Quatro pacientes com GBM e um com LGG foram incluídos após confirmação patológica por um neuropatologista experiente (CMM). A maioria dos pacientes tinha um promotor de MGMT não metilado, e todos os pacientes com GBM eram do tipo selvagem IDH1 e IDH2 (Tabela 1). Em média, o processo de fabricação durou 88,8 min (+/- 6,3 min) na abordagem C e 322 min (+/- 17,2 min) na abordagem M. A taxa de sucesso global foi de 87% na abordagem manual e de 93% na abordagem chopper após 4 semanas de cultura (n = 5). Além disso, as DOPs derivadas do grupo C atingiram a forma arredondada desejada em 1 semana e estavam maduras o suficiente para serem usadas em experimentos in vitro , enquanto as DOPs do grupo M permaneceram em sua maioria com bordas acentuadas e indefinidas (Figura 2). O tecido tumoral processado com a abordagem C resultou em 281 DOP (Média por paciente = 56 +/- 43) após a primeira semana de cultura, enquanto 250 DOP (Média por paciente = 50 +/- 41) se desenvolveram com a abordagem M. Durante a segunda semana de cultura, o tecido de todos os cinco pacientes apresentou maiores números de DOP quando eles foram gerados com a abordagem C (801; Média por paciente= 130 +/- 38) em relação à abordagem M (601; Média por paciente= 76 +/- 44; P = 0,018). Durante a terceira semana de cultura, a abordagem C acumulou 1105 DOP de todos os pacientes (Média por paciente = 221 +/- 32) em comparação com 771 DOP (Média por paciente = 155 +/- 34) na abordagem M (P = 0,032). Além disso, um total de 1195 DOPs (média por paciente= 239 +/- 50) formadas após quatro semanas de cultura quando geradas com a abordagem C em comparação com 784 (Média por paciente= 157 +/- 36) utilizando a abordagem M (P < 0,01). Portanto, o método C mostrou uma contagem de DOPs significativamente maior a partir da segunda semana (Figura 3). Além disso, as flutuações relativas nas contagens de DOP foram avaliadas para explorar as tendências dinâmicas entre semanas sucessivas. A análise revelou um aumento impressionante nas contagens de DOP durante a transição inicial da primeira para a segunda semana na abordagem C (265%), o que foi indicativo de um rápido progresso. Posteriormente, houve um aumento menor nas contagens durante a terceira semana (75%), refletindo um ajuste temporário. Em contraste, a abordagem M demonstrou um aumento consistente e constante nas contagens de DOP (92% na segunda semana, respectivamente 67% na terceira semana), o que contribuiu para uma notável estabilidade nas contagens durante a quarta semana. Esta tendência ascendente consistente nas contagens de DOP sublinha a fiabilidade e a resiliência da abordagem C ao longo do período de observação.
Dois pacientes com GBM e um com LGG foram incluídos para a análise do número de astrócitos (GFAP) dentro de DOPs, proliferação de células DOP (Ki67) e apoptose (CC3). A contagem de astrócitos determinada não revelou diferenças significativas entre os dois métodos de processamento, com uma média de 43% na abordagem C e 45% na abordagem M (Figura 4 e Figura 5, Figura Suplementar 1 e Figura Suplementar 2). Da mesma forma, as taxas de proliferação dentro das DOPs foram comparáveis entre as abordagens C (3%) e M (1%). Apenas as DOPs geradas com a abordagem C do paciente 5 apresentaram uma taxa de proliferação de 26% em comparação com 1% com a abordagem M (P = 0,001; Figura 4C). Em geral, baixas taxas de apoptose foram detectadas em DOPs processadas com a abordagem C (3%) em comparação com 2% da abordagem M para todos os pacientes, que não foram significativamente diferentes (Figura 5C). Além disso, não houve diferença significativa entre os dois métodos quanto ao número de astrócitos submetidos à apoptose (Figura 5D).

Figura 1: Visão gráfica do processo de fabricação de organoides derivados do paciente (DOP) usando um helicóptero automatizado versus uma abordagem manual. A ilustração descreve as várias etapas envolvidas, incluindo (A) coleta de amostras, (B) dissecção do material tumoral, (C) lavagem e (D) incubação. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 2: Morfologia da DOP durante a primeira semana de cultivo. Comparação da formação de DOPs pós-dissecção utilizando o método de picador automático e manual. Barras de escala = 1000 μm. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 3: Contagem de DOP durante as primeiras quatro semanas de cultura. O eixo x exibe o tempo em semanas (W) e o eixo y o número de DOPs das abordagens C (azul) e M (vermelho) (n = 5). Cada ponto de dados representa a contagem média, com barras de erro indicando o erro padrão da média. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 4: Taxas de proliferação celular dentro das DOP. (A) Imagens representativas de imunofluorescência (n = 3) de células positivas para GFAP (verde), células positivas para Ki67 (vermelho) e DAPI (azul) em DOPs dos pacientes 3, 4 e 5 (Tabela 1). Todas as DOPs foram processadas pelos métodos chopper (C) e manual (M). Barras de escala = 100 μm. (B) Comparação dos dois métodos quanto ao número relativo de células positivas para GFAP, (C) células Ki67-positivas e (D) células Ki67/GFAP-duplamente positivas. Resultados não significativos são indicados por "ns". Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 5: Taxas de apoptose dentro das DOPs. (A) Imagens representativas de imunofluorescência (n = 3) de células positivas para GFAP (verde), células positivas para CC3 (vermelho) e DAPI (azul) em DOPs dos pacientes 3, 4 e 5 (Tabela 1). Todas as DOPs foram processadas pelos métodos chopper (C) e manual (M). Barras de escala = 100 μm. (B) Comparação dos dois métodos em relação ao número relativo de células positivas para GFAP, (C) células CC3-positivas e (D) células CC3/GFAP-duplamente positivas. Resultados não significativos são indicados por "ns". Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
Tabela 1: Características dos pacientes e parâmetros clínicos. GBM = glioblastoma, tipo IDH-selvagem, CNS WHO grau 4; LGG = glioma de baixo grau; KPS = escore de desempenho de Karnofsky; MGMT = O 6-metilguanina-DNA metiltransferase; IDH1 = isocitrato desidrogenase 1, IDH2 = isocitrato desidrogenase 2, ATRX = α-talassemia/retardo mental, gene ligado ao X; M = morfologia; CC = contagem celular; p = proliferação; A = apoptose. Clique aqui para baixar esta tabela.
Tabela 2: Composições médias. H-GPSA = Hibernato A-Glutamax, pencilina, estreptomicina, anfotericina B. DOP = Organoides derivados do paciente DMEM: Meio de águia modificado de Dulbecco. NEAA: aminoácidos não essenciais. Pen Strep: Penicilina / Streptomicina Clique aqui para baixar esta tabela.
Tabela 3: Visão geral das técnicas utilizadas para gerar modelos de cultura celular. Clique aqui para baixar esta tabela.
Figura suplementar 1: Canais individuais de coloração de proliferação de DOP. (A) DAPI (azul), (B) células positivas para GFAP (verde), (C) células positivas para Ki67 (vermelho) e (D) canal de sobreposição em DOPs dos pacientes 3, 4 e 5. Barras de escala = 100 μm. Clique aqui para baixar este arquivo.
Figura suplementar 2: Canais individuais de coloração de apoptose das DOPs. (A) DAPI (azul), (B) células positivas para GFAP (verde), (C) células CC3-positivas (vermelho) e (D) canal de sobreposição em DOPs dos pacientes 3, 4 e 5. Barras de escala = 100 μm. Clique aqui para baixar este arquivo.