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Research Article
Adrianna Kolberg1, Christiane Wenzel1, Thorsten Hugel1,3, Markus Gallei2, Bizan N. Balzer1,3
1Institute of Physical Chemistry,Albert-Ludwigs-Universität Freiburg, 2Chair in Polymer Chemistry,Saarland University, 3Cluster of Excellence livMatS at FIT - Freiburg Center for Interactive Materials and Bioinspired Technologies,University of Freiburg
Please note that some of the translations on this page are AI generated. Click here for the English version.
Erratum Notice
Important: There has been an erratum issued for this article. View Erratum Notice
Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
A fixação covalente de moléculas de sondas às pontas de cantilever da microscopia de força atômica (AFM) é uma técnica essencial para a investigação de suas propriedades físicas. Isso nos permite determinar a força de alongamento, a força de dessorção e o comprimento dos polímeros através da espectroscopia de força de molécula única baseada em AFM com alta reprodutibilidade.
A espectroscopia de força única baseada em microscopia de força atômica (AFM) é uma ferramenta ideal para investigar as interações entre um único polímero e superfícies. Para um verdadeiro experimento de molécula única, o apego covalente da molécula da sonda é essencial porque só assim centenas de traços de extensão de força com uma única molécula podem ser obtidas. Muitos traços são necessários para provar que uma única molécula sozinha é sondada. Além disso, a passivação é crucial para evitar interações indesejadas entre a molécula de sonda única e a ponta cantilever AFM, bem como entre a ponta cantilever AFM e a superfície subjacente. O protocolo de funcionalidade aqui apresentado é confiável e pode ser facilmente aplicado a uma variedade de polímeros. Eventos característicos de moléculas simples (isto é, alongamentos e platôs) são detectados nos traços de extensão de força. A partir desses eventos, parâmetros físicos como força de alongamento, força de dessorção e comprimento de dessorção podem ser obtidos. Isso é particularmente importante para a investigação precisa de sistemas de resposta a estímulos no nível de molécula única. Como sistemas exemplares, os sistemas poli(etileno glicol) (PEG),poli(N-isopropylacrylamide) (PNiPAM) e poliestireno (PS) são esticados e desorados do SiOx (para PEG e PNiPAM) e de superfícies monocamadaauto-montadas hidrofóbicas (para PS) em ambiente aquoso.
Desde sua invenção na década de 19801,o microscópio de força atômica (AFM) tornou-se uma das mais importantes técnicas de imagem em ciência natural com resolução espacial sub-nanômetro, resolução da força sub-piconewton e a possibilidade de medição em várias condições de solvente e temperatura2,3,4,5,6,7.
Além da imagem8,9, AFM é usado para realizar espectroscopia de força de molécula única (SMFS) dando uma visão das interações adesivos entre um único polímero e superfícies, propriedades físicas de polímeros únicos e mecanismos de desdobramento de proteínas7,10,11,12,,13,14,15,16. Em um experimento regular de SMFS, a ponta cantilever funcional é trazida em contato com uma superfície para que o polímero na ponta cantilever afsísia aesta superfície. Ao retirar a ponta cantilever da superfície, uma mudança na deflexão do cantilever AFM é convertida em uma força que leva a uma curva de extensão de força4. Parâmetros físicos como força de alongamento, força de dessorção e comprimento de dessorção podem ser determinados como dependentes de diferentes parâmetros, como puxar velocidade, tempo de habitação na superfície, profundidade de recuo na superfície, temperatura, solvente17,,18 e diferentes superfícies como substratos sólidos, filmes de polímeros ou bicamadas lipídicas suportadas19,20,21,22. Além disso, um polímero pode ser sondado em diferentes direções espaciais, investigando assim as propriedades de atrito do polímero23,24,25,26.
A fixação covalente do polímero investigado a uma ponta cantilever da AFM é essencial para tais estudos. Assim, um alto rendimento de eventos de molécula única com um e o mesmo polímero ligado a uma ponta cantilever AFM evita qualquer viés dos resultados devido à calibração da constante de mola do Cantilever AFM27,28, diferentes pontos de fixação29 ou polímeros variados (com diferentes comprimentos de contorno) como no caso de experimentos de nanopesca30,31,32. Além disso, as interações com outros polímeros, bem como efeitos de média, podem ser amplamente evitadas18,28. Para a fixação covalente de um polímero à ponta cantilever AFM, diferentes tipos de modificações químicas podem ser aplicadas, muitas das quais são resumidas no livro por Hermanson33. As reações de ligação baseadas em amina e tiol, bem como a química de cliques representam os métodos mais utilizados na funcionalidade da ponta cantilever AFM34,,35,,36,,37,,38,,39,,40,,41,,42. Becke et al.40 mostram como usar 1-etil-3-(3-dimetilaminopropyl)carbodiimid (EDC)/NHS química para anexar uma proteína a uma ponta cantilever AFM. No entanto, os referidos grupos funcionais tendem a se cruzar, levando a uma perda de funcionalidade43,44. Além disso, os carbodiimides mostram uma tendência à hidrólise rápida na solução43. Os grupos maleimida e tiol são geralmente mais estáveis e não apresentam reações de crosslinking. O protocolo apresentado é uma otimização dos protocolos previamente publicados nos termos das referências35,39.
Aqui, é apresentado um protocolo de funcionalidade confiável que pode ser facilmente ajustado a um grande número de polímeros diferentes, independentemente de propriedades como comprimento de contorno ou hidrofobicidade. Três polímeros diferentes foram escolhidos por exemplo: polietileno glicol hidrofílico (PEG) epoli(N-isopropylacrylamide) (PNiPAM), bem como poliestireno hidrofóbico de massa de alta mola (PS). A fim de fornecer uma capacidade de ligação covalente com uma molécula de ligação apropriada, os três polímeros foram selecionados por apresentarum telechelic thiol moiety como grupo final funcional. A molécula de linker em si é tipicamente um polímero PEG curto com dois locais ativos, um grupo de silano em uma extremidade e um grupo de maleimida na outra extremidade. O primeiro permite um apego covalente à ponta cantilever AFM e o segundo uma reação vinculante com o grupo tiol do polímero de massa de alta molar funcional. Além disso, as moléculas de linker PEG inativas servem como uma camada de passivação para evitar interações indesejadas entre o polímero da sonda e a ponta cantilever AFM, bem como entre a ponta cantilever AFM e a superfície subjacente.
NOTA: Consulte a Figura 1 para obter uma visão geral esquemmática.
1. Configuração do reagente
NOTA: Os polímeros utilizados para este protocolo são: maleimide-polietileno glicol-trietoxisiano (sillane-PEG-mal, 5 kDa), tiol-polietileno glicol-thiol (HS-PEG-SH, 35 kDa), tiol terminou poli(N-isopropylacrylamide) (PNiPAM-SH, 637 kDa) e tiol terminado poliestireno (PS-SH, 1,3 mDa).
2. Configuração do equipamento
NOTA: Use pinças e béquers feitos de aço inoxidável ou vidro. Use pinças invertidas para uma aderência segura (por exemplo, o modelo R3 SA tem uma constante de mola baixa).
3. Funcionalidade da ponta
NOTA: Todas as etapas devem ser realizadas em uma coifa de fumaça para evitar a inalação de vapores orgânicos. Além disso, luvas, jaleco e proteção ocular são necessários. Use luvas de nitríheiro ou látex para evitar contaminação. Use luvas resistentes a solventes quando usar tolueno. Todas as etapas, a menos que especificadas em contrário, são feitas na RT. Use equipamentos e luvas frescos para cada passo para evitar uma possível contaminação cruzada.
4. Preparação da superfície
5. Aquisição de dados
NOTA: Todas as medições aqui apresentadas foram realizadas em água ultrapura com um Cypher ES AFM utilizando um estágio de amostra de aquecimento e resfriamento para variação de temperatura. Geralmente, todos os AFMs que fornecem a capacidade de medir em líquidos podem ser usados.
6. Avaliação de dados
NOTA: Para avaliação de dados, foi utilizado um software personalizado baseado em Igor Pro para a execução das seguintes etapas.
Os exemplos a seguir mostram resultados de alongamento de molécula única e dessorção dos polímeros PEG, PNiPAM e PS. Todas as pontas cantilever da AFM foram funcionalizadas com o protocolo acima informado. PEG e PNiPAM foram medidos em SiOx com variação de temperatura. Para uma discussão detalhada das curvas de alongamento dependentes da temperatura resultantes para PEG e PNiPAM, consulte Kolberg et al.18 Um motivo diferente de extensão de força é um platô de força constante (por exemplo, quando desordenar ps de monocamadas auto-montadas de metil a metil a bala de alcanque em ouro (SAM) na água4,27,39,51).
Exemplo 1: Alongamento do PEG e PNiPAM na água
O comportamento de alongamento dependente da temperatura na água foi medido usando polímeros PNiPAM e PEG univalentemente ligados a uma ponta cantilever AFM em uma extremidade e fisisorados em uma superfície SiOx na outra extremidade. Após os experimentos de calibração e controle limpo (menos de 2% das curvas de extensão de força mostram eventos de molécula única), pelo menos dois mapas de força foram registrados para cada cantilever AFM. O experimento dependente da temperatura foi realizado registrando pelo menos um mapa de força a cada temperatura. Quando apenas alguns eventos de alongamento apareceram, o respectivo cantilever AFM foi descartado e o próximo cantilever AFM do chip foi tomado (geralmente na ordem C, B, D e E de MLCT-Bio-DC). Para os dados exemplares do PEG, observou-se um único evento de alongamento em 95 das 500 curvas de extensão de força medidas (19%). Para o PNiPAM, 252 das 600 curvas de extensão de força apresentaram um padrão de alongamento (42%). Para uma melhor comparação das curvas de extensão de força, foi gerada uma única curva mestre para cada temperatura. Para isso, foram escolhidas apenas aquelas curvas com evento de alongamento a pelo menos 500 pN, onde as flutuações conformacionais e os efeitos solventes são insignificantes,52. O número final de trechos levados em conta foi 3 a 278 K, 7 em 298 K e 4 em 318 K para PEG e 4 em 278 K, 3 a 298 K e 3 a 318 K para PNiPAM18.
O procedimento para a geração de curvas-mestre é dado na Figura 3. As curvas de extensão de força escolhidas (Figura 3A) são redimensionadas para um comprimento L0 (extensão a uma força de 500 pN), ver Figura 3B. O pico de adesão mostra uma grande variação de adesão inespecífica entre a superfície e a ponta cantilever AFM, mas não influencia o comportamento de alongamento do polímero. Após a fusão das curvas de extensão de força redimensionadas, elas são mediadas por uma suavização binominal conforme apresentado na Figura 3C. Para isso, um filtro gaussiano convolve os dados com coeficientes normalizados derivados do triângulo de Pascal em um nível igual ao parâmetro de suavização 2053. Finalmente, uma curva mestre é obtida para cada temperatura, conforme dada na Figura 3D. O zoom-in mostra a faixa onde o efeito de temperatura no comportamento de extensão de força é mais pronunciado.
Uma comparação do comportamento de temperatura de PEG (A) e PNiPAM (B) pode ser encontrada na Figura 4. Para peg foi observada uma diminuição da força de alongamento com aumento da temperatura. Observou-se um aumento de aproximadamente 5% da extensão redimensionada a 100 pN ao aumentar a temperatura de 278 para 318 K. Para o PNiPAM, uma mudança dependente da temperatura oposta poderia ser revelada. Observou-se uma diminuição de aproximadamente 1% da extensão redimensionada a 100 pN quando a temperatura foi aumentada de 278 para 328 K. Além disso, a energia livre de alongamento poderia ser obtida a partir das curvas mestres de extensão de força, determinando a área a curva para qualquer valor de força. Isso poderia ser usado para extrair contribuições energéticas e entrópicas da energia livre de alongamento com a ajuda de simulações de dinâmica molecular (DM)18.
Exemplo 2: Desorção de PS de uma superfície SAM na água
A dessorção de PS de uma superfície SAM na água poderia ser usada para determinar a força de dessorção e comprimento e, assim, quantificar a interação hidrofóbica. Após a calibração, pelo menos dois mapas de força foram registrados em dois pontos diferentes da superfície. Quando o acessório de polímero foi bem sucedido, as curvas de extensão de força mostraram platôs de força constante, como característica característica, ver Figura 5A e Figura 5C. A dessorção semelhante ao planalto é observada quando a dinâmica das ligações sondadas é muito mais rápida do que a taxa de puxar da ponta cantilever AFM (quase-equilíbrio). As forças de dessorção de curvas de extensão de força semelhantes ao planalto fornecem energias livres de adesão integrando o traço de extensão de força54. Foram utilizados para determinar interações eletrostáticas, dispersivas e hidrofóbicas, bem como propriedades de atrito de polímeros únicos em superfícies em ambiente líquido2,,4,23,,51,,54,55.
Cada platô de força constante foi equipado com uma curva sigmoidal para determinar a força de dessorção e o comprimento de dessorção, que foram então plotados em histogramas. Os histogramas foram equipados com um gaussiano para extrair o valor máximo e o desvio padrão. Para uma melhor visão geral, os valores de força de dessorção e comprimento foram exibidos juntos em um gráfico de dispersão, conforme dado na Figura 5B e Figura 5D.
Para o poliestireno no SAM na água, as forças de dessorção determinadas correspondem aos valores previamente obtidos19,23. Como o comprimento de dessorção se correlaciona com o comprimento do contorno do polímero51,a distribuição do comprimento de dessorção pode ser usada como prova da ligação covalente do respectivo polímero à ponta cantilever AFM através de seu grupo final funcional. Assim, o comprimento de dessorção serve como impressão digital.
Para mais de um polímero ligado à ponta cantilever AFM, cascatas de platôs (passos discretos) podem ser observadas nas curvas de extensão de força56. Cada platô representa a dessorção de um polímero em uma extensão diferente. O experimento dado nas Figuras 5C e Figura 5D mostrou um caso típico de dois polímeros ligados à ponta cantilever AFM ao mesmo tempo. Ao encaixar a ruptura final, uma distribuição bimodal pôde ser encontrada para o comprimento da dessorção, enquanto a força de dessorção mostrou uma distribuição estreita. Neste caso, o menor comprimento de dessorção poderia ser encontrado em 90% das curvas de extensão de força, seja como um único platô ou como um platô adicional no planalto mais longo, conforme dado na Figura 5C. O maior comprimento de dessorção foi encontrado em 37% das curvas de extensão de força obtidas. Assim, a distribuição do comprimento de dessorção poderia ser usada para determinar o número de polímeros diferentes ligados à ponta cantilever AFM. Em geral, uma distribuição estreita dos valores de comprimento de dessorção é uma boa indicação de que um e o mesmo polímero único foram sondados nas curvas de extensão de força obtidas. Ao mesmo tempo, uma superposição das respectivas forças-extensão pode ser usada para decidir se um e o mesmo polímero único foi medido.
Depois de provar a ligação covalente de um único polímero PS, outros experimentos com este polímero PS podem ser realizados substrato variável (superfície sólida, bem como pelímos de polímero), condições de solvente, temperatura, velocidade de puxar ou tempo de mora.

Figura 1: Visão geral esquemmática do processo de funcionalização da ponta. Inclui a modificação química da ponta cantilever AFM após (1) ativação plasmática (2) silanização/PEGylation e (3) fixação de polímero. Além disso, são mostradas as estruturas químicas detalhadas dos polímeros utilizados, peg, PNiPAM e PS. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 2: Eliminação de interferências nas curvas de extensão de força. (A) Encontre uma curva de extensão de força mostrando um artefato de sinal de força sinusoidal ao longo da extensão, mas não tendo nenhum evento de alongamento de molécula única. (B) Escolha uma curva de extensão de força com um único evento de molécula, que deve ser corrigido a partir do artefato sinusoidal. (C) Sobrepor as curvas para controlar se os artefatos sinusoidais das curvas realmente coincidirem. (D) Subtraindo a curva de extensão de força(A)de (B) obtém-se uma curva de extensão de força com uma linha de base reta. Embora o pico de adesão não possa ser usado para análise suplementar, a curva de extensão de força é agora corrigida para o artefato que leva a valores de força muito mais precisos na região do evento de molécula única (aqui: > 0,2 μm de extensão). Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 3: Determinação das curvas-mestre das curvas de extensão de força do PEG a 298 K. (A) Dados experimentais a 298 K, utilizando 7 curvas de extensão de força. Após a redimensionamento para um comprimento L0 a uma força de 500 pN(B),as curvas de extensão de força podem ser mescladas e médias por suavização binominal obtendo uma curva mestre(C). As curvas redimensionadas são dadas como pontilhadas, enquanto a curva principal é mostrada como uma linha sólida. Finalmente, as curvas-mestre obtidas para diferentes temperaturas podem ser comparadas (D). O zoom-in indica a faixa onde o efeito de temperatura no comportamento de extensão de força é mais pronunciado. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 4: Comparação das curvas-mestre dependentes da temperatura de PNiPAM e PEG. Para peg, observa-se um aumento da extensão redimensionada a 100 pN (faixa de força média) ao aumentar a temperatura (A),enquanto para o PNiPAM é revelada uma mudança de temperatura dependente da temperatura(B). Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 5: Análise das curvas de extensão de força de PS em SAM na água. (A)Curva de extensão de força exemplar (azul) com um ajuste sigmoidal do platô (roxo). Além disso, as setas marcam a força determinada (vermelha) e o comprimento (verde) do planalto. Os valores de força de dessorção e comprimento de dessorção obtidos por ataques sigmoidais são exibidos em um gráfico de dispersão e os histogramas resultantes são equipados com um gaussiano. (B) Os valores de força de dessorção e dessorção determinados são (112 ± 6) pN e (659 ± 7) nm, onde 93% das curvas de extensão de força apresentam tais eventos de planalto único. (C) Curva de extensão de força exemplar (azul) para dois polímeros ligados à ponta cantilever AFM ao mesmo tempo. Aqui, a força de dessorção mostra uma distribuição unimodal com um valor de força médio de (117 ± 5) pN, enquanto uma distribuição bimodal pode ser encontrada para o comprimento de dessorção levando a valores médios de comprimento de (656 ± 9) nm e (1050 ± 16) nm. (D) 90% das curvas de extensão de força amostradas apresentam apenas eventos de planalto único. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Os autores declaram que não têm interesse financeiro concorrente.
A fixação covalente de moléculas de sondas às pontas de cantilever da microscopia de força atômica (AFM) é uma técnica essencial para a investigação de suas propriedades físicas. Isso nos permite determinar a força de alongamento, a força de dessorção e o comprimento dos polímeros através da espectroscopia de força de molécula única baseada em AFM com alta reprodutibilidade.
B.N.B. e T.H. reconhecem o financiamento da Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG, Fundação Alemã de Pesquisa) a Estratégia de Excelência da Alemanha – EXC-2193/1 – 390951807, gefördert durch die Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) im Rahmen der Exzellenzstrategie des Bundes und der Länder – EXC-2193/1 – 390951807, e conceder HU 997/1-13 (projeto nº 420798410). M.G. reconhece apoio parcial no quadro do Projeto LOEWE iNAPO pelo Ministério estadual de Educação Superior, Pesquisa e Artes de Hessen. Agradecemos ao Dr. Wolfgang Bronner e à Dra.
| 1-Dodecanetiol (≥ 98%) | Sigma-Aldrich, EUA | 417364-500ML | Usado para |
| solução de amônia SAM (30%) | Roth, Alemanha | CP17.2 | Usado para limpeza |
| Cypher ES | Asylum Research, uma empresa de instrumentos de Oxford, EUA-AFM | ||
| Etanol (≥ 99,9%) | Roth, Alemanha | PO76.1 | Solvente |
| Wafer de silício revestido de ouro | Instituto Fraunhofer de Física do Estado Sólido Aplicada IAF, | Alemanha-Usado | para SAM |
| Composto Replicante de Alta Resolução | Microset Products Ltd, Reino Unido | 101RF | Agente de ligação |
| Solução de peróxido de hidrogênio | Sigma-Aldrich, EUA | H1009 | Usado para limpeza |
| Igor Pro | Wavemetrics, | EUA-Ambiente | de software |
| Tetra-30-LF-PC | Diener Electronic, Alemanha-Câmara | de plasma | |
| Maleimida-polietilenoglicol-trietoxissilano | Trabalhos criativos PEG, EUA | PHB-1923 | Polímero ligante |
| MLCT-Bio-DC | Bruker, EUA | MLCT-Bio-DC | AFM cantilever |
| Prime CZ-Si wafer, tipo n (Fósforo) TTV < 10 µ m | MicroChemicals, Alemanha | WSA40600250 P1314SNN1 | Bolacha de silício |
| Purelab Chorus 1, 18.2 MΩ cm | Elga LabWater, Alemanha | 10034-540 Fonte de | água ultrapura |
| R3 SA | Vomm GmbH, Alemanha | 5803 Pinças em branco | |
| Poli(N-isopropilacrilamida)Gallei Group com terminação tiol | , Universidade de Saarland, | Alemanha-Polímero | |
| de sonda PNiPAMFonte de polímero de poliestireno terminado com tiol | , Canadá | P40722-SSH | Polímero de sonda PS |
| Tiol-polietilenoglicol-tiol | Creative PEGWorks, EUA | PSB-615 | Polímero de sonda PEG |
| Tolueno (99,99%) | Fisher Chemicals | T324-500 | Solvente |