Name: Identificação de espécies de micobactérias pelo método de chip de microarranjo de DNA (Vídeo) | JoVE Journal
Uploaded: 2025-06-24T14:30:00.000+00:00
Duration: 6 min 27 s
Description: Aprenda a identificar espécies de Mycobacterium usando o método de chip de microarranjo de DNA. Esta técnica oferece alta sensibilidade e especificidade para diagnóstico rápido em microbiologia clínica.

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<ol><li>Primm, T. P., Lucero, C. A., Falkinham, J. O. III <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Health+impacts+of+environmental+mycobacteria%5BTitle%5D)+AND+%22Trends+Genet%22%5BJournal%5D)">Health impacts of environmental mycobacteria.</a> Trends Genet. 38 (8), 821-830 (2004).</li>
<li>Sawyer, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Mycobacterium+bovis+and+its+impact+on+human+and+animal+tuberculosis%5BTitle%5D)+AND+%22Trends+Genet%22%5BJournal%5D)">Mycobacterium bovis and its impact on human and animal tuberculosis.</a> Trends Genet. 39 (8), 587-592 (2023).</li>
<li>Zhao, Q., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((The+impact+of+DNA+microarray+chip+technology+on+the+diagnosis+and+management+of+non-tuberculous+mycobacterial+infections+in+immunocompromised+patients%5BTitle%5D)+AND+%22Antimicrob+Agents+Chemother%22%5BJournal%5D)">The impact of DNA microarray chip technology on the diagnosis and management of non-tuberculous mycobacterial infections in immunocompromised patients.</a> Antimicrob Agents Chemother. 65 (12), e01500-e01500 (2021).</li>
<li>Liu, S., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+microarray-based+detection+of+drug-resistant+Mycobacterium+strains%3A+a+single-center+experience%5BTitle%5D)+AND+%22Clin+Microbiol+Infect%22%5BJournal%5D)">DNA microarray-based detection of drug-resistant Mycobacterium strains: a single-center experience.</a> Clin Microbiol Infect. 26 (10), 1400-1407 (2020).</li>
<li>Li, J., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Comparative+evaluation+of+DNA+microarray+and+next-generation+sequencing+for+Mycobacterium+identification%5BTitle%5D)+AND+%22Int+J+Infect+Dis%22%5BJournal%5D)">Comparative evaluation of DNA microarray and next-generation sequencing for Mycobacterium identification.</a> Int J Infect Dis. 118, 250-258 (2022).</li>
<li>Chen, K., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Optimizing+probe+design+for+DNA+microarray-based+Mycobacterium+identification%3A+a+computational+biology+approach%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Optimizing probe design for DNA microarray-based Mycobacterium identification: a computational biology approach.</a> BMC Microbiol. 19 (2), 120-129 (2019).</li>
<li>Michelet, L., Boschiroli, M. L. Mycobacterium uberis. <a target="_blank" href="http://scholar.google.com/scholar?hl=en&safe=off&q=author%3aMichelet%2C+L+%22Microorganisms%22">Microorganisms</a>. 8 (11), 1701(2020).</li>
<li>Imran, M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+microarray+technology+for+the+detection+and+identification+of+Mycobacterium+species%3A+a+review%5BTitle%5D)+AND+%22J+Microbiol+Biotechnol+Res%22%5BJournal%5D)">DNA microarray technology for the detection and identification of Mycobacterium species: a review.</a> J Microbiol Biotechnol Res. 6 (2), 275-285 (2020).</li>
<li>Garcia-Sanchez, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Advances+in+DNA+microarray+technology+for+Mycobacterium+detection+and+characterization%5BTitle%5D)+AND+%22J+Mol+Diagn%22%5BJournal%5D)">Advances in DNA microarray technology for Mycobacterium detection and characterization.</a> J Mol Diagn. 24 (5), 650-662 (2022).</li>
<li>Wang, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Machine+learning+analysis+of+SERS+fingerprinting+for+the+rapid+determination+of+Mycobacterium+tuberculosis+infection+and+drug+resistance%5BTitle%5D)+AND+%22Comput+Struct+Biotechnol+J%22%5BJournal%5D)">Machine learning analysis of SERS fingerprinting for the rapid determination of Mycobacterium tuberculosis infection and drug resistance.</a> Comput Struct Biotechnol J. 26 (20), 5364-5377 (2022).</li>
<li>Wang, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Integration+of+DNA+microarray+data+with+clinical+outcomes+in+tuberculosis+patients%3A+implications+for+personalized+medicine%5BTitle%5D)+AND+%22Mol+Diagn%22%5BJournal%5D)">Integration of DNA microarray data with clinical outcomes in tuberculosis patients: implications for personalized medicine.</a> Mol Diagn. 16 (3), 150-160 (2024).</li>
<li>Wang, X., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Rapid+identification+of+Mycobacterium+tuberculosis+complex+and+common+non-tuberculous+Mycobacteria+by+DNA+microarray+chip%5BTitle%5D)+AND+%22BMC+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Rapid identification of Mycobacterium tuberculosis complex and common non-tuberculous Mycobacteria by DNA microarray chip.</a> BMC Microbiol. 21 (1), 242(2021).</li>
<li>Smith, J. D., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((DNA+microarray+insights+into+Mycobacterium+epidemiology+and+control+strategies%5BTitle%5D)+AND+%22J+Clin+Microbiol%22%5BJournal%5D)">DNA microarray insights into Mycobacterium epidemiology and control strategies.</a> J Clin Microbiol. 60, e02033-e02121 (2022).</li>
<li>Garcia, L. M., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Tracking+Mycobacterial+spread+via+DNA+microarray%3A+a+community-based+study%5BTitle%5D)+AND+%22PLoS+One%22%5BJournal%5D)">Tracking Mycobacterial spread via DNA microarray: a community-based study.</a> PLoS One. 18 (3), e0282123(2023).</li>
<li>Li, H., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Economic+evaluation+of+DNA+microarray+chip+technology+in+Mycobacterium+diagnosis%5BTitle%5D)+AND+%22Diagnostics%22%5BJournal%5D)">Economic evaluation of DNA microarray chip technology in Mycobacterium diagnosis.</a> Diagnostics. 11 (12), 2235(2021).</li>
<li>Wang, Z., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Cost-benefit+analysis+of+implementing+DNA+microarray+chip+for+Mycobacterium+detection+in+clinical+settings%5BTitle%5D)+AND+%22J+Med+Econ%22%5BJournal%5D)">Cost-benefit analysis of implementing DNA microarray chip for Mycobacterium detection in clinical settings.</a> J Med Econ. 25 (1), 113-122 (2022).</li>
<li>Liu, Y., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((False+positives+and+false+negatives+in+DNA+microarray+chip+detection+of+Mycobacteria%3A+a+comprehensive+analysis%5BTitle%5D)+AND+%22Microb+Pathog%22%5BJournal%5D)">False positives and false negatives in DNA microarray chip detection of Mycobacteria: a comprehensive analysis.</a> Microb Pathog. 149, 104671(2020).</li>
<li>Chen, L., et al. <a target="_blank" href="http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed?term=((Validation+and+improvement+of+DNA+microarray+chip+for+Mycobacterium+identification%3A+coping+with+genetic+variants%5BTitle%5D)+AND+%22Front+Cell+Infect+Microbiol%22%5BJournal%5D)">Validation and improvement of DNA microarray chip for Mycobacterium identification: coping with genetic variants.</a> Front Cell Infect Microbiol. 11, 627923(2021).</li>
</ol>

<table><tbody><tr><td>Injeção de cloreto de sódio a 0,9% (NaCl)</td><td>FuZhou HAIWANGFUYAO</td><td>H35020289</td><td></td></tr><tr><td>Aparelhos de amplificação da Applied Biosystems</td><td>Thermo Fisher Científico</td><td>Termociclador Veriti de 96 poços</td><td></td></tr><tr><td>CapitalBio LuxScan10K/B</td><td>CapitalBio</td><td>LuxScan10K/B</td><td></td></tr><tr><td>CapitalBio SlideWasher 24&nbsp;</td><td>CapitalBio</td><td>SlideWasher 24&nbsp;</td><td></td></tr><tr><td>&nbsp; Centrífuga</td><td>Eppendorf</td><td>5424R</td><td>MaX.speed 15000 min-1</td></tr><tr><td>Tampão de hibridização</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Chip e tampa do microarray do gene HybSet</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Kit de identificação de espécies de Mycobacterium</td><td>CapitalBio</td><td>301030</td><td></td></tr><tr><td>Controlos negativos, controlos positivos</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Extrator de ácidos nucleicos</td><td>TIANLONG</td><td>GeneRotex 96</td><td></td></tr><tr><td>Reagente de amplificação por PCR</td><td></td><td></td><td></td></tr><tr><td>Tampão fosfato pH 6,8</td><td>Xangai yuanye Bio-Tecnologia</td><td>R20029-10</td><td></td></tr><tr><td>Pipetadores e pontas</td><td>Thermo Científico</td><td>0,1 - 10 &mu; L, 2 - 20 &mu; L e 20 - 200 &mu; L, 100-1000 &mu; L</td><td></td></tr><tr><td>qEx-DNA/RNA Kit de extração ou purificação de ácidos nucleicos</td><td>TIANLONG</td><td>qEx-DNA/RNA</td><td></td></tr><tr><td>SDS</td><td>CapitalBio</td><td>441060</td><td></td></tr><tr><td>Hidróxido de sódio (NaOH)</td><td>XILONGS&nbsp; Científico</td><td>XK13-011-00027</td><td></td></tr><tr><td>CCD</td><td>CapitalBio</td><td>441050</td><td></td></tr><tr><td>banho-maria termostático</td><td>SURUÍ</td><td>HH-W600</td><td></td></tr></tbody></table>

identificação de espécies de micobactérias pelo método de chip de microarranjo de dna

Identification of Mycobacterium Species by DNA Microarray Chip Method

Resultados positivos Para as sondas do gênero Mycobacterium (controle interno, CI) e Mycobacterium tuberculosis, seus valores de resultados positivos são determinados pelo método Receiver Operating Characteristic (ROC). Para as sondas usadas para detectar as outras 16 NTM, seus valores de resultados positivos são determinados pelo método do percentil.
Controle de qualidade experimental O resultado da detecção do produto de controlo posi...

Identificação de espécies de micobactérias pelo método de chip de microarranjo de DNA

This study presents a DNA microarray chip method designed for the accurate identification of Mycobacterium species. By leveraging asymmetric PCR ...

identification-of-mycobacterium-species-by-dna-microarray-chip-method

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Este vídeo demonstra um método para detectar as cepas de cianobactérias em uma amostra ambiental usando um chip de microarray de anticorpos. Amostras portadoras de várias bactérias interagem com anticorpos impressos, e a imunocoloração com anticorpos anti-cianobactérias marcados com fluoróforo revela a presença de cepas específicas de cianobactérias por meio de fluorescência em pontos distintos.

Uma técnica para detectar cepas de cianobactérias usando um chip de microarray de anticorpos

Um microarray amplificação combina assimétrica PCR amplificação e hibridização microarray em uma única câmara, que simplifica significativamente o fluxo de trabalho microarray para o usuário final. Simplificar o fluxo de trabalho microarray é um primeiro passo necessário para a criação de diagnósticos à base de microarray que podem ser rotineiramente usados ​​em ambientes com recursos mais baixos.

Demonstrando um multi-resistente<em&gt; Mycobacterium tuberculosis</em&gt; Ampliação Microarray

Microdissecção tem sido extensivamente utilizada para a análise de DNA, RNA e proteínas dentro do tecido. Microscopia captura a laser (LCM) é o método mais comumente utilizado, mas uma nova técnica de fresagem, mesodissection, é recentemente disponível. Demonstramos extração de RNA a partir de mesodissected formalina parafina fixo lâminas de tecido embebidos de Mycobacterium tuberculosis granulomas.

Uma nova abordagem para Microdissecção Recuperando<em&gt; Mycobacterium tuberculosis</em&gt; transcritos específicos de formalina fixo Parafina incorporado Lung granulomas

Este artigo vídeo descreve um método de microarray baseado in vitro para determinar os genes alvos e sítios de ligação para dois reguladores de resposta do sistema de componentes.

DNA-afinidade-purificada Método Chip (DAP-chip) para determinar genes alvos para bacteriana Dois Sistemas Regulatórios componentes

A espectrometria de massa de tempo de voo de dessorção/ionização a laser assistida por matriz (MALDI-TOF MS) e as técnicas moleculares (sequenciamento do gene 16S rRNA) permitem a identificação de patógenos bacterianos raros em diagnósticos de rotina. O objetivo deste protocolo reside na combinação de ambas as técnicas, o que leva a dados mais precisos e confiáveis.

Identificação de patógenos bacterianos raras, seqüência do gene 16rRNA e MALDI-TOF MS

A presença de toxinas cianobacterianas em reservatórios de água doce para consumo humano é uma grande preocupação para as autoridades de gestão da água. Para avaliar o risco de contaminação da água, este artigo descreve um protocolo para a detecção em campo de cepas de cianobactérias em amostras líquidas e sólidas usando um chip de microarray de anticorpos.

Protocolo experimental para Detectar Cianobactérias Em amostras líquidas e sólidas com um Microarray Chip Antibody

A EUCAST desenvolveu um protocolo direto de teste de suscetibilidade antimicrobiana (AST) para hemoculturas automatizadas. No entanto, sua dependência da identificação microbiana baseada em espectrometria de massa pode ser evitada usando um protocolo de preparação direta de inóculo em um sistema automatizado de identificação microbiana. Essa abordagem pode fornecer relatórios de AST dentro de 24 horas após a coleta da amostra.

Identificação microbiana direta usando um sistema automatizado de identificação microbiana para facilitar o método EUCAST RAST sem espectrometria de massa

A técnica iChip faz uso de um dispositivo de isolamento in-situ simples e barato que aumenta as taxas de descoberta de novos microrganismos do solo. Novos microrganismos podem ser usados para estudos adicionais relativos ao microbioma do solo ou descoberta de produtos naturais, entre outras aplicações.

Isolamento de microrganismos do solo usando a tecnologia iChip

Este protocolo descreve o método CTAB para extrair DNA de alta qualidade de micobactérias, superando desafios causados por suas paredes celulares resistentes e ricas em ácido micólico. O processo envolve digestão enzimática, lise celular com CTAB e purificação do DNA por meio de extração orgânica e precipitação de etanol. Esse método produz DNA adequado para estudos moleculares e é confiável para pesquisas micobacterianas.

Extração de Ácido Desoxirribonucleico de Genoma Integral de Espécies de Mycobacterium via Técnica de Brometo de Cetiltrimetilamônio

Aqui nós propor métodos simples para testar e avaliar a presença de espécies reativas de oxigênio nas células.

Produção e Detecção de Espécies Reativas de Oxigênio (ROS) em Câncer

Aprenda a identificar espécies de Mycobacterium usando o método de chip de microarranjo de DNA. Esta técnica oferece alta sensibilidade e especificidade para diagnóstico rápido em microbiologia clínica.

Identificação de espécies de micobactérias pelo método de chip de microarranjo de DNA

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