17 de junho de 2009
Este vídeo documenta métodos de coleta de amostras de água costeiros marinhos e processá-los para várias aplicações a jusante, incluindo concentração de biomassa, a purificação de ácido nucléico, a abundância de células, nutrientes e gases traço.
Olá, sou Elena Kova do Laboratório de Stephen Hallam, do Departamento de Microbiologia e Imunologia da Universidade da Colúmbia Britânica. Hoje vamos mostrar um procedimento para coletar água do mar para análise física, química e biológica. Utilizamos este procedimento em nosso laboratório para estudar parâmetros oceanográficos das águas marinhas.
Então vamos começar. Primeiro, define-se o número de amostragens e as profundidades em cada amostragem, em seguida as profundidades a serem coletadas, e determina-se o volume total a ser coletado para a amostragem atual. Certifique-se de que os dispositivos de coleta de fluxo e de amostragem de água cinética estejam na posição aberta e que todas as válvulas e torneiras estejam fechadas.
Acople o CTD à base da linha e abaixe-o na água até a profundidade máxima do perfil. Coloque imediatamente após o CTD um dispositivo de amostragem na linha. Certifique-se de que a linha esteja corretamente encaixada no suporte do dispositivo e de que os parafusos estejam bem apertados.
Prenda um mensageiro com peso a cada dispositivo, exceto ao do ponto de amostragem mais profundo, antes de baixá-lo na água. Abaixe a linha e a distância entre a primeira profundidade especificada e a seguinte, então prepare outro dispositivo de amostragem. Observe que, em intervalos de profundidade onde são coletadas amostras de água de grande volume, um total de duas garrafas de 12 litros são carregadas consecutivamente, separadas por aproximadamente 0,75 metros.
Após todos os dispositivos estarem na linha, abaixe a linha até a profundidade máxima e aguarde dois minutos. Envie um mensageiro para baixo, acionando cada dispositivo para a posição fechada. Aguarde alguns minutos antes de recolher a linha.
Para garantir que todos os dispositivos estejam fechados, enrole o cabo e descarregue cada dispositivo no convés à medida que ele emerge da água. Para profundidades que exigem grandes volumes de amostra para purificação de proteínas, DNA ou RNA, utilize dois dispositivos de amostragem em conjunto. Colete imediatamente o RNA de uma garrafa e filtre-o a bordo.
Após coletar amostras de produtos químicos e nutrientes no outro frasco, drenar a água restante para o carro para obter um volume final de 20 litros. Para amostras de baixo volume, reservar um litro de água para filtração em frascos estéreis de Nalgene. Normalmente, amostras de baixo volume provenientes de 16 intervalos de profundidade são coletadas como 16 x uma amostra de um litro e seis x amostras de 20 litros são coletadas como amostras de alto volume.
Ao coletar amostras de gás, colete sempre amostras de oxigênio e de gases traço. Primeiro, conecte um pequeno pedaço de tubo ao bico do dispositivo de coleta de água. Coloque a outra extremidade do tubo nos frascos de soro glos.
Lave o frasco de soro três vezes, mas com água da amostra, e encha-o até transbordar, de modo que não haja bolhas de ar. Adicione 50 microlitros de cloreto de mercúrio ao frasco de soro. Tenha cuidado para não introduzir bolhas de ar na amostra.
Feche o frasco de soro com uma rolha de borracha C e prenda com uma tampa de alumínio, depois armazene em gelo para coletar amostras para medições de nutrientes, incluindo nitrato, fosfato e silicato. Primeiro, enxágue uma seringa de 60 cc com água da amostra. Em seguida, acople um filtro acro disc de 0,2 micrômetro em linha.
Empurre aproximadamente dois ml de água através da seringa para purgar o filtro. Enxágue um frasco de polietileno com aproximadamente 10 ml de água filtrada três vezes.
Agite o frasco durante a lavagem, depois adicione água da amostra filtrada aos frascos até cerca de três quartos da capacidade. Armazene a amostra sobre gelo. Esvazie os tubos de coleta de água distal para coletar amostras destinadas às medições de amônia.
Primeiro, enxágue os tubos de coleta, mas descarte completamente a água da amostra. Encha um cilindro graduado de 10 ml com água da amostra, retire cinco ml da água da amostra do cilindro graduado e esvazie o restante do cilindro. Em seguida, adicione novamente os cinco ml ao cilindro vazio.
Uma vez que as amostras de todas as profundidades tenham sido coletadas, adicione 7,5 ml do reagente de trabalho de amônio a cada tubo. Para coletar amostras para contagem de células, encha um tubo Falcon de 50 ml pré-rotulado contendo 5,4 ml de formaldeído a 37% até a marca de 50 ml, obtendo uma concentração final de 4%. Tenha cuidado para não transbordar o tubo. Armazene a amostra sobre gelo até a coleta das amostras.
Para medições de sulfeto de hidrogênio. Encha até a boca um tubo Falcon de 50 mL pré-rotulado contendo três mL de acetato de zinco a 20%. Tenha cuidado para não derramar o conteúdo do tubo.
Armazene a amostra em gelo para coletar pequenos volumes. Para concentração de biomassa. Encha garrafas Nalgene de um litro até a borda para coletar grandes volumes para concentração de biomassa.
Encha garrafões de 20 litros até o topo. O resultado final da coleta de água do mar resulta em aproximadamente 32 a 48 amostras de gás e 32 amostras de amônio.
16 amostras de sulfeto de hidrogênio. 16 amostras para contagem de células. Seis garrafas de carro de 20 litros, 16 garrafas de um litro e quatro sterex.
Os filtros de dois vírgula dois micrômetros contendo biomassa microbiana são preservados para posterior isolamento de RNA. Acabamos de demonstrar como coletar diferentes tipos de amostras de água para análise bioquímica.
Isso exige uma grande quantidade de preparação e planejamento. Portanto, reserve dois dias antes da viagem para organizar as coisas e um dia após para a limpeza; não permita que água salgada entre em contato com a bomba peralt ou com a caixa de alumínio zago usada para transportar o equipamento de campo. Trate o equipamento com respeito e ele funcionará bem por muito tempo.
É isso aí. Obrigado por assistir e boa sorte com seus experimentos.
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Este vídeo documenta métodos para coletar amostras de água marinha costeira e processá-las para diversas aplicações subsequentes, incluindo concentração de biomassa, purificação de ácidos nucleicos, abundância celular, e análises de nutrientes e gases traço.
Protocolos robustos de coleta e amostragem de água do mar são fundamentais para gerar conjuntos de dados de alta qualidade na descoberta de bioprodutos marinhos, permitindo a avaliação precisa de variáveis ambientais e materiais biológicos. Esses métodos sustentam análises posteriores, como a purificação de ácidos nucleicos, a quantificação da abundância celular e o perfil nutricional, que são críticos para a validação de alvos e a redução de riscos mecanicistas na descoberta de fármacos de origem marinha. A coleta padronizada assegura a reprodutibilidade e a comparabilidade entre programas de descoberta, apoiando decisões abrangentes em todo o portfólio.
Os métodos de amostragem e coleta de água do mar estão posicionados na etapa inicial do contínuo de descoberta de biofármacos marinhos, fornecendo material fundamental para fluxos de trabalho que abrangem a validação de alvos, triagem e pesquisa translacional.