$$\rightleftharpoonup{xx}$$
$$\longleftharp{xx}$$,
$$\longrightharp{xx}$$,
1: Осмотическое анализа избегания.
- Около 16-24 часов до анализа, выбрать L4 личиночной стадии животных каждого генотипа к свежим пластины NGM содержащие OP50 Е. кишечной andincubate это при 20 ° C. На следующий день начать экспериментировать с молодого возраста.
- Рекомендуется проводить анализ "вслепую". Пластины с каждого штамма, чтобы быть проанализированы должны быть relabelled на второй экспериментатор, выступая методом с использованием relabelled пластин, которые будут разоблачены, когда эксперимент закончился.
- День анализа, подготовки 4М маточного раствора фруктозы с 1% раствором конго красный и полностью растворяются при комнатной температуре. Мы рекомендуем проверять решения до каждого теста с красителем может осадок со временем.
- С кольцевой (1 см в диаметре) на пластине NGM изложена в центре твердой среде, с 15 мкл красный раствор фруктозы 4М. Пусть фруктозы решение впитываться в агар, это обычно занимает от 2 до 5 минут.
- Место отдельных молодых взрослых животных каждого штамма в пределах кольца и следовать в течение следующих 10 минут, чтобы определить ответ на осмотический барьер. Животные избегая кольцо более чем в шесть раз подряд, классифицируются как нормальное, а те, выходя на ринг в менее шести попыток считается дефектным в осмотической чувствительности.
Примечание: контрольного штамма необходимо использовать в каждом анализе. N2 молодых взрослых животных используются в качестве положительного контроля, поскольку они решительно избегать кольцо барьер. Животные, которые были ранее голодали, проходили через Dauer личинок или приходят из плит, которые слишком сухой, не должны использоваться. В начале, контрольные животные должны быть оценены в двух экземплярах, чтобы подтвердить, что анализ пластин и решения являются правильными.
2: Генерация нокдаун червей путем подачи RNAi.
- RNAi плит: NGM пластин RNAi кормления содержит на литр: 17 агар г, 2,5 г пептона, 3,0 г хлористого натрия, 1 мл 5 мг холестерина мл -1; заполнить колбе до 1 л Н 2 О и автоклав. После агар охлаждают до 65 ° С, добавить 25 мл 1 М КПО 4, рН 6,0, 1 мл 1 М CaCl 2, 1 мл 1 М MgSO 4, 0,5 мл карбенициллин (50 мг мл -1) и 1 мл 1М IPTG. Если вы начинаете с подготовленными твердых NGM, растопить твердой среде в микроволновую печь, а затем место жидкость NGM на скамейке, чтобы охладиться, а затем добавить КПО 4, рН 6,0, CaCl 2, MgSO 4, карбенициллин и IPTG как указано ранее.
Добавьте 10 мл NGM в каждую 60 мм чашки Петри. Разрешить охлаждения и инвертировать пластин поддержание их при комнатной температуре в течение ночи перед использованием. Плиты можно хранить в полиэтиленовом пакете при температуре 4 ° С в течение 4-5 дней. - Бактериальные подготовки и индукции: изолят колоний E.coli HT115 (DE3) напряжения, трансформированные L4440 вектор, содержащий фрагмент, соответствующий ген-мишень, на Лурия-Бертани (LB) агаром (17 г агара, 10 г триптон, 5 г дрожжевой экстракт, и 10 г хлористого натрия на литр), содержащий ампициллин (50 мкг / мл) и тетрациклином (15 мкг / мл).
Выберите колонии бактерий и переливая ее LB с 50 мкг / мл ампициллина, и выращивали в течение 6 8 часов при встряхивании при 37 ° С; семян капля этой культуры на подготовленную пластин NGM и сухие пластины тщательно, прежде чем инкубации в течение ночи ( 12 24 ч) при комнатной температуре, чтобы размножения болезнетворных бактерий и начать индукции. Инкубации в темноте, так как тетрациклин светочувствительных и это может повлиять на изменчивость анализов RNAi между пластинами.
Необходимо использовать положительный и отрицательный контроль для экспериментов RNAi кормления. Положительного контроля является E.coli HT115 ячейки трансформированных L4440 вектор, содержащий UNC-22 последовательности генов. Нокдаун UNC-22 ген производит "подергивания фенотип". Отрицательного контроля является E.coli HT115 клетка превращается в пустую L4440 вектор. - Worm обработки и подсчета очков: первый день, место L4 стадии червей пластины NGM засеяно OP50 на NGM пластины без бактерий и инкубировать при 20 ° С в течение 12 часов (натощак).
На следующий день, трансфер молодого постился гермафродитов взрослых на тарелку seedded с бактериями выражения конкретной целевой ген РНК-интерференции. Оставьте 40-48 часов при температуре 20 ° С для получения потомства F1.
Затем поместите несколько F1 червей взрослых на другую пластину посеян с теми же бактериями. После 24-48 часов, выбрать и изолировать от F2 потомства, молодые люди (полностью сформирована выступающими вульвы с несколько яиц) и оценки фенотипов.
Примечание: индукция RNAi в нейроны имеют некоторые ограничения из-за огнеупорные свойства C Элеганс нервной системы РНК-интерференции.. Для преодоления проблем этого неэффективность нейрона рекомендуется использовать СБР-3 штамма, сверхчувствительных фоном к действию RNAi в нейронах 10. В наших экспериментах не разностныхх годов были найдены между Бристоль N2 и СБР-3 штаммов для генов и фенотипа проанализированы.
3: Штаммы используется.
C. Элеганс штаммы, используемые в данной работе представлены в таблице 1. Мутантные штаммы были вне пересекли против N2 дикие - типа не менее четырех раз, чтобы удалить нежелательные случайных мутаций, которые могли бы быть, образующихся при мутагенеза протокола.
. OP50 E палочки штамма suppliied на Caenorhabditis генетический центр, Университет Миннесоты, США E.coli HT115 (DE3) с плазмидой pL4440 проведения NRX-1 (JA: C29A12.5). И NLG-1 (JA: C40C9.5 фрагменты) гена были предоставлены д-р Питер Askjaer, Centro Andaluz дель-де-Biología Desarrollo (Абд), CSIC Университета Пабло Olavide, Севилья, Испания.
4: представитель результаты.
Иллюстративные результаты представлены на рисунках 1 и 2. Десять животных каждого штамма и не менее трех экспериментов реплики были выполнены.

Рисунок 1. Эксперименты осмотического поведения избегания.
Управление штаммов и NRX-1 (ok1649 и tm1961) V недостаточно mutantworms реагировать путем обращения вспять назад, когда они сталкиваются осмотического барьера (4М фруктоза). NLG-1 (ok259 и tm474) X мутанты не способны обнаружить этот барьер. Двойные мутанты дефицит NLG-1 и NRX-1, штаммы CRR21 (ok1649; ok259) и VX CRR23 (tm1961; ok259) VX восстановления дикой фенотип типа. * Указывает на существенные различия (р ≤ 0,001) Т-студент испытания, в ответ каждого штамма к Bristol N2 дикого типа Т-студент тест

Рисунок 2. Эксперименты с нокдауна червей путем подачи RNAi.
E.coli HT115 (DE3) преобразуется с пустыми pL4440 вектор или содержащих фрагмент, соответствующий генов-мишеней NRX-1 или NLG-1 были использованы для кормили разными штаммами червей. * Указывает на существенные различия (р ≤ 0,001) Т-студент тест, в реакции N2 напряжение подается с бактериями проведения pL4440 вектор с фрагментом ориентации NLG-1 гена по сравнению с N2 напряжение подается с пустыми pL4440 вектор .