É necessária uma assinatura do JoVE para visualizar este conteúdo. Faça login ou inicie seu teste gratuito.

Artigo de método

Uma abordagem de clonagem perfeita para a construção do vetor de expressão do vírus da síndrome reprodutiva e respiratória suína

1.5K visualizações

⸱

DOI:

10.3791/66320

⸱

17 de maio de 2024

 ,  , 

* These authors contributed equally

Neste artigo

Resumo

Aqui, apresentamos um protocolo para obter o vetor de expressão pVAX1-PRRSV introduzindo locais de restrição adequados na extremidade 3' das inserções. Podemos linearizar o vetor e unir fragmentos de DNA ao vetor um por um por meio da tecnologia de recombinação homóloga.

Resumo

A construção de vetores de expressão gênica é um componente importante do trabalho de laboratório em biologia experimental. Com avanços técnicos como o Gibson Assembly, a construção vetorial torna-se relativamente simples e eficiente. No entanto, quando o genoma completo do Vírus da Síndrome Reprodutiva e Respiratória Suína (PRRSV) não pode ser facilmente amplificado por uma única reação em cadeia da polimerase (PCR) do cDNA, ou é difícil adquirir um vetor de expressão gênica de comprimento total por recombinação homóloga de múltiplas inserções in vitro, a atual técnica de montagem de Gibson não consegue atingir esse objetivo.

Consequentemente, nosso objetivo foi dividir o genoma do PRRSV em vários fragmentos e introduzir locais de restrição apropriados no primer reverso para a obtenção de fragmentos amplificados por PCR. Depois de unir o fragmento de DNA anterior ao vetor por tecnologia de recombinação homóloga, o novo vetor adquiriu o local de clivagem da enzima de restrição. Assim, podemos linearizar o vetor usando o local de clivagem enzimática recém-adicionado e introduzir o próximo fragmento de DNA a jusante do fragmento de DNA a montante.

O local de clivagem da enzima de restrição introduzido na extremidade 3' do fragmento de DNA a montante será eliminado e um novo local de clivagem será introduzido na extremidade 3' do fragmento de DNA a jusante. Desta forma, podemos unir fragmentos de DNA ao vetor um por um. Este método é aplicável para construir com sucesso o vetor de expressão PRRSV e é um método eficaz para montar um grande número de fragmentos no vetor de expressão.

Introdução

Como uma técnica essencial para construir ferramentas experimentais baseadas em DNA para expressão em células procarióticas e eucarióticas, a clonagem molecular é um componente muito importante da biologia experimental. A clonagem molecular envolve quatro processos: a aquisição do DNA da inserção, a ligação da inserção no vetor apropriado, a transformação do vetor recombinante em Escherichia coli (E. coli) e a identificação dos clones positivos1. Até agora, vários métodos foram adotados para unir moléculas de DNA usando enzimas de restrição 2,3 e recombinação mediada p....

Acesso restrito. Inicie sessão ou comece um teste para visualizar este conteúdo.

Protocolo

1. Preparação do molde do gene PRRSV

  1. Descongele o estoque de vírus em 1 mL de reagente de extração de RNA (consulte a Tabela de Materiais).
  2. Adicione 0,2 mL de clorofórmio e misture bem. Incubar por 3 min.
  3. Centrifugue a mistura durante 15 min a 12.000 × g a 4 °C.
    NOTA: A mistura é dividida em três fases, a saber, uma fase aquosa incolor, uma interfase e uma fase vermelha de fenol-clorofórmio.
  4. Pipetar a fase aquosa incolor e transferi-la para um novo tubo.
  5. Misture bem a fase aquosa com 0,5 mL de isopropanol e incube por 10 min a 4 ° C.
  6. Centrifugue por 10 min a 12.00....

Acesso restrito. Inicie sessão ou comece um teste para visualizar este conteúdo.

Resultados

Neste artigo, apresentamos um sistema de recombinação in vitro para montar e reparar moléculas de DNA sobrepostas usando o primer reverso por meio de locais de restrição continuamente introduzidos (Figura 1B). Este sistema é um procedimento simples e eficiente que compreende a preparação do vetor linear e dos fragmentos de inserção contendo saliências introduzidas por PCR com primers com sequências de extensão 5' e locais de restrição apropriados; uma reacção isotérmica única in.......

Acesso restrito. Inicie sessão ou comece um teste para visualizar este conteúdo.

Discussão

A técnica de montagem de Gibson é um método de clonagem molecular baseado em recombinação in vitro para a montagem de fragmentos de DNA8. Este método permite a montagem de vários fragmentos de DNA em um plasmídeo circular em uma reação isotérmica de tubo único. No entanto, um dos obstáculos para a técnica de Montagem de Gibson é a aquisição de longos fragmentos do cDNA. Os fragmentos longos são difíceis de amplificar com precisão por vários motivos. Por exemplo, os primers são mais fáceis.......

Acesso restrito. Inicie sessão ou comece um teste para visualizar este conteúdo.

Divulgações

Os autores declaram não haver conflitos de interesse.

Agradecimentos

Este trabalho foi apoiado pelo apoio financeiro dos fundos de iniciação à pesquisa de doutorado fornecidos pela China West Normal University (nº 20E059).

....

Acesso restrito. Inicie sessão ou comece um teste para visualizar este conteúdo.

Materiais

Lista de materiais utilizados neste artigo
NomeEmpresaNúmero de catálogoComentários
1 kb mais a tecnologiabioquímica de Tiangen da escada do ADN (Pequim) Co., LtdMD113-02
2x a biotecnologia verde universal Co. do gene deRong WeiA303-1
AgaroseSangon Biotech (Shanghai) Co., Ltd.9012-36-6
Microcentrífuga de BancadaThermo Fisher Scientific  Co., LtdFRESCO17
Bancada LimpaSujing Antai Air Technology  Co., LtdVD-650-U
Equipamento de Eletroforese de DNACleaver Scientific  Co., Ltd170905117
Tampão de Carregamento de DNA (6x)Biosharp Biotechnology Co., LtdBL532A
E. Z. N. A. Kit de extração de gelOmega Bio-Tek Co., LtdD2500-01
E.Z.N.A. Mini kit de DNA de plasmídeo IOmega Bio-Tek Co., LtdD6943-01
Cultivador de eletroaquecimento em temperatura estacionáriaShanghai Hengyi Scientific Instrument Co., LtdDHP-9082
ExonArt Kit de clonagem e montagem sem costuraRong Wei Gene Biotechnology Co., LtdA101-02
ExonScript RT SuperMix com dsDNaseRong Wei Gene Biotechnology Co., LtdA502-1
FastDigest Eco321 (EcoRV)Thermo Fisher Scientific  Co., LtdFD0303
FastDigest HindIIIThermo Fisher Scientific  Co., LtdFD0504
FastDigest NheIThermo Fisher Scientific  Co., LtdFD0974
FastDigest NotIThermo Fisher Scientific  Co., LtdFD0596
Gel Doc XRBio-Rad Laboratories Co., Ltd721BR07925
Goldview Ácido Nucleico Gel StainShanghai Yubo Biotechnology Co., LtdYB10201ES03
Máquina de Fazer GeloShanghai Bilang Instrument Manufacturing Co., LtdFMB100
Invitrogen Platinum SuperFi II DNA PolimeraseThermo Fisher Scientific  Co., Ltd12361010
LB Placa de Ágar (Canamicina)Sangon Biotech (Shanghai) Co., Ltd.B530113-0010
LB meio líquido estéril (Kanamicina)Sangon Biotech (Shanghai) Co., Ltd.B540113-0001
MicropipetadoresThermo Fisher Scientific  Co., Ltd—
Forno de microondasPanasonic Electric (China) Co., LtdNN-GM333W
Agitadores orbitaisShanghai Zhicheng Analytical Instrument Manufacturing Co., LtdZHWY-2102C
PRRSV vírusSichuan Agricultural University—
SnapGeneGSL Biotech, LLCv5.1Para projetar primers
T100 PCR Gradient Thermal CyclerBio-Rad Laboratories  Co., LtdT100 Thermal Cycler
TAE bufferSangon Biotech (Shanghai) Co., Ltd.B040123-0010
Reagente TRIzolThermo Fisher Scientific  Co., Ltd15596026Reagente de extração de RNA
do PCR, Ltd

Referências

  1. Lessard, J. C. Molecular cloning. Methods Enzymol. 529, 85-98 (2013).
  2. Shetty, R. P., Endy, D., Knight, T. F. Jr Engineering BioBrick vectors from BioBrick parts. J. Biol. Eng. 2, 5(2008).
  3. Horton, R. M., Cai, Z. L., Ho, S. N., Pease, L. R.

Acesso restrito. Inicie sessão ou comece um teste para visualizar este conteúdo.

Reimpressões e permissões

Explorar mais artigos

Vetor de Expressão de PRRSVRecombinação HomólogaMontagem de GibsonClonagem por Enzimas de RestriçãoAmplificação de Fragmentos por PCREletroforese em Gel de AgarosePCR de ColôniaLinearização de VetorMontagem de Fragmentos de DNA