Imagem pulmonar multimodal: usando informações complementares de TC e ressonância magnética hiperpolarizada de 129Xe para avaliar a função da estrutura pulmonar
April 12th, 2024
A TC e a ressonância magnética com 129Xe fornecem informações complementares sobre a função da estrutura pulmonar que podem ser exploradas para análise regional usando registro de imagem. Aqui, fornecemos um protocolo que se baseia na literatura existente para 129Xe MR para registro de imagem de TC usando plataformas de código aberto.
Para começar, abra as imagens seguidas de máscaras no software de visualização de imagem desejado para verificar se a orientação da imagem e da máscara corresponde a todos os arquivos CT, Proton e Xenon. Em seguida, salve a imagem DICOMS e as máscaras de rótulo único como arquivos NIfTI na mesma pasta que o arquivo reg. py.
Para registro de ressonância magnética de xenônio CT, abra o arquivo reg. py na configuração do ambiente de computação Python desejada. Se estiver usando um ambiente virtual, defina o número de unidades centrais de processamento, o número de threads e a RAM conforme desejado ou disponível no ambiente de computação.
Em seguida, defina a transformação e interpolação desejadas, seguidas pela imagem fixa e em movimento. Execute reg. py no ambiente de computação Python.
Assim que o registro for concluído, prossiga para a avaliação. Mantendo a imagem ct. nii como a imagem base, abra a urdidura de ventilação.
gz como outra imagem e sobreponha-a na imagem CT com o mapa de cores desejado. Revise a sobreposição da imagem de RM de xenônio com a imagem de TC em todos os planos de imagem para avaliar o alinhamento visual de pontos de referência, como os limites da carina e do pulmão. Os resultados do registro mostraram um bom alinhamento de todos os limites pulmonares para o participante saudável.
Nos três participantes com doença pulmonar obstrutiva crônica, houve um bom alinhamento dos limites pulmonares disponíveis, variando de anormalidades ventilatórias difusas, anormalidades ventilatórias do lobo superior com limites pulmonares apicais ausentes e anormalidades ventilatórias do lobo inferior com limites pulmonares diafragmáticos ausentes.
Visão Geral
Este artigo apresenta um protocolo para registrar MRI de 129 Xe com imagens de TC para melhorar a análise da estrutura-função do pulmão. O método utiliza plataformas de código aberto para registro de imagens, facilitando a análise regional.
Componentes Principais do Estudo
Área da Ciência
- Neurociência
- Imagem Médica
- Radiologia
Fundamentos
- TC e MRI de 129 Xe fornecem informações complementares sobre a estrutura e função do pulmão.
- O registro de imagem é essencial para uma análise regional precisa.
- A literatura existente sobre técnicas de RM de 129 Xe informa este protocolo.
- Plataformas de código aberto aumentam a acessibilidade para pesquisadores.
Propósito do Estudo
- Desenvolver um protocolo robusto para o registro de imagens de TC e MRI de 129 Xe.
- Melhorar a análise da função pulmonar através de técnicas de imagem aprimoradas.
- Fornecer um método reproduzível para pesquisadores na área.
Métodos Utilizados
- Abrir imagens e máscaras em software de visualização de imagem.
- Verificar a orientação dos arquivos de TC, Prótons e Xénon.
- Salvar imagens e máscaras como arquivos NIfTI.
- Utilizar um ambiente de computação Python para o registro.
Principais Resultados
- O protocolo permite o registro eficaz de imagens de TC e MRI de 129 Xe.
- Facilita a análise regional detalhada da estrutura e função do pulmão.
- Demonstra a utilidade de ferramentas de código aberto em imagens médicas.
- Fornece uma base para futuras pesquisas em imagens do pulmão.
Conclusões
- O protocolo desenvolvido melhora a precisão da análise de imagem do pulmão.
- Combinar TC e MRI de 129 Xe oferece insights abrangentes sobre a função pulmonar.
- Plataformas de código aberto promovem colaboração e inovação na pesquisa.
