Artigo de método

Um método simplificado para gerar organoides renais a partir de células-tronco pluripotentes humanas

DOI:

10.3791/62452

13 de abril de 2021

Neste artigo

Resumo

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$$\rightleftharpoonup{xx}$$ $$\longleftharp{xx}$$, $$\longrightharp{xx}$$,

Aqui descrevemos um protocolo para gerar organoides renais a partir de células-tronco pluripotentes humanas (hPSCs). Este protocolo gera organoides renais dentro de duas semanas. Os organoides renais resultantes podem ser cultivados em frascos rotadores em larga escala ou placas de agitação magnética multi-bem para abordagens paralelas de teste de drogas.

Resumo

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Organoides renais gerados a partir de hPSCs forneceram uma fonte ilimitada de tecido renal. Os organoides renais humanos são uma ferramenta inestimável para estudar doenças e lesões renais, desenvolver terapias baseadas em células e testar novas terapêuticas. Para tais aplicações, um grande número de organoides uniformes e ensaios altamente reprodutíveis são necessários. Nós construímos nosso protocolo organoide renal publicado anteriormente para melhorar a saúde geral dos organoides. Este protocolo 3D simples e robusto envolve a formação de corpos embrióides uniformes em meio de componente mínimo contendo lipídios, suplemento de insulina-transferrina-selênio-etanolamina e álcool polivinyl com inibidor GSK3 (CHIR99021) por 3 dias, seguido pela cultura em meio contendo soro de reposição de soro de knock-out (KOSR). Além disso, ensaios agitados permitem a redução da aglomeração dos corpos embrionários e a manutenção de um tamanho uniforme, importante para reduzir a variabilidade entre organoides. No geral, o protocolo fornece um método rápido, eficiente e econômico para gerar grandes quantidades de organoides renais.

Introdução

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Nos últimos anos, uma série de protocolos para diferenciar células-tronco pluripotentes humanas em organoides renais foram desenvolvidos 1,2,3,4,5. Os organoides renais forneceram uma importante ferramenta para auxiliar a pesquisa em novas abordagens de medicina regenerativa, doenças relacionadas ao rim, realizar estudos de toxicidade e desenvolvimento de medicamentos terapêuticos. Apesar de sua ampla aplicabilidade, os organoides renais têm limitações como falta de maturação, capacidade de cultura limitada a longo prazo in vitro e uma escassez de vários tipos de células encontrados no rim humano 6,7,8. Trabalhos recentes têm focado na melhoria do nível de maturação organoide, ampliando os períodos culturais e ampliando a complexidade das populações de células renais, modificando os protocolos existentes 9,10,11,12. Nesta atual iteração do nosso protocolo estabelecido 5,13, modificamos os componentes médios na primeira etapa do protocolo para uma base sem soro complementada com insulina-transferrina-selênio-etanolamina (ITSE), lipídios, álcool polivinyl (E5-ILP) e CHIR99021 (Figura 1). Essas mudanças fornecem um meio de baixa proteína totalmente definido, sem soro, com menos componentes do que a nossa composição média anterior 5,13 e sem fatores adicionais de crescimento. Como resultado, o meio da primeira etapa é menos trabalhoso para preparar do que a nossa versão anteriormente publicada, e pode reduzir a variabilidade em lote paralote 5. Estudos anteriores mostraram que tanto a insulina quanto a transferrina são importantes na cultura livre de soro14,15, no entanto, altos níveis de insulina podem ser inibidores para a diferenciação de mesoderm16. Mantivemos os baixos níveis de insulina conforme previsto no protocolo original, e reduzimos ainda mais os níveis de KOSR (contendo insulina) no segundo estágio do ensaio. De acordo com outros protocolos para formação organoide renal, níveis mais baixos de KOSR são benéficos para manter um equilíbrio entre a proliferação e a diferenciação do tecido renal17. Além disso, reduzimos a concentração de glicose em nosso estágio II médio13.

Nosso método descreve uma configuração para ensaio de suspensão de organoides renais, produzindo até ~1.000 organoides de uma placa de cultura hPSC 100 mm confluente inicial de ~60% conforme descrito na publicação original 5,13. Este protocolo pode ser facilmente dimensionado até começar com várias placas de 100 mm ou 150 mm para aumentar ainda mais o número de organoides.

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Protocolo

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Todos os experimentos utilizando hPSCs foram realizados em conformidade com as diretrizes institucionais, e foram realizados em uma capa de biossegurança classe II com equipamentos de proteção individual adequados. Todos os reagentes são de grau de cultura celular, a menos que seja dito o contrário. Todas as culturas são incubadas a 37 °C, 5% de atmosfera de ar CO2 . Em todas as etapas do ensaio, corpos embrionários ou organoides renais podem ser coletados e fixados ou preparados para análise. As linhas hPSC utilizadas para gerar esses dados foram totalmente caracterizadas e publicadas18.

1. Preparando placas de cultura

NOTA: Aproximadamente 1 h antes de dividir hPSCs, casaco 2 x 100 mm placas de cultura tecidual com um extrato de matriz de membrana de porão qualificado por célula-tronco (BME). Pode-se pré-revestir as placas, selá-las com um filme de parafina e armazenar a 4 °C de acordo com as instruções dos fabricantes.

  1. Prepare placas tratadas com cultura de tecido de 2 x 100 mm (1 para ensaio organoide renal, 1 para manter a linha celular) e um tubo cônico de 15 mL na capa de biossegurança classe II.
  2. Aliquot 8 mL de frio, sem soro Dulbecco's Modified Eagle Medium (DMEM) em um tubo cônico de 15 mL e ~4 mL em cada uma das placas de 100 mm, o suficiente para cobrir o fundo de cada placa com meio.
  3. Tire uma alíquota de 100 μL de BME do congelador (-20 °C). Usando uma pipeta sorológica de 2 mL, pegue ~1 mL de DMEM frio do tubo cônico de 15 mL. Descongele lentamente a alíquota do BME, encanar suavemente para cima e para baixo com o DMEM frio, evitando fazer bolhas.
    NOTA: Não deixe que a alíquota BME fique em temperatura ambiente. Use imediatamente.
  4. Transfira o DMEM/BME descongelado de volta para o tubo cônico de 15 mL com o DMEM restante. Com uma pipeta sorológica de 10 mL, misture suavemente o BME diluído por pipetar para cima e para baixo pelo menos 8 vezes para dispersar uniformemente o BME, evitando fazer bolhas.
  5. Transfira 4 mL do BME diluído em cada placa com DMEM e gire suavemente a placa para que o BME seja distribuído uniformemente. Incubar a placa revestida por 1h em temperatura ambiente ou 30 min a 37 °C.
    NOTA: Use 50 μL de BME por placa de 100 mm. O uso de outras mídias de cultura hPSC e linhas de células pode exigir diferentes concentrações de BME.

2. Passaging hPSCs

NOTA: Para a cultura de rotina do HPSC, as linhas de células de passagem a 70-80% de confluência.

  1. Aspire o meio de cultura da placa hPSC a ser passagem. Adicione ~ 8 mL da solução salina tamponada de fosfato (DPBS) de Dulbecco à placa hPSC e gire suavemente para lavar as células.
  2. Aspire DBPS e adicione 2 mL de reagente de dissociação de células suaves (GCDR) à placa de 100 mm, gota por gota em cima para cobrir as células.
    NOTA: Outros reagentes de dissociação também podem ser usados. Ajuste de acordo.
  3. Incubar à temperatura ambiente por ~6-8 min até que as colônias estejam se rompendo e as células estejam refrativas sob contraste de fase (Figura 2A).
    NOTA: O tempo pode variar entre as linhas de celular. Ajuste de acordo.
  4. Durante a incubação, prepare um tubo cônico de 50 mL. Adicione 16 mL de meio hPSC (8 mL por placa de 100 mm) e adicione o inibidor de quinase associado a Rho (ROCKi) a uma concentração final de 5 μM.
  5. Aspire DMEM das placas revestidas de BME e adicione 8 mL de hPSC médio mais ROCKi a cada placa.
  6. Quando as células estiverem prontas (como descrito no ponto 2.3, Figura 2A), aspire o GCDR e incline a placa ~45° em direção ao experimentador e raspe as células com um levantador de células.
    NOTA: Se as células estiverem se desartching, omitir gcdr aspirando e proceder.
  7. Gire a placa ~90° e raspe novamente para levantar as células restantes. Mantenha a placa ~45° e lave as células para baixo com 3 mL de meio hPSC usando uma pipeta sorológica de 10 mL.
  8. Pipeta suavemente para cima e para baixo para quebrar grandes aglomerados (não mais do que 2-3 vezes) e semear as células na razão apropriada para a linha de interesse celular nas placas preparadas. Coloque a placa com as células da incubadora e mova a placa suavemente em 8 movimentos para distribuir as células uniformemente.
    NOTA: Neste experimento as linhas hPSC foram divididas a uma proporção de 1:5, isso pode variar para outras linhas e condições celulares. Deixe o prato imperturbável durante a noite.
  9. Depois de ~ 24 h, examine as células para fixação. Procure por pequenas colônias individuais anexadas. Aspire o médio gasto e reponha com 8 mL de meio hPSC fresco (sem adicionado ROCKi).
  10. Continue observando e se alimentando diariamente até que as células atinjam ~60% de confluência para iniciar o ensaio organoide renal (geralmente chega de 48 a 72h após a passagem). As colônias serão, idealmente, discretas e não se fundindo (Figura 2B).
    NOTA: É muito importante limitar as células a não mais do que 80% de confluência para manter seu estado de pluripotência. Culturas confluentes, manuseio áspero ou passagens mais altas podem levar a diferenciação espontânea indesejada ou baixa eficiência da formação organoide renal.

3. Dia 0 - Configuração do ensaio organoide renal

  1. Antes de começar, prepare tanto a mídia E5-ILP quanto a Fase II conforme formulações (Tabela 1 e Tabela 2).
    NOTA: A mídia pode ser armazenada por até 14 dias a 4 °C.
  2. Para um ensaio organoide renal (uma placa de cultura de 100 mm é necessária para uma placa de 6 poços), prepare o meio E5-ILP completo em um tubo cônico de 50 mL: 18 mL de E5-ILP suplementado com 8 μ CHIR99021 (14,4 μL), 3,3 μM ROCKi (6 μL), 0,1 mM beta-mercaptoetanol (32,7 μL).
  3. Coloque 2 mL de meio E5-ILP completo em cada poço de uma placa de fixação ultra-baixa de 6 poços.
  4. Lave os hPSCs a ~60 % de confluência (Figura 2B) duas vezes com ~ 8 mL de DPBS. Em seguida, adicione 2 mL de dispase por placa de 100 mm, solte a gota para cobrir as células e incubar por 6 min a 37 °C.
    NOTA: Depois de 6 minutos, as bordas das colônias começarão a se enrolar (Figura 2C, setas vermelhas) enquanto o resto da colônia permanece presa. Se isso não for obtido após 6 minutos, coloque as células de volta na incubadora para mais 30 s. Outras mídias e matriz hPSC podem não ser compatíveis com este tempo. O revestimento BME à base de laminina não é compatível com a despase. Se a BME baseada em laminina for a matriz hPSC padrão, cubra uma das placas da seção 1 com a BME descrita neste método a ser utilizado para o ensaio organoide renal.
  5. Lave células 3x com ~10 mL de DPBS. Aspirar DPBS, em seguida, inclinar a placa ~45° e raspar para baixo com um levantador de células.
    NOTA: A desapase não está desativada, portanto, precisa ser lavada completamente. Não reduza o número de lavagens.
  6. Lave as colônias do topo com 6 mL de meio E5-ILP completo usando uma pipeta sorológica de 10 mL. Pipeta para cima e para baixo suavemente para quebrar quaisquer colônias grandes (2 ou 3 vezes geralmente é suficiente).
  7. Distribua os aglomerados da colônia uniformemente adicionando 1 mL por poço na placa de 6 poços. Coloque a placa em um agitador orbital (configurações: orbital = 30, recíproca = 330°, vibração = 5° - 2 s) que é colocada na incubadora de 37 °C (Figura 2D).
    NOTA: O recurso de vibração é importante para a distribuição adequada dos organoides e para evitar o agrupamento.

4. Dia 2 - Alimentação por meio-médio

NOTA: Dentro das 48 horas, aglomerados de colônias formarão corpos embrionários.

  1. Prepare o meio completo: Para uma placa de 6 poços prepare 12 mL de meio E5-ILP + 8 μM CHIR99021 em um tubo cônico de 15 mL.
    NOTA: Beta-mercaptoethanol e ROCKi não são necessários.
  2. Deixe os corpos embrionários se acomodarem na parte inferior da placa, incline a placa ~45° e depois aspire o meio lentamente a partir da parte superior, deixe ~1 mL por poço.
    NOTA: Corpos embrióides nesta fase se aglomeram rapidamente. Não deixe que eles se contentem com > 5 min.
  3. Adicione 2 mL de meio completo preparado (seção 4.1) por poço. Devolva a placa de volta ao agitador.

5. Dia 3 - Transferência de corpos embrionários para o estágio II médio

  1. Prepare um tubo cônico de 50 mL e DMEM (baixa glicose). Deixe os corpos embrionários se estabelecerem no fundo da placa. Incline a placa ~45° e aspire o meio de cima lentamente, deixe ~1 mL por poço.
  2. Colete todos os corpos embrióides cuidadosamente de cada poço usando uma pipeta sorológica de 10 mL e transfira-os para o tubo cônico de 50 mL.
  3. Lave cada poço para coletar quaisquer corpos embrióides restantes com ~ 1 mL de DMEM (baixa glicose) e adicione-os ao mesmo tubo cônico de 50 mL.
  4. Deixe os corpos embrionários se acomodarem no fundo do tubo, ~5 min. Enquanto estiver esperando, adicione 2 mL de meio estágio II a cada poço da placa de 6 poços. Seive grandes corpos embrióides (>300 μm) usando um coador de células de 200 μm (Figura 2E).
    1. Use um novo tubo cônico de 50 mL e coloque o coador de células de 200 μm em cima. Pipeta todos os corpos embrionários usando uma pipeta sorológica de 10 mL cuidadosamente sobre o coador celular.
    2. Enxágüe o coador celular com um adicional de ~5 mL de DMEM (baixa glicose) para coletar quaisquer corpos embrionários presos no coador celular. Permita que os corpos embrionários se acomodem no fundo do tubo cônico.
  5. Quando os corpos embrionários estiverem assentados, aspire o supernasciente e lave com ~10 mL de DMEM (baixa glicose).
  6. Aspirar DMEM e suspender de re suspendida os corpos embrionários em 6 mL do meio estágio II.
  7. Transfira os corpos embrionários de volta para a placa de fixação 6 bem ultra-baixa, distribuindo-os uniformemente entre os 6 poços.
  8. Realizar meia alteração média, conforme descrito nas etapas 4.2 e 4.3 a cada dois dias.
    NOTA: A partir do dia 3, os corpos embrionários terão uma aparência 'dourada' e lisa e esférica (Figura 2F). A partir do 6º dia, a formação de túbulos em corpos embrióides individuais se tornará aparente, com números crescentes nos dias seguintes atingindo números ideais e crescimento até o dia 14 (Figura 2G,H). Para eliminar a formação de aglomerados ocasionais, ao observar visualmente os organoides renais, ou corpos embrionários muito pequenos sem túbulos, peneirar os <200 e grandes organoides de > 500 μm com uma célula de 500 e 200 μm de coador, conforme descrito nas etapas 5.4.1 e 5.4.2.

6. Transferir para frasco de rotador e alimentação

NOTA: Um frasco rotador pode ser usado a qualquer momento a partir do dia 3 para experimentos que requerem um grande número de organoides. A transferência de rotina de organoides acontece em nosso laboratório entre os dias 6 e 8. Consulte a seção Discussão para obter alternativas se o equipamento não estiver disponível.

  1. Transfira corpos embrionários em um frasco rotador de 125 mL com 45 mL de meio estágio II. Defina a velocidade do agitador magnético a 120 rpm e coloque na incubadora (Figura 2I).
  2. Para alimentar corpos embrionários ou organoides renais, deixe os organoides renais se estabelecerem brevemente no fundo do frasco rotador. Levante a tampa de um braço lateral do frasco e coloque a pipeta aspirante dentro, com a ponta tocando o oposto dentro da parede.
  3. Angule lentamente a pipeta aspirada para baixo e aspire aproximadamente metade do meio. Reabasteca com 20 mL de meio fresco estágio II, tubulando-o através da mesma abertura.

7. Configuração de placa de agitação magnética de 6 poços (6MSP)

NOTA: O formato 6MSP pode ser usado no lugar de frascos rotadores se várias condições precisarem ser testadas. Use o 6MSP para tratamentos compostos ou nefrotoxinas. Isso economiza a quantidade de meio utilizado no segundo estágio, mantendo a disponibilidade de nutrientes através da difusão.

  1. Limpe as barras de agitação magnética oval em um tubo cônico de 50 mL lavando em uma cultura de tecido detergente adequado brevemente (se nunca usado) ou de molho por > 1 h, se usado anteriormente.
  2. Lave brevemente 3x em DPBS estéreis.
  3. Lave 1x por 5 min em 70% de etanol, 1x em DPBS estéreis.
  4. Enxágüe com solução anti-adesão e lave 1x em DPBS estérei e aspire.
  5. Com cuidado, usando fórceps longos estéreis coloque uma barra de agitação magnética em cada poço da placa de 6 poços com corpos embrionários ou organoides renais.
  6. Coloque a placa sobre o 6MSP e defina a velocidade para 120 rpm (Figura 2J). Manter organoides renais com meio meio de alteração conforme seção 4.2 e 4.3.
    NOTA: Para que as barras de agitação magnética se posicionem e comecem a girar, talvez seja necessário primeiro colocar o nível de potência para 100 brevemente, então uma vez que todos estejam girando, abaixem o nível de energia para 25.

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Resultados

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Nesta versão mais recente do nosso protocolo, a diferenciação organoide renal é iniciada em um meio de proteína definido e baixo. Os ensaios são realizados inteiramente em suspensão e contam com a capacidade inata de diferenciação e organização dos HPSCs para o início da tubulogênese. Um único ensaio originário de uma placa de cultura hPSC de 100 mm ~60% confluente produz rotineiramente 500-1.000 organoides renais, como mostrado em nossa publicação anterior5. Devido a um número tão alto de organoi...

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Discussão

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Estudos anteriores mostraram que as etapas iniciais do protocolo são fundamentais para a diferenciação intermediária do mesoderm 5,19,20 e, portanto, é essencial implementar uma rigorosa composição média nesta fase. Remover componentes indefinidos como soro, albumina, híbridomoico livre de proteínas II do primeiro estágio do protocolo pode ajudar a melhorar a eficiência de diferenciação consistente entre os ensaios

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Divulgações

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Os autores não têm nada a revelar.

Agradecimentos

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Esta pesquisa foi financiada pelos Institutos Nacionais de Saúde R01 DK069403, UC2 DK126122 e P30-DK079307 e asan Foundation for Kidney Research Ben J. Lipps Research Fellowship Program to AP.

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Materiais

Lista de materiais utilizados neste artigo
NomeEmpresaNúmero de catálogoComentários
2-MercaptoetanolThermo Fisher21-985-023
Solução de enxágue anti-aderênciaSTEMCELL Technologies7010
CHIR99021STEMCELL Technologies72054Estoque de 10 mM em DMSO
Corning  frascos giratórios descartáveisFisher Scientific07-201-152
Corning Ultra-Low Attachment placas de 6 poçosFisher Scientific07-200-601
Agitadores de baixa velocidade CorningFisher Scientific11-495-03Agitador magnético multiplaca para cultura de frasco giratório
ExibirSTEMCELL Technologies7923Alíquota e congelar
DMEM, baixo teor de glicose, piruvato, sem glutamina, sem vermelho de fenolThermo Fisher11054020
DPBS 1x, sem cálcio, sem magnésioThermo Fisher14-190-250
Barras de Agitação para Ovos / Oval2magPI20106
Excelta Pinças de Uso GeralFisher Scientific17-456-103Mantenha estéril no exaustor de cultura de células
Frasco de Mídia de Uso Único EZBio, 250mLFoxx Life Sciences138-3211-FLSUsado para fazer PVA 10%
Falcon Standard Tissue Culture Plates (100 mm)Thermo Fisher08-772E
Fisherbrand  Pipeta de Aspiração Estéril 2mLFisher Scientific14-955-135
Fisherbrand  Cell Lifters - Cell lifterFisher Scientific08-100-240
Marca Fisher  Rotadores 3D MultifuncionaisFisher Scientific88-861-047Agitador Orbital
Geltrex LDEV-Free Fator de Crescimento Reduzido Matriz de Membrana BasalThermo FisherA1413302BME. Alíquota no gelo e congelar. Outra alternativa de matriz adequada é Matrigel ou Cultrex.
Reagente de Dissociação Celular SuaveSTEMCELL Technologies7174GCDR
GlutaMAX SuplementoThermo Fisher35-050-061L-glutamina.
HEPES (1M)Thermo Fisher15-630-080
Insulina-Transferrina-Selênio-EtanolaminaThermo Fisher51-500-056ITSE
KnockOut  Reposição de Soro - Multi-EspéciesThermo FisherA3181502KOSR. Mistura de lipídios de alíquota e congelamento
1, Quimicamente DefinidaMillipore-SigmaL0288-100ML
MEM Solução de Aminoácidos Não EssenciaisThermo Fisher11140-050
MilliporeSigma Stericup Quick Release-GP Sistema de Filtração a Vácuo Estéril 500mLFisher ScientificS2GPU05RE
MilliporeSigma  Sistema de Filtração a Vácuo Estéril Stericup Quick Release-GP 250mLFisher ScientificS2GPU02RE
MIXcontrol MTP / Variomag TELEcontrol MTP Control Unit2magVMF 90250 U
MIXdrive 6 MTP / Variomag TELEdrive 6 MTP Microplate Stirring Drive2magVMF 406006MSP
MP Biomedicals  7X Solução de LimpezaFisher ScientificMP0976670A4Detergente adequado para cultura de tecidos. Faça uma solução a 5% em água
mTeSR1STEMCELL Technologies85850hPSC medium.TeSR-E8, NutriStem XF e mTeSR Plus medium também foram testados e são alternativas adequadas. 
Nunc 50 mL Cônico, Tubos de Centrífuga EstéreisFisher Scientific12-565-270
Nunc 15mL Tubos de Centrífuga Cônicos EstéreisFisher Scientific12-565-268
Penicilina-EstreptomicinaThermo Fisher15-140-122Alíquota e congelamento
PlasmocinInvivogenant-mptAnti-mycoplasma reagent. Alíquota e congelar
filtro® 200 µ mFisher ScientificNC0776417Cell strainer
pluriStrainer® 500 µ mFisher ScientificNC0822591Cell strainer
Poli(álcool vinílico) 87-90% hidrolisado  (PVA)Millipore-SigmaP8136-250G10% em DPBS mexendo a 98 graus C até dissolver, faça em 138-3211-FLS
Inibidor de ROCK Y-27632 (ROCKi)STEMCELL Technologies72304Estoque de 10 mM em DPBS
Pipetas Sorológicas Descartáveis Estéreis  - 10mLFisher Scientific13-678-11E
- 25mLFisher Scientific13-678-11
Pipeta sorológica descartável estéril - 5 mLFisher Scientific13-678-12D
TeSR-E5STEMCELL Technologies5916Sem soro, meio de base de baixa proteína para E5-ILP
Variomag distriBOX 2 Distribuidor2magVMF 90512Se você usar mais de um MIXdrive
Pipetas Sorológicas Descartáveis Estéreis

Referências

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