É necessária uma assinatura do JoVE para visualizar este conteúdo. Faça login ou inicie seu teste gratuito.

Artigo de método

Raman estimulado em tempo real, duas cores, espalhando imagens do cérebro do rato para diagnóstico de tecido

3.1K vistas

DOI:

10.3791/63484

1 de fevereiro de 2022

* These authors contributed equally

Neste artigo

Resumo

A microscopia de dispersão raman estimulada (SRS) é uma técnica de imagem poderosa, não destrutiva e livre de rótulos. Uma aplicação emergente é a histologia raman estimulada, onde imagens de SRS de duas cores nas transições de proteína e lipídio de Raman são usadas para gerar imagens pseudo-hematoxilina e eosina. Aqui, demonstramos um protocolo para imagens de SRS em tempo real e duas cores para diagnóstico de tecido.

Resumo

A microscopia estimulada de dispersão de Raman (SRS) surgiu como uma poderosa técnica de imagem óptica para diagnóstico de tecidos. Nos últimos anos, o SRS de duas cores mostrou-se capaz de fornecer imagens equivalentes à hematoxilina e eosina (H&E) que permitem um diagnóstico rápido e confiável do câncer cerebral. Tal capacidade permitiu aplicações emocionantes de diagnóstico de câncer intraoperatório. A imagem de tecido srs de duas cores pode ser feita com uma fonte de laser picosegundo ou femtosegundo. Os lasers Femtosegundos têm a vantagem de permitir modos de imagem flexíveis, incluindo imagens hiperespectrais rápidas e imagens srs em tempo real de duas cores. Uma abordagem espectral com pulsos laser chirped é tipicamente usado com lasers femtosegundos para alcançar alta resolução espectral.

A aquisição de SRS de duas cores pode ser realizada com modulação ortogonal e detecção de lock-in. A complexidade do pulso, modulação e caracterização é um gargalo para a adoção generalizada desse método. Este artigo fornece um protocolo detalhado para demonstrar a implementação e otimização do SRS focado no espectral e imagens em tempo real de duas cores do tecido cerebral do camundongo no modo epi. Este protocolo pode ser usado para uma ampla gama de aplicações de imagem SRS que aproveitam a alta velocidade e capacidade de imagem espectroscópica do SRS.

Introdução

Os diagnósticos tradicionais de tecido dependem de protocolos de coloração seguidos de exame sob um microscópio óptico. Um método comum de coloração usado pelos patologistas é a coloração de H&E: manchas de hematoxilina nos núcleos celulares um azul arroxeado, e eosina mancha a matriz extracelular e citoplasma rosa. Essa simples coloração continua sendo o padrão ouro na patologia para muitas tarefas de diagnóstico de tecido, particularmente o diagnóstico de câncer. No entanto, a histopatologia H&E, particularmente a técnica de secção congelada usada em um ambiente intraoperatório, ainda tem limitações. O procedimento de coloração é um processo trabalhoso que envolve incorporação de tecidos, secção, fixação e coloração1. O tempo típico de retorno é de 20 minutos ou mais. O desempenho do H&E durante a seção congelada às vezes pode se tornar mais desafiador quando várias seções são processadas ao mesmo tempo devido à necessidade de avaliar características celulares ou padrões de crescimento em 3D para avaliação de margem. Além disso, técnicas histológicas intraoperatórias exigem técnicos e clínicos qualificados. A limitação no número de patologistas certificados pelo conselho em muitos hospitais é uma restrição para consulta intraoperatória em muitos casos. Tais limitações podem ser aliviadas com os interesses de desenvolvimento rápido na patologia digital e no diagnóstico baseado em inteligência artificial2. No entanto, os resultados de coloração do H&E são variáveis, dependendo da experiência do técnico, que apresenta desafios adicionais para o diagnóstico baseado em computador2.

Esses desafios podem ser potencialmente enfrentados com técnicas de imagem óptica sem rótulos. Uma dessas técnicas é a microscopia SRS. O SRS usa lasers pulsados sincronizados — bomba e Stokes — para excitar vibrações moleculares com alta eficiência3. Relatórios recentes demonstraram que a imagem de proteínas e lipídios da SRS pode gerar imagens equivalentes a H&E (também conhecida como histologia raman estimulada ou SRH) com tecido fresco intacto, o que contorna a necessidade de qualquer processamento de tecido, encurta significativamente o tempo necessário para o diagnóstico, e foi adaptado intraoperatóriamente4. Além disso, a imagem SRS pode fornecer imagens 3D, que oferecem informações adicionais para diagnóstico quando as imagens 2D são insuficientes5. O SRH é imparcial e gera imagens digitais prontamente disponíveis para diagnóstico baseado em computador. Ele surge rapidamente como uma possível solução para o diagnóstico de câncer intraoperatório e análise da margem do tumor, especialmente no câncer cerebral 6,7,8. Mais recentemente, a imagem srs de alterações químicas do tecido também foi sugerida para fornecer informações diagnósticas úteis que podem ajudar ainda mais os médicos a estratificar diferentes tipos de câncer ouestágios 9.

Apesar de seu tremendo potencial em aplicações de diagnóstico de tecidos, a imagem SRS é limitada principalmente a laboratórios acadêmicos especializados em óptica devido à complexidade associada à plataforma de imagem, que inclui lasers ultrarrápidos, microscópio de varredura a laser e sofisticados eletrônicos de detecção. Este protocolo fornece um fluxo de trabalho detalhado para demonstrar o uso de uma fonte de laser femtosegundo comum para imagens srs em tempo real e duas cores e a geração de imagens pseudo-H&E a partir do tecido cerebral do mouse. O protocolo abrangerá os seguintes procedimentos:

Alinhamento e otimização de chirp
A maioria dos esquemas de imagem SRS usam picosegundos ou lasers femtosegundos como fonte de excitação. Com lasers femtosegundos, a largura de banda do laser é muito maior que a largura de linha raman. Para superar essa limitação, uma abordagem focalizante espectral é usada para chirp os lasers femtosegundos para uma escala de tempo picosegundo para alcançar a resolução espectral estreita10. A resolução espectral ideal só é alcançada quando o chirp temporal (também conhecido como dispersão de atraso de grupo ou apenas dispersão) é devidamente combinado para a bomba e os lasers stokes. O procedimento de alinhamento e as etapas necessárias para otimizar a dispersão dos raios laser usando hastes de vidro altamente dispersivas são demonstradas aqui.

Calibração de frequência
Uma vantagem do srs focalizado espectral é que a excitação de Raman pode ser rapidamente ajustada alterando o atraso de tempo entre a bomba e os lasers Stokes. Tal ajuste oferece imagens rápidas e aquisição espectral confiável em comparação com comprimentos de onda a laser de ajuste. No entanto, a relação linear entre a frequência de excitação e o atraso de tempo requer calibração externa. Solventes orgânicos com picos raman conhecidos são usados para calibrar a frequência raman para srs focalizando espectral.

Imagem em tempo real, de duas cores
É importante aumentar a velocidade de imagem nas aplicações de diagnóstico tecidual para encurtar o tempo necessário para analisar grandes amostras de tecido. A imagem simultânea de SRS de duas cores de lipídios e proteínas evita a necessidade de ajustar o laser ou o atraso de tempo, o que aumenta a velocidade de imagem em mais de duas vezes. Isso é conseguido usando uma nova técnica de modulação ortogonal e demodulação de dois canais com um amplificador lock-in11. Este artigo descreve o protocolo de modulação ortogonal e aquisição de imagens de dois canais.

Imagem SRS do modo epi
A maioria das imagens SRS mostradas até o momento é realizada no modo de transmissão. A imagem do modo epi detecta fótons recattered do tecido12. Para aplicações patológicas, as amostras cirúrgicas podem ser bastante grandes. Para a imagem do modo de transmissão, a secção tecidual é muitas vezes necessária, o que indesejavelmente requer tempo extra. Em contraste, a imagem do modo epi pode funcionar com amostras cirúrgicas intactas. Como o mesmo objetivo é usado para coletar luz retorcido, também não há necessidade de alinhar um condensador de abertura numérica elevada necessário para a imagem de transmissão. O modo epi também é a única opção quando a seção tecidual é difícil, como com osso. Anteriormente, demonstramos que, para o tecido cerebral, a imagem do modo epi oferece qualidade de imagem superior para a espessura do tecido > 2 mm13. Este protocolo usa um divisor de feixe polarizador (PBS) para coletar fótons dispersos despolarizados pelo tecido. É possível coletar mais fótons com um detector anular em detrimento da complexidade do conjunto de detector personalizado12. A abordagem PBS é mais simples de implementar (semelhante à fluorescência), com o fotodiodo padrão já sendo usado para detecção do modo de transmissão.

Geração de imagens Pseudo-H&E
Uma vez coletadas imagens srs de duas cores, elas podem ser recoloridas para simular a coloração de H&E. Este artigo demonstra o procedimento para converter imagens de SRS lipídicos e proteicos em imagens pseudo-H&E SRS para aplicações patológicas. O protocolo experimental detalha as etapas críticas necessárias para gerar imagens srs de alta qualidade. O procedimento aqui mostrado não é apenas aplicável ao diagnóstico tecidual, mas também pode ser adaptado para muitas outras aplicações de imagem hiperespectral srs, como imagem de drogas e imagem metabólica14,15.

Requisitos gerais do sistema
O sistema laser para este protocolo deve ser capaz de produzir 2 raios laser femtosegundos sincronizados. Os sistemas possuem idealmente um Oscilador Paramétrico Óptico (OPO) para afinação de comprimento de onda amplo de um dos raios laser. A configuração deste protocolo usa um sistema de laser comercial Insight DS+ que produz dois lasers (um feixe fixo a 1.040 nm e um feixe tunable baseado em OPO, variando de 680 a 1.300 nm) com uma taxa de repetição de 80 MHz. Microscópios de varredura a laser, seja de grandes fabricantes de microscópios ou caseiros, podem ser usados para imagens SRS. O microscópio utilizado é um microscópio de varredura a laser vertical construído em cima de um quadro comercial de microscópio vertical. Um par de espelhos galvo de 5 mm são usados para escanear o raio laser. Para os usuários que optarem por adotar um microscópio de varredura a laser construído em casa, consulte um protocolo publicado anteriormente para a construção de um microscópio de varredura a laser16.

Acesso restrito. Inicie sessão ou comece um teste para visualizar este conteúdo.

Protocolo

Todos os procedimentos experimentais de animais foram realizados com cérebros de camundongos fixos e seccionados de 200 μm, de acordo com o protocolo (nº 4395-01) aprovado pelo Comitê de Cuidados e Uso de Animais (IACUC) da Universidade de Washington. Os camundongos do tipo selvagem (cepa C57BL/6J) são eutanizados com CO2. Em seguida, uma craniotomia é realizada para extrair seus cérebros para fixação em 4% de paraformaldeído em soro fisco tamponado. Os cérebros são embutidos em uma mistura de 3% de agarose e 0,3% de gelatina e seccionados em fatias de 200 μm de espessura por um vibratome.

1. Alinhamento inicial

NOTA: Certifique-se de que o tamanho do feixe e a divergência de ambos os braços são combinados para melhor sensibilidade e resolução. Cotoma a bomba e os feixes stokes e ajusta seus tamanhos antes de entrar no microscópio de varredura a laser. Para isso, use um par de lentes acráticas para cada feixe antes de combiná-las no espelho dicrómico. Use sempre óculos laser adequados para alinhamento de feixe.

  1. Colagem de feixe
    1. Instale um par de lentes acráticas para o feixe da bomba. Como ponto de partida, use uma lente de 100 mm e uma lente de 200 mm para ampliar o tamanho do raio laser em 2 vezes. Certifique-se de que a distância das duas lentes é de aproximadamente 300 mm. Alinhe o feixe da bomba através do centro de ambas as lentes.
    2. Coloque um espelho após a segunda lente para enviar o feixe em direção a uma parede (>1 m de distância). Tome cuidado ao enviar o feixe por longas distâncias. Rastreie o feixe do espelho até a parede com um cartão IR e verifique se o feixe muda de tamanho. Cobrem o feixe se o feixe mudar de tamanho em função da distância.
      1. Se o feixe estiver convergindo (tamanho decrescente com propagação), mova as duas lentes mais para perto.
      2. Se o feixe estiver divergindo (aumentando o tamanho com a propagação), mova as duas lentes mais distantes. Ajuste a distância até que o feixe seja colidido.
    3. Repita os passos 1.1.1 e 1.1.2 para que o feixe de Stokes entre em collimate a viga.
  2. Ajuste do tamanho do feixe
    1. Se um profiler de feixe estiver disponível, meça o tamanho do feixe colidido para cada feixe. Alternativamente, estime o tamanho do feixe usando a placa IR e uma régua para obter um diâmetro de feixe de 4-5 mm.
    2. Se o tamanho do feixe for muito pequeno ou muito grande, mude o par de lentes usado na etapa 1.1. Ajuste o par da lente até que ambos os feixes tenham um diâmetro de 4-5 mm.
      NOTA: A ampliação do feixe é a razão entre a distância focal da segunda lente para a primeira lente (f2/f1).
  3. Sobreposição espacial
    NOTA: A imagem srs requer que ambos os raios laser sejam combinados no espaço e no tempo para excitar vibrações moleculares. Um esquema da imagem SRS com foco espectral é mostrado na Figura 1.
    1. Combine os dois raios laser instalando um espelho dicroico com vários espelhos de direção para ajuste. Otimize a sobreposição espacial da bomba e dos Stokes monitorando feixes após o espelhodicróico em duas posições diferentes distantes (~1 m). Ajuste iterativamente o espelho de direção antes dodicróico e do espelho dicroico para alinhar o feixe de Stokes com o feixe da bomba.
      NOTA: Se os dois feixes estiverem se sobrepondo espacialmente em ambas as posições, elas serão suficientemente sobrepostas.
    2. Certifique-se de que os feixes combinados sejam enviados para o centro dos espelhos de varredura do microscópio de varredura a laser, ajustando um par de espelhos de direção quando os espelhos de varredura estiverem na posição estacionada. Certifique-se de que ambos os feixes viajem pelo centro do objetivo do microscópio e do condensador.
    3. Após o condensador, use outro par de lentes com distâncias focais de 100 mm e 30 mm, respectivamente, para retransmitir o feixe transmitido para o fotodiodo. Certifique-se de que ambos os feixes estão contidos dentro do fotodiodo e instale dois filtros de baixa passagem para bloquear o feixe de Stokes modulado.

2. Detecção de sinal SRS

  1. Modulação eletroóptica (EOM)
    NOTA: O EOM de 20 MHz é usado para modular a amplitude de Stokes. Como discutido posteriormente, o EOM é derivado do trem de pulso laser de 80 MHz, que é necessário para modulação ortogonal. Outras frequências de modulação podem ser usadas se apenas o SRS de cor única ou hiperespectral for realizado. Nesse caso, a sincronização da frequência de modulação à frequência laser é desnecessária. Um gerador de frequência com um amplificador de energia RF pode ser usado para conduzir o EOM. Como resultado, as etapas 2.1.1-2.1.4 podem ser ignoradas.
    1. Coloque um sampler de feixe no caminho do feixe de Stokes para pegar 10% do feixe e enviá-lo para um fotodiodo rápido para detectar o trem de pulso de 80 MHz.
      NOTA: O sinal de fotodiodo é enviado a um divisor de frequências para gerar uma saída TTL de 20 MHz. Esta saída é ainda enviada para um buffer de fanout para replicar a saída em quatro saídas idênticas de 20 MHz. Uma das saídas é usada para acionar o osciloscópio.
    2. Pegue uma das saídas do buffer de fanout e filtre-o com um filtro bandpass para obter uma onda sinusoidal de 20 MHz. Use um atenuante RF para ajustar a tensão de pico de saída para ~500 mV.
    3. Envie a saída resultante para um câmbio de fase, o que permite um ajuste fino da fase RF com uma fonte de tensão. Envie esta saída para um amplificador de energia RF e conecte a saída do amplificador ao EOM.
    4. Desbloqueie o feixe de Stokes e otimize a profundidade de modulação do EOM1 colocando um fotodiodo no caminho do feixe. Ajuste a tensão EOM e a placa de quarta-de-onda até que a profundidade de modulação (relação vale a pico) pareça satisfatória.
      NOTA: Na modulação de 20 MHz (1/4 da taxa de repetição do laser), são esperados dois pulsos a cada 50 ns.
  2. Sobreposição temporal
    NOTA: A sobreposição temporal da bomba e Stokes é alcançada atrasando um dos dois trens de pulso laser com um retro-refletor montado em um estágio de atraso (a Figura 1 mostra que os Stokes estão atrasados). A sobreposição grosseira é monitorada com o osciloscópio, e a sobreposição fina é monitorada pelo sinal SRS. A sobreposição temporal fina também pode ser alcançada com um autocorrelador se disponível.
    1. Coloque um fotodiodo após o espelhodicróico para detectar o raio laser. Bloqueie o feixe de Stokes primeiro. Amplie em um dos picos de pulso da bomba no osciloscópio. Coloque um cursor vertical para marcar a posição temporal deste pico com o osciloscópio.
    2. Bloqueie o feixe da bomba e desbloqueie o feixe de Stokes. Traduza o estágio de atraso para corresponder temporalmente à posição de pico do osciloscópio com a posição marcada na etapa anterior. Consulte a Figura 2 para exibir a sobreposição temporal de dois feixes.
      1. (OPCIONAL) Se a tradução da etapa de atraso for insuficiente para corresponder temporalmente às duas vigas, mova o estágio de atraso para o meio de sua faixa de movimento.
      2. Calcule a distância de atraso necessária para combinar com os dois feixes, tomando a diferença temporal entre os dois feixes e multiplicando a diferença pela velocidade da luz para encontrar a quantidade de distância necessária para corresponder às duas vigas temporalmente.
      3. Alongue o caminho do feixe mais rápido ou encurte o caminho do feixe do feixe mais lento para aproximadamente corresponder ao atraso temporal de acordo.
    3. Prepare uma amostra de slides de microscópio com DMSO e fita dupla face como espaçador para segurar a amostra entre o slide e um deslizamento de tampa.
    4. Coloque a amostra no microscópio com o lado de deslizamento de cobertura voltado para o objetivo do microscópio. Altere o microscópio para iluminação de campo brilhante e observe a amostra da ocular. Encontre o foco da amostra primeiro encontrando o foco na camada superior e inferior das bolhas de ar na interface da fita de vidro e, em seguida, mova o foco para estar entre as duas camadas de fita.
      NOTA: Certifique-se de que os raios laser estão bloqueados antes de olhar para a ocular.
    5. Defina a saída do feixe tunable para 798 nm. Com base no rendimento óptico do condensador, ajuste a potência óptica para ser ~40 mW cada para a bomba e os feixes de Stokes no foco objetivo.
    6. Abra o ScanImage no MATLAB (ou em outro software de digitalização que controla o microscópio) e clique no botão rotulado FOCUS para iniciar a digitalização.
      NOTA: Os raios laser serão escaneados através da amostra para gerar uma imagem. A saída de sinal de baixa frequência do fotodiodo (<100 kHz) é enviada diretamente para o canal 1 da placa de aquisição de dados (conhecida como canal DC). A saída de alta frequência (>100 kHz) do fotodiodo é enviada para o amplificador lock-in, e a saída X do sinal do amplificador de travamento é enviada para o canal 2 da placa de aquisição de dados (referida como canal CA).
    7. Ajuste o espelho de direção antes que o scanner galvo centralize o sinal DC no visor do canal 1. Mova o estágio de atraso motorizado e observe de perto a saída de bloqueio mostrada no visor do canal 2 (ou seja, canal CA).
      NOTA: Quando a bomba e Stokes coincidirem com o tempo, um sinal aparecerá no canal CA. É útil ajustar a escala de cores do canal CA para exibir a pequena mudança de intensidade.
    8. Maximize a intensidade do sinal CA ajustando bem o atraso de tempo. Ajuste o espelho dicroico para centralizar o sinal SRS no canal CA (mantendo o canal DC centrado). Ajuste a fase do amplificador de travamento para maximizar o sinal. Consulte a Figura 3 para obter um sinal satisfatório.

3. Otimização da resolução espectral

NOTA: Os feixes de bomba e Stokes que atingem a amostra devem ter a mesma quantidade de dispersão de atraso de grupo (GDD) para maximizar a resolução espectral. A dispersão depende muito da configuração experimental. A configuração experimental descrita aqui utiliza pulsos femtosegundos a 1.040 nm e 800 nm como Stokes e bomba, respectivamente. As barras de vidro de pedra densas (H-ZF52A) são usadas como meio de alongamento de pulso.

  1. Insira 48 cm de uma haste de vidro altamente dispersiva (H-ZF52A ou vidro de pedra denso equivalente) no caminho do feixe de 800 nm. Estimar o GDD usando Eq (1):
    figure-protocol-1 (1)
    NOTA: O GVD de vários materiais de vidro em diferentes comprimentos de onda pode ser encontrado a partir do recurso de banco de dados de índices refrativos. Por exemplo, H-ZF52A tem um GVD de 220,40 fs2/mm a 800 nm. O GDD total é 105792 fs2.
  2. Calcule quantos cm da haste de vidro dispersiva é necessária para adicionar ao caminho do feixe de 1.040 nm para combinar com o GDD da bomba. Insira o comprimento apropriado das hastes de vidro dispersivas no caminho do feixe de 1.040 nm para aproximadamente corresponder ao GDD do feixe de 800 nm. Observe que a adição de hastes de vidro mudará a sobreposição temporal das duas vigas, podendo ser necessário ajuste de atraso.
  3. Calibração da resolução espectral
    1. Faça uma amostra de slides de microscópio com DMSO. Coloque o slide sobre o microscópio e verifique a potência dos feixes que saem do condensador do microscópio. Ajuste a potência de acordo para ter ~40 mW cada um em foco de amostra.
    2. Abra o ScanImage do MATLAB. Encontre o sinal máximo srs através da fase de atraso, que corresponde ao pico raman de 2.913 cm-1 do DMSO. Estime a posição do estágio com base na posição do estágio anterior com o aumento do comprimento do caminho óptico devido à inserção de hastes. Realinhar a sobreposição espacial do feixe devido ao pequeno desvio do feixe quando as hastes de vidro forem adicionadas.
    3. Salve uma varredura srs hiperespectral, tirando sequencialmente uma série de imagens SRS enquanto move o estágio motorizado.
      NOTA: A faixa de varredura de atraso abrange dois picos de Raman, correspondentes aos picos de 2.913 cm-1 e 2.994 cm-1 Raman de DMSO, respectivamente. Estas duas transições são observadas ao utilizar uma bomba de 800 nm e 1.040 nm de laser Stokes.
    4. Plote os espectros SRS da solução DMSO usando ImageJ ou MATLAB. Encaixe o grande pico DMSO de 2.913 cm-1 a uma função gaussiana ou lorentziana no MATLAB para calcular a Largura Total na Metade Máxima (FWHM) do pico.
      NOTA: Os resultados representativos são mostrados na Figura 4. Se apenas um pico amplo estiver presente, isso significa que ou a resolução espectral é muito pobre para distinguir os dois picos e mais barras de vidro são necessárias, ou a faixa digitalizada era muito pequena para detectar o segundo pico. Normalmente, uma resolução espectral aceitável DMSO é ~20-25 cm-1 quando são usadas hastes de vidro de >60 cm. Uma resolução mais baixa é frequentemente usada para imagens de tecido para trocar por sinais mais altos com pulsos mais curtos17.
  4. (OPCIONAL) Use um autocorrelador ou um FROG (Frequency-Resolved Optical Gating) para determinar a duração do pulso de cada braço para calcular exatamente a quantidade de GDD e o comprimento das hastes necessárias para combinar com o GDD entre a bomba e os Stokes.
  5. Repetir passos 3.3.2-3.3.4 para diferentes comprimentos de hastes no feixe stokes para encontrar a resolução espectral ideal, o que significa que a melhor correspondência GDD foi encontrada experimentalmente. Use vários conjuntos de hastes de vidro que diferem em comprimento para obter uma resolução espectral ideal.

4. Caracterização do sinal para ruído (SNR)

  1. Certifique-se de que a etapa 4.2 seja realizada após o alinhamento espacial e temporal completo.
  2. Adquira uma imagem SRS correspondente ao pico raman de 2.913 cm-1 do DMSO. Abra a imagem no ImageJ e selecione uma pequena área no centro do quadro. Use a função de medida para calcular a média e o desvio padrão dos valores na área selecionada.
  3. Divida o valor médio da área selecionada pelo desvio padrão para encontrar o valor SNR, como no Eq (2).
    figure-protocol-2 (2)
    NOTA: Um bom SNR para o sistema (com uma constante de tempo de bloqueio de 4 μs) utilizando DMSO a 40 mw/40 mw em foco para ambos os braços é >800. Concentrações mais baixas de DMSO ou menor potência podem ser usadas para uma estimativa mais precisa do SNR se o cartão de aquisição de dados tiver uma profundidade de bits limitada.
  4. Se o SNR estiver muito baixo, realinhar os pulsos de laser para otimizar a sobreposição espacial, sobreposição temporal, correspondência de tamanho/colisão do feixe e/ou correspondência de dispersão. Para um objetivo com uma coleira de correção de aberração, otimize o sinal ajustando a coleira de correção.

5. Calibração do eixo de frequência

NOTA: Esta etapa é realizada para relacionar a posição do estágio de atraso com a transição de Raman digitalizada. Uma seleção cuidadosa de solventes é necessária para gerar um "Raman Ruler" apropriado. O DMSO é um solvente eficaz para ligações CH, pois tem dois picos de Raman afiados a 2.913 cm-1 e 2.994 cm-1.

  1. Salve uma varredura hiperespectral com o intervalo de estágio de atraso cobrindo os picos de 2.913 cm-1 e 2.994 cm-1 Raman de DMSO. Salve as posições de estágio correspondentes ao conjunto de dados hiperespectral.
    NOTA: O pico máximo global do espectro corresponde ao câmbio DMSO 2.913 cm-1 Raman e o segundo pico máximo corresponde ao câmbio DMSO 2.994 cm-1 Raman.
  2. Realizar regressão linear para as posições do palco e Raman muda a 2.913 cm-1 e 2.994 cm-1. Usando a equação de regressão linear relacionando a posição do palco à mudança de Raman, converta as posições de atraso para as frequências raman correspondentes.

6. Modulação ortogonal e imagem de duas cores

NOTA: A etapa de modulação ortogonal só é necessária quando é necessária uma imagem de duas cores em tempo real. Um esquema deste esquema é mostrado na Figura 5. A modulação ortogonal utiliza um par de EOMs conduzidos a um quarto da frequência laser (20 MHz para laser de 80 MHz) com uma mudança de fase de 90°entre os dois. Esta etapa de modulação ortogonal pode ser ignorada para imagens srs de cor única ou imagens de SRS hiperespectrais.

  1. Modulação EOM1
    1. Instale um PBS (PBS2), uma placa de quarto de onda (QWP2) e um segundo EOM (EOM2) no caminho do feixe de Stokes após o primeiro EOM. Desligue a entrada do sinal para EOM2. Ligue a entrada do sinal para EOM1 e ligue-a.
    2. Modular o feixe stokes (fixado em 1.040 nm) a 20 MHz (f0/4) enviando o feixe através do primeiro EOM. Ajuste a inclinação e a posição do EOM1 para garantir que o feixe esteja em linha reta e centralizou através do cristal EOM.
    3. Monitore a profundidade de modulação observando ambas as polarizações que saem do PBS1 com duas fotodiodes e exibindo a modulação em um osciloscópio.
    4. Ajuste a tensão QWP1, EOM1 e a fase da entrada de 20 MHz (usando um shifter de fase) para otimizar a profundidade de modulação do feixe transmitido para estar perto de 100%. Consulte a Figura 2B para obter uma ilustração de uma boa profundidade de modulação.
  2. Modulação EOM2
    1. Desligue o EOM1 e conecte o EOM2.
    2. Envie a saída de alta tensão do segundo amplificador a 20 MHz para EOM2. Ajuste a inclinação e a posição do EOM2 para garantir que o feixe esteja em linha reta e centralizou através do cristal EOM.
    3. Mais uma vez, monitore a profundidade da modulação olhando para ambas as polarizações que saem do PBS2 com um osciloscópio. Ajuste a tensão QWP2, EOM2 e o câmbio de fase conforme necessário para alcançar quase 100% de modulação para ambas as polarizações.
    4. Certifique-se de que a modulação do trem de pulso tenha uma mudança de fase de 90° a partir da primeira modulação.
      NOTA: Se os dois trens de pulso da bomba não estiverem 90° ortogonais, o crosstalk entre os dois canais será um problema.
    5. Teste a ortogonalidade da modulação ligando e conectando tanto o EOM1 quanto o EOM2. Monitore ambas as polarizações sendo divididas pelo PBS2 com um osciloscópio. Reotimize EOM1 e EOM2 individualmente se o trem de pulso após o segundo PBS não se assemelhar à Figura 2C.
    6. Instale um cristal de quartzo birefringent de 20 mm (BRC) e HWP a jusante de EOM2. Conecte os dois EOMs de uma só vez e monitore o trem de pulso de tal forma que se assemelhe à Figura 2D.
      NOTA: Para o chirp usado neste experimento, 20 mm BRC induz um atraso de tempo que corresponde a uma mudança raman de 80 cm-1 . Um comprimento BRC diferente pode ser necessário se um chirp diferente for usado.
  3. Calibração
    1. Calibrar o sistema usando OMSO detectando sinais do amplificador de bloqueio X e saída de canal Y (enviado aos canais 2 e 3 do cartão de aquisição de dados).
    2. Verifique se os sinais gerados pelo pico de 2.913 cm-1 a partir da polarização mais rápida e que a partir da polarização mais lenta estão perto de 90° fora de fase no amplificador lock-in. Se este não for o caso, ajuste o alinhamento EOM até que os dois sinais estejam perto de 90° fora de fase.
    3. Uma vez que a calibração esteja completa, encontre a posição de atraso que sonda a transição proteica em 2.930 cm-1 para um dos feixes ortogonais. Certifique-se de que a outra polarização sonda a transição lipídica de 2.850 cm-1.

7. Imagem SRS do modo epi

NOTA: No esquema de imagem do modo de transmissão, o objetivo concentra o laser na amostra e, em seguida, uma lente condensadora direciona o feixe transmitido para um fotodiodo para detecção de bloqueio. No esquema de imagem do modo epi, a luz que é retroacionada e despolarizada pela amostra é recolhida pelo objetivo de foco e isolada usando um divisor de feixe polarizador. Os fótons isolados e recattered são enviados para um fotodiodo através de um par de lentes de relé para detecção de lock-in. A figura 6 retrata o esquema de imagem do modo epi.

  1. Instale um HWP antes que o feixe entre no microscópio para alterar a polarização do feixe que vai para o microscópio. Coloque um PBS acima do objetivo de permitir que o feixe despolarizado refletido para chegar ao detector.
  2. Use um par de lentes compostas por uma lente de acromat de 75 mm e uma lente asférica de 30 mm para retransmitir os fótons backscattered da abertura traseira do objetivo para o fotodetetor. Monte o detector para coletar a luz resqueada dirigida pela PBS. Instale um filtro para impedir que o feixe modulado entre no detector.
  3. Coloque a amostra de tecido sob o objetivo. Como o condensador é desnecessário para imagens de modo epi, remova-o se for necessário mais espaço.
  4. Imagiologia
    1. Bloqueie o feixe com um obturador; brilhar uma fonte de luz branca sobre a amostra do lado; e usar brightfield para encontrar foco objetivo.
    2. Desbloqueie ambos os feixes e use as posições de atraso pré-calibradas para adquirir imagens de SRS lipídicos e proteicos a partir do tecido das duas saídas do amplificador lock-in.
    3. Ajuste o fator de ganho de bloqueio e caixa de pixels para adquirir imagens de boa qualidade.

8. Coloração de cor falsa

  1. Abra a pilha de imagens com ImageJ.
  2. Retire as duas imagens que correspondem às espécies lipídica (2.850 cm-1) e proteína (2.930 cm-1) clicando com o botão direito do mouse na imagem e clicando em Duplicata.
  3. Renomeie a imagem lipídica para lipídios e a imagem proteica para proteínas.
  4. Vá para processá-| Calculadora de imagens e realizar proteínas subtraem lipídios.
  5. Combine as imagens indo para Image | | de cor Mesclar canais, colocando lipídios em verde e proteínas em azul. Abra a ferramenta canais de imagem (| de imagem | de cor Ferramenta de canais) e ajuste o brilho e o contraste (| de imagem Ajuste | Brilho/Contraste).
  6. Ajuste o brilho e o contraste para cada canal usando a ferramenta de canais . Para o canal lipíduo, ajuste o contraste até que as características celulares pareçam escuras. Para o canal de proteínas, ajuste o contraste até que as características celulares pareçam azuis. Converta a imagem verde/azul do canal mesclado em uma imagem RGB indo para Image | Tipo | Cor RGB. Exporte esta imagem por | de arquivos Salve como | Tiff, o que está tendo?
    NOTA: Para a falsa coloração de H&E, o esquema de cores mostra citoplasma rosa, enquanto os núcleos são azul-roxo escuro.
  7. Baixe o script HE.m MATLAB do falso recurso de script de coloração H&E na Tabela de Materiais.
  8. Execute o script HE.m no MATLAB. Selecione a imagem RGB exportada da etapa anterior para gerar uma imagem artificialmente manchada de H&E.
  9. (OPCIONAL) Normalize a intensidade da imagem para imagens de grande campo de visão porque a imagem aparece mais escura na periferia do que no centro.
    1. Para realizar a normalização de campo das imagens, média do maior número possível de imagens. Em seguida, remova os recursos de intensidade com ImageJ (Processe | Filtros | | de Borrão Gaussiano Raio=50).
    2. Meça a intensidade máxima da imagem borrada (Ctrl+M). Divida a imagem desfocada pela intensidade máxima (Processar | | de matemática Divida). Divida a imagem SRS bruta pela imagem borrada (Processe | | de imagem Calculadora).

Acesso restrito. Inicie sessão ou comece um teste para visualizar este conteúdo.

Resultados

Otimização da resolução espectral:
A dispersão através de um material é afetada pelo meio dispersivo (comprimento e material) e comprimento de onda. A alteração do comprimento da haste de dispersão afeta a resolução espectral e o tamanho do sinal. É uma relação de dar e receber que pode ser ponderada de forma diferente dependendo da aplicação. As hastes esticam o pulso do feixe de ser larga em frequência e estreita no tempo para ser estreita em frequência e larga no tempo. A Figur...

Acesso restrito. Inicie sessão ou comece um teste para visualizar este conteúdo.

Discussão

O esquema de imagem SRS de duas cores apresentado neste protocolo depende da implementação adequada de imagens SRS de uma cor. Em imagens de SRS de uma cor, as etapas críticas são alinhamento espacial, alinhamento temporal, profundidade de modulação e mudança de fase. A combinação espacial dos dois feixes é realizada por um espelhodicróico. Vários espelhos de direção são usados para ajuste fino ao enviar as vigas para o espelho dicroico. Uma vez que os feixes são combinados com o espelho dicroico, o alinhamento espacial ...

Acesso restrito. Inicie sessão ou comece um teste para visualizar este conteúdo.

Divulgações

Os autores declaram que não há conflitos de interesse.

Agradecimentos

Este estudo foi apoiado pelo NIH R35 GM133435 a D.F.

Acesso restrito. Inicie sessão ou comece um teste para visualizar este conteúdo.

Materiais

Lista de materiais utilizados neste artigo
NomeEmpresaNúmero de catálogoComentários
Lente acromática de 100 mmTHORLABSAC254-100-BBanda larga, 650 - 1.050 nm, distância focal da lente acromática, filtro passa-banda de 100 mm
20 MHzMinicircuitosBBP-21.4+Filtro passa-banda LC concentrado, 19,2 - 23,6 MHz, 50 e ômega;
Lente acromática de 200 mmTHORLABSAC254-200-BBanda larga, 650 - 1.050 nm, distância focal da lente acromática, 200 mm
Meia placa de onda acromáticaUnion OpticWPA2210-650-1100-M25.4Banda larga meia placa de onda
AcromáticaUnion OpticWPA4210-650-1100-M25.4Wideplate Quarter waveplate
Beam SamplerTHORLABSBSN1110:90 Espelho
dicróico dicroicode feixe de placas THORLABSDMSP1000Outros dicróicos com comprimento de onda central em torno de 1.000 nm podem ser usados.
DMSO (dimetilsulfóxido)Sigma Aldrich472301Solvente para calibração do deslocamento Raman. Outros solventes com picos Raman conhecidos podem ser usados.
Modulador de amplitude eletro-ópticoTHORLABSEO-AM-NR-C1São necessários dois EOMs para modulação ortogonal e imagem de canal duplo. A versão ressonante é recomendada para que uma tensão de acionamento mais baixa possa ser usada.
Falso H& Script de coloração EMatlabhttps://github.com/TheFuGroup/HE_Staining
Fanout BufferPRL-414BPulse Research Lab1:4 TTL/CMOS Fanout Buffer e Line Driver, para gerar a frequência de condução EOM e a referência ao
fotodiodo rápidode bloqueio THORLABSDET10A2Si Detector, 1 ns Tempo de subida
Divisor de frequênciaPRL-220ALaboratóriode pesquisa de pulsoDivisor de frequência TTL (f/2, f/4, f/8, f/16), para geração de 20MHz a partir da saída do laser.
Hastes de vidro altamente dispersivasUnion OpticCYLROD01Lente de haste H-ZF52A de alta dispersão 120 mm, SF11 Lente de haste 100 mm
Sistema Insight DS+NewportLaser capaz de emitir dois lasers pulsados sincronizados (um feixe fixo a 1.040 nm e um feixe sintonizável, variando de 680-1.300 nm) com uma taxa de repetição de 80 MHz. 
Amplificador de bloqueioLiquid InstrumentsMoku LabAmplificador de bloqueio para extrair o sinal SRS do fotodiodo. Um instrumento Zurich HF2LI ou instrumento semelhante também pode ser usado.
EspelhosTHORLABSBB05-E03-10Espelho dielétrico de banda larga, 750 - 1.100 nm. Espelhos prateados também podem ser usados.
Estágio de atraso motorizadoZaberX-DMQ12P-DE52Estágio de atraso para controle fino da sobreposição temporal da bomba e dos lasers Stokes. Qualquer outro estágio motorizado deve funcionar.
Condensador de imersão em óleoNikonCSC10031.4 NA. Outros condensadores com NA>1.2 podem ser usados.
OsciloscópioTektronixTDS7054Qualquer outro osciloscópio com largura de banda de 400 MHz ou superior deve funcionar.
Deslocador de faseSigaTekSF50A2Para deslocar a fase da frequência de modulação
FotodiodoHamamatsu CorpS3994-01Diodo PIN de silício com grande área (10 x 10 cm2). Outros diodos com grande área e baixa capacitância podem ser usados.
Divisor de feixe polarizadorUnion OpticPBS9025-620-1000Divisor de feixe polarizador de banda
larga Banco de dadosrefractiveindex.info
RetrorrefletorEdmund Optics34-408BBAR Prisma de ângulo reto. Outros prismas ou retrorrefletores podem ser usados.
Minicircuitosamplificador de potência RFZHL-1-2W +bloco de ganho, 5 - 500 MHz, 50 e ômega;
Espelhos de varreduraCambridge Technologies6215HUsamos um conjunto de espelhos de 5 mm com revestimento prateado
ScanImageVidrioScanImage BasicSoftware de controle de microscópio de varredura a laser
Filtro ShortpassTHORLABSFESH1000Filtro Shortpass Premium de 25,0 mm, Comprimento de onda de corte: 1.000 nm. Para uma supressão eficiente dos Stokes, dois filtros podem ser necessários.
Microscópio verticalNikonEclipse FN1Qualquer outra estrutura de microscópio pode ser usada. Se um microscópio de varredura a laser estiver disponível, ele pode ser usado diretamente. Caso contrário, um scanner galvo e uma lente de varredura precisavam ser adicionados ao microscópio.
Objetiva de imersão em águaOlympusXLPLN25XWMP2A objetiva multifotônica 25X tem um NA de 1,05. Outros objetivos semelhantes podem ser usados.
divisor de índice de refatividade de

Referências

  1. Fischer, A. H., Jacobson, K. A., Rose, J., Zeller, R. Hematoxylin and eosin staining of tissue and cell sections. Cold Spring Harbor Protocols. 2008, (2008).
  2. Cui, M., Zhang, D. Y. Artificial intelligence and computational pathology. Laboratory Investigation. 101 (4), 412-422 (2021).
  3. Freudiger, C. W., et al. Label-free biomedical imaging with high sensitivity by stimulated Raman scattering microscopy. Science. 322 (5909), 1857-1861 (2008).
  4. Orringer, D. A., et al. Rapid intraoperative histology of unprocessed surgical specimens via fibre-laser-based stimulated Raman scattering microscopy. Nature Biomedical Engineering. 1, 0027(2017).
  5. Ji, M., et al. label-free detection of brain tumors with stimulated Raman scattering microscopy. Science Translational Medicine. 5 (201), (2013).
  6. Hollon, T. C., et al. Near real-time intraoperative brain tumor diagnosis using stimulated Raman histology and deep neural networks. Nature Medicine. 26 (1), 52-58 (2020).
  7. Shin, K. S., et al. Intraoperative assessment of skull base tumors using stimulated Raman scattering microscopy. Scientific Reports. 9 (1), 20392(2019).
  8. Lu, F. -K., et al. Label-free neurosurgical pathology with stimulated Raman imaging. Cancer Research. 76 (12), 3451-3462 (2016).
  9. Shin, K. S., et al. Quantitative chemical imaging of breast calcifications in association with neoplastic processes. Theranostics. 10 (13), 5865-5878 (2020).
  10. Fu, D., Holtom, G., Freudiger, C., Zhang, X., Xie, X. S. Hyperspectral imaging with stimulated Raman scattering by chirped femtosecond lasers. The Journal of Physical Chemistry B. 117 (16), 4634-4640 (2013).
  11. Figueroa, B., Hu, R., Rayner, S. G., Zheng, Y., Fu, D. Real-time microscale temperature imaging by stimulated Raman scattering. The Journal of Physical Chemistry Letters. 11 (17), 7083-7089 (2020).
  12. Saar, B. G., et al. Video-rate molecular imaging in vivo with stimulated Raman scattering. Science. 330 (6009), 1368-1370 (2010).
  13. Hill, A. H., Hill, A. H., Manifold, B., Manifold, B., Fu, D. Tissue imaging depth limit of stimulated Raman scattering microscopy. Biomedical Optics Express. 11 (2), 762-774 (2020).
  14. Fu, D., et al. Imaging the intracellular distribution of tyrosine kinase inhibitors in living cells with quantitative hyperspectral stimulated Raman scattering. Nature Chemistry. 6 (7), 614-622 (2014).
  15. Zhang, L., et al. Spectral tracing of deuterium for imaging glucose metabolism. Nature Biomedical Engineering. 3 (5), 402-413 (2019).
  16. Tsai, P. S., et al. Principles, design, and construction of a two-photon laser-scanning microscope for in vitro and in vivo brain imaging. In Vivo Optical Imaging of Brain. Frostig, R. D., et al. , CRC Press. 113-171 (2002).
  17. Francis, A., Berry, K., Chen, Y., Figueroa, B., Fu, D. Label-free pathology by spectrally sliced femtosecond stimulated Raman scattering (SRS) microscopy. PLoS One. 12 (5), 0178750(2017).
  18. Figueroa, B., et al. Broadband hyperspectral stimulated Raman scattering microscopy with a parabolic fiber amplifier source. Biomedical Optics Express. 9 (12), 6116-6131 (2018).
  19. Kong, L., et al. Multicolor stimulated Raman scattering microscopy with a rapidly tunable optical parametric oscillator. Optics Letters. 38, 145-147 (2013).
  20. He, R., et al. Dual-phase stimulated Raman scattering microscopy for real-time two-color imaging. Optica. 4 (1), 44-47 (2017).
  21. Pence, I. J., Kuzma, B. A., Brinkmann, M., Hellwig, T., Evans, C. L. Multi-window sparse spectral sampling stimulated Raman scattering microscopy. Biomedical Optics Express. 12 (10), 6095-6114 (2021).
  22. Wei, M., et al. Volumetric chemical imaging by clearing-enhanced stimulated Raman scattering microscopy. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 116 (14), 6608-6617 (2019).
  23. Wright, A. J., et al. Adaptive optics for enhanced signal in CARS microscopy. Optics Express. 15 (26), 18209-18219 (2007).

Acesso restrito. Inicie sessão ou comece um teste para visualizar este conteúdo.

Reimpressões e permissões

Etiquetas

SRS de duas coresfocaliza o espectralimagem do c rebro de camundongoimagem em tempo realSRS em modo epiimagem de picos Ramanmicroscopia pump probeequivalente a hematoxilina e eosina