volume igual (igual ao volume de mídia removido da etapa 1) de solução de recuperação celular e incubar por 60 min a 4 °C.
- Desalojar a cúpula da membrana do porão usando uma pipeta e esmague a cúpula da membrana do porão usando uma ponta de pipet. Colete a solução de cúpula dissociada e recuperação celular em um tubo de 1,5 mL.
- Centrífuga a 300 x g e 4 °C por 5 min.
- Remova o supernatant (solução de recuperação celular). Salve todos os supernatantes em tubos separados até o final, quando a presença de organoides for confirmada na etapa final de peloção.
- Adicione o volume desejado (Tabela 3) de PBS frio e delicadamente pipette para cima e para baixo para perturbar mecanicamente a pelota.
- Centrífuga a 300 x g e 4 °C por 5 min.
- Remova o supernatant (PBS).
- Fixe a pelota em um volume combinado (por exemplo, 500 μL para uma pelota da condição de cultura da placa de poço 24, Tabela 3) de 4% PFA por 60 min em temperatura ambiente.
- Após a fixação, centrífuga sem 300 x g e 4 °C por 5 min.
- Retire o supernatant (PFA).
- Lave com volume combinado (por exemplo, 500 μL para uma pelota da condição de cultura da placa de 24 poços, Tabela 3) de PBS e centrífuga em 300 x g e 4 °C por 5 min.
- Prepare a garose quente (2% agarose na PBS).
NOTA: Aqui, as pelotas de células para seções congeladas podem ser diretamente resuspensas em 200 μL de composto OCT sem mais passos no Protocolo 7.
- Resuspender a pelota de célula em 200 μL de agarose (2% na PBS).
- Imediatamente após a adição de agarose, retire delicadamente a pelota celular da parede do tubo de 1,5 mL usando a agulha de 25 G presa à seringa de 1 mL. Como mostrado na Figura 3,se a pelota celular não estiver fisicamente separada da parede do tubo de 1,5 mL, então há o risco de perder toda ou parte da pelota celular durante o processo de incorporação de agarose.
- Espere até que a agarose de 2% na PBS seja completamente solidificada.
- Desadere o bloco de agarose solidificado do tubo de 1,5 mL usando uma agulha de 25 G presa à seringa de 1 mL.
- Transfira o bloco de agarose separado contendo a pelota celular para um novo tubo de 1,5 mL.
- Encha o tubo com 70% de EtOH e prossiga ainda mais usando o protocolo convencional para desidratação tecidual e incorporação de parafina.
8. Histologia e citoquímica imunofluorescente (IFC) de organoides
- Selecione os slides para histologia ou IFC.
- Antes de início do processo de coloração, descubra onde as células estão localizadas no slide e desenhe um círculo ao redor das células do slide usando um marcador.
- Desenhe o perímetro ao redor da borda ou pensionista do slide e onde os círculos estão localizados no slide em um notebook de laboratório para registrar suas localizações.
- Realizar a coloração desejada.
NOTA: Durante este processo, círculos marcados desaparecem, uma vez que o fabricante regular não é resistente aos produtos químicos. Mesmo alguns marcadores permanentes de histologia podem ser apagados durante o processo de coloração.
- Após o processo de coloração, coloque o slide sobre o desenho no notebook de laboratório para encontrar os locais das células no slide.