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DOI: 10.3791/50722-v
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This study presents a fluorescence-based assay to measure exonuclease activity, crucial for understanding genome stability. The method allows for the analysis of substrate preferences and enzyme activity in a reproducible manner.
As exonucleases desempenham papéis críticos na garantia da estabilidade do genoma. A perda da função da exonuclease WRN resulta em envelhecimento prematuro. O estudo de substratos e outros requisitos da nuclease in vitro pode ajudar a elucidar seu papel in vivo. Aqui demonstramos um ensaio rápido e reprodutível baseado em fluorescência para medir sua atividade de nuclease.
Este experimento usa um ensaio robusto baseado em fluorescência reprodutível para determinar a atividade da exonuclease. Incube a enzima purificada com o substrato de DNA fluorescente para permitir que a enzima degrade sequencialmente o DNA. Em seguida, resolva o DNA em um gel de acrilamida ureia para separar os produtos de degradação por tamanho.
Em seguida, use imagens de fluorescência para identificar e quantificar a extensão da atividade da exonuclease. Os resultados analisados podem determinar as condições de reação do substrato preferido, a atividade processiva e geral da enzima. A principal vantagem desta técnica sobre as técnicas existentes baseadas em radioatividade é que os substratos de DNA são estáveis por um longo tempo, permitindo excelente reprodutibilidade, diminuindo custos e aumentando a segurança.
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