Análise automatizada de distribuição de tamanho de fragmentos baseada em eletroforese capilar de cfDNA: um método baseado em microchip de DNA para estudar a distribuição de tamanho de fragmentos de DNA isolados de biofluidos

Uma célula moribunda libera fragmentos de cfDNA ou livre de células fora da célula. Para analisar a distribuição de tamanho dos fragmentos de cfDNA, comece com um chip de DNA multipoços - um sistema eletroforético capilar em miniatura. Cada poço no chip contém vários canais de separação microfluídica em sua base.

Carregue a matriz de gel de polissacarídeo e a mistura de corante de fluorescência no poço designado no chip. Posicione o chip no conjunto de escorva equipado com uma seringa vazia. Feche o conjunto de escorva e pressione o êmbolo para baixo para criar pressão para baixo. Isso facilita a entrada do gel viscoso do poço no respectivo canal de separação.

Abra o conjunto e encha os poços restantes com suspensão de cfDNA e uma escada de DNA da faixa de tamanho conhecida. Monte o chip no analisador de fragmentos. A forte voltagem impulsiona a entrada da suspensão de cfDNA dos poços de amostra no canal de separação pré-carregado com matriz de gel, onde o DNA é corado com o corante.

À medida que o DNA se move do cátodo em direção ao ânodo, fragmentos menores de DNA migram mais rapidamente através do gel, enquanto os fragmentos maiores se movem mais lentamente. Isso leva à separaçã