Следующий протокол описывает процесс поджелудочной рассечение для виртуальных изображений ломтик, и последующего количественного всех GFP-меткой бета-клеток в поджелудочной железе все.
Для просмотра этого контента требуется подписка на JoVE. Войдите или начните свой бесплатный пробный период.
Методическая статья
Следующий протокол описывает процесс поджелудочной рассечение для виртуальных изображений ломтик, и последующего количественного всех GFP-меткой бета-клеток в поджелудочной железе все.
Отслеживание изменений конкретных популяций клеток в норме и патологии является важной целью проведения биомедицинских исследований. Процесс мониторинга панкреатических бета-клеток островков и рост особенно сложным. Мы разработали метод захвата распределения бета-клеток в поджелудочной железе нетронутыми трансгенных мышей с флуоресцентными метками бета-клеток с макроса, написанного для ImageJ (rsb.info.nih.gov / ц /). После вскрытия поджелудочной железы и ткани очистки, всей поджелудочной железы захватывается в качестве виртуального ломтик, после чего GFP-меткой бета-клеток рассматриваются. Анализ включает в себя количественную оценку суммарной бета-клеток площадь, количество островок и распределение по размерам со ссылкой на конкретные параметры и места для каждого островка и для небольших кластеров бета-клеток. Все распределение островков могут быть построены в трех измерениях, а также информации от распространения на размер и форму каждого островка позволяет количественное и качественное сравнение изменений в общей бета-клеток области с первого взгляда.
Часть 1: Подготовка образцов
Часть 2: Работа с изображениями и количественного бета-клеток в области нетронутыми поджелудочной железы

Рисунок 1А виртуальных фрагментов изображения анализа весь дистрибутив бета-клеток в поджелудочной железе нетронутыми взрослых
Изображения отдельных оптических панелей мужской поджелудочной железы мыши в 10-недельного взят под 2x цели. Изображения включают все распределение островков, даже небольшие скопления бета-клеток (<10 клеток).

Рис 1B Виртуальный анализа изображений Кусочек весь дистрибутив бета-клеток в поджелудочной железе нетронутыми взрослых
Единого виртуального срез с дорсальной поджелудочной железы на правой и вентральной поджелудочной железы слева. Шкала бар 5 мм.
Представитель Результаты
Опытный подготовки поджелудочной железы для виртуальных изображений фрагментов позволит эффективной количественной оценки всех GFP-меткой бета-клеток в поджелудочной железе всего в качестве виртуального изображения фрагментов с ясным и отчетливым островков. Успешное Виртуальный изображений Кусочек целом поджелудочной железы на месте предоставляет средства для изучения и количественной оценки бета-клеток, а не только индивидуальной и общей островок области, но и островок размер дистрибутива, региональный анализ, и рост клеток, а также. Хотя ImageJ поддерживает возможности для выявления всех бета-клеток одновременно в анализе виртуальной изображения фрагмент, он также может контролировать, какие бета-клеток количественно, ограничиваясь анализом определенных размеров островка (по площади или диаметр), или по месту расположения. Стандартный анализ исключает артефакты, например, мусора меньше, чем одна бета-клеток (<170 мкм 2) и регистрирует площадь, периметр (расстояние окружающих область), округлости (степень округлости, где 1,0 представляет собой идеальный круг), и диаметр Фере (в длинную дистанцию в пределах области) за каждый островок обнаружено. Виртуальный анализ фрагмента, способные повышать виртуальных образов, используя часть водораздела сегментации, которая отличает и отделяет перекрытия островков на отдельные островки в зависимости от их формы. Анализ дальнейшего производит ряд детальных изображений; это включает в себя маски изображения под низкой и высокой интенсивности (рис. 1в), краткое содержание всех предполагаемых островков, каждый из которых индивидуально пронумерованы и перечислены в таблице соответствующей информации (рис. . 1D), а также оригинальные виртуальные изображения фрагментов (рис. 1В). Обратите внимание, что потенциальные технические предвзятость при выборе пороговых значений может исказить количественного островков, включив свет, окружающий безвозмездной крупные структуры, либо за счет снижения общего количества островков, особенно слабые сигналы от мелких частиц.

Рис 1С виртуальных фрагментов изображения анализа весь дистрибутив бета-клеток в поджелудочной железе нетронутыми взрослых
Маска флуоресцентные частицы в виртуальном срез. Цвет коды: [1] синий: низкая интенсивность флуоресценции; [2] Зеленый: промежуточные интенсивности флуоресценции, а также [3] красным: высокая интенсивность флуоресценции.

Рис. 1D Виртуальный анализа изображений Кусочек весь дистрибутив бета-клеток в поджелудочной железе нетронутыми взрослых
Количественная оценка отдельных островков / кластеров бета-клеток. Заметим, что каждый островок (в том числе малых кластеров бета-клеток) имеет номер, с его информации подробно описаны в соответствующей диаграмме. Четыре параметры были взяты для каждой структуры: (1) области; (2) периметр, (3) округлости: степень округлости, где число 1.0 представляет идеальный круг, и (4) диаметр Фере это: длинное расстояние в пределах области. Обратите внимание, что # 706 показывает анализ разрешение с площадью всего несколько бета-клеток. Водораздел сегментации определяет группы прилегающие к нему острова, такие, как показано, и соответствующим образом отличает их в качестве отдельных островков (островков 1554, 1555 и 1556).

Рис 1E виртуальных фрагментов изображения анализа весь дистрибутив бета-клеток в поджелудочной железе нетронутыми взрослых
3-мерный участок виртуального анализа ломтик, с осями площадь, периметр и диаметр Фере в. Каждая точка представляет собой небольшой островок.
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
Анализ виртуальных образов Кусочек островков и бета-клеток кластеров в неповрежденную поджелудочной железы обеспечивает крупномасштабных вид на весь распределения островков. События и изменения в общем распределении островок в течение долгого времени, таким образом, изучать и сравнивать. Такой пример показал в нашем анализе островков поджелудочной железы образование (1). Всесторонний анализ неонатальной pancreata мышей в различные моменты времени (P1-P21) показал, что островки формируются деления. Хотя бета-клеток согла...
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
Работа выполнена при поддержке США Служба общественного здравоохранения Грант DK-081 527, DK-072 473 и DK-20595 в Чикагском университете диабета Научно-учебный центр (Core животных моделях), а также подарок от Фонда семьи Ковлер.
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.
| Имя | Компания | Каталожный номер | Комментарии |
|---|---|---|---|
| Пинцет | Miltex Inc. | ||
| Ножницы | F.S.T. | 14001-13 | 01n2 |
| Ножницы | F.S.T. | 14072-10 | 02s5 |
| Большое предметное стекло | Electron Microscopy Sciences | 71862-01 | 75x51x1.2mm |
| Большое покровное стекло | Ted Pella, Inc. | 260462 | 50x75mm |
| Предметное стекло | Fisher Scientific | 12-550-15 | 25x75x1.0mm |
| Покровное стекло | Fisher Scientific | 12-458-5M | 75x25mm |
| Покровное стекло | Erie Scientific | круг 25mm | |
| Флуоресцентный микроскоп | Olympus Corporation | ||
| Диссекционный микроскоп | Olympus Corporation | ||
| Stereo Investigator | MBF Bioscience | ||
| Мыши MIP-GFP | Jackson Laboratory |
Доступ ограничен. Войдите в систему или начните пробный период, чтобы просмотреть этот контент.