11.14
Эпигенетические изменения изменяют физическую структуру ДНК без изменения генетической последовательности и часто регулируют включение или выключение…
Эпигенетические изменения — это модификации экспрессии генов, которые могут наследоваться дочерними клетками или передаваться из поколения в поколение без изменений в генетической последовательности.
Эти изменения могут происходить во время развития эмбриона в качестве регуляторного процесса или могут быть вызваны факторами окружающей среды, такими как диета, воздействие токсичных веществ и стресс.
Эпигенетическая регуляция происходит с помощью трех основных механизмов: метилирования ДНК, модификации гистонов и процессов на основе РНК.
При метилировании ДНК метильные группы добавляются к определенным основаниям. Это изменяет способность регуляторных белков, таких как факторы транскрипции, связываться с ДНК, обычно предотвращая транскрибирование гена.
Модификация гистонов включает в себя добавление химических групп, таких как метил или ацетил, к белкам гистонов, вокруг которых ДНК оборачивается с образованием хроматина. Эти модификации влияют на оболочку хроматина, открывая ее, что делает ее более легкой для транскрипции, или конденсируя ее и ингибируя транскрипцию.
Различные типы РНК также могут иметь эпигенетические эффекты, в том числе некодирующие РНК, которые рекрутируют ферменты, модифицирующие гистоны. Кроме того, матричная РНК может быть метилирована, изменяя трансляцию.
View the full transcript and gain access to JoVE Core videos
Q1: What are the three main mechanisms of epigenetic regulation?
Epigenetic regulation occurs through DNA methylation, histone modification, and RNA-based processes. DNA methylation adds methyl groups to specific bases, preventing transcription factors from binding to DNA. Histone modification adds chemical groups to histone proteins, either opening chromatin for transcription or condensing it to inhibit transcription. Non-coding RNAs recruit histone-modifying enzymes, while messenger RNA methylation can alter translation.
Q2: How does DNA methylation prevent gene transcription?
DNA methylation adds methyl groups to specific DNA bases, altering the ability of regulatory proteins like transcription factors to bind to DNA. When methyl groups are added to promoter regions, they block transcription machinery from attaching, preventing the gene from being transcribed. This mechanism is particularly important in X-chromosome inactivation, where greater DNA methylation at promoter sites silences one X chromosome in female mammals.
Q3: What causes epigenetic changes in gene expression?
Epigenetic changes can occur during embryo development as a normal regulatory process or result from environmental factors including diet, exposure to toxic substances, and stress. These modifications alter gene expression without changing the DNA sequence itself, ensuring each cell produces only proteins necessary for its specific function. For example, bone growth proteins are not produced in muscle cells through epigenetic regulation.
Q4: How does histone modification affect chromatin structure and gene expression?
Histone modification involves adding chemical groups such as methyl or acetyl to histone proteins that DNA wraps around. These modifications affect how tightly chromatin is packaged: opening it up makes genes more easily transcribed, while condensing it inhibits transcription. Non-coding RNAs recruit the histone-modifying enzymes that catalyze these changes, allowing precise control of gene accessibility and expression.
Q5: Why is X-chromosome inactivation important in female mammals?
Female mammals have two X chromosomes while males have one X and one Y. Since the X chromosome contains significantly more genes than the Y chromosome, females would produce excess X-linked gene products. X-chromosome inactivation randomly silences one X chromosome during early development through DNA methylation, preventing gene dosage imbalance and ensuring proper development and cell function.
Q6: How do epigenetic errors contribute to cancer development?
Epigenetic errors such as modifying the wrong gene or failing to add chemical groups to specific genes can lead to abnormal gene activity. In cancer, CpG islands in promoter regions of tumor suppressor genes become excessively methylated, turning off these protective genes and allowing cancer cells to divide rapidly and uncontrollably. This abnormal DNA methylation is a common cause of cancer and other genetic disorders.
Q7: What role do non-coding RNAs play in epigenetic regulation?
Non-coding RNAs, including long non-coding RNAs, have epigenetic effects by recruiting histone-modifying enzymes to specific chromatin regions. These enzymes add or remove chemical groups from histone proteins, altering chromatin structure and gene accessibility. Additionally, messenger RNA can be methylated, which alters translation. This RNA-based mechanism provides another layer of epigenetic control over gene expression.