Эволюция микробного генома

Микробные геномы меняются со временем через прирост и потерю генов.

Внутри одного вида несколько штаммов последовательно наследуют общий набор генов, известный как основной геном.

Например, бактериальный вид X, по оценкам, обладает примерно пятью основными семействами генов, общих для анализируемых штаммов.

Кроме того, некоторые штаммы могут получать дополнительные гены, часто через горизонтальный перенос генов.

Пангеном вида X формируется полным набором основных семейств генов, присутствующих в изучаемых штаммах, а также дополнительными генами, встречающимися во многих штаммах.

У некоторых видов пангеном постоянно расширяется по мере появления новых наборов генов.

Эти приобретённые гены могут быть нейтральными или даже вредными, что приводит к делециям генов, характерным для микробных геномов, в то время как естественный отбор сохраняет полезные гены.

Таким образом, все гены базового выживания являются частью основного генома вида.