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Research Article
Yonatan R. Lewis-Israeli1,2, Brett D. Volmert1,2, Mitchell A. Gabalski1,2, Amanda R. Huang1,2, Aitor Aguirre1,2
1Institute for Quantitative Health Science and Engineering, Division of Developmental and Stem Cell Biology,Michigan State University, 2Department of Biomedical Engineering, College of Engineering,Michigan State University
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Erratum Notice
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Retraction Notice
The article Assisted Selection of Biomarkers by Linear Discriminant Analysis Effect Size (LEfSe) in Microbiome Data (10.3791/61715) has been retracted by the journal upon the authors' request due to a conflict regarding the data and methodology. View Retraction Notice
Aqui, descrevemos um protocolo para criar organoides cardíacos humanos relevantes de desenvolvimento (hHOs) usando eficientemente células-tronco pluripotentes humanas por auto-organização. O protocolo conta com a ativação sequencial de pistas de desenvolvimento e produz tecidos cardíacos humanos altamente complexos e funcionalmente relevantes.
A capacidade de estudar o desenvolvimento cardíaco humano em saúde e doença é altamente limitada pela capacidade de modelar a complexidade do coração humano in vitro. O desenvolvimento de plataformas mais eficientes semelhantes a órgãos que podem modelar fenótipos complexos in vivo , como organoides e órgãos em um chip, aumentará a capacidade de estudar o desenvolvimento cardíaco humano e doenças. Este artigo descreve um protocolo para gerar organoides cardíacos humanos altamente complexos (hHOs) por auto-organização usando células-tronco pluripotentes humanas e ativação de caminhos de desenvolvimento stepwise usando inibidores de pequenas moléculas. Os corpos embrionários (EBs) são gerados em uma placa de 96 poços com fundo redondo, poços de fixação ultra-baixo, facilitando a cultura de suspensão de construções individualizadas.
Os EBs sofrem diferenciação em hHOs por uma estratégia de modulação de sinalização WNT de três etapas, que envolve uma ativação inicial da via WNT para induzir o destino do mesoderm cardíaco, um segundo passo da inibição de Wnt para criar linhagens cardíacas definitivas, e um terceiro passo de ativação wnt para induzir tecidos proepicardiais de órgãos. Essas etapas, realizadas em formato de 96 poços, são altamente eficientes, reprodutíveis e produzem grandes quantidades de organoides por execução. A análise por imagens de imunofluorescência do dia 3 ao dia 11 de diferenciação revela especificações de campo cardíaco de primeiro e segundo e tecidos de alta complexidade dentro dos HHOs no dia 15, incluindo tecido miocárdio com regiões de cardiomiócitos atrial e ventricular, bem como câmaras internas forradas com tecido endocardial. Os organoides também exibem uma intrincada rede vascular em toda a estrutura e um revestimento externo de tecido epicártico. Do ponto de vista funcional, os HHOs batem robustamente e apresentam atividade normal de cálcio, conforme determinado pela imagem ao vivo fluo-4. No geral, este protocolo constitui uma plataforma sólida para estudos in vitro em tecidos cardíacos semelhantes a órgãos humanos.
Os defeitos cardíacos congênitos (CHDs) são o tipo mais comum de defeito congênito em humanos e afetam aproximadamente 1% de todos os nascidos vivos1,2,3. Na maioria das circunstâncias, as razões para os CHDs permanecem desconhecidas. A capacidade de criar modelos de coração humano no laboratório que se assemelham muito ao coração humano em desenvolvimento constitui um passo significativo para estudar diretamente as causas subjacentes dos CHDs em humanos e não em modelos animais substitutos.
O epítome de modelos de tecido cultivados em laboratório são organoides, construções de células 3D que se assemelham a um órgão de interesse na composição celular e função fisiológica. Organoides são frequentemente derivados de células-tronco ou células progenitoras e têm sido usados com sucesso para modelar muitos órgãos como o cérebro4,5, rim6,7, intestino8,9, pulmão10,11, fígado12,13 e pâncreas14,15 , só para citar alguns. Estudos recentes surgiram demonstrando a viabilidade de criar organoides cardíacos auto-montados para estudar o desenvolvimento cardíaco in vitro. Esses modelos incluem o uso de células-tronco embrionárias de camundongos (mESCs) para modelar o desenvolvimento cardíaco precoce16,17 até especificações atrioventriculares18 e células-tronco pluripotentes humanas (hPSCs) para gerar organoides de endoderme de camada plamífica de camada plamícidos 19 e cardiodos de câmara20 com composição celular altamente complexa.
Este artigo apresenta um novo protocolo de modulação WNT de 3 passos para gerar hHOs altamente complexos de forma eficiente e econômica. Organoides são gerados em placas de 96 poços, resultando em um sistema escalável e de alta produtividade que pode ser facilmente automatizado. Este método se baseia na criação de agregados de hPSC e no desencadeamento de etapas de desenvolvimento da cardiogênese, incluindo mesodermia e formação de mesoderm cardíaco, especificação de primeiro e segundo campo cardíaco, formação de órgãos proepicardial e especificação atrioventricular. Após 15 dias de diferenciação, os HHOs contêm todas as principais linhagens celulares encontradas no coração, câmaras internas bem definidas, câmaras atrial e ventricular, e uma rede vascular em todo o organoide. Este sistema organoide cardíaco altamente sofisticado e reprodutível é favorável à investigação de análises estruturais, funcionais, moleculares e transcriômicas no estudo do desenvolvimento cardíaco e doenças e rastreamento farmacológico.
1. cultura e manutenção hPSC
NOTA: Os PSCs induzidos por humanos (hiPSCs) ou células-tronco embrionárias humanas (hESCs) precisam ser cultivados por pelo menos 2 passagens consecutivas após o descongelamento antes de serem usados para gerar EBs para diferenciação ou criopreservação. hPSCs são cultivados em meio PSC (ver a Tabela de Materiais) em placas de cultura de 6 poços revestidos de membrana de porão (BM-ECM) revestidos de 6 poços. Ao realizar alterações médias em hPSCs em placas de 6 poços, adicione o meio diretamente ao lado interno do poço, em vez de diretamente em cima das células para evitar o descolamento ou estresse celular indesejado. Os usuários devem ter cuidado com a mídia PSC pré-aquecimento que não deve ser aquecida a 37 °C; todos os meios de PSC usados neste protocolo eram termoestáveis.
2. Geração de organoides cardíacos humanos auto-montados em 3D
3. Análise organoide
Para alcançar a auto-organização hHO in vitro, modificamos e combinamos protocolos de diferenciação previamente descritos para diferenciação de monocamadas 2D de células cardiomiocós-ástica21 e epicárida22 usando moduladores de via Wnt e para organoides pré-cardiaco 3D16 usando os fatores de crescimento BMP4 e Activin A. Utilizando a placa de 96 poços EB e protocolo de diferenciação hHO descritos aqui e mostrados na Figura 11 , as concentrações e as durações de exposição do ativador de vias WNT CHIR99021 foram otimizadas para produzir hHOs altamente reprodutíveis e complexos derivados de PSCs humanos. hPSCs ou hESCs cultivados em psc médio a 60-80% de confluência na formação de colônias com diferenciação mínima a nenhuma visível são ideais para a geração de EB (Figura 1B).
Os EBs foram autorizados a incubar por 48h com uma mudança média após 24 horas antes de iniciar a diferenciação no dia 0. No dia 0, os EBs devem aparecer como um agregado esférico escuro no centro de cada poço sob um microscópio de luz (Figura 1B). O protocolo de diferenciação começa no dia 0 com a ativação da via Wnt e a adição do fator de crescimento por exatamente 24 horas. Esta indução de mesoderm seguida de uma indução de mesodermia cardíaca no dia 2 usando o inibidor da via Wnt Wnt Wnt-C59 resultará em um aumento significativo do organoide de ~200 μm de diâmetro a 500-800 μm de diâmetro no dia 4 e até 1 mm (organoides podem experimentar uma ligeira redução no tamanho até o dia 15 (Figura 1C)). O HHO começará a bater já no dia 6 (Vídeo 1), com 100% dos organoides mostrando batida visível até o dia 10 (Vídeo 2) (a menos que se submetam ao tratamento medicamentoso ou se hPSCs inadequados foram usados para gerar os EBs). Isso foi observado em 5 linhas celulares hPSC distintas23.
Para avaliar a capacidade dos HHOs de representar várias etapas do desenvolvimento fisiológico do coração, coletamos organoides em vários pontos de tempo ao longo do protocolo de diferenciação e buscamos a presença e expressão transcriômica dos marcadores do campo cardíaco. A coloração imunofluorescente para o primeiro marcador do campo cardíaco (FHF), HAND1, e o marcador do segundo campo cardíaco (SHF), HAND2, revelaram sua presença nuclear nessas células progenitoras cardíacas surgidas por volta do dia 3 e 5, respectivamente (Figura 3A).
A expressão de ambos os marcadores acontece em regiões dos organoides que diminuem de tamanho após o dia 7 para a FHF e após o dia 9 para o SHF. Curiosamente, imagens de alta ampliação dos organoides do dia 7 revelaram que a maioria das células que expressam HAND1 eram de origem cardiomiocócica (como mostrado pelo marcador específico de cardiomiócito TNNT2). Em contraste, muitas das células que expressam HAND2 não expressaram o marcador de cardiomiócito (Figura 3B). Esta observação está de acordo com os organoides pré-cardíacos derivados de ESCs de camundongos que demonstram o desenvolvimento de células não miócitos a partir de células progenitoras SHF16. É importante notar que os dados do RNA-Sequencing mostram que as transcrições de RNA tanto para HAND1 quanto HAND2 foram expressas a partir do dia 3, com o marcador FHF sendo mais expresso entre os dias 3 e 11 e o marcador SHF sendo mais expresso após o dia 13 (Figura 3C).
A coloração da imunofluorescência revelou a presença de marcadores de várias linhagens do tipo celular que compõem o coração humano. Tecido miocárdio (identificável usando o marcador específico de cardiomiócito TNNT2) adjacente ao tecido epicárdio (marcado pelo fator de transcrição nuclear WT1 e o marcador de membrana epitelial TJP1) (Figura 4A). Células endocárdicos expressas NFATC1 foram detectadas forrando as paredes de estruturas internas semelhantes a câmaras dentro dos organoides (Figura 4B). As células endoteliais em uma rede semelhante a uma embarcação podem ser vistas já no 13º dia de diferenciação (Figura 4C). Por fim, relatamos a presença de fibroblastos cardíacos misturados em todo o organoide (Figura 4D). Esses marcadores do tipo celular também foram observados nos perfis de expressão genética RNA-Seq (Figura 4E). A composição dos tipos celulares nos organoides, como medido pela área do organoide que ocupam, foram encontrados ~58% cardiomiocócitos, com o restante compreendendo células cardíacas não miótidas, incluindo células epicáridas (~15%), células do endocárdio (~13%), fibroblastos cardíacos (~12%) e células endoteliais (~1%) (Figura 4F).
A função eletrofisiológica dos organoides foi medida por imagens vivas de cálcio de células individuais em organoides inteiros. A intensidade da fluorescência fluo-4 varia ao longo do tempo devido à entrada e saída de cálcio da célula, revelando potenciais de ação regulares (Figura 5A). Os heatmaps que mostram intensidades de cálcio sobre uma região de alta ampliação do organoide mostram o aumento da intensidade por causa de transitórios de cálcio em células individuais (Figura 5B e Vídeo 3).

Figura 1: A geração corporal embrionária e os passos de diferenciação organoide do coração. (A) (1-2) As células dissociadas são semeadas em poços de uma placa de fixação ultra-baixa de 96 poços através de uma pipeta multicanal. (3) A placa de 96 poços é então centrifuada, o que permite que as células se agreguem no centro. (4) Com o tempo, após a adição de fatores de crescimento e moduladores de vias, o corpo embrionário começa a se diferenciar em várias linhagens cardíacas e formar populações celulares distintas espacial e fisiologicamente relevantes ao redor de microchambers internos. (B) Imagens representativas da progressão da geração corporal embrionária, começando com a cultura iPSC bidimensional (esquerda) e terminando com um corpo embrionário do dia 0 (à direita); barra de escala = 500 μm. (C) Resumo do protocolo de diferenciação organoide do coração humano, incluindo moduladores de via química e inibidores com respectivos pontos de tempo, durações e imagens organoides em desenvolvimento sob microscopia leve do dia 1 ao dia 15; barra de escala = 500 μm. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 2: Montagem organoide inteira em lâminas para imagem. Passos para preparar slides e organoides de montagem para imagem. (A) Colocação de microesferas na periferia de um deslizamento de vidro. (B) Cobrir as microesferas com meio de montagem. (C) Transferir organoides para o slide entre as contas e remover o excesso de líquido ao redor dos organoides. (D) Cobrir os organoides com meio de clareira/montagem. (E) Colocar a mancha de cobertura em cima do slide com organoides e contas. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 3: Primeira especificação do campo cardíaco e segundo coração em hHOs recapitula desenvolvimento fisiológico do coração humano. (A) Imagens de imunofluorescência confocal do dia 3 ao dia 11 hHOs mostrando a formação de FHF (HAND1, top) e SHF (HAND2, inferior), e cardiomiócitos (TNNT2) e DAPI de corante nuclear; barras de escala = 500 μm. (B) Imagens de alta ampliação dos organoides do dia 7 mostrando co-localização de HAND1 e HAND2 com o marcador de cardiomiócito TNNT2; barras de escala = 50 μm. (C) Perfis de expressão genética RNA-Seq do marcador FHF HAND1 (vermelho) e marcador SHF HAND2 (azul) do dia 0 ao dia 19. Abreviaturas: hHOs = organoides cardíacos humanos; FHF = primeiro campo cardíaco; SHF = segundo campo cardíaco; MÃO = derivados do coração e da crista neural expressos; TNNT2 = troponina cardíaca T2; DAPI = 4',6-diamidino-2-fenildole. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 4: hHOs desenvolvem linhagens cardíacas multiple. (A-D) Imagens de imunofluorescência confocal do dia 15 hHOs mostrando a formação de cardiomiócitos (TNNT2) e coloração com dapi de corante nuclear em células cardíacas não miócitos. (A) Organoide inteiro e alta ampliação do marcador epicárdio WT1 (verde) e marcador de membrana epitelial TJP1 (branco) mostrando células epictícias de origem epitelial em cima e adjacentes ao tecido miocárdio; barra de escala = 500 μm, inset = 50 μm. (B) Expressão do marcador endocárdia NFATC1 (verde) no revestimento das câmaras; barra de escala = 500 μm. (C) Rede de embarcações endoteliais em hHOs mostrados por PECAM1 (verde). Barra de escala = 500 μm. (D) Marcadores de fibroblastos cardíacos THY1 e VIM mostrados em verde e branco, respectivamente, distribuídos por todo o organoide. Barra de escala = 500 μm. (E) Perfis de expressão genética RNA-Seq dos principais tipos de células presentes nos hHOs dos dias 0 a 19 de diferenciação. Abreviaturas: hHOs = organoides cardíacos humanos; TNNT2 = troponina cardíaca T2; DAPI = 4',6-diamidino-2-fenildole; WT1 = Fator de transcrição tumor-1 de Wilm; NFATC1 = fator nuclear citoplasmado da célula T ativada; PECAM1 = molécula de adesão celular endotelial plaquetária-1; VIM = vimentina. (F) Gráfico de tortas da composição média do tipo de tecido em hHOs, calculado como a área percentual com o respectivo marcador celular sobre um organoide inteiro por coloração nuclear em três z-planes em todo o organoide usando ImageJ. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 5: Gravações transitórias de cálcio ao vivo fluo-4 em organoides cardíacos humanos vivos. (A) Registros representativos de cálcio transitórios de cardiomiócitos individuais dentro de organoides inteiros. (B) Mapa de calor mostrando níveis baixos e máximos de cálcio entre potenciais de ação determinados pela intensidade do Fluo-4; barras de escala = 10 μm. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Vídeo 1: Imagem viva de organoide representativo derivado de hPSCs no dia 6 de diferenciação sob microscopia leve à temperatura ambiente. Abreviação: hPSC = célula-tronco pluripotente humana. Clique aqui para baixar este vídeo.
Vídeo 2: Imagem ao vivo de organoide representativo derivado de hPSCs no dia 15 de diferenciação sob microscopia leve à temperatura ambiente. Abreviação: hPSC = célula-tronco pluripotente humana. Clique aqui para baixar este vídeo.
Vídeo 3: Gravação ao vivo do dia 10 organoide mostrando o mapa de calor de transitórios de cálcio sob um microscópio de fluorescência. Clique aqui para baixar este vídeo.
Os autores não têm conflitos de interesse para declarar.
Aqui, descrevemos um protocolo para criar organoides cardíacos humanos relevantes de desenvolvimento (hHOs) usando eficientemente células-tronco pluripotentes humanas por auto-organização. O protocolo conta com a ativação sequencial de pistas de desenvolvimento e produz tecidos cardíacos humanos altamente complexos e funcionalmente relevantes.
Este trabalho foi apoiado pelo National Heart, Lung, and Blood Institute dos Institutos Nacionais de Saúde sob os números de premiação K01HL135464 e R01HL15151505 e pela American Heart Association sob o prêmio número 19IPLOI34660342. Agradecemos ao Núcleo avançado de Microscopia da MSU e ao Dr. William Jackson do Departamento de Farmacologia e Toxicologia da MSU pelo acesso aos microscópios confocal, ao Núcleo de Microscopia de QI e ao Núcleo de Genômica da MSU para serviços de sequenciamento. Também queremos agradecer a todos os membros do Laboratório Aguirre por seus valiosos comentários e conselhos.
| Anticorpos | |||
| Alexa Fluor 488 Burro anti-rato | Invitrogen | A-21202 | 1:200 |
| Alexa Fluor 488 Burro anti-coelho | Invitrogen | A-21206 | 1:200 |
| Alexa Fluor 594 Burro anti-rato | Invitrogen | A-21203 | 1:200 |
| Alexa Fluor 594 Burro anti-coelho | Invitrogen | A-21207 | 1:200 |
| Alexa Fluor 647 Burro anti- cabra | Invitrogen | A32849 | 1:200 |
| HAND1 | Abcam | ab196622 | Coelho; 1:200 |
| HAND2 | Abcam | ab200040 | Coelho; 1:200 |
| NFAT2 | Abcam | ab25916 | Coelho; 1:100 |
| PECAM1 | DSHB | P2B1 | Coelho; 1:50 |
| TNNT2 | Abcam | ab8295 | Mouse; 1:200 |
| THY1 | Abcam | ab133350 | Coelho; 1:200 |
| TJP1 | Invitrogen | PA5-19090 | Cabra; 1:250 |
| VIM | Abcam | ab11256 | Cabra; 1:250 |
| WT1 | Abcam | ab89901 | Coelho; 1:200 |
| Meios e Reagentes | |||
| Accutase | Tecnologias Celulares Inovadoras | NC9464543 | reagente de dissociação celular |
| Activin A | R& D Systems | 338AC010 | |
| B-27 Suplemento (Menos Insulina) | Suplemento | de cultura de células sem insulina Gibco A1895601 | |
| B-27 Suplemento | Gibco | 17504-044 | Suplemento de cultura de células |
| BMP-4 | Gibco | PHC9534 | |
| Albumina de soro bovino | Bioworld | 50253966 | |
| CHIR-99021 | Selleck | 442310 | |
| D-(-)-Frutose | Millipore Sigma | F0127 | |
| DAPI | Thermo Scientific | 62248 | 1:1000 |
| Dimetil Sulfóxido | Millipore Sigma | D2650 | |
| DMEM/F12 | Gibco | 10566016 | |
| Essential 8 Flex Medium Kit | Gibco | A2858501 | meio de células-tronco pluripotentes (PSC) contendo 1% penicilina-estreptomicina |
| Fluo4-AM | Invitrogen | F14201 | |
| Glicerol | Millipore Sigma | G5516 | |
| Glicina | Millipore Sigma | 410225 | |
| Matrigel GFR | Corning | CB40230 | Matriz extracelular da membrana basal (BM-ECM) |
| Soro de burro normal | Millipore Sigma | S30-100mL | |
| Paraformaldeído | MP Biomedicals | IC15014601 | Pó dissolvido em tampão PBS - use a 4% |
| penicilina-estreptomicina | Gibco | 15140122 | |
| solução tampão de fosfato | Gibco | 10010049 | |
| solução tampão de fosfato (10x) | Gibco | 70011044 | |
| Polybead Microspheres | Polysciences, Inc. | 73155 | 90 µ m |
| ReLeSR | Stem Cell Technologies | NC0729236 | reagente de dissociação para hPSCs |
| RPMI 1640 | Gibco | 11875093 | |
| Tiazovivina | Millipore Sigma | SML1045 | |
| Triton X-100 | Millipore Sigma | T8787 | |
| Trypan Blue Solution | Gibco | 1525006 | |
| VECTASHIELD Vibrance Antifade Montagem Média | Vector Laboratories | H170010 | |
| WNT-C59 | Selleck | NC0710557 | |
| Outros | |||
| Tubos de Microcentrífuga de 1,5 mL | Fisher Scientific | 02682002 | |
| Tubos Falcon de 15 mL | Fisher Scientific | 1495970C | |
| Frascos Criogênicos de 2 mL | Corning | 13-700-500 | |
| Reservatórios de Reagentes de 50 mL | Fisherbrand | 13681502 | |
| Placas de Cultura de Células de Fundo Plano de 6 Poços | Corning | 0720083 | |
| 8 Vidro de cobertura com vidro de cobertura de alto desempenho #1.5 | Cellvis | C8-1.5H-N | |
| Microplacas de Fixação Ultra Baixa Transparente de 96 poços | Costar | 07201680 | |
| ImageJ | NIH | Image software de processamento | |
| Kimwipes Kimberly-Clark Professional | 06-666 | toalhetes de laboratório | |
| Micro Cover Glass | VWR | 48393-241 | 24 x 50 mm No. 1.5 |
| Lâminas de Microscópio | Fisherbrand | 1255015 | |
| Moxi Cell Counter | Orflo Technologies | MXZ001 | |
| de contagem de células Moxi Z - Tipo M | Orflo Tecnologias | MXC001 | |
| Pipetas Multicanal | Fisherbrand FBE1200300 | 30-300 µ L | |
| Olympus cellVivo | Olympus | Para Caclium Imaging, análise com Imagej | |
| Sorvall Legend X1 Centrífuga | ThermoFisher Scientific | 75004261 | |
| Misturador Térmico | ThermoFisher Scientific | 13-687-717 | |
| Top Coat Nail Varish | Seche Vite | Pode comprar em qualquer supermercado |