1. Производство кремния мастеров с использованием стандартных SU-8 фотолитографии 1 (не показано в этом видео).
- Используйте стандартные SU-8 методами фотолитографии для создания СУ-8 "мастеров" (SU-8 2050 года, MicroChem, Ньютон, штат Массачусетс) для изготовления различных компонентов (PDMS мембраны различной толщины, со-культуры камеры) в чистом помещении. Такие формы мастера могут быть изготовлены в любой микротехнологий объекта (например, Стэнфордский Microfluidics Литейный; http://thebigone.stanford.edu/foundry/ ).
- До репликации PDMS, подвергать SU-8 мастеров fluorosilane пара в сушильном шкафу придает источником вакуума для облегчения выпуска PDMS от хозяина. Добавить каплю fluorosilane к бумажным полотенцем и применять вакуумные для одного мин. Снимите вакуумный и позволить 30 мин для осаждения fluorosilane. Держите SU-8 мастер в закрытом контейнере для использования в будущем.
2. Реплика формования PDMS от SU-8 мастер 2
- Жидкостный слой и слой управления, сделаны реплики формования PDMS от SU-8 хозяина.
- Смешайте PDMS предварительно полимера и сшивающего агента в 10:01 мас. соотношение и Дега в эксикаторе в течение 1 часа (или пока пузырьки воздуха удаляют из смеси PDMS).
- Место SU-8 мастером в чашке Петри и осторожно вылейте смесь PDMS поверх SU-8 хозяина. Дега PDMS снова.
- Спиновые плесень при 1200 оборотов в минуту в течение одной минуты, чтобы получить равномерную толщину PDMS около 100 мкм на плесень.
- Тепло чашке Петри содержащие PDMS и SU-8 мастер формы при 80 ° С в течение одного часа, чтобы вылечить PDMS.
- Удалить вылечить PDMS покрытые SU-8 мастера из плиты.
- Пил плесень PDMS от SU-8 хозяина.
- Просверлите четыре отверстия в форме использования PDMS 20 калибра тупой конец иглы в течение двух бактерий входов, один выход и один пневматический порт.
3. Склеивание Многослойные PDMS устройств: Это устройство монтируется с тремя слоями, верхний слой, который содержит основной канал, средний слой пневматического и нижней бактериальный слой, содержащий каналы для бактерий. Три слоя собираются, как описано ниже.
- Влажные PDMS мембран с метанолом и тщательно чистить их от SU-8 мастер формы, используя чистую щипцами. Место мембраны на лист тефлона.
- Место мембранных пневматических и жидкостный слой на плазменной камеры кислорода. Включите плазмы в течение 40 сек (давление кислорода 10 SCCM, ВЧ мощность 100 Вт).
- После контакта с плазмой, выравнивание (в течение 10 минут) мембраны на дне PDMS канал с помощью щипцов. Добавление метанола на мембране и PDMS слоев позволяет свободное перемещение слоев, и делает выравнивание проще. В этом случае устройство помещается на кусочек марли, чтобы метанола пары к бегству.
- Cure выровнены PDMS слоев на плите при температуре 80 ° С в течение 8 ч.
- После связывания пневматический мембранный на нижний слой, повторите шаги 3,2 - 3,4 для соединения верхней канал на собранном композитного устройства PDMS.
4. Сборка устройства PDMS 3,4
- Просверлите отверстия в входных и выходных портов, используемых для посева эукариотических клеток и бактерий.
- Подключите Tygon трубки (0,01 дюйма OD) в порты и эксплуатации пневматических слой, потянув с 20 мл шприца.
- Место модели PDMS и предварительно очищенное стекло в плазменной камере кислорода. Включите плазмы в течение 20 сек (давление кислорода 20 SCCM, ВЧ мощность 300 Вт) без применения вакуума.
- Для того, чтобы предотвратить контакт между островом стене (PDMS) крепление к стеклу, сразу же подключить шприца к устройству и применять вакуум, потянув шприц и удерживая его на месте.
- Аккуратно нажмите модели PDMS на стекле (в течение 2 минут).
- Cure устройство PDMS при 80 ° С в течение 10 минут.
5. Лечение стеклянной поверхности с фибронектин
- Стерилизовать устройство под действием УФ в течение 15 минут после подключения трубки к Tygon каждого порта.
- Заполнить и поток стерилизовать PBS в канал для удаления мусора в канал. Применить потока в течение 10 минут, чтобы удалить пузырьки воздуха. Пузырьки воздуха могут легко выбраться PDMS из-за его газопроницаемость.
- Заполните цветовое решение красителя в пневматических канала, чтобы предотвратить образование воздушных пузырьков в канале.
- Для облегчения посева эукариотической клетки на стекло, ввести 1 мкг / мл раствора фибронектина в устройство и инкубировать в течение 40 мин при 37 ° C.
- Вымойте избыток фибронектина с 1 мл питательной среды.
6. Формирование и измерение комменсальной Е. кишечной биопленки востровов
- Развести синантропных бактерий (например, кишечная палочка BW25113/pCM18) в M9 минимальных средах с OD 600 ~ 1 для формирования синантропных биопленки в закрытых камерах / островами.
- Закрыть острове стены с применением положительного давления жидкости. Домашний воздух-жидкость давления преобразователь используется для предотвращения образования пузырьков воздуха в канале.
- Ввести комменсальной Е. кишечной на острова с клапан закрыт, и позволяют бактериям придают течение 1 часа при 32 ° C.
- Вымойте одиноких бактерий и заливать разбавленный бактериальной суспензии (OD 600 ~ 0,05) в 0.25mL/hr течение 12 часов.
- Промыть биопленки со свежими питательной среды DMEM, чтобы удалить слабо прилагается бактерий и эукариот подготовиться к привязанности клетки.
- Изображение биопленки использовании Leica TCS SP5 конфокальной лазерной сканирующей микроскопии (Bannockburn, IL) и визуализировать биопленки архитектуры с использованием программного обеспечения IMARIS 5.
7. Посев эукариотических клеток вокруг бактериальных острова 6-8
- Trypsinize HeLa клетки из ткани колбу культуры и ресуспендируют в DMEM средств массовой информации для посева плотность 5 х 10 5 клеток / мл.
- Ввести HeLa клетки в устройство на скорости потока 2 мл / мин с помощью насоса Picoplus шприц (Гарвардский Apparattus, MA). Убедитесь, что остров стене опускается так, что бактериальные биопленки является отдельным от региона ячейки HeLa. Этот шаг должен быть выполнен на сцене световой микроскоп, так что равномерность посева может быть определена.
- Зажим ячейки выход к снижению движение суспензии клеток в канале и инкубировать в течение 6 ч при 37 ° С в 5% СО 2 инкубатора.
- Заливать устройство с ростовой среде на уровне 0,5 мл / ч, чтобы удалить одиноких клеток.
- Обновить DMEM средств массовой информации для HeLa и синантропных Е. кишечной каждые 6 часов.
8. Введение патогенных бактерий на остров и воздействия эукариотических клеток
- Подготовка Е. палочки O157: H7 (EHEC) для заражения клетки HeLa при множественности заражения (МВД) 100:1 200:1 (количество EHEC на клетку HeLa).
- Промыть и промыть слабо прилагается синантропных бактерий.
- Ввести разбавленный EHEC подвеска (OD 600 ~ 0,1) на островах.
- Инкубируйте устройство при температуре 37 ° С в 5% СО 2 инкубатора в течение 6 часов без потока, чтобы EHEC подвергаться сигналы присутствуют в синантропных биопленки.
- Поднимите PDMS стене подвергать EHEC в синантропных островов HeLa клетки в течение 6 часов.
- Промойте канал PBS и пятна для живых и мертвых клеток, используя Live / Мертвые комплектом (L3224, Invitrogen, Калифорния).
- Изображение нескольких местах на Zeiss Axiovert 200M флуоресцентного микроскопа и оценить количество живых и мертвых клеток.
9. Представитель Результаты 9
Последовательность событий при инфекциях желудочно-кишечного тракта была передразнил путем разработки монослоя клеток HeLa и синантропных Е. биопленки палочка и подвергая EHEC в синантропных биопленки до заражения клеток HeLa. Этапы изготовления микрожидкостных совместно культуры модели показаны на рисунке 1. Рисунок 2А показывает, 3-мерные оказание со-культуры устройства. Двух регионах в совместной культуре устройство эукариотических камеры культуре клеток и бактериальной острова показаны на рисунке 2B с различными красителями цвета (фиолетовый для эукариотических регионов и зеленый для бактериальных остров). Возможность выделения бактериальной культуры из регионов окружающих эукариотических область показана на рис 2С с помощью цвета красителей. На рисунке 3 показана репрезентативные результаты от совместного культуры эпителиальных клеток и бактерий. Рис.3 показана колонизация комменсальной биопленки (зеленый) острова EHEC (красный). Рис 3B показывает сопоставление эпителиальных клеток и синантропных Е. палочка с EHEC в бактериальной острова. RFP выражения EHEC и GFP выражения синантропных бактерий локализуются на острове, когда PDMS стене опускается, иллюстрирующие возможности выделения бактериальных остров из эпителиальных клеток.

Рисунок 1: Сотовый посева схемы совместного культуры модели. (1) PDMS стена опускается на форму острова, синантропных бактерий вводятся в остров, и фибронектин текла по всему острову. (2) HeLa клетки высевают в регионах, окружающих остров. (3) После HeLa клетки достигают слияния и синантропных биопленки сложилось, EHEC вводится в остров. (4) PDMS стеной поднимаетсядо подвергать HeLa клеток, окружающих остров, чтобы EHEC. Вставка детали показы клапана.


Рисунок 2: микрожидкостных моделью для сотрудничества культуре эпителиальных клеток и бактерий. () Трехмерный исполнение совместного культуре устройство показывает пневматическим приводом захвата регионов для формирования бактериальной островах среди эпителиальных клеток. Каждая бактериальная острове (1200 мкм и диаметром 1000 мкм друг от друга) имеет отдельный вход и выход для обеспечения питательной среды и удаления отходов с острова. (B) Микрофотография со-культуры устройства с цветными красителями с указанием различных регионах (эпителиальные зоне клетки, бактериальная острова). (C) точность системы захвата пневматического показывает снижение PDMS стене (слева) с использованием пневматического активированного канала (синие), представляя пурпурной краски в закрытом острова остров, и течет желтая краска вокруг него в течение 48 ч. Когда PDMS стены поднимается (справа), регион острова подвергается воздействию окружающей желтый краситель. Шкала бар представляет 500 мкм.

Рисунок 3: Со-культуре клеток HeLa и бактерий. (А) Флуоресценция образ RFP, экспрессирующих EHEC и GFP-выражения E. кишечной BW25113 в остров. (В) Наложение передается, зеленый и красный флуоресцентные изображения в устройстве. Шкала бар представляет 200 мкм.