Geração de rd29A: vetor de expressão DREB1A (Figura 1)
O quadro de leitura aberto DREB1A de comprimento total (ORF, 651 pb) foi amplificado a partir do cDNA de Arabidopsis thaliana L. usando primers específicos de genes incorporando locais de restrição BamHI e EcoRI: forward 5 / -GGCGGATCCATGAACTCATTTTCTGCT-3 / e reverse 5 / -GGCGAATTCTTAATAACTCCATAACGA-3 /. Da mesma forma, o promotor rd29A (499 pb) foi amplificado a partir do DNA genômico de Arabidopsis usando primers contendo sítios KpnI e BamHI: forward 5 / -GCGGGTACCCCTATTAGAACGATTAAGGAG-3 / e reverse 5 / -GGCGGATCCGGTGGTTCCTCTGTTTGATCC-3 /. As reações de PCR foram realizadas em volume de 25 μL contendo 2,5 μL de tampão de PCR 10x, 1,5 mM de MgCl2, 0,2 mM de cada dNTP, 0,4 μM de cada primer, 1 U de Taq DNA polimerase e 1 μL de molde de DNA (aproximadamente 100 ng para DNA genômico ou 50 ng para cDNA), com água livre de nuclease adicionada ao volume final. As condições de amplificação para os fragmentos promotores de DREB1A e rd29A foram as seguintes: desnaturação inicial a 95 °C por 3 min; 35 ciclos de desnaturação a 95 °C por 30 s, recozimento a 58 °C por 30 s e extensão a 72 °C por 1 min; seguido por uma extensão final a 72 °C por 7 min. Os produtos amplificados foram resolvidos em gel de agarose a 0,7% e purificados em gel usando um Kit de Extração de Gel de acordo com o protocolo do fabricante.
Os produtos amplificados de PCR do promotor DREB1A e rd29A foram clonados no vetor de clonagem, pTZ57R/T, usando clonagem TA, e os produtos foram submetidos ao sequenciamento de Sanger para confirmação. A sequência DREB1A (Access. AM992886) foi submetido ao GenBank (o promotor rd29A foi inserido nos sítios KpnI e BamHI, e a sequência de codificação DREB1A foi inserida a jusante nos sítios BamHI e EcoRI, substituindo assim o promotor 2x35S original e posicionando o DREB1A sob o controle de rd29A. O final (rd29A::DREB1A::CamV) foi excisado usando KpnIe EcoRV e clonado na região T-DNA do vetor binário pGA482 para gerar a construção usada para transformação de plantas (Figura 1). Após o sequenciamento inicial de Sanger para validar os produtos clonados, nenhuma verificação adicional de sequenciamento foi realizada.
Análise de sequência gênica
Usando a ferramenta de bioinformática referenciada, uma análise filogenética das sequências proteicas de AtDREB1A e DREB1 de 13 espécies diferentes de dicotiledôneas e monocotiledôneas foi realizada e comparada por meio do método de junção de vizinhos. As sequências de aminoácidos foram recuperadas de Phytozome (http://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html) e GenBank (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/). A análise de alinhamento de sequências múltiplas foi realizada usando o programa online Clustal Omega. Uma vez que as sequências essenciais tenham sido adquiridas do Phytozome e do GenBank, não é necessária mais recuperação de sequências.
Preparação de explantes e pistola de indução de calos20,34
A cultivar de cana-de-açúcar foi cultivada no campo experimental do NIBGE, Faisalabad. Após 6 meses, a porção superior da cana sadia foi excisada para recuperar a região apical, que foi aparada até a gema terminal. Em condições estéreis, os rolos de folhas foram descascados em segmentos cilíndricos de ~ 5 mm e a superfície esterilizada com etanol a 70%. A partir da região imediatamente acima do meristema apical, aproximadamente 10-15 discos apicais (~ 3 mm de tamanho) foram preparados por cana. Os discos foram cultivados no meio de indução de calos (CIM) conforme descrito anteriormente 1,20,34. Após 4-6 semanas, os calos embriogênicos resultantes foram subcultivados em CIM fresco para posterior proliferação. NOTA: O uso de etanol a 70% para desinfecção de superfícies foi considerado suficiente, e nenhuma etapa adicional de esterilização foi necessária.
Transformação genética de rd29A: DREB1A em cana-de-açúcar através de Gene Gun20,34
O calo embriogênico proliferado foi disposto no centro da placa de Petri contendo CIM. Após 3 dias, os calos foram bombardeados com um vetor binário expressável de plantas revestido de ouro, pGA482, contendo rd29A: DREB1A, usando uma pistola biolística PDS-1000 / He, conforme descrito em detalhes34. Após o bombardeio, pequenas porções de calos foram cultivadas em CIM por 3 dias e colocadas no escuro a 26 ± 2 oC. Em seguida, os calos foram cultivados em meio de seleção de calos (MSC) contendo 60 mg/L de geneticina, subcultivados em MSC a cada 10 dias e colocados no escuro a 26 ± 2 oC.
Após 30 dias, calos saudáveis foram cultivados em meio de seleção de regeneração (RSM) contendo 60 mg/L de antibiótico para obtenção de brotos. As placas foram colocadas em uma sala de crescimento por 4 semanas a uma temperatura controlada (26 ± 2 °C), fotoperíodo claro/escuro de 16 h/8 h, intensidade de luz de 500 μmol m-2 s-1 e umidade controlada35. As brotações saudáveis regeneradas foram cultivadas em meio de seleção de enraizamento (RtSM) contendo 60 mg/L de antibiótico em potes de vidro e colocadas na sala de crescimento nas condições acima mencionadas. Após 4-6 semanas, os transformantes putativos foram transferidos para pequenos potes de plástico contendo solo arenoso esterilizado e colocados na sala de crescimento nas condições acima mencionadas. Não é necessária mais subcultura em meio de seleção de calos (CSM) além de 10 dias.
Confirmação molecular de plantas transgênicas de cana-de-açúcar
Conforme descrito anteriormente, o DNA genômico foi isolado das folhas jovens de plântulas de cana-de-açúcar transgênicas putativas usando o método de extração CTAB36. A qualidade e a concentração do DNA foram avaliadas usando um espectrofotômetro NanoDrop e eletroforese em gel de agarose. A amplificação por PCR do gene marcador selecionável nptII (750 pb) e do transgene DREB1A (651 pb) foi realizada usando primers específicos do gene listados na Tabela 1. Cada reação de PCR de 25 μL continha 1x tampão de PCR, 2,5 mM de MgCl₂, 0,2 mM de dNTPs cada, 0,4 μM de cada primer, 1 U de Taq DNA polimerase, ~ 100 ng de DNA genômico e água deionizada em volume. As reações foram executadas em um termociclador nas seguintes condições: desnaturação inicial a 95 °C por 3 min; 35 ciclos de 94 °C durante 30 s, 58 °C durante 30 s, 72 °C durante 45 s; seguido por uma extensão final a 72 °C por 5 min. Os produtos de PCR foram resolvidos em um gel de agarose a 1% e visualizados sob luz UV para confirmar a amplificação. Plântulas transgênicas positivas para PCR (T0) foram então transferidas para grandes vasos de barro e endurecidas em ambiente controlado de estufa até a maturidade. Após a maturação, segmentos de cana de cinco eventos T₁ confirmados por PCR selecionados aleatoriamente foram plantados e propagados em microparcelas por 12 meses para gerar conjuntos clonais suficientes para o experimento de estresse hídrico. NOTA: Uma vez que os genes nptII e DREB1A foram confirmados, nenhuma amplificação adicional de PCR foi realizada.
Estudo de expressão de DREB1A
A expressão relativa de DREB1A em folhas estressadas de plantas de cana-de-açúcar transgênicas e não transgênicas foi quantificada por meio de PCR em tempo real (qPCR). O RNA total foi isolado de ~100 mg de tecido foliar usando o reagente de extração de acordo com o protocolo do fabricante. A qualidade do RNA foi verificada por eletroforese em gel de agarose e quantificada por espectrofotômetro. Para cada amostra, 2 μg de RNA foram transcritos reversamente usando o Kit de Síntese de cDNA seguindo as instruções do fornecedor, com oligo(dT) primers.
O cDNA resultante foi usado como modelo para amplificar um DREB1A de 188 pb usando primers específicos do gene: 5'-ACAGAGGAGTTCGTCGGAGA-3' direto e 5'-GAGTCTCCAAGCCGAGTCAG-3'. Cada reação de qPCR de 25 μL continha 12,5 μL de 2x SYBR Green qPCR Master Mix, 0,4 μM de cada primer, 2 μL de cDNA diluído (modelo de ~ 100 ng) e água livre de nuclease para trazer o volume para 25 μL. As reações foram realizadas em triplicata em um termociclador usando o seguinte programa: desnaturação inicial a 95 ° C por 5 min, seguido por 40 ciclos de 95 °C por 30 s, 56 °C por 30 s e 72 °C por 30 s, com uma extensão final a 72 °C por 10 min.
Para confirmar a eficiência e linearidade das reações de qPCR, uma curva padrão foi inicialmente gerada usando diluições seriais de 10 vezes do DNA do plasmídeo contendo o fragmento clonado de DREB1A . No entanto, para análise de expressão, a quantificação relativa foi realizada usando o método 2−ΔΔCt 37. O gene da actina serviu como referência endógena, e o nível de expressão de DREB1A em cada linhagem transgênica foi normalizado para o controle do tipo selvagem. Todos os valores de Ct foram coletados usando configurações automáticas de linha de base e limite recomendadas pelo software do instrumento. Apenas curvas de fusão com picos únicos e agudos foram aceitas, confirmando a especificidade. O RNA não degradado de alta qualidade foi essencial para uma quantificação precisa. Amostras de RNA impuro ou degradado foram excluídas para evitar comprometer a confiabilidade da síntese de cDNA e análise de expressão gênica a jusante.
Estudo das alterações mediadas por DREB1A em cana-de-açúcar: experimento de estresse hídrico20,34
Após 1 ano, três repetições de cinco segmentos de cana (dois nós/segmento) de plantas transgênicas e não transgênicas (tipo selvagem) foram semeadas a 5 cm de profundidade em vasos de barro contendo 18 kg de solo (ECe 1,34; SAR 2,72; pH 7,8). Foram aplicados três regimes de estresse hídrico: 100, 80 e 60% de CA ( Tabela 2). A atividade fotossintética da cana-de-açúcar (PN, E e gs) e as relações hídricas das plantas (Ψw, Ψs e RWC) foram estudadas após 12 meses. Não altere os regimes hídricos estabelecidos, pois isso afetará a consistência dos tratamentos.
Determinação da atividade fotossintética
Após 180 dias de estresse hídrico, os parâmetros de troca gasosa - taxa fotossintética (PN), taxa de transpiração (E) e condutância estomática (gs) - foram medidos em plantas de cana-de-açúcar transgênicas e selvagens usando um sistema portátil de fotossíntese portátil. As medições foram feitas entre 09:00 e 11:00 usando a terceira folha totalmente expandida do topo de cada planta. A folha selecionada foi inserida suavemente na câmara de folhas transparente embutida (área de grampo de 3 cm2 ), garantindo contato completo sem vincos ou obstruções. As condições ambientais foram registradas em tempo real pelo sistema, enquanto a intensidade da luz foi mantida em aproximadamente 1.000 μmol m-2 s-1 sob luz solar natural. O dispositivo foi deixado em equilíbrio por 30-60 s até que as leituras em estado estacionário fossem obtidas para assimilação de CO2 e troca de vapor d'água. Os sensores internos do instrumento registraram automaticamente a temperatura da folha, a umidade relativa e a concentração ambiente de CO2 . Para cada genótipo e tratamento, as medidas foram replicadas em pelo menos três plantas biologicamente independentes, e os dados foram armazenados internamente e posteriormente exportados para análise. Foi tomado cuidado para manter condições ambientais consistentes entre as réplicas para garantir a confiabilidade dos dados.
Determinação do potencial hídrico foliar e do potencial osmótico
O potencial hídrico (Ψw) da terceira folha totalmente expandida do topo das plantas foi determinado usando a câmara de pressão do tipo Scholander. As folhas foram então congeladas a -20 oC em tubos de 1,5 mL, e a seiva celular obtida das folhas congeladas foi utilizada para analisar o potencial osmótico (Ψs) usando o Osmômetro.
Determinação do teor relativo de água foliar
O teor de água das folhas das plantas transgênicas e selvagens foi examinado em detalhes. Os pesos frescos das folhas foram medidos e as folhas foram imersas em água destilada durante a noite. Posteriormente, o peso túrgido das folhas foi registrado, enquanto o peso seco foi determinado incubando as folhas a 70 °C por 72 h. O CRP foliar foi calculado usando a seguinte fórmula:

NOTA: Para analisar com precisão o potencial osmótico usando um osmômetro, as folhas devem ser congeladas a -20 °C uma vez que o potencial de água tenha sido determinado.
Atributos de rendimento
As características de produtividade da cana-de-açúcar foram medidas na fase de colheita, como altura da cana (cm), diâmetro, número de canas moídas, brix (%) e biomassa da parte aérea e da raiz.
Análises estatísticas
Os experimentos de campo (controlados por meio de cerca) foram realizados em delineamento de blocos ao acaso, com três repetições por tratamento (cinco plantas por repetição; n = 15). Uma análise de variância de duas vias foi realizada para analisar as mudanças em diferentes características agronômicas e fisiológicas em um nível de significância de P ≤ 0,05.