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Research Article
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Este protocolo experimental descreve o isolamento de CBSCs de amostras de células e tecidos de câncer de mama, bem como os ensaios in vitro e in vivo que podem ser usados para avaliar o fenótipo e a função do CBSC.
As células-tronco do câncer de mama (CBSCs) são células cancerígenas com características hereditárias ou adquiridas semelhantes a células-tronco. Apesar de sua baixa frequência, eles são os principais contribuintes para o início do câncer de mama, recaída, metástase e resistência à terapia. É imperativo entender a biologia das células-tronco do câncer de mama, a fim de identificar novos alvos terapêuticos para tratar o câncer de mama. As células-tronco do câncer de mama são isoladas e caracterizadas com base na expressão de marcadores únicos da superfície celular, como CD44, CD24 e atividade enzimática da aldeído desidrogenase (ALDH). Essas células CD44+CD24-altasde ALDH constituem a população de CBSC e podem ser isoladas por classificação celular ativada por fluorescência (FACS) para estudos funcionais a jusante. Dependendo da questão científica, diferentes métodos in vitro e in vivo podem ser usados para avaliar as características funcionais dos CBSC. Aqui, fornecemos um protocolo experimental detalhado para o isolamento de BCSCs humanos de populações heterogêneas de células de câncer de mama, bem como tecido tumoral primário obtido de pacientes com câncer de mama. Além disso, destacamos ensaios funcionais in vitro e in vivo a jusante, incluindo ensaios de formação de colônias, ensaios de mamosfera, modelos de cultura 3D e ensaios de xenoenxerto tumoral que podem ser usados para avaliar a função do CBSC.
Compreender os mecanismos celulares e moleculares das células-tronco do câncer de mama humano (CBSCs) é crucial para enfrentar os desafios encontrados no tratamento do câncer de mama. O surgimento do conceito de CBSC remonta ao início doséculo 21, onde uma pequena população de células CD44+CD24-/baixo câncer de mama foi capaz de gerar tumores heterogêneos em camundongos 1,2. Posteriormente, observou-se que as células de câncer de mama humano com alta atividade enzimática da aldeído desidrogenase (ALDHalta) também apresentaram propriedades semelhantes às células-tronco3. Esses CBSCs representam uma pequena população de células capazes de auto-renovação e diferenciação, contribuindo para a natureza heterogênea dos tumores em massa 1,2,3. Evidências acumuladas sugerem que alterações nas vias de sinalização evolutivamente conservadas impulsionam a sobrevivência e a manutenção do CBSC 4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14 . Além disso, o microambiente extrínseco celular demonstrou desempenhar um papel fundamental na ditadura de diferentes funções do CBSC15,16,17. Essas vias moleculares e os fatores externos que regulam a função do CBSC contribuem para a recidiva do câncer de mama, metástase18 e desenvolvimento de resistência às terapias 19,20,21, sendo que a existência residual de CBSCs pós-tratamento representa um grande desafio para a sobrevida global de pacientes com câncer de mama 22,23 . A avaliação pré-clínica desses fatores é, portanto, muito importante para identificar terapias direcionadas ao BCSC que possam ser benéficas para alcançar melhores resultados de tratamento e melhorar a sobrevida global em pacientes com câncer de mama.
Vários modelos de linhagem celular de câncer de mama humano in vitro e modelos de xenoenxerto humano in vivo têm sido utilizados para caracterizar BCSCs24,25,26,27,28,29. A capacidade das linhagens celulares de repovoar continuamente após cada passagem sucessiva faz delas um sistema modelo ideal para realizar estudos farmacogenômicos e baseados em ômica. No entanto, as linhagens celulares muitas vezes não conseguem recapitular a heterogeneidade observada em amostras de pacientes. Por isso, é importante complementar os dados da linhagem celular com amostras derivadas do paciente. O isolamento de BCSCs em sua forma mais pura é importante para permitir a caracterização detalhada de BCSCs. Alcançar essa pureza depende da seleção de marcadores fenotípicos que são específicos para BCSCs. Atualmente, o fenótipo de células CD44 + CD24- de alta ALDH é mais comumente usado para distinguir e isolar BCSCs humanos de populações de células de câncer de mama em massa usando a classificaçãode células ativadas por fluorescência (FACS) para máxima pureza1, 3,26. Além disso, as propriedades de CBSCs isolados, como auto-renovação, proliferação e diferenciação, podem ser avaliadas usando técnicas in vitro e in vivo.
Por exemplo, ensaios de formação de colônias in vitro podem ser usados para avaliar a capacidade de uma única célula de se auto-renovar para formar uma colônia de 50 células ou mais na presença de diferentes condições de tratamento30. Os ensaios da mamosfera também podem ser usados para avaliar o potencial de auto-renovação das células de câncer de mama sob condições independentes de ancoragem. Este ensaio mede a capacidade de células individuais de gerar e crescer como esferas (mistura de BCSCs e não-BCSCs) a cada passagem sucessiva em condições de cultura não aderente livre de soro31. Além disso, modelos de cultura 3-Dimensional (3D) podem ser usados para avaliar a função do CBSC, incluindo interações célula-célula e célula-matriz que recapitulam de perto o microambiente in vivo e permitem a investigação da atividade de potenciais terapias direcionadas ao BCSC32. Apesar das diversas aplicações de modelos in vitro, é difícil modelar a complexidade de condições in vivo usando apenas ensaios in vitro. Esse desafio pode ser superado pelo uso de modelos de xenoenxerto de camundongos para avaliar o comportamento do CBSC in vivo. Em particular, tais modelos servem como um sistema ideal para avaliar a metástase do câncer de mama33, investigar as interações com o microambiente durante a progressão da doença 34, imagens in vivo 35 e para prever a toxicidade específica do paciente e a eficácia dos agentes antitumorais34.
Este protocolo fornece uma descrição detalhada para o isolamento de ALDH humanos CD44 + CD24-BCSCselevadosna pureza máxima de populações em massa de células heterogêneas de câncer de mama. Também fornecemos uma descrição detalhada de três técnicas in vitro (ensaio de formação de colônias, ensaio de mamosfera e modelo de cultura 3D) e um ensaio de xenoenxerto tumoral in vivo que pode ser usado para avaliar diferentes funções de CBSCs. Esses métodos seriam apropriados para uso por pesquisadores interessados em isolar e caracterizar BCSCs de linhagens celulares de câncer de mama humano ou células de câncer de mama derivadas de pacientes primários e tecido tumoral para fins de compreensão da biologia do BCSC e / ou investigação de novas terapias direcionadas ao BCSC.
A coleta de amostras cirúrgicas ou de biópsia derivadas de pacientes diretamente de pacientes com câncer de mama consentidas foi realizada sob protocolo de ética humana aprovado pelo conselho de ética institucional. Todos os camundongos usados para gerar modelos de xenoenxerto derivados do paciente foram mantidos e alojados em uma instalação animal aprovada pela instituição. O tecido tumoral de modelos de xenoenxerto derivados de pacientes usando camundongos foi gerado de acordo com o protocolo de ética aprovado pelo comitê institucional de cuidados com animais.
1. Preparação de linhagens celulares
2. Preparação do tecido tumoral do câncer de mama
3. Geração de suspensões unicelulares de células de câncer de mama
4. Geração de suspensão unicelular a partir de amostras de tecido
5. Isolamento de células-tronco de câncer de mama (CBSCs)

Figura 1: Estratégia de bloqueio FACS para isolamento de BCSCs de linhagens celulares de câncer de mama e amostras de tecido. (A) Fluxograma descrevendo o procedimento de isolamento BCSC. (B) Gráficos FACS representativos mostrando a estratégia de classificação usada para isolar BCSCs viáveis e não-BCSCs de um pool heterogêneo de células. As células de câncer de mama humano MDA-MB-231 são marcadas simultaneamente com 7-AAD, CD44-APC, CD24-PE e o substrato ALDH. Os subconjuntos celulares foram isolados usando um protocolo de quatro cores em uma máquina FACS. As células são selecionadas com base na dispersão de luz esperada, depois para singletos e na viabilidade com base na exclusão de 7-AAD. As células são então analisadas quanto à atividade da ALDH e os 20% mais positivos são selecionados como a população ALDH alta, enquanto os 20% inferiores das células com a menor atividade da ALDH foram consideradosALDH baixos. Finalmente, 50% das célulasbaixas de ALDH são selecionadas com base em um fenótipo CD44baixo/-CD24+ , e 50% das célulasaltas de ALDH são selecionadas com base no fenótipo CD44+CD24- . Essa figura foi adaptada de Chu et al.17. Por favor, clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 2: As proporções de CBSCs são variáveis em diferentes linhagens celulares de câncer de mama. Imagem representativa mostrando a proporção diferencial de CBSCs e não-BCSCs em (A) SUM159 e (B) MDA-MD-468 linhas celulares de câncer de mama triplo negativo após rotulagem e classificação, conforme descrito na Figura 1. Por favor, clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
6. Ensaio de formação de colônia
7. Ensaio da mamosfera
8.3D modelo de cultura

Figura 3: Ensaios in vitro para avaliar a função celular do CBSC. Os ensaios in vitro foram realizados conforme descrito nas seções 6.1 a 6.5 (A), 7.1 a 7.4 (B) ou 81. para 8,4 + 8,6 (C). (A) Imagem representativa mostrando as colônias geradas por células de câncer de mama humano MDA-MB-231; (B) Imagens representativas mostrando a formação da mamosfera por MCF7, SUM159 ou MDA-MB-468 linhagens celulares humanas, bem como células de câncer de mama LRCP17 derivadas do paciente. (C) Imagens representativas mostrando as estruturas 3D formadas por células de câncer de mama MCF7 e MDA-MB-231 em modelos de culturas 3D. Por favor, clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
NOTA: Realizar experimentos com animais sob um protocolo de ética animal aprovado pelo comitê institucional de cuidados com animais.
9. Modelo de xenoenxerto in vivo
O protocolo descrito permite o isolamento de BCSCs humanos de uma população heterogênea de células de câncer de mama, seja de linhagens celulares ou de tecido tumoral dissociado. Para qualquer linhagem celular ou amostra de tecido, é crucial gerar uma suspensão celular única uniforme para isolar BCSCs na pureza máxima, pois a contaminação de populações não-BCSC pode resultar em respostas celulares variáveis, especialmente se o objetivo do estudo for avaliar a eficácia de agentes terapêuticos direcionados aos BCSCs. A aplicação de uma estratégia de classificação rigorosa minimizará a presença de não-BCSCs contaminantes e resultará na capacidade de coletar a proporção de células de câncer de mama. com características semelhantes a células-tronco que exibem um fenótipo celular que os distingue da população em massa de células cancerígenas. As células de câncer de mama humano que exibem atividade enzimática de ALDH aumentada, expressam altos níveis do marcador de superfície celular CD44 e expressão baixa/negativa de CD24 têm um fenótipo CD44 + CD24- altode ALDH e podem ser classificadas como BCSCs. A proporção de CBSCs dentro da população em massa pode variar entre linhagens celulares ou pacientes (Figura 2), e muitas vezes depende do estágio da doença, com o câncer de mama mais agressivo geralmente apresentando uma proporção maior de BCSCs26,36,37.
BCSCs isolados podem ser usados para realizar diferentes ensaios in vitro e in vivo , onde seu comportamento e função podem ser comparados com os das populações a granel e/ou não-CBSC. Por exemplo, a capacidade de uma única célula de câncer de mama de se auto-renovar e gerar colônias de 50 células pode ser avaliada por ensaios formadores de colônias (Figura 3A). A capacidade dos BCSCs de se auto-renovarem em condições experimentais independentes de ancoragem pode ser avaliada por ensaios de mamosfera, onde o número variável da esfera, o tamanho e a capacidade de iniciação da esfera podem ser analisados e correlacionados com a presença e a função dos BCSCs (Figura 3B). É importante determinar as densidades celulares de semeadura para diferentes linhagens celulares de câncer de mama ou amostras de tumor de mama para obter resultados ótimos. Isso é particularmente importante ao realizar SLDA, pois densidades celulares mais altas podem levar à agregação celular, resultando em má interpretação da atividade celular.
A cultura de células de câncer de mama em BME permite que os BCSCs formem estruturas 3D que recapitulam em condições in vivo (Figura 3C). A cultura 3D de células de câncer de mama na presença de outros tipos de células microambientais, como fibroblastos, células endoteliais e/ou células imunes, tem a capacidade adicional de investigar o papel do microambiente no crescimento 3D de CBSCs38,39. Os números de células específicas necessários para gerar organoides 3D podem variar dependendo da linhagem celular ou da fonte do tumor do paciente e, portanto, é importante otimizar as condições de cultura e o número de células antes de qualquer experimento em larga escala.
Finalmente, modelos de xenoenxerto in vivo de camundongos podem ser usados para entender as diferenças no crescimento (Figura 4) de auto-renovação, diferenciação e / ou capacidade de início de tumor de BCSCs in vivo em comparação com não-BCSCs ou populações de células a granel. Muitas vezes, as respostas celulares in vitro observadas na presença de fatores exógenos ou agentes terapêuticos não são representativas do cenário in vivo, sugerindo que a observação in vitro deve ser complementada com estudos in vivo sempre que possível. Usando modelos de xenoenxerto in vivo, a heterogeneidade celular e a arquitetura tumoral são preservadas e, portanto, esses modelos podem servir como um sistema que imita de perto o microambiente em pacientes humanos. In vivo A LDA pode ser realizada para determinar a proporção de células iniciadoras de tumores em uma determinada população mista de células cancerígenas (BCSCs ou não-BCSCs)40,41. A gama de diluições celulares utilizadas deve ser otimizada e dependerá da frequência de células iniciadas na população celular de interesse. Idealmente, essas diluições devem incluir doses que resultem em 100% de formação de tumor, até doses celulares sem formação de tumor e uma faixa razoável entre elas. A frequência de células iniciadoras de tumores em amostras primárias pode ser variável e, nos casos em que os tumores de mama têm números muito baixos ou populações heterogêneas de células iniciadoras de tumores, a realização de LDA pode ser particularmentedesafiadora 42. Nesses casos, injetar um número maior de células seria mais apropriado para entender a biologia do câncer de mama.

Figura 4: Ensaios de xenoenxerto in vivo para avaliar a função do CBSC. As células de câncer de mama MDA-MB-231 foram isoladas por FACS, conforme descrito na Figura 1, e injetadas na almofada de gordura mamária torácica direita de camundongos NSG fêmeas, conforme descrito nas seções do protocolo 9.1 a 9.8 (5 x 105 células/camundongo; 4 camundongos/população celular). A cinética de crescimento do tumor primário de mama é mostrada para populações ALDHhiCD44+CD24- (■) versus ALDH low CD44low/-CD24+ (□). Os dados representados como a média ± S.E.M. * = tamanho do tumor significativamente diferente dos respectivos subconjuntos deALDH baixo CD44baixo/- no mesmo ponto de tempo (P < 0,05). Essa figura foi adaptada de Croker et al.26. Por favor, clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Os autores não têm nada a revelar.
Este protocolo experimental descreve o isolamento de CBSCs de amostras de células e tecidos de câncer de mama, bem como os ensaios in vitro e in vivo que podem ser usados para avaliar o fenótipo e a função do CBSC.
Agradecemos aos membros do nosso laboratório por suas discussões úteis e apoio. Nossa pesquisa sobre células-tronco de câncer de mama e o microambiente tumoral é financiada por doações do Instituto de Pesquisa da Sociedade Canadense de Pesquisa do Câncer e do Programa de Câncer de Mama do Departamento de Defesa do Exército dos EUA (Grant # BC160912). V.B. é apoiado por uma Western Postdoctoral Fellowship (Western University), e tanto a A.L.A. quanto a V.B. são apoiadas pela Breast Cancer Society of Canada. C.L. é apoiado por uma Bolsa de Pós-Graduação Vanier Canada do Governo do Canadá.
| 7-Aminoactinomicina D (7AAD) | BD | 51-68981E | sugerido: 0,25 µ g/1x106 células |
| de aldeído desidrogenase (ALDH) | Fisher | A18-1Stemcell Technologies 1700 Vendido comercialmente como parte do kit de ensaio ALDEFLOUR; siga as instruções do fabricante para a preparação do substrato ALDH Extrato de | |
| membrana de porão (BME) | Corning | 354234 | Vendido sob o nome comercial Matrigel |
| Placas de cultura de células: 6 poços | Corning | 877218 | |
| Placas de cultura de células: 60mm | Corning | 353002 | |
| Placas de cultura de células: 96 poços de fixação ultrabaixa | Corning | 3474 | |
| Filtro de células: 40 mícrons | BD | 352340 | |
| Collagen | Stemcell Technologies | 7001 | Preparar diluição de 1:30 de 3 mg/mL de colágeno em PBS |
| Collagenase | Sigma | 11088807001 | 1x |
| Tubos cônicos: 50 mL | Fisher scientific | 05-539-7 | |
| Cristal violeta | Sigma | C6158 | Use solução de cristal violeta a 0,05% em água para coloração |
| Dispase | Stemcell Technologies | 7913 | 5U/mL |
| DMEM:F12 | Gibco | 11330-032 | 1x, Com L-glutamina e 15 mM HEPES |
| DNAse | Sigma | D5052 | 0.1 mg/mL concentração final |
| FBS | Avantor Seradigm Lifescience | 97068-085 | |
| : 5ml | BD | 352063 | tubos de fundo redondo de polipropileno |
| Metanol | Fisher | 84124 | |
| anticorpo anti-CD24 humano | BD | 561646 | R-ficoeritrina e corante de cianina conjugado Clone: ML5 |
| anticorpo anti-CD44 humano | BD | 555479 | R-ficoeritrina conjugado, Clone: G44-26 |
| N, N-dietilaminobenzaldeído (DEAB) | Stemcell Technologies | 1700 | Vendido comercialmente como parte do kit de ensaio ALDEFLOUR; siga as instruções do fabricante Preparação DEAB |
| PBS | Wisent Inc | 311-425-CL | 1x, Sem cálcio e magnésio |
| Tripsina-EDTA | Gibco | 25200-056 | |
| Mammosphere Media Composição | |||
| B27 | Gibco | 17504-44 | 1x |
| bFGF | Sigma | F2006 | 10 ng/mL |
| BSA | Bioshop | ALB003 | 04% |
| DMEM:F12 | Gibco | 11330-032 | 1x, Com L-glutamina e 15 mM HEPES |
| EGF | Sigma | E9644 | 20 ng/mL |
| Insulina | Sigma | 16634 | 5 µ g/mL |
| 3D Composição de Mídia Organoide | |||
| A8301 | Tocris | 2939 | 500 nM |
| B27 | Gibco | 17504-44 | 1x |
| DMEM:F12 | Gibco | 11330-032 | 1x, Com L-glutamina e 15 mM HEPES |
| EGF | Sigma | E9644 | 5 ng/mL |
| FGF10 | Peprotech | 100-26 | 20 ng/mL |
| FGF7 | Peprotech | 100-19 | 5 ng/mL |
| GlutaMax | Invitrogen | 35050-061 | 1x |
| HEPES | Gibco | 15630-080 | 10 mM |
| N-acetilcisteína | Sigma | A9165 | 1,25 mM |
| Neuregulina β 1 | Peprotech | 100-03 | 5 nM |
| Nicotinamida | Sigma | N0636 | 5 mM |
| Noggin | Peprotech | 120-10C | 100 ng/mL |
| R-spondin3 | R& D | 3500 | 250 ng/mL |
| SB202190 | Sigma | S7067 | 500 nM |
| Y-27632 | Tocris | 1254 | 5 µ O |