Alta resolução In Vivo Manual Protocolo Segmentação para hipocampo humano subcampos Utilizando Ressonância Magnética 3T

O objetivo geral deste protocolo é fornecer um método confiável e anatomicamente preciso para segmentar o hipocampo humano com subcampos em imagens de ressonância magnética. Aqui, os subcampos do hipocampo são divididos em cinco rótulos, CA um, CA dois, ca três, CA quatro, giro denteado, S-R-S-L-S-M e o icm. Este método pode ajudar a responder a questões-chave no campo da neuroimagem, como a forma como a estrutura do subcampo do hipocampo muda em estados saudáveis e de doença.

A principal vantagem dessa técnica é que ela é adaptada para imagens de alta resolução coletadas em um scanner de três T e inclui definições de subcampo para todo o comprimento ântero-posterior do hipocampo. Comece inserindo a seguinte cena de comando aqui no terminal. Para abrir a interface do software em uma imagem ponderada T um, amplie a visualização coronal e amplie o hipocampo, selecione segmentação na janela de navegação e, em seguida, selecione o raio XY.

Defina o tamanho do pincel XY como 0,1. Role até a fatia coronal mais anterior do hipocampo para a fatia a, a fatia de mott anterior. Desenhe a borda mais externa da substância cinzenta do hipocampo onde ela encontra a substância branca do lobo temporal circundante e use a substância branca de alta intensidade das védegas para ajudar na borda superior.

Use a tecla de preenchimento do rótulo no menu de segmentação da janela de navegação para preencher o rótulo dentro da borda. Para a fatia B, a cabeça do hipocampo venceu. Continue a desenhar as bordas da cabeça do hipocampo usando a substância branca do lobo temporal e alves como guia.

Em seguida, para a fatia C, o hipocampo cabeça dois com dações. Desenhe as dações do hipocampo usando a substância branca do álio. Em seguida, use a vista axial para desenhar uma linha horizontal a partir da borda anterior do hipocampo lateral e designar qualquer coisa abaixo dessa linha como parte do hipocampo.

Agora, para a fatia D, a cabeça do hipocampo, três, desenhe a borda inferior do hipocampo na substância branca do lobo temporal e a borda lateral no corno inferior do ventrículo lateral. Desenhe a borda superior na substância branca da fibra alius e a borda medial na região hipointensa da cisterna ambiente. Para fatia, E, desenhe as bordas inferior, lateral, superior e medial.

Como antes, defina a borda medial de inferir desenhando a porção inferior da borda medial onde o hipocampo se afina ligeiramente e se estende até a substância cinzenta do córtex interal. Nessas fatias, inclua o ônus nas segmentações do hipocampo. Em seguida, designe o corpo do hipocampo na fatia F.As antes, não inclua o líquido cefalorraquidiano de baixa intensidade do sulco vestigial do hipocampo na segmentação.

Agora, para o segmento da fatia G, a cauda do hipocampo começa a segmentar a cauda. Quando o cruzeiro do fórnice é visível pela primeira vez. Exclua o giro vesicular extrapolando a forma do giro vesicular para a cauda do hipocampo para fatias mais anteriores.

Quando o giro vesicular não puder mais ser distinguido, trate toda a substância cinzenta visível como cauda do hipocampo. Então, para a fatia H, a cauda do hipocampo dois segmentos, a substância cinzenta de baixa intensidade da cauda posterior do hipocampo da substância branca de alta intensidade circundante. Finalmente, ou olho de fatia, o segmento de fatia mais posterior, a pequena área remanescente da substância cinzenta do hipocampo da substância branca circundante do lobo temporal.

Comece rolando até a fatia coronal mais anterior do hipocampo em uma imagem ponderada em T dois. Altere a cor do pincel selecionando definir rótulo de tinta e inserindo um número entre um e 255 no terminal. Para a fatia A, a fatia mais anterior, desenhe uma linha dividindo a substância cinzenta do hipocampo visível ao longo de seu eixo visível mais longo em duas seções iguais.

Use duas cores diferentes para rotular a parte superior dessas duas seções como ca um e a seção inferior como o sulu para a fatia B, a cabeça do hipocampo. Rotule a área de baixa intensidade no meio da formação do hipocampo. Como SR SLSM, defina o csum inferolateral ca uma borda na curva do hipocampo inferior.

Continue a seguir o eixo mais longo do hipocampo para desenhar a borda ca one sulu na ponta medial superior para o corte C, a cabeça do hipocampo. Dois com tentações. Rotule a banda escura S-R-S-L-S-M que segue a curva do rótulo ca um, qualquer substância cinzenta de alta intensidade dentro do S-R-S-L-S-M como CA quatro dg.

Em seguida, defina o sicm ca uma borda usando a curva e o hipocampo inferior. Defina a fronteira entre CA um e ca dois, CA três como uma linha angular de 45 graus, estendendo-se na direção superolateral a partir da borda mais superolateral do S-R-S-L-S-M. Estenda o ca dois CA três medialmente ao longo da borda superior até a calha entre as dações e rotule o resto da borda superior como ca um para a fatia D, a cabeça do hipocampo três.

Rotule o S-R-S-L-S-M CA quatro, DG e ICM exatamente como acabamos de descrever. Para a fatia C, estenda o CA dois, CA três medialmente até a metade da borda superior e rotule a outra metade da borda superior como CA um. Divida a cabeça do hipocampo super medial verticalmente ao meio.

Rotule a metade medial como S-R-S-L-S-M. Em seguida, horizontalmente, divida a metade lateral ao meio. Novamente, rotule a porção inferior como CA dois, CA três e rotule a porção superior como CA quatro DG para a fatia E, a cabeça do hipocampo quatro com Angus.

Defina a borda do saeculum ca um como uma linha vertical que se estende na direção inferior da borda mais medial do CA quatro dg. Continue a definir as bordas CA um, CA dois, CA três s, RSL, SM e ca quatro DG. Como antes, rotule o ônus do hipocampo à medida que a cabeça do hipocampo faz a transição para o corpo do hipocampo no rótulo de ônus, a região de baixa intensidade no centro como o SRSL sm.

Continuando na fatia E, desenhe uma linha na borda superior da seção S-R-S-L-S-M ao longo do eixo supermedial inferolateral do rótulo UCAS. Toda a matéria cinzenta acima desta linha como CA dois, CA três, rotula qualquer substância cinzenta não rotulada abaixo desta linha como CA quatro D.Em seguida, ou fatia F, o corpo do hipocampo. Continue a aplicar as bordas para o sulu S-R-S-L-S-M ca quatro, DG ca dois, CA três, conforme mencionado para a fatia E na fatia G, a cauda do hipocampo.

A borda ICM ca um torna-se uma linha angular de 45 graus, estendendo-se na direção infra-medial a partir da borda medial do CA quatro DG para a fatia H. A cauda do hipocampo dois rotula a camada interna de baixa intensidade como S-R-S-L-S-M e a camada externa de alta intensidade como CA um. Uma vez que o giro vesicular não pode mais ser distinguido da formação hipocampal, rotule qualquer substância cinzenta remanescente no meio como CA quatro dg. Finalmente, para o olho de fatia, a fatia mais posterior deixa toda a estrutura como CA um.

Uma vez que o SRSL escuro não é mais visível na formação do hipocampo, este protocolo usa ressonância magnética para segmentar o hipocampo humano. Aqui, todo o hipocampo é dividido em nove cortes coronais usando imagens ponderadas em T um. Cinco, subcampos do hipocampo são então segmentados usando T duas imagens ponderadas aqui, CA um, CA dois, CA três, CA quatro, giro denato, S-R-S-L-S-M e ICM podem ser vistos dentro desta fatia da cabeça do hipocampo.

Uma vez dominada, essa técnica pode ser concluída para cada sujeito em 40 horas se for executada corretamente. É importante lembrar de seguir os padrões de intensidade nas imagens o máximo possível e ser consistente com as fronteiras entre os sujeitos após este procedimento. Outras técnicas de segmentação automatizada podem ser realizadas para responder a perguntas sobre o volume e a forma do hipocampo em populações vulneráveis, como aquelas em envelhecimento saudável ou que sofrem da doença de Alzheimer.

Depois de assistir a este vídeo, você poderá replicar de forma confiável este protocolo e obter informações sobre a anatomia detalhada do subcampo do hipocampo de seus sujeitos.