Microscopia de imunofluorescência: Coloração por imunofluorescência de secções de tecido embebidos em parafina

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Immunofluorescence Microscopy: Immunofluorescence Staining of Paraffin-Embedded Tissue Sections

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09:56 min
April 30, 2023

Overview

Fonte: Thomas Chaffee1, Thomas S. Griffith2,3,4, e Kathryn L. Schwertfeger1,3,4
1 Departamento de Medicina de Laboratório e Patologia, Universidade de Minnesota, Minneapolis, MN 55455
2 Departamento de Urologia, Universidade de Minnesota, Minneapolis, MN 55455
3 Centro de Câncer Maçônico, Universidade de Minnesota, Minneapolis, MN 55455
4 Center for Imunology, University of Minnesota, Minneapolis, MN 55455

Análises patológicas de seções teciduais podem ser utilizadas para obter uma melhor compreensão da estrutura tecidual normal e contribuir para a compreensão dos mecanismos da doença. Biópsias teciduais, seja de pacientes ou de modelos in vivo experimentais, são frequentemente preservadas por fixação em formalina ou paraformaldeído e incorporação em cera de parafina. Isso permite que o armazenamento a longo prazo e os tecidos sejam seccionados. Os tecidos são cortados em seções finas (5 μm) usando um microtome e as seções são aderidas a lâminas de vidro. As seções teciduais podem ser manchadas com anticorpos, que permitem a detecção de proteínas específicas dentro das seções teciduais. A coloração com anticorpos conjugados a fluoroforos (também conhecidos como fluorochromes) – compostos que emitem luz em comprimentos de onda específicos quando excitados por um laser – é conhecida como imunofluorescência. A capacidade de detectar proteínas dentro de uma seção pode fornecer informações como heterogeneidade do tipo celular dentro do tecido, ativação de vias específicas de sinalização e expressão de biomarcadores. Dependendo dos fluoroforos utilizados e do tipo de microscópio disponível para análise, podem ser utilizadas múltiplas cores, o que permite a análise multiplexada dos alvos.

O protocolo a seguir descreve as etapas básicas envolvidas na coloração da imunofluorescência das seções de tecido incorporado parafina. É importante notar que este protocolo não incluirá detalhes sobre a fixação de tecido, processo de incorporação de parafina ou secção dos tecidos. Uma vez que os tecidos são seccionados e colocados em lâminas de vidro, eles são reidratados através de uma série de incubações de etanol classificado (EtOH). As seções são incubadas com um reagente bloqueador para reduzir a ligação não específica de anticorpos à seção tecidual. As seções são então incubadas com um anticorpo primário que pode ou não ser rotulado diretamente com um fluoróforo. Se o anticorpo primário não for rotulado diretamente, as seções são então incubadas com um anticorpo secundário rotulado com um fluoróforo. Diferentes anticorpos podem exigir diferentes condições de coloração, assim estão incluídas sugestões de otimização de anticorpos. Após a lavagem para remover todos os anticorpos desvinculados, os slides são montados com mídia contendo DAPI para rotular fluorescentemente o núcleo. Uma vez que a mídia de montagem secou, os slides podem ser imagens usando um microscópio com lasers que podem detectar os diferentes fluoroforos.

Procedure

1. Configuração

  1. O protocolo de coloração típico envolve as seguintes etapas:
    1. Re-hidratando as seções teciduais nas lâminas usando uma série de etanols classificados.
    2. Incubando as seções teciduais com um tampão de bloqueio, o que ajudará a bloquear a ligação não específica de anticorpos ao tecido e reduzir a fluorescência de fundo.
    3. Removendo o tampão de bloqueio e incubando a seção em anticorpos primários, momento em que o anticorpo ligará seu alvo peptídeo.
    4. Removendo o anticorpo primário e lavando extensivamente as seções em tampão de lavagem.
    5. Incubando as seções com anticorpos secundários para permitir a vinculação ao anticorpo primário, se o anticorpo primário não for diretamente rotulado com um fluoróforo e um anticorpo secundário for necessário.
    6. Lavando o anticorpo secundário dos slides.
    7. Montar os slides em meios de montagem e permitir que eles sequem antes da visualização em um microscópio fluorescente.
  2. São necessários os seguintes itens: porta-slides (vidro ou plástico), frascos, pipetas, caneta pap, câmara úmida, deslizamentos de tampa e mídia de montagem com DAPI.
  3. Xileno é usado para a reidratação de slides. O xileno é perigoso e deve ser usado em um capuz de fumaça, juntamente com EPI apropriado, incluindo luvas e um jaleco.
  4. Receitas para buffers, soluções e reagentes
    1. Etanols classificados
      Etanol – 160 mL 200 prova EtOH e 40mL ddH2O
      Etanol – 140 mL 200 prova EtOH e 60mL ddH2O
    2. Solução de recuperação de antígenos
      Citrato de sódio de 10 mM, pH 6.0
    3. Tampão de bloqueio
      100 μL Soro de animal hospedeiro do qual o anticorpo secundário foi feito
      900 μL 1X PBS
      Nota: Este é o volume de 10 seções; ajustar o volume para cerca de 100 μL tampão por seção, conforme necessário.
    4. Tampão de lavagem (1X PBS)

2. Protocolo

  1. Reidratação com xileno e etanol
    1. Coloque slides em um suporte de slides e, em seguida, submere os slides na solução de isômeros 100% xileno, garantindo que os slides estejam totalmente cobertos com solução.
    2. Incubar lâminas nos isômeros de 100% xileno por 3 min. Repita duas vezes para um total de 3 incubações separadas. Certifique-se de limpar o rack de slides com uma toalha de papel antes de transferir para uma nova solução para minimizar a contaminação.
      Nota: Recomenda-se que essas incubações sejam realizadas em três recipientes separados.
    3. Incubar slides em 100% EtOH por 2 min. Repita duas vezes para um total de 3 incubações separadas.
      Nota: Recomenda-se que essas incubações sejam realizadas em três recipientes separados.
    4. Incubar slides em 95% EtOH por 2 min.
    5. Incubar slides em 80% EtOH por 2 min.
    6. Incubar slides em 70% EtOH por 2 min.
    7. Incubar slides em 1X PBS por 5 min.
  2. (Opcional) Recuperação de antígenos para epítopos desmascarados reconhecidos pelo anticorpo primário
    Nota 1: Este procedimento é altamente dependente do anticorpo utilizado e recomenda-se que sejam realizados procedimentos iniciais de otimização para determinar a exigência de recuperação de antígenos.
    Nota 2: Este procedimento não foi realizado com a coloração F4/80 mostrada abaixo. A exigência de recuperação de antígenos deve ser otimizada a cada novo anticorpo.
    1. Coloque slides em um suporte de deslizamento de plástico ou vidro resistente ao calor e certifique-se de que o rack esteja cheio de lâminas para garantir uma distribuição uniforme do calor. Slides em branco podem ser usados se houver menos amostras do que ranhuras no rack.
    2. Coloque rack em 1000 mL de solução de unmasking de antígeno em béquer 2L – 10 mL antígeno ungindo estoque para 990mL de água.
    3. Micro-ondas em alta por 20 minutos no total, certifique-se de que os slides permaneçam cobertos com água.
    4. Resfrie slides por 20 minutos no béquer.
    5. Lave o rack de slides em suportes de slides contendo ddH2O por 5 min cada. Repita duas vezes para um total de 3 incubações separadas usando ddH2O fresco cada vez. Os slides podem ser lavados no mesmo suporte de lâmina durante cada lavagem.
    6. Incubar slides em 1X PBS por 5 min.
  3. Seções circulares com uma caneta pap. Isso permitirá o uso de um volume mínimo de tampões necessários para cobrir as seções teciduais. Não permita que as seções de tecido sequem.
  4. Adicione o buffer de bloqueio a cada seção. A quantidade de tampão necessária para cobrir a seção varia dependendo do tamanho da seção, mas pode variar de 25-500 μL. Tampão suficiente deve ser usado para formar uma conta que cubra toda a superfície da seção, incluindo as bordas.
    Nota: A escolha do tampão de bloqueio pode variar dependendo do anticorpo que está sendo usado. Por exemplo, 10% de soro do animal hospedeiro no qual o anticorpo secundário foi criado pode ser usado para reduzir a ligação não específica do anticorpo secundário (por exemplo, o soro de cabra normal pode ser usado se o anticorpo secundário foi criado em cabra). A otimização do buffer de bloqueio deve ser realizada para cada anticorpo primário. Para colorar seções de tumor mamário com F4/80, foi utilizado 0,1 ml de soro de cabra 10% normal na PBS.
  5. Incubar as seções no bloqueio de tampão em uma câmara umidificada por 1 hora à temperatura ambiente ou 4°C até 24 horas. A câmara umidificada garante que as seções não sequem.
  6. Remova o tampão de bloqueio drenando-o do slide. Alternativamente, o tampão de bloqueio pode ser removido usando uma pipeta, embora tome cuidado para não tocar na seção com a ponta da pipeta.
  7. Diluir o anticorpo primário no bloqueio do buffer.
    Nota: A diluição correta precisará ser determinada para cada anticorpo e tipo de amostra. A otimização incluiria a realização de uma série de diluições para identificar a coloração ideal. Para colorir seções de tumores mamários com F4/80, as seções de tecido foram incubadas durante a noite a 4°C em 0,1 mL de anticorpo anti-F4/80 diluído 1:100 em 1% de soro de cabra normal na PBS.
  8. Adicione o anticorpo primário a cada seção e incuba em uma câmara umidificada por até 16 horas (durante a noite) a 4°C. Deixe pelo menos uma seção no buffer de bloqueio sem anticorpo primário para servir como controle, o que ajudará a identificar a ligação não específica pelo anticorpo secundário.
  9. Escorra o anticorpo primário ou bloqueie o buffer da seção e lave as seções com PBS colocando slides no rack de slides e colocando em um suporte de slides com 1x PBS. Lave 3 vezes por 10 minutos cada vez.
  10. Diluir o anticorpo secundário 1:200 no buffer de bloqueio. A diluição pode ser otimizada dependendo do anticorpo secundário.
  11. Adicione o anticorpo secundário a todas as seções, incluindo o controle, e incubar por 1 hora em uma câmara umidificada protegida da luz.
  12. Drene o anticorpo secundário das seções e lave 3 vezes em PBS por 10 minutos cada vez.
  13. Adicione 2-3 gotas de mídia de montagem contendo DAPI nos slides e coloque uma mancha de cobertura nas amostras. Se a mídia de montagem não for um tipo de mídia de secagem rápida, pode ser necessário selar as bordas do slide com cera de parafina derretida ou polimento de unhas para evitar vazamentos e manter as amostras a longo prazo.
  14. Deixe os slides secarem durante a noite no escuro e imagem as seções usando um microscópio fluorescente.

3. Análise e Resultados de Dados

  1. Seções manchadas são analisadas usando um microscópio fluorescente. Os detalhes específicos da captura e análise da imagem dependerão das especificações do microscópio e do software utilizado para realizar a análise. Normalmente, as imagens podem ser tiradas como imagens de cores únicas e sobrepostas para gerar imagens multicolorires. Por cento de células positivas podem ser quantificadas contando o número de células manchadas positivamente e dividindo-se pelo número total de células manchadas de DAPI dentro de uma seção. Para a coloração F4/80 das seções de tumor mamário, utilizando-se o software Leica Application Suite, versão 3.8, sob a guia Acquire e no modo de aquisição de Sobreposição de Imagem, FORAM ambos habilitados DAPI e RFP. Exposição, Ganho e Gama foram ajustados (20,0 ms, 1,0x e 1,53, respectivamente, para DAPI e 944,2 ms, 1,0x e 1,08, respectivamente, para RFP), embora isso varie entre os experimentos. O botão Acquire Overlay foi usado para criar imagens sobrepostas das exposições DAPI e RFP.
  2. A imagem abaixo (Figura 1) mostra um exemplo de imagem de imunofluorescência de uma seção de tumor manchada com F4/80, que detecta um antígeno em macrófagos e outras células mielóides. A seção foi montada usando mídia de montagem contendo DAPI e os núcleos são mostrados em azul.

A função de uma proteína em uma célula é em grande parte dependente de sua localização adequada dentro da célula. A microscopia de imunofluorescência é um método pelo qual uma proteína pode ser visualizada dentro das células usando corantes fluorescentes. Um corante fluorescente é um fluoróforo, que é uma molécula que absorve energia leve em um comprimento de onda específico por um processo chamado excitação, e imediatamente libera a energia em um comprimento de onda diferente, conhecido como emissão.

Os corantes fluorescentes são conjugados a um anticorpo específico do alvo e introduzidos em células ou tecidos cultivados por imunosstaining. Quando este anticorpo primário se liga à proteína de interesse, a proteína é rotulada com o corante fluorescente. Alternativamente, o corante fluorescente pode ser conjugado a um anticorpo secundário, em vez do anticorpo primário, e o anticorpo secundário se liga ao complexo de anticorpos primários proteicos para rotular o alvo. Depois disso, a amostra é selada em um meio de montagem antifade para preservar a rotulagem de fluorescência e, em seguida, está pronta para a imagem em um microscópio de fluorescência.

Um microscópio de fluorescência é equipado com uma poderosa fonte de luz. O feixe de luz passa primeiro através de um filtro de excitação, que permite que apenas a luz no comprimento de onda de excitação passe. A luz de excitação então atinge um espelho especializado, chamado espelhodicróico ou divisor de feixe, que é projetado para refletir seletivamente o comprimento de onda de excitação em direção a uma lente objetiva. A lente então concentra a luz em uma pequena região da amostra. Ao chegar à amostra, a luz excita os fluoroforos, que então emitem a energia da luz em um comprimento de onda diferente. Esta luz é transmitida de volta através da lente objetiva para o espelho dicroico. Como o comprimento de onda de emissão é diferente do comprimento de onda de excitação, o espelhodicróico permite que a luz de emissão passe. Em seguida, passa por um segundo filtro, chamado filtro de emissão, que elimina a luz de qualquer outro comprimento de onda que possa estar presente. Depois disso, os raios de luz agora atingem a ocular ou câmera, onde apresentam uma imagem ampliada criada a partir da luz emitida a partir dos fluoroforos específicos. Esta imagem representa a localização da proteína de interesse dentro da célula.

Corantes fluorescentes de ligação de DNA são frequentemente usados juntamente com a imunostenção para rotular núcleos como um ponto de referência dentro das células. Vários fluoroforos diferentes, com diferentes comprimentos de onda de emissão de excitação, podem ser usados para diferentes proteínas dentro da mesma amostra para comparar a localização das proteínas.

Este vídeo demonstra o procedimento para coloração imunofluorescente de uma proteína de interesse em uma amostra de tecido seguido de imagem da amostra em um microscópio de fluorescência.

Antes de iniciar o processo de coloração, as seções, que foram desidratadas durante o processo de incorporação, precisam ser rehidratadas. Para isso, primeiro, coloque os slides em um suporte de slides e, em seguida, submere completamente os slides em isômeros 100% Xlene. Deixe os slides incubarem por três minutos. Em seguida, remova os slides do recipiente, limpe qualquer excesso de xileno com uma toalha de papel e coloque-os em um novo banho de xileno em um recipiente fresco, por mais três minutos. Repita esta incubação cada vez em um novo recipiente com xileno fresco e limpe os slides com toalhas de papel antes de transferir para o novo recipiente, para um total de três incubações. Em seguida, incubar as seções em uma série de soluções de etanol classificados, começando com 100% de etanol por dois minutos. Limpe o rack de slides com uma toalha de papel e transfira os slides para um novo recipiente de 100% de etanol por mais dois minutos. Continue o ciclo de lavagem, eliminando o excesso de etanol com uma toalha de papel, e transferindo os slides para um novo banho, seguindo as concentrações indicadas de etanol para o tempo especificado. Após a lavagem final do etanol, retire a solução em excesso e incubar os slides em 1X PBS por cinco minutos.

Para iniciar o processo de coloração, primeiro, circule as seções com uma caneta PAP para identificar a área mínima que os buffers precisam cobrir. Uma vez que as seções estejam claramente marcadas no slide, adicione 100 microliters de tampão de bloqueio a cada slide, certificando-se de cobrir toda a superfície da seção. Depois que os tecidos estiverem cobertos pelo tampão de bloqueio, coloque os slides em uma câmara umidificada. Deixe os slides para incubar por uma hora em temperatura ambiente.

Após o tempo de incubação desejado, remova o tampão de bloqueio drenando-o do slide. Em seguida, diluir o anticorpo primário no tampão de bloqueio. Para uma diluição de 1:100, adicione 990 microliters de tampão de bloqueio a um tubo de centrífuga de 1,5 mililitro, seguido por 10 microliters do anticorpo primário ao mesmo tubo. Rotule um slide como controle e adicione 100 microliters de tampão de bloqueio. Este controle ajudará a identificar qualquer ligação não específica do anticorpo secundário. Agora, adicione 100 microliters de tampão de anticorpos primários aos slides restantes. Incubar as seções durante a noite em uma câmara umidificada a quatro graus celsius, no escuro.

Após a incubação durante a noite, remova as seções da câmara e drene o anticorpo primário de cada slide e o tampão de bloqueio do controle. Coloque os slides em um rack de slides e depois lave-os três vezes em 1X PBS por dez minutos cada. Enquanto os slides estiverem lavando em 1X PBS, diluir o anticorpo secundário no buffer de bloqueio. Para uma diluição de 1:200, adicione 995 microliters de tampão de bloqueio a um tubo de 1,5 mililitro, seguido por cinco microliters do anticorpo secundário ao mesmo tubo. Adicione o anticorpo secundário a todas as seções, incluindo o controle, e incuba-os por uma hora em uma câmara umidificada protegida da luz. Quando o temporizador soar, remova os slides da incubadora. Drene o anticorpo secundário das seções. Uma vez que o anticorpo secundário seja removido, coloque os slides em um rack de slides e, em seguida, submerga completamente os slides em 1X PBS por 10 minutos, protegido da luz. Repita esta lavagem três vezes, usando pbs 1X fresco para cada lavagem. Após as lavagens, adicione duas a três gotas de mídia de montagem contendo DAPI em cada slide e coloque uma mancha de vidro nas amostras. Deixe os slides secarem durante a noite em um lugar escuro antes de imaginar as seções usando um escopo fluorescente.

Durante a imagem, os detalhes da captura de imagem dependerão do microscópio e software específicos disponíveis. No entanto, neste exemplo em particular, o software Leica Application Suite, Versão 3. 8, é usado para realizar a análise. Usando este programa, clique na guia Adquirir e no modo de aquisição de sobreposição de imagem, habilite tanto DAPI quanto RFP. Em seguida, ajuste a Exposição, Ganho e Gama para DAPI e RFP, tomando uma inicial usando as configurações padrão definidas pelo software e, em seguida, otimizando para brilho modificando o tempo de exposição e o ganho, tendo em mente que configurações mínimas ideais são desejáveis para evitar a saturação de imagem e fotobleaching das amostras. Gama pode ser modificada para otimizar áreas mais escuras de uma imagem.

Uma vez que as configurações sejam ajustadas, pressione o botão Adquirir sobreposição para criar imagens sobrepostas das exposições DAPI e RFP. Esta imagem de exemplo, capturada usando a técnica demonstrada, mostra uma seção de tumor mamário do rato, manchada com o anticorpo F4/80, que detecta um antígeno, retratado em vermelho, em macrófagos e outras células mieloides. Desde que a mídia de montagem contendo DAPI foi usada, os núcleos são mostrados em azul. Os dados da imagem fornecerão informações sobre a intensidade e localização da proteína dentro da seção tecidual.

Por exemplo, na imagem do tumor manchado com F4/80, observa-se a coloração da superfície celular deste antígeno. Esses dados também podem fornecer informações sobre a frequência de populações celulares específicas dentro da seção tecidual. Isso pode ser quantificado contando o número de células manchadas positivamente, aqui mostradas em vermelho, e comparando-a com a população celular total, mostrada em azul, e calculando a frequência usando a equação a seguir.

Results

Figure 1
Figura 1: Mancha F4/80 de uma seção de tumor mamário. Após a fixação, um tumor mamário do rato foi seccionado e manchado com anti-F4/80 e montado usando uma mídia de montagem contendo DAPI. A coloração é mostrada pela mancha f4/80 da superfície celular em vermelho. Clique aqui para ver uma versão maior desta figura.

Os dados obtidos a partir da imagem fornecerão informações sobre a intensidade e localização da expressão da proteína de interesse dentro da seção tecidual. Dependendo da proteína ser examinada, esses dados também poderiam fornecer informações sobre a frequência de populações celulares específicas dentro da seção tecidual. Isso pode ser quantificado contando o número de células manchadas positivamente e comparando com a população celular total.

Applications and Summary

A imunofluorescência permite a investigação da expressão proteica e localização no contexto de uma seção tecidual. Essa técnica pode ser usada para entender como os tecidos mudam no contexto da doença, examinando a localização de proteínas ou número celular em tecidos normais e doentes. Alterações na localização ou nos padrões de expressão podem ser determinadas e ligadas a atributos específicos das amostras.

References

  1. Im K, Mareninov S., Diaz MFP, Yong WH. An Introduction to Performing Immunofluorescence Staining. Yong W. (eds) Biobanking. Methods in Molecular Biology. 1897, Humana Press, New York, NY (2019)
  2. Ramos-Vara JA. Principles and Methods of Immunohistochemistry. Gautier JC. (eds) Drug Safety Evaluation. Methods in Molecular Biology. 1641, Humana Press, New York, NY (2017)
  3. Donaldson JG. Immunofluorescence Staining. Current protocols in Cell Biology. 69 (1):1 4.3.1-4.3.7. (2015)

Transcript

The function of a protein in a cell is largely dependent on its proper localization within the cell. Immunofluorescence microscopy is a method by which a protein can be visualized inside cells using fluorescent dyes. A fluorescent dye is a fluorophore, that is a molecule that absorbs light energy at a specific wavelength by a process called excitation, and then immediately releases the energy at a different wavelength, known as emission.

Fluorescent dyes are conjugated to a target-specific antibody and introduced into cultured cells or tissue by immunostaining. When this primary antibody binds to the protein of interest, the protein gets labeled with the fluorescent dye. Alternatively, the fluorescent dye can be conjugated to a secondary antibody, instead of the primary antibody, and the secondary antibody binds to the protein primary antibody complex to label the target. After that, the sample is sealed in an antifade mounting medium to preserve the fluorescence labeling and is then ready for imaging on a fluorescence microscope.

A fluorescence microscope is equipped with a powerful light source. The light beam first passes through an excitation filter, which allows only the light at the excitation wavelength to pass through. The excitation light then reaches a specialized mirror, called a dichroic mirror or a beam splitter, which is designed to selectively reflect the excitation wavelength towards an objective lens. The lens then focuses the light onto a small region in the sample. Upon reaching the sample, the light excites the fluorophores, which then emit the light energy at a different wavelength. This light is transmitted back through the objective lens to the dichroic mirror. Since the emission wavelength is different from the excitation wavelength, the dichroic mirror allows the emission light to pass through. Then, it goes through a second filter, called the emission filter, which eliminates light from any other wavelengths that may be present. After that, the light rays now reach the eyepiece or camera, where they present a magnified image created from the emitted light from the specific fluorophores. This image represents the location of the protein of interest within the cell.

DNA binding fluorescent dyes are often used along with immunostaining to label nuclei as a point of reference within the cells. Multiple different fluorophores, with different excitation emission wavelengths, can be used for different proteins within the same sample to compare localization of the proteins.

This video demonstrates the procedure for immunofluorescent staining of a protein of interest in a tissue sample followed by imaging the sample on a fluorescence microscope.

Before beginning the staining process, the sections, which were dehydrated during the embedding process, need to be rehydrated. To do this, first, place the slides into a slide holder and then completely submerge the slides in 100% Xlene isomers. Allow the slides to incubate for three minutes. Then, remove the slides from the container, wipe off any excess Xylene with a paper towel, and place them into a new Xylene bath in a fresh container, for a further three minutes. Repeat this incubation each time in a new container with fresh Xylene and wiping down the slides with paper towels before transferring to the new container, for a total of three incubations. Next, incubate the sections in a series of graded ethanol solutions, starting with 100% ethanol for two minutes. Wipe off the slide rack with a paper towel, and transfer the slides to a new container of 100% ethanol for another two minutes. Continue the cycle of washing, wiping excess ethanol with a paper towel, and transferring the slides to a new bath, following the indicated concentrations of ethanol for the specified time. After the final ethanol wash, shake off the excess solution and incubate the slides in 1X PBS for five minutes.

To begin the staining process, first, circle the sections with a PAP pen to identify the minimal area that the buffers need to cover. Once the sections are clearly marked on the slide, add 100 microliters of blocking buffer to each slide, making sure to cover the entire section surface. After the tissues are covered in blocking buffer, place the slides in a humidified chamber. Leave the slides to incubate for one hour at room temperature.

Following the desired incubation time, remove the blocking buffer by draining it off the slide. Next, dilute the primary antibody in blocking buffer. For a 1:100 dilution, add 990 microliters of blocking buffer to a 1.5 milliliter centrifuge tube, followed by 10 microliters of the primary antibody to the same tube. Label one slide as a control and then add 100 microliters of blocking buffer. This control will help identify any non-specific binding of the secondary antibody. Now, add 100 microliters of primary antibody buffer to the remaining slides. Incubate the sections overnight in a humidified chamber at four degrees celsius, in the dark.

Following the overnight incubation, remove the sections from the chamber and drain the primary antibody off each slide and the blocking buffer from the control. Place the slides into a slide rack and then wash them three times in 1X PBS for ten minutes each. While the slides are washing in 1X PBS, dilute the secondary antibody in blocking buffer. For a 1:200 dilution, add 995 microliters of blocking buffer to a 1.5 milliliter tube, followed by five microliters of the secondary antibody to the same tube. Add the secondary antibody to all of the sections, including the control, and incubate them for one hour in a humidified chamber protected from light. When the timer sounds, remove the slides from the incubator. Drain the secondary antibody off the sections. Once the secondary antibody is removed, place the slides in a slide rack and then completely submerge the slides in 1X PBS for 10 minutes, protected from light. Repeat this wash three times, using fresh 1X PBS for each wash. Following the washes, add two to three drops of mounting media containing DAPI to each slide and place a glass coverslip on the samples. Allow the slides to dry overnight in a dark place before imaging the sections using a fluorescent scope.

During imaging, the details of image capture will depend upon the specific microscope and software available. However, in this particular example, the software Leica Application Suite, Version 3. 8, is used to perform the analysis. Using this program, click on the Acquire tab and in Image Overlay Acquisition mode, enable both DAPI and RFP. Next, adjust the Exposure, Gain, and Gamma for both DAPI and RFP, by taking an initial using the default settings defined by the software, and then optimizing for brightness by modifying the exposure time and the gain, keeping in mind that minimal optimal settings are desirable to avoid image saturation and photobleaching of the samples. Gamma can be modified to optimize darker areas of an image.

Once the settings are adjusted, press the Acquire Overlay button to create overlay images of the DAPI and RFP exposures. This example image, captured using the demonstrated technique, shows a mouse mammary tumor section, stained with the antibody F4/80, which detects an antigen, depicted in red, on macrophages and other myeloid cells. Since DAPI-containing mounting media was used, nuclei are shown in blue. The data from the imaging will provide information regarding the intensity and localization of the protein within the tissue section.

For example, in the image of the tumor stained with F4/80, cell surface staining of this antigen is observed. These data can also provide information regarding the frequency of specific cell populations within the tissue section. This can be quantified by counting the number of positively stained cells, here shown in red, and comparing that with the total cell population, shown in blue, and calculating the frequency using the following equation.