Identificar colônias de Campylobacter spp. entre a flora fecal concorrente requer visão aguçada e julgamento considerável. O menor número de colônias que podem ser detectadas pela cultura não foi estudado, embora os espécimes de pacientes tenham sido estimados para abrigar 106-109 UFC/mL16,17. No entanto, as amostras dos pacientes não podem ser utilizadas quantitativamente, pois não há um método independente para estabelecer números bacterianos precisos. Para superar essa limitação, duas medidas simultâneas são feitas com um estoque bacteriano. Um teste é usado para detecção visual de colônias de Campylobacter a partir de diluições seriais das bactérias de estoque em uma matriz fecal, simulando amostras clínicas; o outro é usado analiticamente para quantificar o CFU/mL presente na cultura de estoque bacteriano utilizada para espiar(Figura 2A).
Os limiares de detecção de Campylobacter não serão definidos. Isso é de se esperar porque cada matriz fecal é complexa e única, e o crescimento de bactérias é variável. Um parâmetro-chave para o sucesso é identificar as colônias de tamanho sumido entre a flora fecal concorrente. Uma placa representativa de cultura de fezes cravadas é mostrada na Figura 2C e Figura 2D. A placa de controle negativa sem adição de Campylobacter é importante para ajudar a identificar outras flora fecal. Coloração de gram muitos candidatos também treina o olho para distinguir as colônias brilhantes corretas e a cor rosa intermediária de bactérias gram-negativas manchadas de fúcsina e confirma a morfologia das bactérias nas colônias selecionadas(Figura 2B). Foram realizados sete experimentos independentes, utilizando 5 caldos C. jejuni e 2 C. coli, e deram limiares que se sobrepuseram e se estenderam de 0,3-5 x 106 CFU/mL. Consulte a Tabela 2 para obter dados típicos. Os limites de detecção foram em média 2 x 106 para C. jejuni e 1,2 x 106 UFC/mL para C. coli. Isso indica que a cultura pode provavelmente detectar ~1−2 x 106C. jejuni ou C. coli por grama de espécime fecal em análo específico de Campylobacterpadrão contendo antibióticos usados por muitos laboratórios clínicos. Existem vários ágaros especializados com antibióticos diferentes que podem dar diferentes limiares para detecção de colônias. Os métodos aqui descritos devem incentivar estudos mais quantitativos e comparativos para melhorar a precisão da cultura e ampliar a versatilidade das novas mídias. Por exemplo, 152 colônias foram contadas nas primeiras 10-5 placas e 144 colônias na segunda placa10-5. A média entre as duas placas é de 148 colônias. As placas foram inoculadas com 0,1 mL (100 μL) de 10-5 diluição, que pela Equação 1 equivale a 148 x 106 (14,8 x 107) UFC/mL no estoque de cultura pura. Quando as diluições fecais foram feitas, a cultura foi cravada em piscina fecal negativa a uma proporção de 1:1. Portanto, pela Equação 2, o primeiro ponto (placa "a") na curva fecal corresponde a 14,8 x 107 dividido por 2 e equivale a 7,4 x 107 UFC/mL. Este tubo "a" é usado para fazer 9 diluições adicionais. Na Figura 1,a última diluição com uma colônia grama-negativa visível com morfologia semelhante a Campylobacterestá na placa "g". Isso equivale a 1,1 x 106 UFC/mL para o limiar de cultura fecal de detecção neste exemplo.
Embora a viabilidade sustentada seja fundamental para a precisão da cultura, a retenção da viabilidade do Campylobacter spp. durante o manuseio e envio de espécimes de pacientes para clínicas para laboratórios de referência é problemática. O armazenamento típico é refrigerar espécimes em tubos com tampa comum com exposição ao ar e sem atmosfera especial. Acredita-se que os espécimes em meios de transporte (também conhecidos como amostras preservadas) tenham melhor sobrevida, mas há poucos relatórios que fornecem dados quantitativos18.
A combinação de métodos amostrais analíticos e inventados mostrados acima foi novamente utilizada para obter estimativas de viabilidade e tempo de sobrevivência de C. jejuni em meios de transporte. Um caldo de estoque bacteriano foi usado para preparar dez diluições de amostras duplicadas de duas a 1024 vezes em matriz fecal. O caldo inicial foi encontrado pelas contagens analíticas com concentração de 4,8 x 107 UFC/mL. Nas placas feitas no dia 0, C. jejuni foi detectado (2 dias depois) na placa com a diluição de 32 vezes, equivalente a 1,5 x 106 UFC/mL. No entanto, nas placas feitas após a refrigeração da amostra fecal de Cary Blair por 24 horas, apenas a diluição de duas vezes (equivalente a 2,4 x 107 UFC/mL) cresceu colônias visíveis. Nenhuma perda adicional de viabilidade foi observada até 96 horas, quando o estudo foi interrompido. Essa perda de viabilidade equivale a 16 vezes (94%) perda de organismos culturais em menos de 24 horas e indica que, mesmo com refrigeração, fezes no meio Cary Blair com menos de 107 UFC/mL C. jejuni podem ser perdidos pela cultura.
Em contraste com os resultados da cultura, o EIA detectou a presença de C. jejuni na diluição de 256 vezes no ponto de tempo inicial e durante o período de teste de 4 dias. O limiar de detecção de C. jejuni para este EIA utilizando amostras fecais cravadas é de 8,4 x 104 UFC/mL. Este limiar está abaixo do da cultura fecal e permite uma detecção mais sensível e estável de C. jejuni.
Para testar a capacidade da cultura de detectar Campylobacter spp. em um ambiente clínico real, 1.552 amostras de fezes clínicas foram caracterizadas por 6 procedimentos: cultura fecal, um novo imunoensaio para Campylobacter spp., e 4 métodos moleculares. Todas as amostras foram coletadas prospectivamente e inicialmente classificadas pela cultura convencional em 3 laboratórios nos Estados Unidos, e depois cruzadas pelo EIA. Quaisquer espécimes culturais positivos ou EIA/cultura-discrepante foram então examinados pelos métodos moleculares12. Os espécimes foram atribuídos um status verdadeiro-positivo ou verdadeiro-negativo com base nos resultados dos 5 métodos não culturais. Os 5 métodos não culturais mostraram total concordância em todos os 48 espécimes positivos e discrepantes, enquanto a cultura identificou erroneamente 14 (28%). Os espécimes que foram incorretamente identificados pela cultura incluíram 13 amostras falsas negativas e 1 falsa amostra positiva.

Figura 1: Esquema para preparação simultânea de amostras fecais analíticas e cravadas. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 2: Identificação de colônias C. jejuni de culturas puras e fecais. (A)Fotografia de colônias C. jejuni de cultura bacteriana pura após 72 horas de incubação. (B) Mancha grama de C. jejuni de cultura bacteriana pura, ampliação 400x de imersão de óleo. (C) Fotografia de C. jejuni-cultura fecal positiva cravada após 48h de incubação. (D) Área ampliada em caixa em (C), ampliação de 10x. As setas brancas indicam o tamanho do ponto de pino gram-negativo c. jejuni colônias. A ponta da seta preta indica uma colônia ligeiramente maior, gram-positiva, e não C. jejuni. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
| Culturas | OD600 @ T0 | OD600 @ T Final1 | Final CFU/mL |
| C. jejuni | 0.146 | 0.321 | 1.28 x 107
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| C. coli | 0.245 | 0.508 | 4,50 x 108
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Tabela 1: Crescimento típico e CFU/mL dos estoques C. jejuni e C. coli. 1C. a cultura jejuni foi interrompida após 48h de incubação. A cultura c. coli foi interrompida após 54 h de incubação.
| Tubo de diluição para amostra fecal cravada | Número de colônias semelhantes a Campylobacter | Número de colônias gram-negativas1 | Cultura positiva? | CFU/mL calculado de amostra cravada |
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C. jejuni (1,28 x 108 ações de UFC/mL) | (2 vezes) a | Densa | dia2
| Sim | 6.40 x 107
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| (4 vezes) b | 20+ | Nd | Sim | 3.20 x 107
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| (8 vezes) c | 4-10 | Nd | Sim | 1,60 x 107
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| (16 vezes) d | Nd | Sim | 8,00 x 106
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| (32 vezes) e | Nd | Sim | 4,00 x 106
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| (64 vezes) f | 1-3 | 1 de 2 | Sim | 2,00 x 106
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| (128 vezes) g | 2 de 3 | Sim | 1,00 x 106
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3(256 vezes) h
| 1 de 2 | Sim | 5,00 x 105
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| (512 vezes) i | 0 de 1 | Não | 2,50 x 105
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| (1024 vezes) j | 0 | Nd | Não | Nfp |
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C. coli (4,50 x 108 estoque de UFC/mL) | (2 vezes) a | Densa | Nd | Sim | 2.25 x 108
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| (4 vezes) b | Nd | Sim | 1.13 x 108
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| (8 vezes) c | Mais de 50 anos | Nd | Sim | 5.63 x 107
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| (16 vezes) d | 30+ | Nd | Sim | 2,81 x 107
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| (32 vezes) e | 10+ | Nd | Sim | 1.41 x 107
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| (64 vezes) f | 3-8 | Nd | Sim | 7.03 x 106
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| (128 vezes) g | Nd | Sim | 3,52 x 106
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3(256 vezes) h
| 1-3 | 1 de 3 | Sim | 1,76 x 106
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| (512 vezes) i | 0 de 1 | Não | 8.79 x 105
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| (1024 vezes) j | 0 | Nd | Não | Nfp |
Tabela 2: Números típicos de colônias em placas de amostras fecais cravadas. 1 Gramas colônias negativas entre colônias semelhantes a Campylobacter, 2nd = não determinadas, 3Dados em negrito indicam a última diluição positiva.
| Espécie | Alvo genético |
| C. jejuni | hipO |
| C. coli | cadF |
| C. upsaliensis | cpn60 |
| Lari | cpn60 |
| C. helveticus | cpn60 |
| C. feto | cpn60 |
| C. hyointestinalis | cpn60 |
| C. concisus | cpn60 |
Tabela 3: Genes úteis para detecção de espécies individuais de Campylobacter qPCR.