Este protocolo apresenta um método para geração de organoides vasculares utilizando células-tronco pluripotentes humanas.
Artigo de método
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Este protocolo apresenta um método para geração de organoides vasculares utilizando células-tronco pluripotentes humanas.
Organoides vasculares derivados de células-tronco pluripotentes induzidas por humanos (hiPSCs) recapitulam a diversidade do tipo de célula e a arquitetura complexa das redes vasculares humanas. Este modelo tridimensional (3D) possui um potencial substancial para modelagem de patologia vascular e triagem de drogas in vitro . Apesar dos avanços recentes, um desafio técnico importante permanece na geração reprodutível de organoides com qualidade consistente, o que é crucial para ensaios e aplicações a jusante. Aqui, é apresentado um protocolo modificado que melhora a homogeneidade e a reprodutibilidade da geração de organoides vasculares. O protocolo modificado incorpora o uso de micropoços e o coquetel CEPT (croman 1, emricasan, poliaminas e o inibidor integrado de resposta ao estresse, trans-ISRIB) para melhorar a formação do corpo embrióide e a sobrevivência celular. Organoides vasculares maduros e diferenciados gerados usando este protocolo são caracterizados por microscopia de imunofluorescência 3D de montagem total para analisar sua morfologia e vasculatura complexa. Este protocolo permite a produção de organoides vasculares de alta qualidade de maneira escalável, potencialmente facilitando seu uso em aplicações de modelagem de doenças e triagem de medicamentos.
Modelos microfisiológicos in vitro, incluindo sistemas organoides e de tecido em chip, surgiram na última década 1,2,3. Esses sistemas tridimensionais (3D) derivados de células humanas abordam as limitações da cultura de células bidimensionais (2D) convencionais e modelos animais, como a falta de muitos componentes no microambiente fisiológico e diferenças genéticas entre as espécies, respectivamente. Eles fornecem mais informações fisiológicas e são mais adequados para modelagem de doenças e triagem de medicamentos do que os modelos convencionais. Entre os modelos microfisiológicos, organoides derivados de células-tronco pluripotentes induzidas por humanos (hiPSCs) provaram recapitular as características arquitetônicas dos tecidos humanos nativos de forma eficaz e foram desenvolvidos para imitar diferentes órgãos humanos, incluindo o cérebro 4,5, rim6, fígado 7,8 e retina9. Aqui, nos concentramos particularmente na geração de organoides vasculares a partir de hiPSCs e delineamos um protocolo simplificado que visa minimizar as variações entre diferentes amostras e lotes de organoides, melhorando assim a reprodutibilidade geral.
A vasculatura desempenha um papel crucial na manutenção da homeostase fisiológica em todos os órgãos humanos. A formação da vasculatura envolve os processos de vasculogênese e angiogênese, orquestrados por meio das interações entre células endoteliais e murais (por exemplo, pericitos e células musculares lisas vasculares) e influenciados por vários estímulos10. Penninger, Wimmer e colegas desenvolveram o primeiro método de geração de organoides vasculares11,12 que imita esses dois processos. Com os organoides gerados a partir desse método, seu grupo12 e nós13,14 demonstraram o potencial dos organoides vasculares para modelar disfunções vasculares em doenças. Por exemplo, em nossos trabalhos recentes 13,14, fenótipos distintos foram observados, como brotamento de vasos e variações na composição de células murais, entre organoides vasculares que imitam doenças e suas contrapartes do tipo selvagem. Esses exemplos destacam que o modelo organoide vascular pode servir como uma plataforma para triagem de drogas, imitando disfunções vasculares relacionadas à doença.
Construído com base nos trabalhos iniciais de geração de organoides vasculares11,12, é apresentado um protocolo revisado que inclui o uso de micropoços para facilitar a formação de corpos embrióides homogêneos (EB), um fator crítico para minimizar as variações frequentemente observadas dentro do mesmo lote de geração de organoides. Além disso, o coquetel CEPT, uma combinação de cromano 1, emricasan, poliaminas e o inibidor integrado da resposta ao estresse (trans-ISRIB)15, é empregado para melhorar a viabilidade de hiPSCs e células diferenciadas durante o processo de formação de EB. Essa modificação é principalmente para reduzir as variações entre diferentes amostras e lotes de organoides. Organoides vasculares uniformes podem ser produzidos com este protocolo de aproximadamente duas semanas, onde a vasculogênese é induzida para ajudar o endotélio a se organizar em redes tubulares primitivas no Dia 1, seguida pela indução da angiogênese no Dia 5 para desenvolver redes vasculares complexas em organoides. No dia 12-15, os organoides gerados devem mostrar redes vasculares maduras compostas por endotélio e células murais.
A Figura 1 apresenta uma visão geral das etapas envolvidas neste protocolo. Informações detalhadas sobre os reagentes e materiais utilizados neste protocolo são fornecidas na Tabela de Materiais. Recomenda-se que todos os meios sejam pré-aquecidos a 37 °C antes do uso, salvo indicação em contrário. Todos os materiais e suprimentos de cultura de células devem ser autoclavados ou estéreis, e o manuseio das células deve ser feito em um gabinete de biossegurança. Além disso, o valor do pH da mistura de colágeno I deve ser cuidadosamente ajustado para pH 7,3 para evitar possíveis problemas de solidificação.
1. Manutenção humana do iPSC
2. Formação EB (Dia 0)
3. Diferenciação vascular (dia 1 - 5)
4. Incorporação de hidrogel (dia 5)
5. 3D Ensaio de imunofluorescência
A Figura 1A apresenta o esquema deste protocolo, incluindo os principais componentes usados em cada estágio. A diferenciação iniciou-se com a formação de EB, seguida pela indução do mesoderma e especificação da linhagem vascular (Figura 1B-D). Os agregados cresceram maiores e menos esféricos ao longo do tempo. Os organoides começaram a mostrar arestas no dia 5. Depois de incorporadas na mistura de matriz de membrana basal de colágeno I, as células endoteliais vasculares e pericitos brotaram e cresceram para formar redes vasculares complexas já no dia 7 (Figura 1E). Como o principal objetivo desse método modificado é minimizar as variações entre os diferentes lotes de geração, medimos o tamanho do EB a partir de dois lotes independentes, e tanto as medidas de tamanho quanto a análise estatística confirmaram a consistência e uniformidade com esse método (Figura 1F).
Para validar a diferenciação vascular, os organoides foram coletados no dia 5 antes da inclusão e corados com marcadores vasculares, incluindo CD31, ERG1 e PDGFRβ. Os organoides expressaram CD31, ERG1 e PDGFRβ (Figura 2), indicando a presença de células endoteliais vasculares e pericitos.
Após a clareação do tecido, as redes vasculares foram analisadas com microscopia de imunofluorescência total (Figura 3A). Os organoides maduros foram corados com CD31, ERG1 e PDGFRβ no dia 17 (Figura 3B, amostra no bloco de gel) e no dia 28 (Figura 3C, a amostra foi recuperada do bloco de gel e cultura individualmente em uma placa de 96 poços; observe que a rede vascular nas bordas envolveu os esferoides em vez de se expandir radialmente após a recuperação do bloco de gel).

Figura 1: Geração de organoides vasculares. (A) Esquema das etapas e cronograma para geração de organoides vasculares. (BE) Imagens representativas de campo claro de organoides vasculares em diferentes estágios. Barras de escala: 100 μm. (F) Análise estatística em tamanho de EB de dois lotes diferentes de geração de EB utilizando o método de micropoços apresentado neste trabalho. Para a geração de EB, foram utilizadas 1.000 células por micropoço, e para os lotes 1 e 2, n = 42 e n = 40, respectivamente. A significância é apresentada como ns, não significativa. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 2: Imunomarcação de organoides vasculares antes da incorporação em gel. Imagens fluorescentes representativas de organoides corados com os marcadores endoteliais (A) CD31 (verde) e (B) ERG1 (verde), bem como (C) o marcador pericito, PDGFRβ (verde), respectivamente. Os núcleos foram contracorados com DAPI (azul). Barras de escala: 50 μm. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 3: Caracterizações imunofluorescentes da rede vascular em organoides vasculares. (A) Uma imagem representativa mostra organoides vasculares embebidos em gel no prato de vidro após a limpeza do tecido. Os organoides eram transparentes, mas visíveis sob uma luz UV de 385 nm. (B) Uma imagem 3D representativa de montagem total do organoide vascular no dia 17. O organoide vascular foi corado com DAPI (azul), o marcador de células endoteliais vasculares, CD31 (verde) e o marcador de pericito, PDGFRβ (magenta). (C) Uma imagem 3D representativa de montagem total de um organoide vascular recuperado no dia 28, corado com os marcadores endoteliais CD31 (vermelho) e ERG1 (verde). Barras de escala: 150 μm. Clique aqui para ver uma versão ampliada desta figura.
| meio de expansão hiPSC | 500 mL |
| mTeSR Plus meio basal | 400 mL |
| Suplemento mTeSR Plus | 100 mL |
| Gentamicina (50 mg/mL) | 1 mL |
Tabela 1: Composição do meio de expansão hiPSC.
| meio de semeadura hiPSC | 20 mL |
| Meio de expansão PSC | 20 mL |
| Croman 1 (100 μM) | 10 μL |
| Emricasan (1 mM) | 30 μL |
| Suplemento de poliamina (1000x) | 20 μL |
| trans-ISRIB (1 mM) | 14 μL |
Tabela 2: Composição do meio de semeadura hiPSC.
| N2B27 médio | 100 mL |
| DMEM/F-12, suplemento GlutaMAX | 48,6 mL |
| Meio neurobasal | 48,6 mL |
| Suplemento GlutaMAX (100x) | 0,5 mL |
| Solução de Aminoácidos Não Essenciais MEM (NEAA, 100x) | 0,5 mL |
| 2-Mercaptoetanol (1000x) | 0,1 mL |
| Gentamicina (50 mg/mL) | 0,1 mL |
| Suplemento N2 (100x) | 0,5 mL |
| Suplemento de B27 sem vitamina A (50x) | 1 mL |
| Heparina 4 kU/mL | 0,1 mL |
Tabela 3: Composição do meio N2B27.
| Meio de indução mesoderma (MIM) | 3 mL |
| N2B27 médio | 3 mL |
| BMP4 (100 ng/μL) | 0,9 μL |
| CHIR99021 (12 mM) | 3 μL |
Tabela 4: Composição do meio de indução do mesoderma (MIM).
| Meio de diferenciação vascular 1 (VDM1) | 3 mL |
| N2B27 médio | 3 mL |
| Forsklin (12 mM) | 0,5 μL |
| VEGFA (100 ng/μL) | 3 μL |
Tabela 5: Composição do meio de diferenciação vascular 1 (VDM1).
| Mistura de colágeno I | 5 ml |
| Colágeno I (3,61g/mL) | 2,77 mL |
| 10x DMEM/F12 médio | 0,5 mL |
| Bicarbonato de sódio, 7,5% | 0,5 mL |
| HEPES, 1 M | 0,5 mL |
| H2O | 0,73 mL |
| NaOH, 1M | 75 μL |
Tabela 6: Composição da mistura de colágeno I.
| Colágeno I - mistura de matriz de membrana basal | 6,5 ml |
| Colagem I mistura | 5 ml |
| Matrigel (10 mg/ml) | 1,5 mL |
Tabela 7: Composição da mistura de matriz de membrana basal de colágeno I.
| Meio de diferenciação vascular 2 (VDM2) | 5 ml |
| DMEM/F-12, suplemento GlutaMAX™ | 3,67 ml |
| Gentamicina (50 mg/mL) | 5 μL |
| Solução de Aminoácidos Não Essenciais MEM (NEAA, 100X) | 50 μL |
| 2-Mercaptoetanol (1000x) | 5 μL |
| Heparina 4 kU/mL | 5 μL |
| Reposição de soro nocaute | 0,75 mL |
| FBS | 0,5 mL |
| VEGFA (100 ng/μL) | 5 μL |
| FGF2 (100 ng/μL) | 5 μL |
Tabela 8: Composição do meio de diferenciação vascular 2 (VDM2).
| Buffer de bloqueio | 50 mL |
| Soro de burro | 2,5 ml |
| Pré-adolescente 20 | 0,25 mL |
| Tritão X-100 | 0,25 mL |
| Solução de desoxicolato de sódio (1%, p/v) | 0,5 mL |
| PBS | 46,5 mL |
Tabela 9: Composição do tampão de bloqueio para imunocoloração.
O protocolo descrito inclui duas modificações principais para a geração homogênea e reprodutível de organoides vasculares de alta qualidade. A primeira modificação é o uso de uma placa de micropoços para permitir um melhor controle da uniformidade do EB. Como ponto de partida da diferenciação vascular, o tamanho dos EBs é crítico, pois regula o destino das células-tronco e a eficácia da diferenciação em diferentes linhagens. Variações no tamanho do EB geralmente levam a organoides heterogêneos com estrutura e organização inconsistentes16,17. O método convencional de geração de EB levantando colônias de hiPSC11,12 dificulta o controle do número de células para EBs individuais e geralmente resulta na formação heterogênea de EB. Nesse protocolo, as hiPSCs são dissociadas em suspensão unicelular e reagregadas em micropoços 16,18. Ao ajustar o número de células de semeadura, o tamanho dos EBs pode ser otimizado para garantir uma diferenciação mesodérmica consistente e eficaz. Para a semeadura de micropoços, são usadas 500-1.000 células, e isso pode produzir EBs relativamente pequenos (com um diâmetro de 100-200 μm). Este método poderia gerar EBs uniformes de forma reprodutível com tamanhos desejados de lote para lote (Figura 1F) e entre várias linhagens celulares13. Desde o Dia 0, a morfologia do EB mudou ao longo do tempo durante a diferenciação: a forma torna-se menos esférica e a superfície torna-se mais áspera (Figura 1), mas o volume não aumenta significativamente. A morfologia da vasculatura 3D depende da densidade de incorporação e dos tamanhos dos organoides incorporados. Organoides muito grandes (>500 μm) geralmente resultam em diferenciação insuficiente de células vasculares, enquanto organoides muito pequenos tendem a ter vasculatura subdesenvolvida.
A segunda modificação é incorporar o coquetel CEPT para melhorar a viabilidade do hiPSC durante a formação do EB. A viabilidade celular é crucial, além da qualidade das colônias de hiPSC durante esse processo. Quando os hiPSCs são dissociados em uma suspensão de célula única, o inibidor de ROCK Y27632 geralmente é adicionado para melhorar a viabilidade celular. No entanto, o Y27632 mostrou-se subótimo para hiPSCs em baixa densidade e pode causar estresse indesejado na membrana, enquanto o coquetel CEPT (composto de cromo 1, emricasan, poliaminas e trans-ISRIB) pode reduzir significativamente o estresse celular e melhorar a viabilidade durante esse processo de formação de EB com hiPSCs em menor densidade15.
Antes da incorporação de organoides no gel, os organoides são mantidos na placa de micropoços, e a mudança do meio deve ser suave para evitar possíveis interrupções. Seria melhor usar uma pipeta de 200 μL para trocar o meio nos primeiros 5 dias. Todos os meios utilizados para a geração de organoides vasculares devem ser pré-aquecidos antes do uso. Especialmente após a incorporação em gel, o uso de meios frios pode liquefazer parcialmente a matriz da membrana basal e afetar o nicho de hidrogel 3D para a formação da rede vascular. A densidade de incorporação e a distribuição uniforme dos organoides também são fatores críticos para a formação da rede vascular. A incorporação densa de organoides pode levar à fusão excessiva de redes vasculares, enquanto a baixa densidade de incorporação pode levar à formação insuficiente de redes. Semear 60-80 organoides por poço e mover suavemente a placa para frente e para trás imediatamente após adicioná-los à primeira camada do gel 3D pode distribuir melhor esses organoides.
Este protocolo pode ser modificado para diferentes aplicações. Por exemplo, pistas de barreira hematoencefálica (BHE) podem ser aplicadas para restringir ainda mais as células endoteliais vasculares da formação da interface BHE 19,20,21,22,23,24,25. A composição do hidrogel 3D também pode ser ajustada. Por exemplo, a fibrina e a vitronectina são comumente usadas para a formação de redes vasculares in vitro 25,26,27,28,29,30,31,32. A matriz da membrana basal sem colágeno I pode ser usada para incorporação, o que pode simplificar o processo de incorporação e fornecer diferentes estímulos mecânicos.
Embora os organoides vasculares gerados a partir deste protocolo possam ser potencialmente usados para modelagem de doenças ou aplicações de triagem de medicamentos, uma limitação é que esses organoides apenas recapitulam principalmente a vasculatura capilar com poucos vasos maiores. Para pesquisas com foco em vasos maiores, a geração de organoides pode exigir estímulos mecânicos adicionais24 , 31 , 32 , 33 . Conectar os organoides vasculares com a recirculação, como transplante para animais34 ou dispositivos micro / macrofluídicos com bombas de perfusão33, poderia resolver isso.
Os autores declaram não haver interesse financeiro conflitante.
Gostaríamos de agradecer o apoio técnico do Recurso Compartilhado de Microscopia Confocal e Especializada do Herbert Irving Comprehensive Cancer Center da Universidade de Columbia, financiado em parte pelo NIH Center Grant (P30CA013696). Este trabalho é apoiado pelo NIH (R21NS133635, Y.-H.L.; UH3TR002151, K. W. L.). A Figura 1A foi criada usando BioRender.
| Nome | Empresa | Número de catálogo | Comentários |
|---|---|---|---|
| 2-Mercaptoetanol (1000x) | Gibco | 21985023 | |
| Accutase | Sigma-Aldrich | A6964 | |
| Alexa Fluor 488 AffiniPure F(ab')2 Fragment Donkey Anti-Rabbit IgG (H+L) | Jackson Immuno Research Labs | 711-546-152 | reconstitui com 0,25 mL de glicerol a 50%, armazene a -20 ° C por até 1 ano, razão de diluição para uso: 1:1000 |
| Alexa Fluor 647 AffiniPure F(ab')2 Fragment Donkey Anti-Goat IgG (H+L) | Jackson Immuno Research Labs | 705-606-147 | reconstitui com 0,25 mL de glicerol a 50%, armazene a -20° C por até 1 ano, taxa de diluição para uso: suplemento de B27 1:1000 |
| menos vitamina A (50x) | Gibco | 12587010 | descongelar a 4 ° C, alíquota e armazene a -20 & C, evite o ciclo de congelamento e descongelamento |
| BMP4 | ProSpec | CYT-081 | reconstituir com ddH2O estéril a uma concentração de 100 ng/µ L, alíquota e armazene a -20 ° Anticorpo C |
| CD31 | abcam | ab28364 | taxa de diluição: 1:400 |
| Centrífuga | Eppendorf | 022626001 | |
| CHIR99021 | Tocris Bioscience | 4423/10 | faça a solução estoque a 12 mM com DMSO e armazene a -20 ° C por até 1 ano. |
| Chroman 1 | Tocris | 7163/10 | faz a solução estoque em 100 µ M com DMSO e armazene a -20 ° C por até 1 ano. |
| Colágeno I | Corning | 40236 | |
| Nikon | AXRMP/Ti2 | ||
| Placas de Elplasia Corning Contador | Corning | 4441 | |
| Countess II FL | Thermo Fisher | AMQAF1000 | |
| DMEM/F-12, suplemento GlutaMAX | Gibco | 10565018 | |
| DMEM/F-12, pó | Gibco | 12500062 | faça 10x solução estoque com ddH2O biograu e esterilize-a com um 0,2 µ m. Armazene a 4 ° C. |
| Edi042A | Cedars Sinai | ||
| Emricasan | Medchemexpress LLC | HY1039610MG | fazer a solução estoque a 1 mM com DMSO e armazenar a -20 &graus; C por até 1 ano. |
| anticorpo ERG | Cell Singali Technology | 97249 | : 1:400 |
| Soro Fetal Bovino - Premium | Atlanta Biologicals | S11150 | descongela a 4 ° C e alíquota, loja em -20 & graus; C por até cinco anos, ou armazene a 4 & C por até um mês |
| FGF2 | ProSpec | CYT557 | reconstituir com ddH2O estéril a uma concentração de 100 ng/µ L, alíquota e armazene a -20 ° C |
| Fluorodish Cell Culture Dish | World Precision Instruments | FD35-100 | |
| Forskolin | Tocris Bioscience | 1099 | reconstituir com DMSO a uma concentração de 12 mM, alíquota e armazenar a -20 ° C |
| Gentamicina (50 mg/mL) | Suplemento | Gibco 15710064 | |
| GlutaMAX (100x) | Gibco | 35050061 | |
| Heparina, 100 kU | MilliporeSigma | 375095100KU | reconstituir com ddH2O estéril na concentração de 4 kU/mL |
| HEPES (1 M) | Gibco | 15630080 | |
| Incubadora | Thermo Scientific | 13998123 | |
| Substituição de Soro Knockout | Gibco | 10828028 | descongelar a 4 ° C, alíquota e loja em -20° C, evite o ciclo de congelamento e descongelamento |
| Matrigel, GFR Basement Membrane Matrix | Corning | 356230 | descongelar a 4 ° C, alíquota e loja a -80° C, evite o ciclo de congelamento e descongelamento |
| MEM Solução de Aminoácidos Não Essenciais (NEAA, 100x) | Gibco | 11140050 | |
| Molecular Biology Grade Water | Corning | 46000CV | |
| mTeSR plus kit | STEMCELL Technologies | 1001130 | descongelar a 4 ° C, alíquota e loja em -20° C, evite o ciclo de congelamento e descongelamento |
| suplemento N2 (100x) | Gibco | 17502048 | descongelar a 4 ° C, alíquota e loja em -20° C, evite o ciclo de congelamento e descongelamento |
| Solução de NaOH (1 M) | Cytiva HyClone | SH31088.01 | |
| NeuroBasal medium | Gibco | 21103049 | |
| NIS-Elements, ver 5.42 | Nikon | ||
| Normal Donkey Serum | Jackson Immuno Research Labs | 17000121 | reconstituir com 10 mL de ddH2O estéril, armazenar a 4 ° C por até duas semanas |
| paraformaldeído, 20% | Microscopia Eletrônica Sciences | 15713S | diluído com |
| PBS PBST, 20x | Thermofisher | 28352 | |
| PDGFRβ anticorpo | R& Relação | AF385 | : suplemento de poliamina 1:400 |
| (1000x) | Reagente de limpeza Sigma-Aldrich | P8483 | |
| Rapiclear, 1,49 | SUNJIN LAB | RC149001 | |
| Bicarbonato de sódio (7,5%) | Gibco | 25080094 | |
| Desoxicolato de sódio monohidratado | Thermofisher | J6228822 | dissolver com ddH2O para solução estoque a 1% (peso / v) |
| TBST, 20x | Thermofisher | 28360 | |
| trans-ISRIB | Tocris Bioscience | 5284/10 | faça a solução estoque a 1 mM com DMSO e armazene a -20° C por até 1 ano. |
| Tritin X-100 | Sigma-Aldrich | T8787-50ML | |
| Trypan Blue Stain (0,4%) | Thermo Fisher | 15250061 | |
| Tween 20 | Sigma-Aldrich | P7949-100ML | |
| VEGF-A | ProSpec | CYT-116 | reconstituir com ddH2O estéril a uma concentração de 100 ng/µ L, alíquota e loja a -20° O |