Purificação de subpopulações de vesículas extracelulares: uma técnica para purificar subpopulações de vesículas extracelulares usando ultracentrifugação com gradiente de densidade

0 vistas4:27 min • April 30th, 2023

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As vesículas extracelulares ou EVs são vesículas nanométricas, heterogêneas e ligadas à membrana secretadas por várias células, incluindo células tumorais cerebrais. Os pequenos EVs são uma subpopulação composta por EVs derivados de endossomos e de membrana.

Para purificar os pequenos EVs, comece tomando EVs pré-extraídos suspensos em um tampão suplementado com sacarose que mantém uma solução homogênea e preserva a integridade estrutural dos EVs.

A esta solução, então, adicione um volume apropriado de iodixanol - um meio de gradiente de densidade inerte e não tóxico - para atingir a densidade desejada.

O iodixanol solubiliza as proteínas contaminantes a serem removidas posteriormente.

Em seguida, adicione camadas de soluções de iodixanol de densidades sucessivamente decrescentes para criar um gradiente de densidade descontínuo.

Centrifugue o tubo em alta velocidade.

Dependendo de suas taxas de flutuação, os EVs mais densos migram para uma camada igualmente densa de meio gradiente, enquanto os EVs menos densos migram ainda mais para uma camada mais leve, e os contaminantes mais densos formam uma pelota no fundo do tubo.

Agora, transfira pequenas frações das camadas de gradiente em tubos novos contendo um tampão adequado.

Em seguida, centrifugue os tubos em velocidade ultra-alta em condições refrigeradas.

Durante a centrifugação, a baixa temperatura evita que os EVs sofram danos causados pelo calor induzidos em alta velocidade.

Depois que os EVs puros descerem, remova o sobrenadante. Ressuspender os EVs em um tampão apropriado e prosseguir para caracterização e análise proteômica.

Primeiro, adicione 1,5 mililitros de iodixanol a 60% aos 1,5 mililitros do tampão sacarose/Tris que contém os EVs para criar uma solução final contendo 30% de iodixanol. Pipete várias vezes para cima e para baixo para misturar bem a solução.

Transferir esta solução para o fundo de um tubo de ultracentrifugação de 5,5 mililitros. Em seguida, misture o estoque de iodixanol a 60% com água ultrapura para preparar pelo menos 1,5 mililitros de uma solução de iodixanol a 20% e a 10%.

Usando uma seringa e uma agulha 18G, meça 1,3 mililitros da solução de iodixanol a 20% e coloque-a cuidadosamente em cima do gradiente inferior.

Mantenha o chanfro da agulha em contato com o interior do tubo logo acima do menisco e adicione a solução gota a gota para evitar misturar as camadas na interface de densidade.

Em seguida, coloque 1,2 mililitros da solução de iodixanol a 10% em cima da camada a 20% usando a mesma técnica. Equilibre e carregue cuidadosamente os tubos de ultracentrifugação em caçambas de rotor.

Defina as velocidades de aceleração e desaceleração de um rotor de caçamba oscilante para as taxas mínimas e centrifugue a 268.000 x g e a 4 graus Celsius por 50 minutos.

Enquanto a amostra está sendo centrifugada, rotule dez tubos de microcentrífuga de 1,5 mililitro para cada amostra que corresponderá às frações de 1 a 10 do gradiente de densidade.

Quando a centrifugação estiver concluída, remova cuidadosamente os tubos das caçambas do rotor e coloque-os em um suporte estável. Pipetar 10 frações seriais de 490 microlitros do topo do gradiente para os tubos correspondentes.

Usando um refratômetro, meça os índices de refração das frações. Em seguida, transfira cada fração para um tubo de ultracentrifugação limpo de 12 mililitros.

Adicione 5 mililitros de 1x PBS a cada tubo e pipete para cima e para baixo lentamente para misturar. Adicione mais 6 mililitros de 1x PBS na parte superior do tubo e misture cuidadosamente novamente.

Ultracentrifugar os tubos a 100.000 x g e a 4 graus Celsius para re-pellet as pequenas vesículas. Transvase o sobrenadante e seque os tubos antes de lisar as vesículas para análise de proteínas ou ressuspender as EVs para análise morfológica.

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Última atualização: 15 agosto 2026