June 17th, 2009
Este vídeo documenta métodos de coleta de amostras de água costeiros marinhos e processá-los para várias aplicações a jusante, incluindo concentração de biomassa, a purificação de ácido nucléico, a abundância de células, nutrientes e gases traço.
Olá, sou Elena Kova, do Laboratório de Stephen Hallam no Departamento de Microbiologia e Imunologia da Universidade da Colúmbia Britânica. Hoje vamos mostrar um procedimento de coleta de água do mar para análises físicas, químicas e biológicas. Usamos esse procedimento em nosso laboratório para estudar parâmetros gráficos oceânicos de águas marinhas.
Então vamos começar. Primeiro, o número de lançamentos e profundidades em cada elenco são atribuídos, depois as profundidades a serem amostradas e o volume total a ser coletado para o elenco atual são determinados. Certifique-se de que o fluxo de fluxo e água de parentesco sampdispositivos estão na posição aberta e que todas as válvulas e torneiras estão fechadas.
Prenda o CTD na base da linha e abaixe-o na água para obter a profundidade mais profunda do perfil. Colocar um dispositivo de recolha de amostras na linha imediatamente a seguir ao DTC. Certifique-se de que a linha esteja encaixada corretamente no suporte do dispositivo e que os parafusos estejam apertados.
Anexe um mensageiro ponderado a cada dispositivo, exceto para a profundidade de amostragem mais profunda, antes de baixá-lo na água. Abaixe a linha e a distância entre a primeira profundidade especificada e a próxima e, em seguida, monte outro dispositivo de amostragem. Observe que, para intervalos de profundidade em que amostras de água de grande volume são coletadas, um total de duas garrafas de 12 litros são carregadas consecutivamente a aproximadamente 0,75 metros de distância.
Depois que todos os dispositivos estiverem na linha, abaixe a linha até a profundidade mais profunda e deixe passar dois minutos. Envie um mensageiro para baixo, tropeçando em cada dispositivo na posição fechada. Aguarde alguns minutos antes de recuperar a linha.
Para garantir que todos os dispositivos estejam fechados, enrole a linha e descarregue cada dispositivo no convés à medida que ele emerge da água. Para profundidades que requerem grandes volumes de amostra para purificação de DNA ou RNA de proteína, empregue dois dispositivos de amostragem em conjunto. Colete RNA imediatamente de uma garrafa e filtre-o no navio.
Depois de amostrar produtos químicos e nutrientes na outra garrafa, drene a água restante para o carro para obter um volume final de 20 litros. Para amostras de baixo volume, reserve um litro de água para filtração em garrafas estéreis de Nalgene. Normalmente, amostras de baixo volume de 16 intervalos de profundidade são coletadas como amostras de 16 x um litro e seis amostras de x 20 litros são coletadas como amostras de alto volume.
Ao coletar amostras de gás, sempre colete amostras de oxigênio e gases residuais. Primeiro, conecte um pedaço fino de tubo à torneira do dispositivo de amostragem de água. Coloque a outra extremidade do tubo nos frascos de soro glos.
Enxágue o frasco de soro três vezes, mas experimente água e encha-o até transbordar de forma que não haja bolhas de ar. Adicione 50 microlitros de cloreto de mercúrio ao frasco de soro. Tenha cuidado para não introduzir bolhas de ar na amostra.
Feche o frasco de soro com uma rolha de borracha C com uma tampa de alumínio e armazene-o no gelo para coletar amostras para medições de nutrientes, incluindo nitrato, fosfato e silicato. Primeiro enxágue uma seringa de 60 cc com sample água. Em seguida, conecte um filtro de disco acro de 0.2 micrômetro em linha.
Empurre aproximadamente dois ml de água através da seringa. Para purgar o filtro. Enxágue um frasco de polietileno com aproximadamente 10 ml de água filtrada três vezes.
Agite a garrafa ao enxaguar e, em seguida, adicione água filtrada às garrafas cerca de três quartos cheias. Armazene a amostra no gelo. Esvazie os tubos de coleta de água distal para coletar amostras para medições de amônia.
Primeiro enxágue os tubos de coleta, mas faça uma amostra completa da água. Encher uma garrafa graduada de 10 ml com um tubo de água de recolha a cinco ml de água de amostra para fora da garrafa graduada e esvaziar o restante da garrafa. Em seguida, adicione os cinco ml de volta ao cilindro vazio.
Uma vez que amostras de todas as profundidades tenham sido coletadas a 7,5 ml de reagente de trabalho de amônio para cada tubo. Para coletar amostras para contagem de células, encha um tubo Falcon de 50 ML pré-rotulado contendo 5,4 ml, 37% de altura de formalidade até a marca de 50 ml para uma concentração final de 4% Tome cuidado para não transbordar o tubo. Armazene a amostra no gelo para coletar amostras.
Para medições de sulfeto de hidrogênio. Encha um tubo Falcon de 50 ML pré-rotulado contendo três ml de acetato de zinco a 20% até o topo. Tome cuidado para não transbordar o tubo.
Armazene a amostra no gelo para coletar pequenos volumes. Para concentração de biomassa. Encha garrafas de Nalgene de um litro até o topo para coletar grandes volumes para concentração de biomassa.
Encha garrafões de 20 litros até o topo. O resultado final da amostragem de água do mar resulta em aproximadamente 32 a 48. Amostras de gás, 32 amostras de amônio.
16 amostras de sulfeto de hidrogênio. 16 amostras para contagem de células. Seis carros de 20 litros, 16 garrafas de um litro e quatro sterex.
Ponto dois, dois filtros micrométricos contendo biomassa microbiana são preservados para mais tarde. Isolamento de RNA. Acabamos de demonstrar como coletar diferentes tipos de amostras de água para análise bioquímica.
Isso requer muita preparação e planejamento. Portanto, faça um orçamento dois dias antes da viagem para colocar as coisas em ordem e um dia depois para a limpeza, não deixe a água salgada entrar em contato com uma bomba de peralt ou na caixa de zago de alumínio usada para transportar o equipamento de campo. Trate o equipamento com respeito e ele servirá bem por muito tempo.
Então é isso. Obrigado por assistir e boa sorte com seus experimentos.
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Este vídeo documenta métodos para coletar amostras de água marinha costeira e processá-las para várias aplicações subsequentes, incluindo concentração de biomassa, purificação de ácidos nucléicos, abundância celular, análises de nutrientes e gases traço.
Robust seawater sampling and collection protocols are foundational for generating high-quality datasets in marine biopharma discovery, enabling accurate assessment of environmental variables and biological materials. These methods underpin downstream analyses such as nucleic acid purification, cell abundance quantification, and nutrient profiling, which are critical for target validation and mechanistic de-risking in marine-derived drug discovery. Standardized collection ensures reproducibility and comparability across discovery programs, supporting portfolio-wide decision-making.
Seawater sampling and collection methods are positioned at the front end of the marine biopharma discovery continuum, providing foundational material for workflows spanning target validation, screening, and translational research.