A maneira mais significativa pela qual o modelo aqui descrito difere dos modelos de inoculação vaginal publicados anteriormente é o uso de bactérias cultivadas anaerobicamente, que requerem considerações especiais para a preparação de inóculo viável e a recuperação de bactérias dos camundongos. As etapas específicas do protocolo acima podem variar ligeiramente dependendo da espécie/cepa de bactérias utilizadas, conforme sugerido no Arquivo Suplementar 1. Além disso, este manuscrito descreve um novo método processual para a administração de bactérias e lavagens vaginais que requer menos experiência por parte do investigador e menos contenção para os camundongos. Se o experimentador não se sentir confortável com a forma de contenção descrita na etapa 3.2. e na etapa 3.3., os camundongos podem, em vez disso, ser desgrenhados como descrito anteriormente34 com ou sem anestesia de acordo com o desenho experimental e as diretrizes institucionais da IACUC.
Uma ressalva importante para o uso de bactérias cultivadas anaerobicamente em modelos murinos é que certas etapas (como qualquer envolvimento de animais vivos) devem ser feitas fora da câmara anaeróbica. Portanto, as etapas mais críticas neste protocolo são aquelas em que as bactérias de interesse serão expostas a um ambiente aeróbio, como durante a inoculação dos camundongos. A utilização de qualquer novo anaeróbio neste modelo exigirá uma investigação preliminar sobre a sua capacidade de manter a viabilidade após a exposição ao oxigénio (tal como a comparação das UFC pré e pós-inoculação, conforme descrito nos passos 2.5 e 3.4.). Dependendo do grau de oxigénio e da sensibilidade ao PBS do organismo, devem ser considerados diferentes métodos de preparação do inóculo (Dossier Suplementar 1, passo 2.4.5.). Para inoculações usando G. vaginalis JCP8151B, descobrimos que um único tubo de inóculo pode ser preparado em PBS e usado para infectar todos os camundongos. Se estiver a ser utilizada uma bactéria anaeróbia diferente que seja mais sensível ao oxigénio, o inóculo pode ser preparado em tubos separados para cada rato, de modo a que não seja necessária uma abertura/fecho repetido do tubo. Da mesma forma, se a espécie bacteriana de interesse é mais fastidiosa/menos capaz de sobreviver em PBS do que G. vaginalis, a inoculação pode ser preparada em meios de cultura. Se o meio utilizado contiver agentes redutores, como o meio anaeróbio CDC usado para cultivar Prevotella bivia (Arquivo Suplementar 1, etapa 2.1. e etapa 2.2.), as bactérias também terão maior proteção contra a exposição ao oxigênio.
Métodos alternativos de homogeneização também podem ser considerados, como o batimento de esferas22,35, que é feito com a tampa do tubo fechada e pode, portanto, introduzir menos oxigênio do que o homogeneizador portátil. Além disso, organismos mais sensíveis ao oxigênio podem exigir um tempo de equilíbrio mais longo para a mídia. Um indicador de oxigénio, como a resazurina, pode ser utilizado para verificar se as condições anaeróbias foram atingidas (passo 2.1.). Métodos alternativos, como frascos anaeróbios, podem afetar os resultados e devem ser examinados quanto à viabilidade bacteriana antes do uso.
A sensibilidade ao oxigênio e a fastidiosidade do organismo experimental também podem desempenhar um papel na recuperação bem-sucedida de bactérias viáveis do camundongo durante lavagens/homogeneização (Arquivo Suplementar 1, etapa 3.2. e etapa 5.1.). Para organismos altamente sensíveis, o tempo entre a lavagem sendo tomada e banhada pode levar a uma perda de viabilidade e causar uma estimativa artificialmente baixa de colonização vaginal bacteriana. Para mitigar esse efeito, as lavagens coletadas podem ser imediatamente diluídas em meios de cultura anaeróbicos frescos (com agente redutor). Da mesma forma, a homogeneização de órgãos pode ser feita em meios de cultura frescos em vez de PBS para aumentar a viabilidade bacteriana e também pode ser feita na própria câmara anaeróbia para minimizar a exposição ao oxigênio.
Dependendo do propósito de um determinado experimento, o experimentador deve prestar atenção aos grupos de controle. Para testar hipóteses, as medidas basais de camundongos controle não infectados que são tratados com veículo sozinho ajudarão a estabelecer se há indução de quimiocinas/citocinas ou outros resultados específicos de infecção. O veículo de controlo utilizado deve ser o mesmo que o veículo utilizado para a inoculação, pelo que, se as bactérias forem inoculadas em meios de cultura, deve ser utilizado como comando o meio de cultura não inoculado (dossier suplementar 1, passo 2.4.5.).
Os métodos descritos neste protocolo também poderiam ser aplicados a bactérias facultativas capazes de crescer anaerobicamente, mas que são tradicionalmente estudadas usando condições de cultura aeróbia (como Escherichia coli ou Streptococcus do Grupo B). Isso pode ser especialmente relevante para infecções por esses organismos em locais do corpo que se acredita conter baixos níveis de oxigênio, como o colo do útero. Pode ser que um organismo facultativo infecte com mais sucesso locais com menos oxigênio quando o inóculo é preparado anaerobicamente em comparação com a aeróbia. Em tal experimento, a recuperação de bactérias viáveis para a enumeração de UFC pode não exigir condições anaeróbias.