Os recém-nascidos ingerem cepas maternas de E. coli que colonizam seu trato intestinal na época do parto. Cepas de E. coli com a capacidade de se deslocar através do intestino invadem a corrente sanguínea do recém-nascido, causando bacteremia com risco de vida. A metodologia aqui apresentada utiliza células epiteliais intestinais polarizadas cultivadas em pastilhas semipermeáveis para avaliar a transcitose de isolados de bacteremia neonatal de E. coli in vitro. Este método usa a linhagem celular intestinal T84 estabelecida que tem a capacidade de crescer até a confluência e formar junções apertadas e desmossomos. Após atingir a confluência, as monocamadas maduras de T84 desenvolvem resistência transepitelial (TEER), que pode ser quantificada usando um voltímetro. Os valores de TEER estão inversamente correlacionados com a permeabilidade paracelular de componentes extracelulares, incluindo bactérias, através da monocamada intestinal. A passagem transcelular de bactérias (transcitose), por outro lado, não altera necessariamente as medidas do TEER. Neste modelo, a passagem bacteriana através da monocamada intestinal é quantificada por até 6 h pós-infecção, e medições repetidas de TEER são feitas para monitorar a permeabilidade paracelular. Além disso, esse método facilita o uso de técnicas como a imunocoloração para estudar as mudanças estruturais em junções apertadas e outras proteínas de adesão célula a célula durante a transcitose bacteriana através do epitélio polarizado. O uso deste modelo contribui para a caracterização dos mecanismos pelos quais a E. coli neonatal transcita através do epitélio intestinal para produzir bacteremia.