Este protocolo descreve um método de triagem de alto rendimento baseado em citometria de fluxo para identificar drogas de moléculas pequenas que inibem a ativação de integrinas β2 em neutrófilos humanos.
Method Article
Este protocolo descreve um método de triagem de alto rendimento baseado em citometria de fluxo para identificar drogas de moléculas pequenas que inibem a ativação de integrinas β2 em neutrófilos humanos.
Este protocolo visa estabelecer um método para identificar pequenos antagonistas moleculares da ativação de integrinas β2, utilizando anticorpos notificadores de mudança conformacional e citometria de fluxo de alto rendimento. O método também pode servir como um guia para outros métodos de triagem de alto rendimento baseados em anticorpos. As integrinas β2 são moléculas de adesão leucocitárias específicas que são cruciais na resposta imune. Os neutrófilos dependem da ativação da integrina para sair da corrente sanguínea, não apenas para combater infecções, mas também para estar envolvidos em múltiplas doenças inflamatórias. O controle da ativação das integrinas β2 apresenta uma abordagem viável para o tratamento de doenças inflamatórias associadas a neutrófilos. Nesse protocolo, um anticorpo monoclonal, mAb24, que se liga especificamente ao headpiece de alta afinidade das integrinas β2, é utilizado para quantificar a ativação da integrina β2 em neutrófilos humanos primários isolados. N-formilmetionil-leucil-fenilalanina (fMLP) é usado como um estímulo para ativar integrinas β2 neutrófilos. Um citômetro de fluxo de alto rendimento capaz de executar automaticamente amostras de placas de 384 poços foi usado neste estudo. Os efeitos de 320 produtos químicos na inibição da integrina β2 são avaliados dentro de 3 h. Moléculas que têm como alvo direto integrinas β2 ou moléculas-alvo na via de sinalização de ativação de dentro para fora da integrina iniciada pelo receptor acoplado à proteína G podem ser identificadas através desta abordagem.
Muitas doenças inflamatórias são caracterizadas pela infiltração de neutrófilos no local do edema ou lesão1. Para infiltração desses tecidos, os neutrófilos devem completar a cascata de recrutamento de neutrófilos, que envolve parada no endotélio, extravasamento através da parede do vaso e recrutamento para o tecido2. Os neutrófilos circulantes necessitam da ativação da integrina β2 para completar essa cascata, especialmente para a fase de parada. Assim, drogas inibidoras de integrinas que reduzem a adesão, o extravasamento e o recrutamento de neutrófilos podem efetivamente tratar doenças inflamatórias 3,4.
As integrinas β2 já foram alvo de doenças inflamatórias anteriormente. O efalizumabe, um anticorpo monoclonal que tem como alvo direto a integrina αLβ2, foi desenvolvido para o tratamento da psoríase5. Entretanto, o efalizumabe foi suspenso devido ao seu efeito colateral letal - leucoencefalopatia multifocal progressiva resultante da reativação do vírus JC 6,7. Novas terapias anti-inflamatórias baseadas em integrinas devem considerar a manutenção das funções anti-infecciosas dos leucócitos para minimizar os efeitos colaterais. Os efeitos colaterais do efalizumabe podem ser devidos à circulação prolongada de anticorpos monoclonais na corrente sanguínea, o que poderia inibir as funções imunes em longo prazo8. Um estudo recente mostra que o efalizumabe medeia ligações cruzadas αLβ2 e a internalização indesejada de integrinas α4, fornecendo uma explicação alternativa para os efeitos colaterais9. Assim, antagonistas de pequenas moléculas de curta duração poderiam evitar esse problema.
Um método de alto rendimento para triagem de antagonistas de integrinas β2 de pequenas moléculas usando neutrófilos humanos é apresentado aqui. A ativação da integrina β2 requer mudanças conformacionais do ectodomínio da integrina para obter acesso e aumentar sua afinidade de ligação ao seu ligante. No modelo canônico de switchblade, o ectodomínio de integrina dobrado-fechado primeiro se estende a uma conformação estendida-fechada e, em seguida, abre seu cabeçote para uma conformação estendida-aberta totalmente ativada10,11,12,13. Há também uma via alternativa que parte do dobrado-fechado para o dobrado-aberto e estendido-aberto, eventualmente 14,15,16,17,18,19. O anticorpo conformação-específico mAb24 liga-se a um epítopo no domínio β2-I-like humano quando a cabeça do ectodomínio está aberta20,21,22,23.
Aqui, mAb24-APC é usado para determinar se as integrinas β2 estão ativadas. Para ativar neutrófilos e integrinas, N-formilmetionil-leucil-fenilalanina (fMLP), um peptídeo quimiotático curto derivado de bactérias que pode ativar integrinas β2 de neutrófilos24, é usado como estímulo nesse protocolo. Quando fMLP se liga ao Fpr1 em neutrófilos, cascatas de sinalização a jusante envolvendo proteínas G, fosfolipase Cβ e γ de fosfoinositida 3-quinase são ativadas. Esses eventos de sinalização acabam resultando na ativação da integrina através da via de sinalização de dentro para fora18,25. Além de antagonistas de pequenas moléculas que se ligam diretamente às integrinas β2 e impedem mudanças conformacionais da ativação da integrina26, compostos que podem inibir componentes da via de sinalização de ativação de dentro para fora da integrina β2 também seriam detectados com este método. Os citômetros de fluxo automatizados permitem a triagem de alto rendimento. A identificação de novos antagonistas pode não apenas aprofundar nossa compreensão da fisiologia das integrinas, mas também fornecer informações translacionais sobre a terapia anti-inflamatória baseada em integrina.
Amostras de sangue total heparinizadas foram obtidas de doadores humanos saudáveis não identificados após a obtenção do consentimento informado, conforme aprovado pelo Comitê de Ética em Pesquisa da UConn Health, seguindo os princípios da Declaração de Helsinque. Todos os doadores assinaram o termo de consentimento livre e esclarecido. Os critérios de inclusão/exclusão deste estudo foram cuidadosamente desenvolvidos para garantir a adequação dos participantes e minimizar potenciais riscos. Os participantes elegíveis tinham idade entre 18 e 65 anos, de qualquer etnia, fluentes na língua inglesa e capazes de fornecer consentimento informado. Os participantes excluídos incluíram aqueles incapazes de fornecer consentimento informado para si mesmos, tais como aqueles que exigem um representante legalmente autorizado, indivíduos com menos de 18 anos ou mais de 65 anos, indivíduos encarcerados e mulheres grávidas. Além disso, os participantes tinham que estar livres do uso de medicamentos anti-inflamatórios e condições inflamatórias. Infecções atuais ou condições inflamatórias crônicas ou agudas em curso também foram critérios de exclusão. Finalmente, os indivíduos com uma história actual ou recente da infecção COVID-19 eram inelegíveis para o estudo. Esses critérios foram elaborados para garantir a segurança e adequação dos participantes, minimizando potenciais fatores de confusão que poderiam impactar os resultados do estudo.
1. Preparação dos reagentes
2. Isolamento de neutrófilos do sangue humano
3. Preparação da placa de 384 poços
4. Tratamento de células
5. Citometria de fluxo
6. Análise dos dados
Dados de uma triagem representativa de placas de 384 poços (Figura 4) revelaram que os controles negativos tinham uma MFI de mAb24-APC de 3236 ± 110, enquanto os controles positivos tinham uma MFI de mAb24-APC de 7588 ± 858. O fator Z' para esta placa é de aproximadamente 0,33, que está dentro de uma faixa aceitável31. No entanto, Z' requer validação adicional em ensaios secundários.
Para normalizar os dados, todos os valores foram dimensionados para atribuir um valor máximo de 1 para a média positiva e um valor mínimo de 0 para a média negativa. O fator Z' passará por validação mais rigorosa em ensaios secundários. O ponto de corte para essa placa é de 0,41, o que significa que amostras com MFI relativo menor que 0,41 serão consideradas como acertos inibidores da ativação da integrina β2 induzida por fMLP em neutrófilos humanos. Nenhuma batida foi identificada a partir desta placa.
Para confirmar a eficácia do protocolo, foram utilizados o Nexinhib20, que inibe a ativação da integrina β2 antagonizando a função Rac-1, e o lifitegrast, que antagoniza diretamente a integrina αLβ232,33. No entanto, os tempos de incubação foram ajustados para uma hora para Nexinhib20 e meia hora para lifitegrast. Os dados resultantes desses experimentos foram normalizados usando o mesmo método de escalonamento descrito acima. Esses dados foram então combinados com os resultados da placa e analisados coletivamente (Figura 4).

Figura 1: Layout da placa para peneiramento composto. Um diagrama esquemático ilustrando a disposição dos compostos de triagem e controles em uma placa de 384 poços. Os poços de controle negativo são representados em azul (colunas 1 e 23), e os poços de controle positivo são mostrados em vermelho (colunas 2 e 24). Os poços de teste estão representados em bege (colunas 3 a 22). As setas indicam a sequência de leitura da placa. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 2: Separação dos neutrófilos utilizando meio de gradiente de densidade. Fotos representativas demonstrando a separação bem-sucedida e malsucedida de neutrófilos usando meio de gradiente de densidade. (A) Inicialmente, 4 mL de sangue são estratificados em 8 mL de meio de gradiente de densidade. (B) Após a centrifugação, duas bandas turvas devem ser visíveis: a banda superior contendo principalmente células mononucleares do sangue periférico (PBMCs) e a banda inferior contendo principalmente neutrófilos com algumas hemácias. A maioria das hemácias é peletizada na parte inferior. (C) Uma separação malsucedida onde as hemácias não são peletizadas e a banda de neutrófilos não é observada. Centrifugação adicional (10-30 min) seria necessária para separar a banda de neutrófilos. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 3: Agrupamento de neutrófilos utilizando gráficos FSC/SSC. Gráficos representativos de espalhamento anterior (FSC) e espalhamento lateral (SSC) ilustrando a estratégia de gating para identificar neutrófilos. (A) Os neutrófilos são fechados com base na área de espalhamento anterior (FSC-A) e dispersão lateral (SSC-A) registrada pelo citômetro de fluxo. (B) As células individuais são ainda limitadas com base na largura (FSC-W) e altura (FSC-H) da dispersão para a frente, e (C) na largura (SSC-W) e altura (SSC-H) da dispersão lateral. A escala de cores representa a densidade celular, fazendo a transição do vermelho para o amarelo, verde e azul à medida que a densidade diminui. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 4: Resultados da triagem em uma placa representativa de 384 poços. A triagem resulta de uma placa representativa de 384 poços, demonstrando um fator Z' de 0,3. Os controles negativo e positivo são indicados por pontos azuis e vermelhos, respectivamente. Amostras de teste tratadas com vários compostos são representadas como pontos bege. A linha tracejada representa o ponto de corte da intensidade média de fluorescência (MFI) para identificar acertos. Nenhum dos compostos testados foi identificado como antagonistas de integrinas β2, pois todos os compostos testados apresentaram valores de IFM acima da linha de corte. Resultados de experimentos independentes testando antagonistas de integrina β2 conhecidos com tempos de incubação variados (Nexinhib20 por 1 h, lifitegrast por meia hora) são agrupados para apresentação nesta figura. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
O início e o término da estimulação e coloração de neutrófilos são determinados pela adição de neutrófilos e do PFA fixador. Portanto, garantir o mesmo intervalo de tempo entre a pipetagem de neutrófilos ou PFA em cada coluna é fundamental. Isso garante que o tempo de estimulação e coloração dos neutrófilos de cada poço permaneça consistente. Devido ao curto tempo de vida dos neutrófilos, todo o experimento, desde a coleta de sangue de doadores até a conclusão da citometria de fluxo, deve ser realizado no mesmo dia. Os neutrófilos são altamente sensíveis às mudanças de temperatura e podem ser ativados quando expostos a aumentos rápidos de temperatura, como a transição de 4 °C para a temperatura ambiente ou da temperatura ambiente para 37 °C. Além disso, com base em nossa experiência anterior, a ativação da integrina β2 de neutrófilos induzida por fMLP não ocorre quando as células são armazenadas em gelo ou a 4 °C (dados não mostrados). Portanto, antes da fixação, o sangue total e os neutrófilos devem ser mantidos à temperatura ambiente ou a 20 °C (durante a etapa de centrifugação de isolamento). Não coloque sangue total e neutrófilos no gelo.
A coloração de mAb24 em controles negativos deve produzir resultados muito baixos. Se um alto nível de coloração de mAb24 for observado em um experimento, verifique o seguinte: (1) se houve uma mudança significativa de temperatura durante o experimento antes da fixação; (2) se houve contaminação por fMLP ou endotoxina no meio neutrófilo; (3) se o manuseio da amostra foi muito agressivo, como a geração de bolhas durante a pipetagem e mistura.
O protocolo atual emprega mAb24 para relatar a abertura do headpiece de integrina β2. Teoricamente, o KIM127, um anticorpo monoclonal que relata a extensão das integrinas β2 34,35, pode ser usado em conjunto com o mAb24 para avaliar de forma abrangente a conformação das integrinas β2. No entanto, a relação sinal-ruído da coloração KIM127 (1,5 a 2 vezes) não é tão favorável quanto a do mAb24 (5 a 10 vezes), que normalmente não fornece um fator Z' satisfatório no ensaio da placa de 384 poços. No ensaio de placa de 96 poços, as amostras podem ser lavadas antes de realizar a citometria de fluxo, reduzindo os sinais de fundo derivados de anticorpos solúveis. Portanto, o ensaio baseado em KIM127 pode ser conduzido no ensaio de placa de 96 poços, que tem menor rendimento em comparação com o ensaio de placa de 384 poços.
Como esse método utiliza a intensidade da fluorescência como leitura para avaliar o efeito inibitório de integrinas de fármacos, algumas drogas fluorescentes podem interferir nos resultados. Além disso, drogas tóxicas que induzem morte de neutrófilos dentro do período de estimulação de 10 min também parecem relatar inibição de integrinas. Drogas que inibem a degranulação de neutrófilos suprimirão a expressão global de β2 integrinas. Esses inibidores de degranulação também serão identificados em nossa triagem. Portanto, a triagem secundária com outros controles é necessária para confirmar os efeitos inibitórios dos acertos. As telas secundárias são referenciadas como um meio de validar e determinar o mecanismo de ação dos acertos. Além da repetição dos testes de mAb24, a expressão total de CD18 na superfície celular será avaliada usando um anticorpo pan anti-human CD18. O nível de integrina β2 ativada, medido por mAb24, será normalizado pela expressão total de CD18. Isso nos permitirá determinar se o mecanismo de ação do agente envolve antagonizar a ativação da integrina e/ou inibir a expressão de CD18 na superfície celular. Um ensaio de viabilidade também deve ser realizado na tela secundária para excluir quaisquer efeitos tóxicos dos acertos.
Este protocolo tem limitações. Primeiro, o mAb24 é capaz de detectar o domínio β2 I-like apenas nos casos em que a integrina está em um estado de alta afinidade. Portanto, não pode identificar antagonistas alostéricos α/β I-like, como o lifitegrast, através da diminuição da ligação do mAb24. Lifitegrast induz mais ligação de mAb2432 e mostra um valor anormalmente aumentado de MFI com mAb24 (Figura 4). Para tais valores anormais, outros ensaios podem ser necessários para verificar se esses acertos são antagonistas alostéricos α/β I-like como o lifitegrast. Em segundo lugar, o fator Z' para este ensaio é subótimo e poderia ser potencialmente melhorado através do uso de pipetagem e agitação automáticas. Infelizmente, nosso laboratório não possui os equipamentos necessários para testar essa hipótese. Duplicar ou triplicar ensaios será útil na identificação de falsos positivos e negativos, caso o fator Z' não possa ser melhorado com os métodos acima. Além disso, pode ser benéfico estender o tempo de incubação para identificar mais hits, como observado com o conhecido inibidor de ativação de integrinas β2 Nexinhib20, que requer uma hora de incubação para produzir efeitos inibitórios. Este estudo teve como foco a identificação de agentes de ação rápida. Os pesquisadores devem observar que eles podem modificar o tempo de incubação para atender às suas necessidades específicas.
Até onde sabemos, este é o primeiro método de triagem de alto rendimento para antagonistas de integrinas β2. Essa abordagem poderia ser usada para identificar compostos de pequenas moléculas que se ligam diretamente às integrinas β2 e prevenir mudanças conformacionais que levam a estados de integrinas intermediárias/de alta afinidade, semelhantes a antagonistas sem propriedades "agonísticas" recentemente descritas para integrinas αIIbβ3 e α4β126. Os neutrófilos são críticos em muitas doenças inflamatórias, como lesão de isquemia-reperfusão miocárdica 36, sepse37 e doenças autoimunes38,39. Drogas de moléculas pequenas podem oferecer mais flexibilidade no tratamento dessas doenças em comparação com drogas baseadas em anticorpos. Acessos de nossa tela podem fornecer tratamentos potenciais para doenças inflamatórias.
O método atual é uma tela de alto rendimento baseada em anticorpos fluorescentes. Como anticorpos repórteres de ativação também estão disponíveis para integrinas β1 40,41,42,43,44, αIIbβ3 45,46 e αL47,48,49,50, esse método pode ser estendido para identificar antagonistas para outras integrinas. Um anticorpo conformacionalmente sensível como o HUTS-21, que se liga ao domínio híbrido β1 51,52,53, tem sido usado em uma triagem de alto rendimento para identificar antagonistas alostéricos muito tardios do antígeno-4 (VLA-4, integrina α4β1) 54. O presente método de triagem também pode ser modificado e estendido para encontrar drogas que inibem ou promovam a expressão de outros receptores de superfície, como compostos que aumentam a expressão de superfície do cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) em células da fibrose cística (FC). Na FC, múltiplas mutações levam ao desdobramento do CFTR, resultando na ausência de expressão do CFTR na membrana celular55. Demonstrou-se que fármacos de moléculas pequenas restauram a expressão de CFTR56. Para modificações no protocolo, é necessário aumentar o tempo de incubação dos fármacos para várias horas para permitir que ocorram mudanças na expressão proteica.
Os autores declaram não haver interesse financeiro concorrente.
Agradecemos ao Dr. Evan Jellison e à Sra. Li Zhu no núcleo de citometria de fluxo da UConn Health por sua assistência com a citometria de fluxo, à Dra. Lynn Puddington no Departamento de Imunologia da UConn Health por seu apoio aos instrumentos, à Sra. Slawa Gajewska e ao Dr. Paul Appleton no núcleo de pesquisa clínica da UConn Health por sua ajuda na obtenção de amostras de sangue. Agradecemos ao Dr. Christopher "Kit" Bonin e ao Dr. Geneva Hargis da UConn School of Medicine por sua ajuda com a redação científica e edição deste manuscrito. Esta pesquisa foi apoiada por subsídios do National Institutes of Health, National Heart, Lung, and Blood Institute (R01HL145454), National Institute of General Medical Sciences (P20GM121176), EUA, um Prêmio de Desenvolvimento de Carreira da American Heart Association (18CDA34110426) e um fundo de startups da UConn Health. A Figura 1 foi criada com BioRender.com.
| Name | Company | Catalog Number | Comments |
|---|---|---|---|
| Pipetas de 16 canais | Thermo | 4661090N | |
| Instrumento Placa de 384 poços | Greiner | 784201 | Materiais |
| APC anti-humano CD11a/CD18 (LFA-1) Anticorpo Clone: m24 | BioLegend | 363410 | Reagentes |
| Bravo Plataforma Automatizada de Manuseio de Líquidos | Agilent | 16050-102 | 384 manipulador de líquidos multicanal |
| Centrífuga | Eppendorf | Modelo 5810R | |
| Instrumento FlowJo | Becton, Dickinson & Empresa | NA | Software |
| Solução de Albumina de Soro Humano (25%) | GeminiBio | 800-120 | Reagentes |
| Lifitegrast | Thermofisher | 50-208-2121 | Reagentes |
| Nexinhib20 | Tocris | 6089 | Reagentes |
| N-Formyl-Met-Leu-Phe (fMLP) | Sigma | F3506 | Reagentes |
| Paraformaldeído 16% solução | Electron Microscopy Sciences | 15710 | Reagentes |
| Baldes de placa | Eppendorf | UL155 | Agitador de placa acessória |
| Instrumento Fisher | 88-861-023 | ||
| PolymorphPrep | PROGEN | 1895 (1114683 anterior) | Reagentes |
| Prestwick Chemical Library Compound Plates (10 mM) | Prestwick Chemical Libraries | Ver19_384 | 1520 pequenas moléculas, 98% de medicamentos aprovados no mercado (aprovado pela FDA, EMA, JAN e outras agências) |
| RPMI 1640 Médio, sem fenol vermelho | Gibco | 11-835-030 | Reagentes |
| Rotor de balanço-bucket | Eppendorf | A-4-62 | Rotor |
| ZE5 Analisador de Células | Bio-Rad Laboratories | Modelo ZE5 | Instrumento |
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