O mosquito midgut abriga um microbioma altamente dinâmico que afeta o metabolismo hospedeiro, reprodução, aptidão e competência vetorial. Estudos têm sido realizados para investigar o efeito de micróbios intestinais como um todo; no entanto, diferentes micróbios poderiam exercer efeitos distintos em relação ao hospedeiro. Este artigo fornece a metodologia para estudar o efeito de cada micróbio intestinal específico do mosquito e o mecanismo potencial.
Este protocolo contém duas partes. A primeira parte introduz como dissecar o mosquito midgut, isolar colônias de bactérias cultivaveles e identificar espécies de bactérias. A segunda parte fornece o procedimento para gerar mosquitos tratados com antibióticos e reintroduzir uma espécie específica de bactérias.