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O método semi-automatizado para mapear e classificar comunidades vegetais foi projetado para gerar informações precisas sobre a cobertura do solo para áreas úmidas costeiras, que são dominadas por plantas herbáceas heterogêneas de baixo crescimento e caracterizadas por microtopografia; veja um exemplo desse tipo de habitat na fotografia da Figura 1. Foi realizado um estudo de caso da área úmida boreal costeira do Báltico na Ilha Hiiumaa, Estônia. No local, quatro comunidades vegetais foram amostradas para treinamento do modelo de classificação: Open Pioneer (OP), Lower Shore (LS), Upper Shore (EUA) e Tall Grass (TG). A Figura 2 oferece uma visão concisa da metodologia implementada em quatro fases distintas. Em contraste, a Figura 3 ilustra um guia diagramático detalhado que delimita etapas numeradas e acionáveis acopladas por setas para representar o fluxo de dados, sintetizando assim a metodologia ao longo das etapas e fases do protocolo. Os resultados finais desse método, utilizando um sensor multiespectral e um sensor RGB, são mapas de comunidades vegetais multiespectrais e baseados em RGB, que são armazenados como camadas em um projeto SIG junto com todos os conjuntos de dados intermediários. A qualidade dos conjuntos de dados geoespaciais foi avaliada ao final de cada fase do protocolo, já que a qualidade dos resultados nas fases seguintes depende da qualidade dos resultados da fase anterior, culminando na fase final, onde as entradas compõem o agregado de todas as etapas anteriores.
A seguir se resumem os resultados de cada uma das quatro fases do protocolo:
Na primeira fase, o levantamento aéreo de UAVs foi realizado a uma altitude de 120 m, resultando em uma Distância Amostra-Terrestre (GSD) de aproximadamente 10 cm/pixel. O levantamento aéreo produziu imagens multiespectrais e RGB. Após o pós-processamento cinemático (PPK), as geotags foram corrigidas para cada imagem de drone, e as imagens foram mosaicadas em softwares profissionais de fotogrametria para produzir mapas de levantamento aéreo. O processamento fotogramétrico de imagens aéreas multiespectrais gerou arquivos raster com refletância RED, GREEN, NIR e Red-edge.
Imagens aéreas multiespectrais e RGB eram processadas como projetos separados devido às resoluções inerentemente distintas das fotografias. Veja a Figura 4 das configurações de mosaico de imagens RGB. Figura 4A. Opções de processamento selecionando blocos fundidos e gerando mapas de saída unificados e sem interrupções. Figura 4B. a seleção de cálculos automatizados de índice a partir de imagens de câmeras RGB produziu quatro mapas raster: um por banda (vermelho, verde e azul) e o DSM (Modelo Digital de Superfície). Figura 4C. demonstra a geração de pontos de ligação automáticos para corresponder a pixels comuns entre imagens sobrepostas durante a etapa inicial de processamento. Junto com 3 índices RGB (vermelho, verde, azul) e DSM, o software de fotogrametria gerou um raster em tons de cinza gerado por software: uma representação monocromática, de canal único, que escala e combina as diferentes bandas (por exemplo, vermelho, verde, azul), com valores baixos de pixels aparecendo preto e valores altos aparecendo brancos. A formulação desse índice em tons de cinza é específica de software e não padronizada entre as plataformas de fotogrametria.
O software de fotogrametria gerou relatórios de qualidade descrevendo os resultados de processamento para ambos os conjuntos de projetos de mosaico de imagens aéreas: multiespectral e RGB. Esses relatórios fornecem métricas-chave para validar a precisão. Indicadores de resultados de alta qualidade são baixo erro de reprojeção: quanto mais próximo de 0, melhor (qualquer coisa abaixo de 1,0 é geralmente aceita). Por exemplo, linhas densas de "correspondência" significam correspondências fortes entre a maioria das imagens. Os mapas de saída foram avaliados visualmente e constatados livres de lacunas e outras discrepâncias visuais. Discrepâncias visuais são um sinal de possíveis erros de reflectância e mosaicagem, além de problemas subjacentes na grade de georreferenciação. O relatório de fotogrametria, junto com manuais de software específicos e recursos de treinamento, é usado para identificar o problema, encontrar uma solução e reprocessar imagens aéreas.
Os mapas de levantamento aéreo de UAVs serviram como um conjunto de dados de base para recalcular informações espectrais complexas em índices padronizados baseados em pixels (ou seja, índices de vegetação VIs gerados na terceira fase), permitindo seu uso como entradas estruturadas para classificação por aprendizado de máquina (na fase final do protocolo).
Observações biofísicas no local foram coletadas como um conjunto de dados de verificação de terreno. No local do estudo de caso (área úmida costeira do Báltico Boreal), quatro comunidades vasculares principais de plantas foram identificadas e amostradas: Open Pioneer (OP), Lower Shore (LS), Upper Shore (EUA) e Tall Grass (TG). Utilizando o método de amostragem quadrática estratificada delineado na segunda fase do protocolo, a comunidade vegetal do OP foi identificada pela presença de espécies indicadoras: Salicornia europaea e Suaeda maritima; LS por altas porcentagens de Glaux maritima e Juncus geradii; EUA por espécies indicadoras: Festuca rubra e Leontodon autumnalis; enquanto TG se distingue por uma presença significativa de gramíneas altas: Deschampsia cespitosa, Elytrigia repens e Molinia caerulea. Pelo menos 10 amostras quadradas foram coletadas para cada comunidade vegetal. Cada amostra quadrática incluiu as seguintes observações biofísicas: composição das espécies de plantas (%), umidade do solo (%), alturas da vegetação em centímetros e localizações precisas das coordenadas quadradas. Essas variáveis foram digitalizadas como um conjunto de dados tabulado, importadas para o GIS Project, adicionadas ao arquivo shapefile de dados GNSS quadrático amostral e salvas como um GeoPackage (.gpkg). Um arquivo independente de plataforma desse tipo, contendo observações biofísicas das comunidades vegetais de áreas úmidas e dados precisos de coordenadas amostrais, serve a um duplo propósito: para avaliação e modelagem adicional de ecossistemas ambientais e ecológicos. Mais importante ainda, para a execução bem-sucedida desse protocolo, este arquivo GeoPackage serve como dados de treinamento e validação do modelo no processo de aprendizado de máquina delineado na fase 4. Codificação de comunidades de plantas: OP, LS, US, TG; foram usados como etiquetas de treinamento no processo de aprendizado de máquina. Precisão (rótulos de alta fidelidade, auditoria humana, formato consistente) e estrutura (formato limpo e retangular (linhas/colunas)) são cruciais para produzir um conjunto de dados de verdade de alta qualidade. Rótulos de verdade fundamentada devem ter taxas de erro próximas de zero (por exemplo, erros de digitação) para garantir convenções de rotulagem consistentes. Por exemplo, se "OP" for a verdade fundamentada, garantir que não seja rotulado de outra forma (como "op", "O.P.") é essencial para evitar duplicação.
Para executar a terceira fase do protocolo, os conjuntos de dados do levantamento aéreo realizado na primeira fase foram usados para recalcular os dados brutos do levantamento aéreo em índices de vegetação (VIs). Primeiro, para reduzir o tamanho do conjunto de dados e agilizar o processo de computação, as saídas de fotogrametria "cortadas" para omitir dados de pixels irrelevantes ou de baixa qualidade fora dos limites do local do estudo (veja a Figura 5 como ilustração das ações realizadas em um software GIS).
Depois, 19 VIs multiespectrais foram calculados usando mapas de reflectância RED, GREEN, NIR e Red-edge. Os seguintes arquivos raster multiespectrais VI foram gerados e incluídos no Projeto GIS: índice Datt 4 (Datt4)41, Índice de Vegetação Aprimorado (EVI)42, Índice de Clorofila Verde (GCI)43, Índice de Diferença de Verde (GDI)44, Índices de Vegetação de Diferença Generalizada (GDVI)45, Índice de Vegetação de Percentual de Infravermelho Verde (GIPVI)46, Índice de Vegetação de Diferença Normalizada Verde (GNDVI)47, Índice de Diferença Verde-Vermelho (GRDI)44, Índice de Vegetação Verde-Vermelho (GRVI)45, Índice de Vegetação Diferencial Normalizada Modificada (mNDVI)48, Índice de Vegetação Ajustado Modificadopelo Solo 49 (MSAVI: veja Figura 6. uma captura de tela de uma calculadora raster em software GIS com entrada de fórmula MSAVI), Razão Simples Modificada de borda vermelha (MSRred_edge)50, Índice de Diferença Normalizada de Água (NDWI)51, Índice de Vegetação Diferenciada Normalizada (NDVI52), NDVI de Borda Vermelha (NDVIre)47, Índice de Vegetação Triangulada de Borda Vermelha (RTVIcore) 50, Índice de Vegetação Ajustada ao Solo (SAVI) 53,54, Razão Simples (SR) 55, Razão Simples Red-Edge (SRre) 47.
Além disso, um total de 23 VIs baseados em RGB foram calculados e salvos como arquivos raster no projeto GIS para análise espacial adicional: Índice de Razão Azul–Verde (BGRI)57, Índice de Brilho (BI)58, Índice de Vegetação de Faixa Dinâmica Azul (BRVI)59, Índice de Cor da Vegetação (CIVE)60, Índice de Vegetação Verde Aprimorado (EGVI)61, Índice de Vegetação Aprimorado (ERVI)62, Índices Verdes em excesso ExG e ExGI63, Índice de Combinação (COM)64, Coordenada Cromática Verde (GCC)34,65, Índice Verde Folha (GLI)66, Índice de Vegetação Verde-Vermelho (GRVI)67, Índice Verde Vermelho Modificado (MGRVI)68, Índice de Diferença Verde-Azul Normalizado (NGBDI)69, Índice Normalizado de Diferença Verde-Vermelho (NGRDI)69, Índice de Razão Vermelho–Verde–Azul e Índice de Vegetação Vermelho-Verde-Azul (RGBRI70 e RGBVI68), Índice de Razão Vermelho-Verde (RGRI)57, Índice de Vegetação Ajustada ao Solo Visível (SAVI)53, Índice de Verdor Triangular (TGI)69, Índice Visível de Resistência Atmosférica (VARI)47, Índice Vegetativo (VEG)71, Índice de Woebbecke (WI)63.
Os resultados finais incluem dois mapas separados de classificação de comunidades vegetais multiespectrais e RGB, salvos como GeoTIFFs dentro do projeto GIS, juntamente com todos os dados geoespaciais anteriores. 19 VIs multiespectrais, juntamente com o conjunto de dados ground-truth, foram usados como preditores em nível de pixel em um fluxo de trabalho de aprendizado de máquina (por exemplo, algoritmo RF) para classificar comunidades vegetais costeiras boreais (OP, LS, US, TG) e gerar um mapa multiespectral de comunidades vegetais. E preditores baseados em RGB (25 RGB VIs, índice em tons de cinza e56 índices normalizados vermelho, azul, verde e DSM), junto com o conjunto de dados de verdade, para classificar e gerar um mapa de comunidades vegetais baseado em RGB (veja a Figura 7. Resultados finais plotados no console R; A Figura 7A representa o multiespectro, e a Figura 7B representa mapas de comunidades vegetais baseados em RGB).
Para gerar resultados finais, o ambiente R (fase 4 do protocolo) foi usado para programar e executar o fluxo de trabalho de aprendizado de máquina (por exemplo, algoritmo RF), permitindo a visualização de saídas intermediárias, como rankings de desempenho do índice de vegetação (VI) (Figura 8). Ao mapear e classificar comunidades de plantas, o console R fornecia mensagens de erro em tempo real e explicações, facilitando a resolução de problemas e garantindo uma progressão suave em cada etapa.
Este estudo avaliou dois modelos de algoritmos RF para mapas de classificação de comunidades vegetais. O primeiro modelo RF, usando VIs multiespectrais como conjunto de dados de entrada, alcançou 92,34% de precisão com uma pontuação F1 de 0,915 no conjunto de dados de validação. Esse é um resultado válido, pois as pontuações F1 variam de 0 (pior) a 1 (perfeito), com pontuações mais altas indicando desempenho superior. A pontuação F1 em um modelo RF representa a média harmônica de precisão e recordação. Essa métrica equilibra efetivamente falsos positivos e negativos, ou seja, não permite que um tipo de erro supere o outro, o que é essencial para conjuntos de dados desequilibrados, e frequentemente é feita em média entre classes ou reportada por classe para avaliar o desempenho geral domodelo 78,79. A taxa de erro OOB do modelo multiespectral foi de 7,75%, indicando um risco moderado de classificação incorreta. As pontuações F1 em nível de classe no conjunto de dados de validação variaram de 0,845 em TG a 0,984 nas comunidades de plantas OP, indicando variabilidade moderada no desempenho entre comunidades.
O segundo modelo de RF avaliado foi baseado em VIs e DSM derivados do levantamento aéreo RGB, alcançando 98,89% de precisão com uma pontuação geral F1 de 0,987. Sua taxa de erro OOB era de apenas 1,14%, refletindo uma confiabilidade muito alta. As pontuações F1 em nível de turma foram consistentemente altas (0,986–0,993), indicando uma classificação robusta para todas as comunidades.
O gráfico de importância variável em R (Figura 8A) demonstrou as capacidades preditivas de cada VI para as comunidades vegetais de áreas úmidas costeiras boreais. Os VIs multiespectrais mais influentes como preditores foram mNDVI e SR, que indicam forte sensibilidade à vegetação e biomassa do dossel. Da mesma forma, GRDI, NDVIvi, NDVIre e SRre também foram altamente classificados, refletindo o papel dos índices de diferença de borda vermelha e normalizados na distinção dos tipos de vegetação. Em contraste, o índice baseado em RGB e o gráfico de importância variável do DSM mostram que o modelo de altura estrutural derivado do DSM como preditor é um fator chave para a precisão da classificação (Figura 8B). Outros preditores importantes incluem TGI, escala de cinza e VARI, que aproveitam a variabilidade da reflectância RGB. Assim, esses resultados indicam que o DSM e os índices derivados do RGB melhoram significativamente a confiabilidade da classificação e reduzem o risco de classificação errada.
Todo o conjunto de dados geoespacial foi salvo como o Projeto GIS, uma pasta, incluindo levantamentos de UAVs e mapas raster VI, o GeoPackage de observação biofísica (verdade no terreno) e mapas das comunidades vegetais; todos vinculados como um projeto QGIS (arquivo .qgz). O projeto é adequado para uso offline e possibilita interoperabilidade entre plataformas GIS.

Figura 1: Local do estudo. Fotografia com um alfinete de localização no mapa global, apontando para a ilha de Hiiumaa, no arquipélago ocidental da Estônia. O local de estudo, Kõrgessaare rannaniit, está localizado na vila de Viscosa e é uma área de conservação natural. Tipo de habitat: prado costeiro báltico boreal (código Natura 2000 1630). Por favor, clique aqui para ver uma versão ampliada desta figura.

Figura 2: Diagrama conceitual do fluxo de trabalho. (1) levantamento aéreo baseado em UAV, (2) coleta e georreferenciamento de dados de precisão no solo, (3) cálculo de índice de vegetação e (4) classificação supervisionada usando Random Forest in R. Mapas reais da implementação do protocolo ilustram esse método em quatro fases. Por favor, clique aqui para ver uma versão ampliada desta figura.

Figura 3: Diagrama detalhado do fluxo de trabalho. O diagrama lista as 4 fases (e etapas principais) do protocolo em painéis de cores diferentes, juntamente com conjuntos de dados gerados em cada fase. Arrors simbolizam o fluxo de dados. A cor azul distingue o conjunto de dados multiespectral do RGB em vermelho. Por favor, clique aqui para ver uma versão ampliada desta figura.

Figura 4: Exemplo de software de fotogrametria. (A–C) Uma captura de tela de um projeto de mosaico de imagens RGB: (A) Opções de processamento para DSM e ortomosaicos. (B) Opções de processamento para índices vermelho, verde e azul. (C) Visão do progresso do processamento, incluindo imagens aéreas e ângulos de câmera. Por favor, clique aqui para ver uma versão ampliada desta figura.

Figura 5. Recorte de arquivos raster de mapas em softwares GIS. Captura de tela de um espaço de trabalho QGIS com camadas visíveis e abas abertas em sequência demonstrando como recortar dados desnecessários: raster extraction-clip raster por Extent ("extent" neste caso refere-se a uma forma de polígono desenhada conforme desejado e usada para mascarar pixels que caem fora de seus limites) Por favor, clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Figura 6. Captura de tela da calculadora Raster do software GIS. Introdução da fórmula do Índice de Vegetação Ajustado ao Solo (MSAVI) como exemplo. Por favor, clique aqui para ver uma versão ampliada desta figura.

Figura 7. Ambiente de computação estatística para capturas de tela da versão R demonstrando resultados finais plotados no console R (RStudio). (A) mapas de comunidades vegetais multiespectrais e (B) baseados em RGB. Por favor, clique aqui para ver uma versão ampliada desta figura.

Figura 8. Ambiente de computação estatística para capturas de tela em R demonstrando rankings de desempenho VI. (A, B) Visualizações de um console R: (A) Captura de tela ao usar VIs multiespectrais como conjunto de dados de entrada, e (B) Captura de tela ao usar um conjunto de dados RGB+DSM. Ambas as visões (A e B) incluem gráficos de importância variável chamados "final_rf" (nome do objeto gerado por script). Por favor, clique aqui para ver uma versão ampliada desta figura.
Arquivo Suplementar 1: Equações do índice de vegetação. Lista de equações multiespectrais e de índice de vegetação (VI) baseadas em RGB usadas neste protocolo, incluindo fórmulas para normalização da banda RGB antes do cálculo do RGB VI. Por favor, clique aqui para baixar este arquivo.
Arquivo Suplementar 2: script de classificação e validação RF. Por favor, clique aqui para baixar este arquivo.