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Artigo de método

Isolamento de clones de células de melanoma transfectadas de forma estável

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DOI:

10.3791/63371

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4 de agosto de 2022

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Neste artigo

Resumo

Um protocolo é descrito para isolar clones de células de melanoma transfectadas de forma estável usando cilindros de vidro. Focamo-nos em conselhos práticos que podem ser decisivos para o sucesso de todo o procedimento.

Resumo

Populações de células que apresentam mudanças estáveis em suas informações genômicas são amplamente utilizadas pelos cientistas como modelo de pesquisa. Eles não requerem transfecção celular repetida, pois podem levar a uma população celular heterogênea e eficiência de transfecção variável, afetando a reprodutibilidade. Além disso, eles são preferíveis para análises em larga escala. A geração de clones celulares estáveis é útil para uma ampla gama de aplicações, como pesquisa sobre funções gênicas e produção de proteínas recombinantes. Existem alguns métodos para obter uma população de células homogênea após a transfecção transitória inicial. Aqui, descrevemos o isolamento de clones de células únicas com cilindros de vidro. Embora esse método seja conhecido há algum tempo, existem algumas etapas cruciais e negligenciá-las pode levar ao fracasso. Usamos com sucesso este método para obter clones superexpressando de forma estável uma proteína de interesse (POI) ou com nocaute de um gene de interesse (GOI). Descrevemos etapas de preparação, como a otimização da seleção de concentrações de drogas, preparação de cilindros de vidro e validação se os clones obtidos têm a mudança desejada na expressão do GOI por PCR, análise de western blot, imunocoloração ou sequenciamento de gDNA (dependendo do tipo de clones derivados). Também discutimos a heterogeneidade fenotípica de linhagens celulares bem estabelecidas, pois isso pode ser um problema na obtenção de clones celulares estáveis.

Introdução

A transfecção estável de células de mamíferos é um método usado rotineiramente em várias aplicações de cultura de células, incluindo a pesquisa do câncer. Sua vantagem sobre a transfecção transitória é que o material genético estranho introduzido não pode ser perdido devido a fatores ambientais (por exemplo, confluência celular ou estágio de replicação) e divisão celular porque está integrado ao genoma do hospedeiro1. O desenvolvimento de linhagens celulares que expressam de forma estável pode ser trabalhoso e desafiador, mas se uma expressão sustentada de genes for necessária por um longo....

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Protocolo

1. Subcultura e semeadura de células para otimização da concentração de fármacos

  1. Aqueça o meio de cultura celular (neste caso, o meio de Eagle modificado de Dulbecco com uma concentração reduzida (1,5 g / L) de NaHCO3, 10% (v / v) de soro fetal bovino (FBS), 1% (v / v) de L-glutamina e 1% (v / v) antibiótico-antimicótico) e solução de tripsina em banho-maria a 37 ° C.
  2. Aspirar e rejeitar o meio de cultura das células A735 que crescem num balão de cultura de células T25. A linhagem celular é obtida de fontes comerciais.
  3. Lave qualquer meio de cultura celular restante das células....

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Resultados

Usando o protocolo apresentado, fornecemos uma demonstração detalhada do isolamento de clones de células de melanoma transfectadas de forma estável com o método do cilindro de vidro (Figura 1A). Nossos estudos estão relacionados à biologia celular do melanoma, e o modelo de pesquisa mais comum que usamos é a linha de melanoma A375 aderente e altamente invasiva. Como nossa pesquisa mostrou que as células de melanoma produzem gelsolina (GSN) em alto nível em comparação com outros tipos de cânc.......

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Discussão

Fornecemos uma descrição detalhada do isolamento de clones de células de melanoma transfectadas de forma estável com cilindros de vidro. É importante obter clones de controle ao derivar clones com expressão alterada de genes, pois os resultados obtidos para os clones de modificação direcionados devem sempre ser comparados com os resultados obtidos para os controles. Desta forma, podemos verificar se a transfecção em si ou a cultura com um antibiótico seletivo não afeta os resultados dos .......

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Divulgações

Os autores declaram não haver interesses financeiros concorrentes.

Agradecimentos

Este trabalho foi apoiado pelo Centro Nacional de Ciência, Polônia (projeto # 2016 / 22 / E / NZ3 / 00654, concedido ao AJM).

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Materiais

Lista de materiais utilizados neste artigo
NomeEmpresaNúmero de catálogoComentários
Tubo de centrífuga de 15 mlGoogleLab ScientificG66010522
Placa de cultura de células de 150 mm com grelha de 20 mmPlacaFalcon 353025
de 24 poçosVWR International10062-896
Placa de cultura de 35 mmEppendorfEP0030700112
placa de 6 poçosEppendorfEP0030700113
de 96 poços placaVWR International10062-900 
Solução de ácido acético, 80%Chempur115687330
AgaroseProna-AboBLE500
Antibiótico-AntimicóticoGibco15240062
anticorpos anti-GAPDHSanta Cruz Biotechnology Inc.,sc-47724
anticorpos anti-GSN  - clone C20Santa Cruz Biotechnology Inc.,sc-6405
anticorpos anti-GSN  - clone GS-2C4Sigma-AldrichG44896
Albumina de soro bovino (BSA)Sigma-AldrichA3294
Color Taq PCR Master Mix (2x)EurXE2525
Controle Duplo Nickase PlasmídeoSanta Cruz Biotechnology Inc.,sc-437281
Coverslipsbionovo16283
Dako Meio de montagem ClontechS3023
DMSO -  Kit deA3672,0250applichem
 EurX3555-02
burro anti-rato-Alexa Fluor 488Invitrogen# A-21202
DTT - 1,4-DithiothreitolSigma-Aldrich10197777001
EcoRI Thermo Fisher ScientificFD0274
EDTA- ácido etilenodiaminotetracético Poch (Pol-Aura)593280117
EGTA - etilenoglicol-bis(2-aminoetil éter)- N,N,N',N'-ácido tetracético Sigma-AldrichE0396
FBS - Soro Fetal BovinoGibco10270-106
Gelsolin CRISPR PlasmidsSanta Cruz Biotechnology Inc.,sc-401005-NIC
FormaldeídoSigma-AldrichP6148
GlicerolSigma-AldrichL-4909
glicose alta Dulbecco' s Águia modificada' s meio com concentração reduzida (1,5 g/l) de NaHCO3 Academia Polonesa de Ciências, Wrocfigure-materials-1aw, Polônia11-500
Hoechst 33342 Thermo Fisher ScientificH3570
L-GlutaminaGibco25030-024
Lignina BionovoB-0521
Lipofectamine 3000 Reagente de Transfecção InvitrogenL3000-008
Na3VO4Sigma-AldrichS6508
Na4P2O7Sigma-AldrichP8010
NaFSigma-Aldrich450022
NEBuilder Ferramenta de Montagem http://nebuilder.neb.com/#!/
pACGFP-C1 PageRuler da Clontech
Thermo Fisher Scientific 26616
Perfect 100 bp DNA ladderEurXE3134
faloidina-Alexa Fluor 568InvitrogenA12380
Inibidor de fosfatase Cocktail 2Sigma-AldrichP5726
Fosfatase Inhibitor Cocktail 3Sigma-AldrichP0044
Phusion DNA polimerase de alta fidelidade Pierce F530SThermo Fisher Scientific
 Thermo Fisher Scientific 23225
polietilenimina (PEI)Sigma-Aldrich408727
inibidor de protease coquetelSigma-AldrichP8340
puromicinaInviviGenant-pr
SDS - dodecil sulfato de sódio Sigma-AldrichL4509
silicone CX80 Polska
Cloreto de sódio - NaClChempur7647-14-5
desoxicolato de sódioSigma-AldrichD6750259
sacarosePoch (Pol-Aura)PA-06-772090110
os cilindros de vidro Sigma-AldrichC3983-50EA
Balão de Cultura de Tecidos 25mLVWR International10062-868
Balão de Cultura de Tecidos 75 cm2VWR10062-872
Base TrismaSigma-AldrichT1503
Triton X-100Sigma-AldrichX100
tripsina Academia Polonesa de Ciências, Wrocfigure-materials-2aw, Polônia20-500
ureiaSigma-Aldrich8656
solução de xilenoChempur115208603
Purificação de DNA Dimethylsulfoxide Escada de Proteína Prestained Kit de Ensaio de Proteína BCA da

Referências

  1. Recillas-Targa, F. Multiple strategies for gene transfer, expression, knockdown, and chromatin influence in mammalian cell lines and transgenic animals. Molecular Biotechnology. 34 (3), 337-354 (2006).
  2. Wurm, F. M.

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