$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
Na exposição a condições ambientais prejudiciais, um subconjunto de bactérias entra em um estado de baixa atividade metabólica, evitando os efeitos prejudiciais. Essas bactérias, chamadas persistentes, podem tolerar a exposição transitória a altas concentrações de antibióticos.
Para estudar o efeito dos osmólitos - pequenos solutos orgânicos - na persistência bacteriana, primeiramente, obtém-se uma cultura de células bacterianas de fase exponencial com persistentes pré-existentes abaixo do limite de detecção, suspensos em meio.
Em seguida, transfira a suspensão para poços contendo osmólito de uma placa de microarray. Mantenha um conjunto de poços sem osmólito como controle. Sele a placa com uma membrana permeável a gás para permitir a rápida difusão do gás para o crescimento celular e incubação.
Os osmólitos no meio em concentrações apropriadas induzem estresse osmótico, fazendo com que algumas células reprogramem seu metabolismo celular de crescimento rápido para lento, formando persistentes.
Agora, transfira as células tratadas com osmólito e controle para uma placa de ensaio persistente contendo antibióticos. Selar a placa de ensaio do persistente e incubar.
Na presença de antibióticos, as células normais sofrem morte celular, enquanto as persistentes - sendo tolerantes a antibióticos - sobrevivem. Por último, colete uma pequena fração das células, dilua em série com tampão e coloque em uma placa de ágar sem antibióticos. Incube a placa.
Na ausência de antibióticos, os persistentes retomam o crescimento e proliferam, formando colônias. Conte o número de colônias na placa de ágar.
Um número maior de colônias do que o controle sem osmólito após o tratamento com antibióticos sugere um efeito positivo dos osmólitos na formação de persistentes.
Comece preparando culturas de células de microarray.
Transfira 250 microlitros de células de fase exponencial para 25 mililitros de meio LB modificado fresco, em um tubo de centrífuga de 50 mililitros. Em seguida, misture suavemente a suspensão celular para torná-la homogênea.
Transfira a suspensão celular diluída para um reservatório estéril de 50 mililitros. Usando uma pipeta multicanal, transfira 150 microlitros da suspensão celular para cada poço de uma placa de microarray, contendo vários produtos químicos. Os microarrays também podem ser gerados manualmente, seguindo o método descrito no manuscrito do texto.
Cubra a placa de microarray com uma membrana de vedação permeável a gás e incube-a em um agitador orbital a 37 graus Celsius e 250 RPM por 24 horas.
Para fazer placas de ensaio Persister, prepare 25 mililitros de meio LB modificado, contendo 5 microgramas por mililitro de ofloxacina em um tubo de centrífuga de 50 mililitros, e transfira esse meio para um reservatório estéril.
Transfira 190 microlitros do meio LB modificado para cada poço de uma placa genérica de fundo plano de 96 poços. Após a incubação de 24 horas, remova o microarray do agitador e transfira 10 microlitros de culturas de células do microarray para os poços da placa de ensaio Persister, contendo meio LB modificado com Ofloxacina.
Pegue 10 microlitros de suspensões celulares da placa de ensaio Persister e dilua-as em série 3 vezes em 290 microlitros de solução PBS, usando uma placa de fundo redondo de 96 poços e uma pipeta multicanal. Em seguida, localize 10 microlitros de todas as suspensões de células diluídas em série em placas de ágar fresco sem antibióticos.
Cubra a placa de ensaio Persister com uma membrana de vedação permeável a gás e incube-a em um agitador orbital a 37 graus Celsius e 250 RPM por seis horas.
Após a incubação de 6 horas, repita a diluição seriada e a mancha em placas de ágar. Incube as placas de ágar por 16 horas a 37 graus Celsius e, em seguida, conte as unidades formadoras de colônias, ou UFCs. Use os níveis de UFC antes e seis horas após o tratamento com antibióticos para calcular a fração de persistência em cada poço.
As contagens de UFC antes do tratamento com OFX também ajudam a avaliar os efeitos dos osmólitos na viabilidade de E. coli.