Утечочное сканирование

Во время эукариотической трансляции, рибосомы сканируют мРНК, начиная с с 5-го прайм-конца до тех пор, пока они не столкнутся с первой AUG-последовательностью, старт-кодоном, и инициируют синтез белков. Тем не менее, возможно, у мРНК Два или более AUG-кодона в её последовательности. Рибосомы иногда не могут узнать первый AUG кодон, и вместо этого, начинают ситез белка со стартового кодона Далее вниз по ветви мРНК.

Это явление называется сканированием с утечкой"и это позволяет производить различные типов белков от той же мРНК. Конкретная консенсусная последовательность, известная как последовательность Козака, определяет, будет ли эта рибосома в состоянии запустить синтез белка на старт-кодоне, или пропустит его. В этой последовательности, A из Первый старт кодон AUG нумеруется как плюс один.

Нуклеотиды после него являются положительными, и нуклеотиды до него были отрицательными. Оптимальная последовательность происходит, когда пурин присутствует в позиции минус три и гуанин присутствует в позиции плюс четыре. В позиции минус три, аденин более эффективен, чем гуанин при запуске трансляция.

Изменения в остальной части нуклеотидной последовательности оказывают незначительное влияние при