Бактериальная транскрипция

Чтобы инициировать транскрипцию, голофермент РНК-полимераза неспецифически связывается с ДНК с низким сродством. Затем он скользит по ДНК, чтобы найти последовательность промотора.

Когда он скользит в промотор, а именно в области -10 и -35 выше сайта инициации, сигма-субъединица РНК-полимеразы плотно связывается с промотором и раскручивает ДНК, образуя комплекс «открытого промотора».

Голофермент РНК-полимеразы, теперь расположенный в месте инициации транскрипции, синтезирует транскрипт РНК путем добавления комплементарных нуклеотидов к матрице ДНК. Как только 10-нуклеотидная длинная цепь РНК синтезирована, сигма-фактор высвобождается.

Фермент РНК-полимеразы продолжает добавлять нуклеотиды к растущему транскрипту РНК. По мере продвижения полимеразы вперед ДНК непрерывно раскручивается перед ферментом и перематывается за ним.

Процесс продолжается до тех пор, пока ген не будет транскрибирован и полимераза ядра не столкнется с сигналом терминации. Наиболее распространенным терминирующим сигналом является симметричный инвертированный повтор последовательности, богатой GC, за которым следует поли-А хвост.

Когда эта последовательность транскрибируется в РНК, самокомплементарная последовательность образует пары оснований, образуя стабильную структуру петли шпильки.

Шпилька дестабилизирует ассоциацию мРНК и матрицы ДНК и приводит к остановке и диссоциации полимеразы. Таким образом, пузырь транскрипции схлопывается, и ДНК перематывается в двойную спираль, а вновь образованный транскрипт пре-мРНК высвобождается.