Древо жизни – бактерии, археи, эукариоты.

Чарльз Дарвин сравнил эволюционные отношения между различными видами с ветвями дерева, происходящими от общего предка. Исторически, положение организма на дереве определялось на основании его наблюдаемых характеристик, или признаков фенотипа, таких, например, как наличие листьев, позвоночника или глаз. Вымершие виды могли быть расположены на дереве аналогичным образом с помощью фенотипических признаков, найденных у ископаемых останков.

Вскоре после того, как Дарвин опубликовал работу О происхождении видов"в 1866 году, Хеккель предложил концепцию трёх Царств живых организмов Растений, Животных, и Протистов, которые не являются ни растениями, ни животными на основании наблюдаемых фенотипов. В конечном счете, это различие между растениями и животными было признано менее важным чем предполагалось ранее. Таким образом, в 1937 году концепция Древа жизни эволюционировала и содержала уже две крупные группы, эукариотов с ядрами, окружёнными мембраной, и прокариотов без ядер.

Однако, эта парадигма в результате, создала проблемы когда дело дошло до размещения прокариотов на Древе. Одного микроба стержнеобразной формы фенотипически трудно отличить от другого микроба такого же типа. Достижения в области генетического анализа, в частности секвенирование гена 16s рибосомальной РНК привели к коллапсу этого Древа, когда выяснилось, что у организмов, традиционно попадавших в один класс, как прокариоты, обнаружились генетически различные эволюционные корни.

Так что Древо жизни в 1990 году снова видоизменилось. И группа прокариотов была разделена на два домен, что даёт нам три домена в Современном Древе Жизни, бактерии, архея, и эукариоты. Первый из этих доменов, бактерии, состоит из одноклеточных прокариотических организмов, у которых отсутствует ядро, окружённое мембраной.

Следующий домен, архея, также состоит из одноклеточных прокариот, отличающихся от бактерий своей уникальной историей эволюции. Наконец, эукариоты состоят из одноклеточных и многоклеточных организмов, отличающихся своими ядрами, окружёнными мембраной. Этот домен включает грибы, растения и животных.

Эволюционное Древо Жизни, как и реальное дерево, метафора, живущая своей жизнью. И классификация многих организмов, и сами различия между археями и бактериями, часто оспариваются и время от времени меняются.