3 de outubro de 2012
Uma nova espécie de proteína príon celular (PrP C) Foi recentemente identificada em cérebros humanos não infectadas com os métodos descritos aqui. Estes métodos podem ser utilizados para isolar espécies diferentes de PrP, enquanto alguns deles são também úteis no isolamento de outros agregados de proteínas mal dobradas a partir de cérebros humanos.
O objetivo deste procedimento é isolar a proteína pion solúvel e insolúvel ou PRP em todos os ligamentos do cérebro humano normal. Isso é realizado primeiramente homogeneizando o tecido cerebral humano e isolando as frações. Em seguida, é realizada a sedimentação por velocidade em gradientes de sacarose em etapas.
Em seguida, realiza-se a cromatografia de exclusão por tamanho. Finalmente, o PRP é capturado com a proteína do gene cinco ou G cinco P. Em última análise, podem ser obtidos resultados que demonstram o isolamento de PRP solúvel e insolúvel ou ligamentos a partir do cérebro humano normal por meio de ultracentrifugação em gradientes de sacarose, cromatografia de exclusão por tamanho e captura do PRP com G cinco P. Este método pode ajudar a responder perguntas fundamentais na pesquisa de doenças priônicas, incluindo a doença de Creutzfeldt-Jakob, encefalopatia espongiforme bovina e doenças clínicas de desgaste. Além disso, podem fornecer subsídios para o isolamento de proteínas priônicas solúveis e insolúveis, não apenas para doenças priônicas, mas também para outras doenças, como a doença de Alzheimer e a doença de Parkinson.
Em geral, indivíduos novos nestes métodos terão dificuldades, pois todas as etapas experimentais são importantes e exigem cuidado adicional. A demonstração em vídeo desta técnica é essencial, já que a SEC Fi possui grande profundidade e a captura de PRP com G cinco P são etapas difíceis de descrever e podem ser imprecisas sem uma operação mais cuidadosa. Para preparar um homogeneizado cerebral, comece adicionando 100 microlitros de tampão de lise a 100 miligramas de tecido cerebral congelado usando um pistilo motorizado, homogeneíze o tecido em gelo, congele em gelo seco por cinco minutos e homogeneíze novamente.
Prepare um homogeneizado total de cérebro a 20% ou 10% adicionando respectivamente 300 ou 800 microlitros de tampão de lise. Usando uma centrífuga de bancada, centrifugue o homogeneizado a 1000 G durante 10 minutos a quatro graus Celsius. Colete a SNA em um rotor S SW 55 e centrifugue a fração S1 a 35.000 RPM durante uma hora a quatro graus Celsius.
Transfira o sobrenadante para um tubo limpo de ressuspensão. Suspenda o pellet insolúvel em detergente no tampão de lise para preparar as amostras para o western blot. Incube as frações S2 e P2 com 50 microgramas por mililitro de proteinase K por uma hora a 37 graus Celsius.
Interrompa a digestão adicionando PMSF a cinco milimolar e tampão amostral de SDS. Ferva as amostras por 10 minutos e deixe esfriar à temperatura ambiente por cinco minutos. Para realizar a sedimentação por velocidade, comece incubando 450 microlitros da fração S um 20% com volume igual de água 2% Sarco X em gelo durante 30 minutos em tubos de centrífuga de cinco mililitros. Adicione 0,5 mililitros de cada solução de sacarose a 60, 30, 25, 20, 15 e 10%, e carregue 0,4 mililitros do S um incubado no topo do gradiente de sacarose de 10 a 60%.
Centrifugue gradientes em etapas em rotor SW 55 a 48.000 RPM por uma hora a quatro graus Celsius a partir do topo do tubo. Colete 12 frações iguais de 283 microlitros cada. Utilize 20 microlitros de cada fração e volume igual de tampão amostral SDS.
Para preparar as amostras de gel de SDS-PAGE. Ferva as amostras por 10 minutos, depois resfrie-as por quatro minutos. Centrifugue as amostras a 1000 ×g por um minuto.
Em seguida, vortexe-os antes de carregá-los em um gel predefinido de exclusão por tamanho. A cromatografia é utilizada para determinar o estado oligomérico das moléculas de PRP. Comece carregando volumes de amostra de 200 microlitros de sete marcadores individuais de massa molecular em uma coluna de 1 por 30 de perlas SUEx 200 HR.
Utilize o volume eluído de dextrana azul como volume de exclusão. Calcule os volumes eluídos de pico de VE a partir do cromatograma e das retenções fracionais. Calcule o coeficiente de partição KAV utilizando a equação KAV igual a V menos V zero sobre VT menos V zero.
Para gerar uma curva de calibração, plote o KAV dos padrões proteicos contra o log do peso molecular dos padrões. Em seguida, aplique 200 microlitros de S um na coluna a uma taxa de fluxo de 0,25 mililitros por minuto.
Lave a coluna com tampão de lise 1% cile e, utilizando um coletor de frações, elua frações de 0,25 mililitro. Incube 125 microlitros de cada fração com 500 microlitros de metanol pré-resfriado a menos 20 graus Celsius por duas horas. Centrifugue as amostras a 13.000 ×g por 30 minutos a quatro graus Celsius.
Reese, ressuspenda o pellet em 20 microlitros de tampão amostral SDS e ferva por 10 minutos. Deixe esfriar até a temperatura ambiente e separe em géis de poliacrilamida a 15%. Utilize a curva padrão para extrapolar os pesos moleculares das várias espécies de PRP recuperadas para conjugação da molécula G cinco P às microesferas magnéticas.
Incube 100 microgramas de G cinco P com 350 microlitros de microesferas magnéticas ativadas com toci em um mililitro de PBS a 37 graus Celsius por 20 horas. Utilize um ímã externo para atrair as microesferas de G cinco P para a parede lateral dos tubos eppendorf e remova a solução. Lave as microesferas três vezes com um mililitro de PBS 0,1% BSA para bloquear a ligação não específica.
Incube as microesferas conjugadas com G cinco P em um mililitro de tris 0,2 molar, HCL pH 7,4 contendo 0,1% de BSA por cinco horas a 37 graus Celsius. Em seguida, lave as microesferas três vezes. Remova a última lavagem e adicione um mililitro de PBS para isolar PRP; incube 100 microlitros de S um ou P dois com 60 microlitros de microesferas conjugadas com G cinco B em um mililitro de tampão de ligação sob rotação constante por três horas à temperatura ambiente.
Coloque o tubo no ímã. Remova a solução e lave as microesferas três vezes com tampão de lavagem. Remova a última lavagem e adicione o tampão amostral de SDS.
Aqueça as esferas a 95 graus Celsius por cinco minutos. Carregue as amostras em géis pré-moldados a 15% e execute a 150 volts por cerca de 80, durante 80 minutos. Transfira as proteínas para PVDF a 70 volts por duas horas após bloquear as membranas com leite a 5% em TBST.
Incube-os por duas horas à temperatura ambiente com os anticorpos PRP. Três F quatro um E quatro anti N ou anti C após a incubação com anticorpos secundários conjugados à HRP, incube a membrana e a solução de quimioluminescência de acordo com as instruções do fabricante e exponha o filme conforme visto aqui em comparação com amostras esporádicas de doença da válvula CRUT jaakko ou doença de CJD. Uma pequena quantidade de PRP celular insolúvel foi detectada na fração P dois de cérebros normais.
No entanto, a maior parte foi recuperada na fração S2. O PRP insolúvel representa aproximadamente de cinco a 25% do PRP total, incluindo espécies de comprimento completo e truncadas nos terminais. Análises utilizando sedimentação em gradiente de sacarose em degraus revelaram que, embora a maior parte do PRPC proveniente de cérebros não afetados pela DCE fosse recuperada nas frações superiores, pequenas quantidades de PRP também foram detectadas nas frações inferiores (nove a 11), que normalmente contêm grandes agregados. Uma variedade de espécies patogênicas de PRP ou PRP-SC, variando desde monômeros,
Ligamentos menores e agregados maiores foram isolados por filtração em gel no cérebro com doença yakup da válvula CRUT. Surpreendentemente, uma pequena quantidade de agregados maiores com massa molecular superior a 2000 quilodaltons também foi detectada em frações insolúveis de cérebros normais. Além disso, dímeros e tetrâmeros de PRPC não foram detectados apenas em frações insolúveis, mas também em frações insolúveis.
Após o tratamento com PK e P NGAs. O PRP capturado por G cinco P foi detectado com o anticorpo um E quatro contra PRP 97 1 0 5 3. Fragmentos centrais resistentes à PK, denominados PRP asterisco 20, PRP asterisco 19 e PRP asterisco sete, foram detectados migrando em 20 kilodaltons, 19 kilodaltons e 7 kilodaltons, respectivamente.
No entanto, nenhuma PRP foi detectada quando o anticorpo one E four foi pré-incubado com um peptídeo sintético que possui uma sequência idêntica ao epítopo one E four, indicando que as bandas detectadas pelo one E four são fragmentos de PRP. O anticorpo anti C detectou dois fragmentos diferentes de PRP que migraram em torno de 18 quilodaltons e em torno de 12 a 13 quilodaltons. Além disso, ao método PRP ETE 20 Once.
Essa técnica pode ser realizada em quatro dias se for executada corretamente. Após assistir a este vídeo, você deverá ter uma boa compreensão de como isolar as frações solúvel e insolúvel de PRP poligâmico no cérebro humano inferior após o seu desenvolvimento. Essa técnica abriu caminho para pesquisas sobre o destino de PIP, a fim de explorar informações sobre a confirmação de PIP no cérebro.
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Este artigo apresenta um método para isolar proteínas priônicas solúveis e insolúveis de tecido cerebral humano normal. As técnicas descritas também podem ser aplicadas a outros agregados de proteínas desdobradas incorretamente, fornecendo insights sobre diversas doenças neurodegenerativas.
O isolamento de oligômeros de proteína priónica solúveis e insolúveis a partir de tecido cerebral humano normal permite a eliminação mecanicista de hipóteses sobre a propagação semelhante à priónica em alvos de doenças neurodegenerativas. Este método apoia a validação de alvos ao fornecer espécies bioquimicamente definidas de PrP para interrogatório funcional, reduzindo a ambiguidade nos testes iniciais de hipóteses terapêuticas. A abordagem oferece confiança preditiva na distinção entre agregados proteicos fisiológicos e patogênicos, orientando a triagem de portfólios para programas de doenças de Alzheimer e Parkinson, onde há implicação de interações com a PrP.
O método integra-se aos fluxos de trabalho iniciais de descoberta ao fornecer oligômeros de PrP caracterizados bioquimicamente para validação de alvos, avançando para o desenvolvimento de ensaios para triagem de moduladores do dobramento incorreto de proteínas e orientando decisões pré-clínicas por meio de análise comparativa de isoformas de PrP.