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Existem vários estágios nos quais a diferenciação de organoides das vias aéreas derivadas de iPSC, células endoteliais, células imunes e co-culturas pode ser avaliada como concluída com sucesso. As diferenciações podem ser realizadas em diferentes linhagens de iPSC, e este protocolo foi testado em pelo menos cinco linhagens diferentes. O protocolo precisa ser adaptado a cada nova linha de iPSC, especificamente modificando e otimizando a densidade de semeadura.
O rendimento bem-sucedido de organoides das vias aéreas derivados de iPSC pode ser avaliado via campo claro e terá quatro características: limites/bordas definidos, morfologia translúcida/cística, capacidade de proliferar/expandir e falta de células necróticas. Os organoides das vias aéreas que parecem difusos não aumentam de tamanho ao longo das 2 semanas de cultura e têm necrose não devem ser usados para experimentos de cocultura. Organoides com uma camada luminal espessa na periferia vs. Os organoides translúcidos/císticos ainda podem ser usados para experimentos subsequentes. No entanto, os organoides translúcidos/císticos das vias aéreas são compostos predominantemente por células basais, enquanto os organoides de membrana dupla espessa são compostos predominantemente por células de clube. Como as células basais proliferam e se expandem facilmente, elas são mais adequadas para cultura e polarização de interfase ar-líquido. Outros métodos para avaliar o rendimento bem-sucedido de organoides pulmonares derivados de iPSC são a análise de citometria de fluxo no estágio de progenitor pulmonar (dia 16 da diferenciação) para o marcador de superfície CPM (Tabela 1), um rendimento de diferenciação bem-sucedido >50% de células CPM+.
Para a dissociação do organoide das vias aéreas e a cultura de interfase ar-líquido, certifique-se de que todo o polímero ECM foi removido, ou isso impedirá que as células se expandam na membrana. As células devem ser confluentes no dia 3 da cultura, antes do levantamento de ar. A confirmação dos tipos de células no iAirways pode ser avaliada pela coloração dos respectivos marcadores específicos do tipo de célula: células basais (p63+), células do clube (SCGB1A1+), células caliciformes (MUC5AC+) e células ciliadas (AcTub+). A caracterização e os marcadores específicos do tipo de células pulmonares são verificados no LungMAP21. O mesênquima pode ser detectado com anticorpos contra vimentina ou actina de músculo liso. Para gerar mais células ciliadas, as culturas podem exigir levantamento de ar por um longo período de tempo ou a adição de DAPT.
O rendimento bem-sucedido de células endoteliais derivadas de iPSC pode ser avaliado por meio de campo claro, mostrando uma morfologia semelhante a paralelepípedos (Dia 6 da diferenciação endotelial derivada de iPSC). Uma cultura endotelial derivada de iPSC bem-sucedida conterá >50% de células CD31 +, e células suficientes devem ser geradas para que, após a classificação, o rendimento seja superior a 500.000 células. As células podem ser passadas ou criopreservadas, e o marcador CD31 deve ser testado via fluxo a cada passagem ou nova cultura. As células não devem ser passadas além de P4. Para referência, consulte a classificação de células endoteliais derivadas de iPSC pré / pós CD31 (Figura 1C). As células endoteliais serão planas com um grande corpo celular com morfologia alongada e fusiforme.
Para a diferenciação de macrófagos, os corpos embrióides devem permanecer no fundo do poço ULA e apenas um EB deve estar em cada poço. Eles devem mostrar alterações císticas no dia 5-7. Se eles não formarem um EB após a centrifugação, semeie os iPSCs na placa ULA de 96 poços sem girar. Pode ser necessário aumentar o número de iPSCs. O rendimento bem-sucedido de células imunes derivadas de iPSC depende inteiramente da capacidade dos corpos embrióides (EBs) de se desenvolverem em cistos (Dia 7 de diferenciação). EBs imunes derivados de iPSC que não desenvolvem cistos não formarão estroma quando semeados na gelatina e não produzirão progenitores mieloides. Após a transferência para a placa revestida de gelatina, os EBs devem permanecer presos ao fundo da placa. O movimento da placa deve ser feito com cuidado para não desalojá-los. As placas devem ser trocadas duas vezes por semana manualmente e as células suspensas devem ser passadas para Mac-CM2 ou criopreservadas. Além disso, após a colheita dos progenitores mielóides suspensos, eles devem aderir ao frasco plástico não revestido e gerar células brilhantes sob campo claro com vacúolos, indicando macrófagos. O marcador para monócitos, CD14+, deve ser >90% nas células suspensas. O marcador de macrófagos, CD68, deve aumentar com o tempo, com ~ 50% dos macrófagos expressando CD68 + após 2 semanas (Figura 1D). A eficiência de adesão deve ser determinada para cada linha celular. Alcançamos uma média de 20% de eficiência de adesão. Para polarização, os macrófagos M0 são polarizados para macrófagos M1 (iPSC-M1) ou M2 (iPSC-M2) por 48 h em meio de diferenciação II suplementado com diferentes estímulos: 100 ng/mL LPS e 20 ng/mL IFN-g para polarização M1 ou 50 ng/mL IL-4 e 20 ng/mL IL-13 para polarização M2. O marcador para polarização M1 é CD80+ e a polarização M2 é CD206+.
A geração bem-sucedida da co-cultura tripla pode ser avaliada por imunofluorescência para marcadores de junção epitelial EPCAM, ECAD ou ZO-1, ou marcador de junção endotelial CD31 (Figura 2C, Tabela 1). A funcionalidade da co-cultura tripla também pode ser avaliada por meio da resistência epitelial/endotelial transelétrica (TEER). Coculturas organoides e endoteliais das vias aéreas bem montadas terão maior resistência elétrica, indicando comunicação e conexão celular ideais. Insultos ambientais, como cigarros eletrônicos ou desafio viral, comprometerão a integridade da barreira epitelial e endotelial, resultando em redução da resistência elétrica da co-cultura (Figura 3A, B) e junções apertadas desorganizadas ( Figura 3C ).

Figura 1: Diferenciação e caracterização do epitélio das vias aéreas derivado de iPSC, endotélio e culturas imunes. (A) Esquema de diferenciações direcionadas por iPSC para a montagem do iAirway. (B) Organoides do epitélio das vias aéreas derivados de iPSC caracterizados por campo claro (esquerda) e análise de citometria de fluxo (direita) para EPCAM e ECAD. (C) endotélio das vias aéreas derivado de iPSC caracterizado por campo claro (esquerda), imunofluorescência e análise de citometria de fluxo (direita) para CD31. O respectivo campo claro após a classificação CD31 é mostrado à direita. (D) Os macrófagos derivados de iPSC são caracterizados por análise de campo claro (esquerda) e citometria de fluxo (direita) para o marcador pan-hematopoiético CD45, fabricante de monócitos CD14 e marcador de macrófagos CD68. Barras de escala: 100 μm. Clique aqui para ver uma versão ampliada desta figura.

Figura 2: Co-cultura de células epiteliais, mesenquimais, endoteliais e macrófagos derivadas de iPSC. (A) Esquema da montagem do iAirway. (B) Imagens de campo claro da respectiva monocultura epitelial e endotelial, da bicultura epitelial e endotelial e da cocultura epitelial, endotelial e de macrófagos. Macrófagos marcados com citorastreador vermelho. Barras de escala: 100 μm. (C) Coloração imunofluorescente para marcador de junção apertada ZO-1 no lado apical do inserto de cultura de células e CD31 no lado basolateral. Barras de escala: 100 μm. (D) Seção transversal do inserto de cultura de células com organoides dissociados das vias aéreas no lado apical, 1 semana após o levantamento de ar. O painel esquerdo com coloração H & E com a seta preta mostra células ciliadas. O painel do meio, com imagem de imunofluorescência, mostra o marcador epitelial E-caderina (ECAD). O painel direito, com imagem de imunofluorescência, mostra marcadores mesenquimais como vimentina (VIM) e actina de músculo liso (AMS). Barras de escala: 100 μm. Clique aqui para ver uma versão ampliada desta figura.

Figura 3: Alterações na função de barreira das vias aéreas dos iAirways expostos a cigarros eletrônicos e vírus. (A) Esquema da ferramenta de medição de resistência epitelial/endotelial transelétrica (TEER). (B) Gráfico de barras de TEER após 7 dias de adição de cigarro eletrônico mentolado à mídia. Intervalo de confiança médio de +/- 95%. N = 5 réplicas biológicas e 3 réplicas técnicas; Valor de p <0,001. (C) Coloração imunofluorescente para proteína de junção apertada ZO-1 antes e depois da infecção por SARS-CoV-2. Observe o layout desordenado do ZO-1 pós-infecção. Barras de escala: 50 μm. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.
| Anticorpo | Aplicação | Diluição |
| CD 31 PECAM-1 (APC) | citometria de fluxo (FC) | 10 μl em tampão de 100 ul |
| EPCAM/CD 326 (APC) | FC | 1:500 |
| E-CAD/CD 324 (APC) | FC | 5 μl em tampão de 100 ul |
| CPM | FC | 1:200 |
| CD 45 (PE) | FC | 5 μl em tampão de 100 ul |
| CD 14 (FITC) | FC | 5 μl em tampão de 100 ul |
| CD 68 (PE) | FC | 5 μl em tampão de 100 ul |
| ZO-1 | Imunofluorescência (IF) | 1:300 |
| Vimentina | SE | 1:200 |
| SMA | SE | 1:100 |
Tabela 1: Anticorpos usados em FACS e Imunofluorescência.
Arquivo Suplementar 1: Composições de mídia e buffer. Clique aqui para baixar este arquivo.